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PDBsum entry 7e0h

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Top Page protein ligands Protein-protein interface(s) pores links
Pore analysis for: 7e0h calculated with MOLE 2.0 PDB id
7e0h
Pores calculated on whole structure Pores calculated excluding ligands

View options
MOLEonline 2.0 manipulation
and
visualization
with HETATM:
without HETATM:
 
0 pores, coloured by radius 15 pores, coloured by radius 15 pores, coloured as in
list below
Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown.
Pores
Free R
Length
HPathy
HPhob
Polar
Rel Mut
Residue..type
Ligands
Radius
1 2.13 2.13 26.7 -0.63 -0.05 2.7 62 0 0 1 4 4 0 1  CHL 601 X CLA 604 Z CHL 606 Z CHL 607 Z CHL 609 Z
CLA 610 Z LUT 1621 Z XAT 1622 Z NEX 1623 Z
2 4.80 6.29 27.7 0.55 0.31 1.8 59 0 0 2 3 7 0 1  CHL 601 X CLA 602 X CLA 613 X CLA 614 X LHG 2630
X CLA 603 Z CLA 604 Z CHL 606 Z CHL 607 Z CHL 609
Z LUT 1621 Z XAT 1622 Z NEX 1623 Z
3 2.03 2.13 28.7 -1.77 -0.21 27.5 71 4 3 1 2 4 1 0  CHL 601 X CLA 602 X CLA 613 X LHG 2630 X CLA 603
Z CHL 606 Z CHL 607 Z CHL 609 Z XAT 1622 Z
4 4.93 6.30 32.5 1.41 0.67 1.7 66 1 0 1 5 7 0 0  CLA 603 Y CLA 604 Y CHL 606 Y CHL 607 Y CHL 609 Y
LUT 1621 Y XAT 1622 Y NEX 1623 Y CHL 601 Z CLA
613 Z CLA 614 Z LHG 2630 Z
5 2.34 3.38 33.1 -0.43 0.14 19.7 77 3 3 2 6 3 0 0  CHL 601 X CLA 602 X CLA 613 X CLA 614 X LHG 2630
X CLA 603 Z CHL 607 Z CHL 609 Z XAT 1622 Z
6 4.25 5.81 34.3 3.33 1.30 0.3 67 0 0 0 5 7 0 0  CLA 603 Y CHL 606 Y CHL 607 Y CHL 609 Y XAT 1622
Y CHL 601 Z CHL 609 Z CLA 613 Z CLA 614 Z LHG
2630 Z
7 1.33 1.53 36.0 -0.47 -0.28 5.8 62 0 2 3 2 6 1 1  CLA 603 X CLA 604 X CHL 606 X CHL 607 X CHL 609 X
LUT 1621 X XAT 1622 X NEX 1623 X CHL 601 Y CLA
613 Y LHG 2630 Y
8 4.19 5.79 39.7 1.73 0.90 1.2 59 0 0 1 3 9 0 1  CLA 603 X CLA 604 X CHL 606 X CHL 607 X CHL 609 X
LUT 1621 X XAT 1622 X NEX 1623 X CHL 601 Y CHL
609 Y CLA 613 Y LHG 2630 Y
9 2.01 2.17 41.4 0.20 0.24 1.8 72 0 0 3 5 7 0 1  CLA 603 X CLA 604 X CHL 605 X CHL 606 X CHL 607 X
CHL 608 X CHL 609 X LUT 1621 X XAT 1622 X NEX
1623 X CHL 601 Y CLA 613 Y LHG 2630 Y
10 4.25 5.91 42.5 1.58 0.80 1.2 67 0 0 1 7 9 0 0  CLA 603 Y CLA 604 Y CHL 606 Y CHL 607 Y CHL 609 Y
LUT 1621 Y XAT 1622 Y NEX 1623 Y CHL 601 Z CHL
609 Z CLA 613 Z LHG 2630 Z
11 1.61 1.75 49.1 -0.15 0.34 17.2 67 4 3 1 6 8 1 0  CLA 602 X CLA 603 X CHL 607 X CHL 609 X LUT 1621
X CLA 602 Y CLA 603 Y CHL 607 Y CHL 609 Y LUT
1621 Y CLA 602 Z CLA 603 Z CHL 607 Z CHL 609 Z L
UT 1621 Z
12 4.97 6.42 55.2 3.16 1.24 0.6 69 1 0 1 8 10 0 0  CLA 602 X CLA 603 X CHL 606 X CHL 607 X CHL 609 X
LUT 1621 X XAT 1622 X CHL 601 Y CLA 602 Y CLA 603
Y CHL 606 Y CHL 607 Y CHL 609 Y CLA 613 Y CLA 614
Y XAT 1622 Y LHG 2630 Y CHL 601 Z CLA 602 Z CLA
603 Z CHL 607 Z CHL 609 Z CLA 613 Z CLA 614 Z LHG
2630 Z
13 1.62 1.75 56.0 -0.36 0.28 17.1 71 4 3 2 7 7 1 0  CLA 603 Y CHL 606 Y CHL 607 Y CHL 609 Y XAT 1622
Y CHL 601 Z CLA 602 Z CLA 603 Z CLA 613 Z CLA 614
Z LUT 1621 Z LHG 2630 Z
14 1.63 1.78 65.3 -0.16 0.29 16.6 68 3 3 3 7 10 1 0  CHL 601 X CLA 602 X CLA 603 X CHL 609 X CLA 613 X
CLA 614 X LUT 1621 X LHG 2630 X CLA 603 Y CLA 602
Z CLA 603 Z CHL 606 Z CHL 607 Z CHL 609 Z LUT
1621 Z XAT 1622 Z
15 1.19 1.44 118.7 0.07 0.36 11.5 67 6 3 1 13 11 3 0  CLA 602 X CLA 603 X CHL 607 X CHL 608 X CHL 609 X
CLA 610 X LUT 1620 X CHL 601 Y CLA 602 Y CLA 603
Y CLA 604 Y CHL 606 Y CHL 607 Y CHL 608 Y CHL 609
Y CLA 610 Y LUT 1621 Y XAT 1622 Y NEX 1623 Y CHL
601 Z CLA 602 Z CLA 603 Z CHL 609 Z CLA 613 Z LUT
1621 Z LHG 2630 Z

Residue-type_colouring
Positive Negative Neutral Aliphatic Aromatic Pro & Gly Cysteine
H,K,R D,E S,T,N,Q A,V,L,I,M F,Y,W P,G C

Acknowledgement
Pores were calculated by MOLE 2.0 program version 2.5.13.11.08 and visualized using Pymol 0.97rc.
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