PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=332-H6-3B9)

Interfaces in PDB 1cw9 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.55 Å

DNA DECAMER WITH AN ENGINEERED CROSSLINK IN THE MINOR GROOVE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`45`	`9`	`2401`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`46`	`9`	`2407`	`440.3`	`-5.1`	`0.464`	`23`	`0`	`0`	`0.939`
2	`2`		D	`42`	`9`	`2374`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`42`	`9`	`2427`	`407.5`	`-5.3`	`0.455`	`26`	`0`	`0`	`0.942`
3	`3`		[G47]A:5	`22`	`1`	`558`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`35`	`3`	`2407`	`285.7`	`3.9`	`0.749`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		[G47]B:5	`23`	`1`	`557`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`35`	`3`	`2401`	`281.4`	`3.8`	`0.767`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		[G47]C:5	`23`	`1`	`574`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`35`	`3`	`2427`	`280.7`	`2.9`	`0.726`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`282.6`	`3.6`	`0.748`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		[G47]D:5	`23`	`1`	`555`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`33`	`3`	`2374`	`272.9`	`3.9`	`0.770`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
5	`7`		B	`17`	`3`	`2401`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`12`	`2`	`2407`	`120.5`	`-2.5`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`8`		C	`15`	`1`	`2427`	`x`	C	x-1,y,z	`1_455`	`11`	`1`	`2427`	`100.8`	`2.5`	`0.753`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		A	`13`	`1`	`2407`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`1`	`2407`	`100.3`	`2.2`	`0.728`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		B	`15`	`1`	`2401`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`12`	`1`	`2401`	`99.9`	`2.9`	`0.775`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`11`		D	`12`	`1`	`2374`	`x`	D	x-1,y,z	`1_455`	`14`	`1`	`2374`	`99.3`	`3.0`	`0.784`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`100.1`	`2.7`	`0.760`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`12`		[G47]B:5	`8`	`1`	`557`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`3`	`2407`	`95.8`	`-1.2`	`0.482`	`3`	`0`	`0`	`0.263`
	`13`		[G47]A:5	`8`	`1`	`558`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`3`	`2401`	`95.1`	`-0.4`	`0.517`	`3`	`0`	`0`	`0.263`
	*Average:*													`95.4`	`-0.8`	`0.500`	`3`	`0`	`0`	`0.263`
8	`14`		[G47]C:5	`9`	`1`	`574`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`2`	`2374`	`89.7`	`-0.2`	`0.542`	`3`	`0`	`0`	`0.085`
9	`15`		[G47]B:5	`9`	`1`	`557`	`◊`	[G47]A:5	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`558`	`87.4`	`-2.3`	`0.398`	`1`	`0`	`0`	`0.168`
10	`16`		[G47]D:5	`7`	`1`	`555`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`2`	`2427`	`83.7`	`-0.6`	`0.492`	`2`	`0`	`0`	`0.085`
11	`17`		[G47]D:5	`8`	`1`	`555`	`◊`	[G47]C:5	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`574`	`80.0`	`-2.3`	`0.364`	`2`	`0`	`0`	`0.178`
12	`18`		B	`9`	`1`	`2401`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`7`	`2`	`2427`	`78.0`	`-0.7`	`0.478`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`19`		B	`9`	`1`	`2401`	`◊`	[G47]C:5	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`9`	`1`	`574`	`67.7`	`0.7`	`0.593`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`20`		B	`6`	`2`	`2401`	`◊`	[G47]C:5	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`7`	`1`	`574`	`60.2`	`-0.2`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`21`		A	`6`	`2`	`2407`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`5`	`1`	`2401`	`52.7`	`-1.5`	`0.323`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`22`		C	`6`	`1`	`2427`	`◊`	[G47]D:5	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`8`	`1`	`555`	`50.9`	`-0.0`	`0.541`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		B	`5`	`1`	`2401`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2407`	`42.7`	`-0.6`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		C	`6`	`1`	`2427`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`7`	`1`	`2374`	`41.0`	`-0.9`	`0.450`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		A	`4`	`1`	`2407`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`2`	`2374`	`38.0`	`-0.9`	`0.346`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`26`		C	`5`	`1`	`2427`	`◊`	D	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`4`	`2`	`2374`	`37.1`	`-1.4`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`27`		A	`9`	`2`	`2407`	`◊`	C	x-1,y-1,z	`1_445`	`4`	`1`	`2427`	`36.6`	`-1.6`	`0.291`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`28`		A	`5`	`1`	`2407`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`3`	`1`	`2374`	`36.6`	`-1.4`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`29`		[G47]D:5	`5`	`1`	`555`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`4`	`1`	`2427`	`31.8`	`-0.0`	`0.508`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`30`		B	`5`	`1`	`2401`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`5`	`2`	`2427`	`30.9`	`0.2`	`0.542`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`31`		D	`3`	`1`	`2374`	`◊`	C	x-1/2,-y+3/2,-z+1	`4_466`	`3`	`1`	`2427`	`30.3`	`0.2`	`0.499`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`32`		[CA]A:11	`1`	`1`	`85`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`2407`	`24.5`	`-2.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.208`
	`33`		[CA]A:11	`1`	`1`	`85`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`2401`	`21.8`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.208`
	*Average:*													`23.1`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.208`
27	`34`		D	`4`	`1`	`2374`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2427`	`23.2`	`-1.0`	`0.412`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`35`		[CA]A:11	`1`	`1`	`85`	`◊`	[G47]A:5	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`558`	`22.6`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.235`
	`36`		[CA]A:11	`1`	`1`	`85`	`◊`	[G47]B:5	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`557`	`21.9`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.235`
	*Average:*													`22.3`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.235`
29	`37`		A	`5`	`1`	`2407`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`2401`	`20.4`	`-0.6`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`38`		C	`4`	`2`	`2427`	`◊`	B	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`4`	`2`	`2401`	`17.9`	`-0.4`	`0.446`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`39`		A	`3`	`1`	`2407`	`◊`	[G47]B:5	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`2`	`1`	`557`	`16.5`	`-0.4`	`0.378`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`40`		B	`1`	`1`	`2401`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`1`	`2427`	`11.2`	`-1.1`	`0.248`	`0`	`0`	`0`	`0.022`
33	`41`		C	`1`	`1`	`2427`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2407`	`11.2`	`-1.2`	`0.172`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`42`		[G47]A:5	`1`	`1`	`558`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`2374`	`10.4`	`-0.0`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`43`		[G47]A:5	`3`	`1`	`558`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`2`	`1`	`2374`	`9.4`	`0.1`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`44`		A	`2`	`1`	`2407`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`2374`	`9.1`	`0.2`	`0.444`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`45`		A	`3`	`1`	`2407`	`◊`	C	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`1`	`1`	`2427`	`8.6`	`-0.9`	`0.256`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`46`		[G47]B:5	`3`	`1`	`557`	`◊`	A	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`3`	`1`	`2407`	`8.4`	`0.1`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`47`		[G47]A:5	`2`	`1`	`558`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`2374`	`7.3`	`-0.7`	`0.239`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
40	`48`		B	`1`	`1`	`2401`	`◊`	[G47]D:5	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`555`	`6.9`	`-0.7`	`0.229`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
41	`49`		D	`1`	`1`	`2374`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2407`	`5.1`	`-0.5`	`0.179`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`50`		[G47]B:5	`1`	`1`	`557`	`◊`	D	x-1/2,-y+1/2,-z+1	`4_456`	`1`	`1`	`2374`	`3.8`	`-0.4`	`0.211`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`51`		B	`3`	`1`	`2401`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`2374`	`2.9`	`-0.1`	`0.391`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
44	`52`		A	`1`	`1`	`2407`	`◊`	C	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`1`	`1`	`2427`	`1.8`	`0.1`	`0.458`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`53`		[CA]A:11	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`2374`	`1.2`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.013`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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