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PDBsum entry 9h2s
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Pore analysis for: 9h2s calculated with  MOLE 2.0
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PDB id
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9h2s
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Pores calculated on whole structure |
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Pores calculated excluding ligands
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12 pores,
coloured by radius |
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12 pores,
coloured by radius
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12 pores,
coloured as in
list below
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Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
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Free R
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Length
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HPathy
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HPhob
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Polar
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Rel Mut
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Residue..type
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Ligands
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Radius |
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1 |
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1.22 |
1.58 |
45.5 |
1.86 |
0.83 |
8.8 |
77 |
|
4 |
0 |
1 |
12 |
4 |
0 |
0 |
|
D12 401 A D12 401 G
|
 |
|
2 |
 |
1.36 |
1.41 |
68.6 |
2.35 |
0.65 |
2.8 |
76 |
2 |
0 |
2 |
32 |
2 |
0 |
0 |
D12 402 A D12 402 B D12 403 C D12 402 D D12 402 E
D12 403 E D12 401 F D12 402 F D12 403 G
|
|
3 |
 |
1.36 |
1.38 |
72.2 |
2.57 |
0.76 |
2.5 |
76 |
2 |
0 |
2 |
33 |
2 |
0 |
0 |
D12 402 A D12 402 B D12 401 C D12 403 C D12 401 D
D12 402 D D12 402 E D12 402 F D12 403 G
|
|
4 |
 |
1.19 |
1.58 |
72.2 |
2.40 |
0.93 |
6.1 |
77 |
4 |
0 |
1 |
22 |
6 |
0 |
0 |
D12 401 A D12 403 F D12 401 G D12 402 G
|
|
5 |
 |
1.22 |
1.64 |
76.4 |
2.22 |
0.84 |
5.7 |
80 |
4 |
0 |
2 |
23 |
4 |
0 |
0 |
D12 403 E D12 401 F D12 403 F D12 402 G
|
|
6 |
 |
1.22 |
1.58 |
78.6 |
2.50 |
0.67 |
3.1 |
75 |
2 |
0 |
0 |
40 |
3 |
0 |
0 |
D12 402 A D12 402 B D12 403 C D12 402 D D12 402 E
D12 402 F D12 403 F D12 402 G D12 403 G
|
|
7 |
 |
2.52 |
2.52 |
85.0 |
2.44 |
0.99 |
5.2 |
81 |
4 |
0 |
3 |
24 |
5 |
0 |
0 |
D12 401 A D12 403 E D12 401 F D12 403 F D12 401 G
D12 402 G
|
|
8 |
 |
2.52 |
2.52 |
85.5 |
2.59 |
1.02 |
4.5 |
81 |
4 |
0 |
3 |
24 |
5 |
0 |
0 |
D12 401 C D12 401 D D12 403 D D12 401 E D12 403 E
D12 401 F
|
|
9 |
 |
2.52 |
2.52 |
108.6 |
2.79 |
1.05 |
3.7 |
83 |
4 |
0 |
3 |
33 |
5 |
0 |
0 |
D12 401 A D12 403 A D12 401 B D12 403 B D12 401 C
D12 402 C D12 401 D D12 401 G
|
|
10 |
 |
1.23 |
1.64 |
123.2 |
2.75 |
0.95 |
3.5 |
82 |
4 |
0 |
2 |
41 |
4 |
0 |
0 |
D12 401 C D12 401 D D12 403 D D12 401 E D12 403 E
D12 401 F D12 403 F D12 402 G
|
|
11 |
 |
1.31 |
1.47 |
149.8 |
0.45 |
0.07 |
9.1 |
80 |
11 |
5 |
11 |
45 |
4 |
0 |
0 |
D12 401 A D12 402 A D12 402 B D12 403 C D12 402 D
D12 402 E D12 402 F D12 401 G D12 403 G
|
 |
12 |
|
1.12 |
1.64 |
165.3 |
0.60 |
0.10 |
8.9 |
80 |
11 |
6 |
10 |
54 |
4 |
0 |
0 |
D12 401 A D12 402 A D12 402 B D12 403 C D12 402 D
D12 402 E D12 402 F D12 401 G D12 403 G
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Residue-type_colouring |
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|
Positive
|
Negative
|
Neutral
|
Aliphatic
|
Aromatic
|
Pro & Gly
|
Cysteine
|
|
H,K,R
|
D,E
|
S,T,N,Q
|
A,V,L,I,M
|
F,Y,W
|
P,G
|
C
|
|
|
|
MOLE 2.0 program