PDBsum entry 7ld5 Go to PDB code:  Pore analysis for: 7ld5 calculated with MOLE 2.0 PDB id 7ld5 Pores calculated on whole structure Pores calculated excluding ligands View options MOLEonline 2.0 manipulation and visualization with HETATM: without HETATM:   17 pores, coloured by radius 28 pores, coloured by radius 28 pores, coloured as in list below Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. Pores Free R Length HPathy HPhob Polar Rel Mut Residue..type Ligands Radius 1 2.49 3.18 27.3 -1.74 -0.47 25.4 80 4 4 1 1 2 0 0  DA 3 E DA 4 E 2 3.59 5.61 29.4 -1.55 -0.52 21.7 85 3 5 3 2 2 0 0  DA 3 E DA 4 E 3 3.49 5.64 31.5 -1.43 -0.43 22.7 82 3 5 1 2 2 0 0  DA 4 D 4 2.56 2.86 36.3 -2.41 -0.74 31.4 82 2 6 0 1 0 0 0  DA 4 D 5 1.21 2.20 52.0 -0.62 -0.04 21.1 85 6 5 2 6 1 0 0   6 1.75 1.78 52.6 -0.96 -0.18 22.4 83 7 6 2 5 3 0 0  DA 3 F DA 4 F 7 1.22 2.14 59.0 -0.30 -0.10 15.7 85 5 5 3 7 3 0 0  DA 3 E DA 4 E 8 2.17 2.19 62.4 -2.22 -0.54 32.4 78 8 13 2 5 2 1 0  DA 3 D DA 4 D 9 1.10 1.72 82.8 -2.12 -0.59 31.2 81 8 15 5 6 2 1 0  DA 3 F DA 4 F 10 1.09 1.73 84.1 -2.10 -0.60 31.0 81 9 15 5 6 2 1 0  DA 3 E DA 4 E 11 1.78 1.79 85.9 -2.19 -0.47 30.9 78 10 15 3 6 3 1 0  DA 3 E DA 4 E 12 3.59 3.55 96.8 -2.37 -0.63 28.8 84 10 8 4 2 2 0 0  DA 1 D DA 1 E DA 2 E DA 3 E DA 4 E DA 1 F DA 2 F DA 3 F DA 4 F 13 3.64 3.63 98.6 -2.41 -0.62 29.3 84 11 8 5 2 2 0 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 1 E DA 2 E DA 3 E DA 4 E DA 1 F 14 1.96 2.17 101.6 -1.71 -0.46 24.2 85 10 10 6 7 1 2 0  DA 1 D DA 2 D DA 1 E DA 2 E DA 3 E DA 4 E DA 1 F 15 2.89 2.89 100.8 -2.36 -0.58 30.5 80 11 8 2 1 2 0 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 1 E DA 2 E DA 3 E DA 4 E DA 1 F 16 1.70 1.77 103.0 -1.95 -0.42 27.3 85 14 7 5 5 1 0 0  DA 1 D DA 1 E DA 2 E DA 3 E DA 4 E DA 1 F DA 2 F DA 3 F DA 4 F 17 2.64 2.91 103.8 -2.58 -0.73 31.7 82 10 8 2 1 0 0 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 1 E DA 2 E DA 3 E DA 4 E DA 1 F 18 2.56 2.56 104.3 -2.32 -0.65 25.0 88 10 5 8 2 1 0 0  DA 1 D DA 9 D DA 1 E DA 2 E DA 3 E DA 4 E DA 9 E DA 1 F DA 9 F 19 3.33 5.36 124.6 -1.90 -0.55 26.3 81 11 9 3 2 4 0 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 1 E DA 1 F DA 2 F DA 3 F DA 4 F 20 1.18 1.81 132.2 -1.95 -0.44 27.6 85 10 10 8 8 2 2 0  DA 1 D DA 2 D DA 9 D DA 9 E DA 9 F 21 1.76 1.74 130.8 -1.65 -0.42 25.5 83 14 8 4 5 3 0 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 1 E DA 1 F DA 2 F DA 3 F DA 4 F 22 2.38 2.38 131.0 -2.06 -0.59 24.8 83 11 6 6 2 4 0 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 9 D DA 1 E DA 9 E DA 1 F DA 9 F 23 1.65 1.78 136.5 -1.34 -0.42 22.2 83 11 7 2 6 4 0 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 1 E DA 1 F DA 2 F DA 3 F DA 4 F 24 1.74 1.75 142.9 -1.60 -0.48 21.5 88 11 4 6 6 2 0 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 9 D DA 1 E DA 9 E DA 1 F DA 9 F 25 1.29 1.81 150.9 -1.62 -0.49 24.7 85 11 13 7 8 3 2 0  DA 1 D DA 2 D DA 1 E DA 1 F DA 2 F DA 3 F DA 4 F 26 1.31 1.81 154.4 -2.02 -0.44 27.0 83 11 13 8 8 3 3 0  DA 1 D DA 2 D DA 9 D DA 9 E DA 9 F 27 1.26 1.81 175.7 -2.05 -0.61 24.1 83 11 11 9 3 5 1 0  DA 1 D DA 9 D DA 1 E DA 9 E DA 1 F DA 2 F DA 3 F DA 4 F DA 9 F 28 1.33 1.81 186.5 -1.79 -0.51 23.1 86 14 10 10 6 3 1 0  DA 1 D DA 2 D DA 3 D DA 4 D DA 9 D DA 1 E DA 9 E DA 1 F DA 9 F Residue-type_colouring Positive Negative Neutral Aliphatic Aromatic Pro & Gly Cysteine H,K,R D,E S,T,N,Q A,V,L,I,M F,Y,W P,G C Acknowledgement Pores were calculated by MOLE 2.0 program version 2.5.13.11.08 and visualized using Pymol 0.97rc.