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PDBsum entry 8guj
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Pore analysis for: 8guj calculated with  MOLE 2.0
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PDB id
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8guj
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Pores calculated on whole structure |
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Pores calculated excluding ligands
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22 pores,
coloured by radius |
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22 pores,
coloured by radius
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22 pores,
coloured as in
list below
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Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
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Free R
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Length
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HPathy
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HPhob
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Polar
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Rel Mut
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Residue..type
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Ligands
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Radius |
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1 |
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4.06 |
4.06 |
32.4 |
-1.21 |
-0.74 |
11.7 |
90 |
|
3 |
1 |
3 |
1 |
0 |
0 |
0 |
|
DC 10 I DG 19 I DC 93 I DC 49 J DG 125 J DA 133 J
DC 134 J
|
 |
|
2 |
 |
3.17 |
3.17 |
32.7 |
-2.57 |
-0.43 |
28.9 |
81 |
7 |
1 |
1 |
0 |
1 |
0 |
0 |
DA 39 I DT 112 I DG 114 I DT 115 I DG 29 J DG 30
J DA 31 J DG 32 J DA 33 J DC 34 J DT 105 J DG 106
J
|
|
3 |
 |
2.02 |
2.42 |
66.1 |
-1.00 |
-0.75 |
10.5 |
86 |
3 |
0 |
1 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DG 3 I DG 4 I DA 5 I DG 6 I DA 7 I DA 8 I DT 9 I
DC 10 I DC 11 I DG 85 I DT 86 I DA 59 J DA 60 J D
A 133 J DC 134 J DC 135 J DA 146 J DG 147 J
|
|
4 |
 |
1.36 |
1.56 |
66.4 |
-1.46 |
-0.65 |
15.5 |
78 |
8 |
0 |
0 |
0 |
1 |
1 |
0 |
DA 69 I DC 70 I DA 139 I DC 140 I DA 141 I DT 142
I DC 143 I DC 144 I DT 145 I DT 147 I DT 9 J DA
10 J DT 11 J
|
|
5 |
 |
3.28 |
3.28 |
70.5 |
-1.27 |
-0.52 |
15.8 |
89 |
6 |
1 |
6 |
3 |
0 |
0 |
0 |
DA 39 I DA 49 I DC 51 I DA 52 I DC 53 I DA 19 J
DG 29 J DA 90 J DA 91 J DC 93 J DG 94 J DG 95 J
DT 105 J
|
|
6 |
 |
2.05 |
2.39 |
71.9 |
-1.17 |
-0.72 |
13.0 |
74 |
4 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
0 |
DG 3 I DG 4 I DA 5 I DG 6 I DA 7 I DA 8 I DT 9 I
DC 10 I DC 11 I DC 12 I DG 13 I DG 85 I DT 86 I D
A 59 J DA 60 J DG 131 J DA 133 J DC 134 J DC 135
J DA 146 J DG 147 J
|
|
7 |
 |
2.03 |
2.42 |
80.5 |
-1.19 |
-0.73 |
12.7 |
83 |
4 |
1 |
2 |
1 |
0 |
0 |
0 |
DG 3 I DG 4 I DA 5 I DG 6 I DA 7 I DA 8 I DT 9 I
DG 19 I DG 85 I DT 86 I DC 93 I DC 49 J DA 59 J D
A 60 J DG 125 J DC 134 J DC 135 J DA 146 J DG 147
J
|
|
8 |
 |
2.52 |
2.50 |
91.3 |
-2.20 |
-0.54 |
27.5 |
84 |
10 |
2 |
4 |
1 |
1 |
0 |
0 |
DG 19 I DA 103 I DT 104 I DT 42 J DA 43 J DA 44 J
DC 49 J DG 125 J DC 126 J
|
|
9 |
 |
2.94 |
3.01 |
93.8 |
-1.66 |
-0.68 |
20.7 |
84 |
8 |
3 |
4 |
1 |
0 |
0 |
0 |
DG 19 I DA 29 I DT 38 I DA 39 I DA 103 I DG 114 I
DT 115 I DG 29 J DG 38 J DG 39 J DC 49 J DT 105 J
DG 106 J DC 114 J DC 115 J DG 125 J
|
|
10 |
 |
2.91 |
3.00 |
94.6 |
-1.63 |
-0.63 |
18.0 |
86 |
8 |
3 |
6 |
2 |
1 |
0 |
0 |
DG 21 I DG 22 I DC 23 I DA 29 I DT 38 I DA 39 I
DG 114 I DT 115 I DG 29 J DG 38 J DG 39 J DT 105
J DC 114 J DC 115 J DG 124 J DG 125 J DG 130 J DG
131 J
|
|
11 |
 |
1.89 |
3.52 |
98.9 |
-1.80 |
-0.46 |
20.6 |
83 |
11 |
1 |
8 |
4 |
3 |
0 |
0 |
DA 49 I DC 51 I DA 52 I DC 53 I DA 19 J DA 90 J D
A 91 J DC 93 J DG 94 J DG 95 J
|
|
12 |
|
1.77 |
2.02 |
99.1 |
-1.59 |
-0.54 |
21.6 |
84 |
11 |
0 |
0 |
3 |
0 |
0 |
0 |
DG 3 I DG 4 I DA 5 I DG 6 I DA 69 I DC 70 I DG 71
I DC 72 I DG 73 I DC 74 I DT 75 I DT 145 I DG 68
J DG 69 J DG 70 J DA 71 J DC 72 J DG 74 J DC 145
J DA 146 J DG 147 J
|
|
13 |
|
2.45 |
2.45 |
101.3 |
-1.20 |
-0.62 |
12.7 |
82 |
9 |
1 |
5 |
2 |
1 |
0 |
0 |
DC 51 I DA 52 I DC 53 I DA 133 I DT 134 I DA 139
I DC 140 I DA 141 I DT 142 I DA 10 J DT 11 J DA
19 J DA 90 J DA 91 J DC 93 J DG 94 J DG 95 J
|
|
14 |
|
1.61 |
1.70 |
103.8 |
-1.04 |
-0.63 |
11.9 |
80 |
6 |
1 |
3 |
2 |
0 |
1 |
0 |
DC 51 I DA 52 I DC 53 I DA 59 I DA 60 I DG 67 I
DT 68 I DT 134 I DA 135 I DT 145 I DG 146 I DT
147 I DA 6 J DT 7 J DG 8 J DT 9 J DA 19 J DC 85 J
DA 90 J DA 91 J DC 93 J DG 94 J DG 95 J
|
|
15 |
|
1.63 |
1.69 |
111.9 |
-1.55 |
-0.45 |
18.4 |
86 |
10 |
1 |
8 |
4 |
4 |
0 |
0 |
DC 119 I DA 120 I DG 121 I DG 122 I DC 123 I DA
124 I DC 125 I DA 21 J DC 22 J DG 23 J DT 24 J DG
30 J DA 31 J
|
|
16 |
|
1.88 |
2.10 |
118.7 |
-1.79 |
-0.49 |
22.1 |
85 |
12 |
2 |
7 |
6 |
0 |
0 |
0 |
DA 69 I DC 70 I DG 71 I DC 72 I DG 73 I DC 74 I
DT 145 I DT 147 I DC 72 J DG 74 J
|
|
17 |
|
2.39 |
2.38 |
127.7 |
-1.56 |
-0.65 |
16.9 |
87 |
13 |
2 |
8 |
2 |
1 |
0 |
0 |
DA 39 I DA 49 I DA 133 I DT 134 I DA 139 I DC 140
I DA 141 I DT 142 I DA 10 J DT 11 J DA 19 J DG 29
J DC 93 J DG 94 J DT 105 J DG 106 J
|
|
18 |
|
3.03 |
3.12 |
129.1 |
-2.01 |
-0.66 |
25.5 |
78 |
12 |
4 |
1 |
0 |
1 |
0 |
0 |
DA 29 I DT 38 I DA 39 I DA 103 I DT 104 I DT 105
I DG 114 I DT 115 I DG 29 J DG 38 J DG 39 J DA 40
J DG 41 J DT 42 J DA 43 J DA 44 J DT 105 J DG 106
J DC 114 J DC 115 J
|
|
19 |
|
1.62 |
1.69 |
130.1 |
-1.38 |
-0.65 |
15.7 |
86 |
10 |
2 |
6 |
2 |
0 |
1 |
0 |
DA 39 I DA 49 I DA 59 I DA 60 I DG 67 I DT 68 I
DT 134 I DA 135 I DT 145 I DG 146 I DT 147 I DA 6
J DT 7 J DG 8 J DT 9 J DA 19 J DG 29 J DC 85 J DC
93 J DG 94 J DT 105 J DG 106 J
|
|
20 |
|
1.59 |
1.60 |
147.1 |
-1.00 |
-0.59 |
11.8 |
89 |
10 |
1 |
8 |
3 |
2 |
0 |
0 |
DA 49 I DC 119 I DA 120 I DG 121 I DG 122 I DC
123 I DC 125 I DA 133 I DT 134 I DA 139 I DC 140
I DA 141 I DT 142 I DA 10 J DT 11 J DA 19 J DC 20
J DA 21 J DC 22 J DG 23 J DT 24 J DG 30 J DA 31 J
DC 93 J DG 94 J
|
|
21 |
|
1.80 |
4.67 |
152.8 |
-2.13 |
-0.41 |
25.9 |
84 |
20 |
3 |
9 |
6 |
2 |
0 |
0 |
DG 19 I DA 69 I DC 70 I DG 71 I DC 72 I DG 73 I
DC 74 I DA 103 I DT 145 I DC 49 J DC 72 J DG 74 J
DG 125 J DC 126 J
|
 |
22 |
|
1.88 |
2.09 |
165.0 |
-1.40 |
-0.59 |
17.6 |
81 |
12 |
0 |
0 |
3 |
0 |
1 |
0 |
DA 7 I DA 8 I DT 9 I DC 10 I DC 11 I DC 12 I DG
13 I DA 69 I DC 70 I DG 71 I DC 72 I DG 73 I DC
74 I DT 75 I DG 85 I DT 86 I DT 145 I DA 59 J DA
60 J DG 66 J DG 67 J DG 68 J DG 69 J DG 70 J DA
71 J DC 72 J DG 74 J DG 131 J DA 133 J DC 134 J
DC 135 J DC 145 J DA 146 J
|
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Residue-type_colouring |
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Positive
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Negative
|
Neutral
|
Aliphatic
|
Aromatic
|
Pro & Gly
|
Cysteine
|
|
H,K,R
|
D,E
|
S,T,N,Q
|
A,V,L,I,M
|
F,Y,W
|
P,G
|
C
|
|
|
|
MOLE 2.0 program