PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=512-9O-466)

Interfaces in PDB 1log crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 2.10 Å

X-RAY STRUCTURE OF A (ALPHA-MAN(1-3)BETA-MAN(1-4)GLCNAC)-LECTIN COMPLEX AT 2.1 ANGSTROMS RESOLUTION

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`346`	`51`	`6154`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`459`	`114`	`11476`	`3942.0`	`-39.9`	`0.464`	`98`	`1`	`0`	`0.843`
	`2`		B	`327`	`45`	`5782`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`442`	`111`	`11402`	`3769.8`	`-40.1`	`0.466`	`86`	`1`	`0`	`0.843`
	*Average:*													`3855.9`	`-40.0`	`0.465`	`92`	`1`	`0`	`0.843`
2	`3`		C	`86`	`25`	`11476`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`80`	`22`	`11402`	`734.6`	`1.2`	`0.866`	`18`	`1`	`0`	`0.003`
3	`4`		A	`37`	`14`	`11402`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`41`	`14`	`11476`	`364.4`	`-2.3`	`0.491`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
4	`5`		D	`27`	`7`	`6154`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`36`	`12`	`11402`	`253.6`	`-2.7`	`0.557`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
	`6`		B	`16`	`3`	`5782`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`11476`	`139.8`	`-0.9`	`0.574`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
	*Average:*													`196.7`	`-1.8`	`0.566`	`1`	`0`	`0`	`0.002`
5	`7`		C	`22`	`6`	`11476`	`◊`	C	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`22`	`6`	`11476`	`172.2`	`-0.2`	`0.685`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		[MAN]C:581	`9`	`1`	`290`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`17`	`10`	`11476`	`118.7`	`1.5`	`0.325`	`3`	`0`	`0`	`0.006`
	`9`		[MAN]A:591	`9`	`1`	`291`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`10`	`11402`	`113.3`	`1.2`	`0.332`	`4`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`116.0`	`1.3`	`0.329`	`4`	`0`	`0`	`0.006`
7	`10`		A	`11`	`2`	`11402`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`18`	`7`	`11402`	`116.4`	`0.6`	`0.781`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	`11`		C	`17`	`7`	`11476`	`x`	C	x,y,z-1	`1_554`	`11`	`2`	`11476`	`113.5`	`0.9`	`0.809`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`114.9`	`0.8`	`0.795`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
8	`12`		B	`8`	`3`	`5782`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`11`	`3`	`11476`	`111.5`	`-0.7`	`0.556`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
9	`13`		D	`9`	`3`	`6154`	`◊`	D	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`10`	`3`	`6154`	`109.9`	`-0.5`	`0.688`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		C	`10`	`2`	`11476`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`11`	`5`	`11402`	`107.4`	`-0.0`	`0.576`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		A	`12`	`5`	`11402`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`12`	`5`	`11476`	`98.2`	`2.2`	`0.887`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		[BMA]A:592	`7`	`1`	`290`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`10`	`4`	`11476`	`92.7`	`0.3`	`0.203`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`17`		D	`9`	`2`	`6154`	`◊`	C	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`9`	`4`	`11476`	`89.3`	`0.3`	`0.774`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
14	`18`		[MAN]C:581	`7`	`1`	`290`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`3`	`6154`	`75.9`	`0.6`	`0.296`	`5`	`0`	`0`	`0.017`
	`19`		[MAN]A:591	`7`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`5782`	`64.7`	`0.3`	`0.267`	`4`	`0`	`0`	`0.017`
	*Average:*													`70.3`	`0.4`	`0.282`	`5`	`0`	`0`	`0.017`
15	`20`		[NAG]C:583	`6`	`1`	`368`	`cf`	[BMA]C:582	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`290`	`63.0`	`1.2`	`0.105`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		[MN]A:562	`1`	`1`	`123`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`9`	`11402`	`61.6`	`-6.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
	`22`		[MN]C:572	`1`	`1`	`123`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`11476`	`61.0`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
	*Average:*													`61.3`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
17	`23`		[NAG]A:593	`5`	`1`	`367`	`cf`	[BMA]A:592	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`290`	`59.0`	`1.2`	`0.120`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[NAG]A:593	`7`	`1`	`367`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`5782`	`57.7`	`1.4`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		[NAG]C:583	`4`	`1`	`368`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`6154`	`44.6`	`0.8`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`51.1`	`1.1`	`0.415`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`26`		[BMA]C:582	`5`	`1`	`290`	`cf`	[MAN]C:581	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`290`	`57.5`	`2.6`	`0.267`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		[BMA]A:592	`6`	`1`	`290`	`cf`	[MAN]A:591	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`291`	`53.8`	`2.4`	`0.245`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`55.7`	`2.5`	`0.256`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`28`		B	`8`	`2`	`5782`	`◊`	C	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`4`	`4`	`11476`	`43.8`	`-0.8`	`0.363`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`29`		[CA]A:561	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`11402`	`41.2`	`-11.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.119`
	`30`		[CA]C:571	`1`	`1`	`85`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`11476`	`38.4`	`-11.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.119`
	*Average:*													`39.8`	`-11.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.119`
22	`31`		C	`3`	`1`	`11476`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`2`	`5782`	`37.6`	`1.0`	`0.890`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`32`		D	`2`	`1`	`6154`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`11402`	`3.4`	`0.1`	`0.693`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`20.5`	`0.5`	`0.791`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
23	`33`		[MAN]A:591	`5`	`1`	`291`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`5`	`3`	`11476`	`37.4`	`1.0`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`34`		[BMA]C:582	`6`	`1`	`290`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`6154`	`36.0`	`0.4`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		[BMA]A:592	`6`	`1`	`290`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`5782`	`31.0`	`0.5`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`33.5`	`0.5`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`36`		A	`10`	`4`	`11402`	`◊`	[NAG]C:583	x,y-1,z+1	`1_546`	`6`	`1`	`368`	`35.7`	`0.4`	`0.302`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`37`		[NAG]C:583	`6`	`1`	`368`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`11476`	`34.6`	`-0.0`	`0.146`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`38`		[NAG]A:593	`5`	`1`	`367`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11402`	`31.6`	`-0.2`	`0.099`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
28	`39`		[BMA]C:582	`4`	`1`	`290`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11476`	`30.9`	`0.4`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`40`		D	`3`	`2`	`6154`	`◊`	B	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`2`	`1`	`5782`	`30.1`	`0.5`	`0.839`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
30	`41`		[BMA]A:592	`4`	`1`	`290`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11402`	`29.8`	`0.4`	`0.270`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`42`		A	`3`	`2`	`11402`	`◊`	[BMA]C:582	x,y-1,z+1	`1_546`	`3`	`1`	`290`	`27.4`	`1.2`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`43`		B	`4`	`2`	`5782`	`◊`	[NAG]C:583	x,y-1,z+1	`1_546`	`2`	`1`	`368`	`20.9`	`0.5`	`0.521`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`44`		[NAG]A:593	`3`	`1`	`367`	`f`	[MAN]A:591	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`291`	`18.2`	`0.5`	`0.206`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`45`		C	`2`	`1`	`11476`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`6154`	`12.4`	`0.2`	`0.740`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`46`		C	`1`	`1`	`11476`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`1`	`1`	`11402`	`12.0`	`-0.4`	`0.187`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`47`		D	`2`	`1`	`6154`	`◊`	A	-x+1,-y+1,z	`2_665`	`2`	`1`	`11402`	`10.9`	`-0.3`	`0.466`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`48`		[NAG]C:583	`3`	`1`	`368`	`f`	[MAN]C:581	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`290`	`10.1`	`0.2`	`0.214`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`49`		[MN]C:572	`1`	`1`	`123`	`f`	[CA]C:571	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`9.9`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
39	`50`		[MN]A:562	`1`	`1`	`123`	`f`	[CA]A:561	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`9.6`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
40	`51`		B	`1`	`1`	`5782`	`◊`	C	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`1`	`1`	`11476`	`9.1`	`-0.3`	`0.278`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`52`		[CA]A:561	`1`	`1`	`85`	`◊`	[MAN]A:591	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`291`	`0.6`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.001`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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