 |
PDBsum entry 3a0h
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
 |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Pore analysis for: 3a0h calculated with  MOLE 2.0
|
PDB id
|
|
|
|
3a0h
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Pores calculated on whole structure |
|
Pores calculated excluding ligands
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
 |
|
|
|
|
|
21 pores,
coloured by radius |
|
30 pores,
coloured by radius
|
30 pores,
coloured as in
list below
|
|
|
|
|
|
Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. |
|
|
|
|
|
|
|
Free R
|
|
|
|
|
|
|
Length
|
|
|
|
|
|
|
HPathy
|
|
|
|
|
|
|
HPhob
|
|
|
|
|
|
|
Polar
|
|
|
|
|
|
|
Rel Mut
|
|
|
|
|
|
|
Residue..type
|
|
|
|
|
|
|
Ligands
|
|
|
|
|
|
|
 |
Radius |
 |
1 |
 |
1.25 |
1.36 |
44.8 |
-0.45 |
-0.07 |
15.8 |
78 |
|
4 |
2 |
3 |
8 |
2 |
0 |
0 |
|
|
 |
|
2 |
 |
2.63 |
2.64 |
59.1 |
1.11 |
0.63 |
7.1 |
66 |
3 |
1 |
3 |
10 |
8 |
0 |
0 |
CLA 1010 B CLA 1016 B DGD 1058 B CLA 1008 D CLA
1017 H
|
|
3 |
 |
2.32 |
2.91 |
61.3 |
1.83 |
0.96 |
2.2 |
69 |
2 |
0 |
2 |
11 |
10 |
1 |
0 |
CLA 1006 A PQ9 1043 A CLA 1028 C CLA 1032 C DGD
1056 C DGD 1057 C CLA 1004 D BCR 1050 D MGE 1059
D CLA 1034 K
|
|
4 |
 |
2.33 |
2.88 |
67.9 |
1.52 |
0.78 |
5.4 |
67 |
4 |
0 |
2 |
13 |
10 |
1 |
0 |
CLA 1006 A PQ9 1043 A LHG 1063 A CLA 1030 C CLA
1031 C CLA 1032 C CLA 1033 C CLA 1035 C CLA 1036
C DGD 1057 C CLA 1004 D BCR 1050 D MGE 1059 D CLA
1034 K BCR 1051 K
|
|
5 |
 |
3.57 |
4.03 |
74.3 |
0.64 |
0.74 |
9.2 |
76 |
8 |
0 |
5 |
12 |
8 |
3 |
0 |
CLA 6025 c CLA 6026 c CLA 6028 c CLA 6029 c CLA
6030 c CLA 6031 c CLA 6033 c CLA 6036 c BCR 6054
c DGD 6056 c DGD 6057 c CLA 6034 k
|
|
6 |
 |
2.16 |
3.67 |
76.0 |
1.55 |
0.94 |
7.1 |
75 |
6 |
1 |
2 |
16 |
14 |
0 |
0 |
CLA 1006 A PQ9 1043 A LHG 1063 A CLA 1028 C CLA
1032 C DGD 1056 C DGD 1057 C BCR 1050 D MGE 1059
D HEM 1040 F CLA 1034 K BCR 1051 K
|
|
7 |
 |
3.42 |
3.55 |
77.0 |
0.39 |
0.53 |
9.8 |
70 |
5 |
4 |
4 |
14 |
8 |
3 |
1 |
CLA 1015 B CLA 1019 B CLA 1021 B CLA 1022 B BCR
1045 B BCR 1047 B MGE 1061 L BCR 1046 t IOD 6066 t
|
|
8 |
 |
2.38 |
4.57 |
87.4 |
0.47 |
0.41 |
13.5 |
73 |
5 |
7 |
1 |
17 |
10 |
3 |
0 |
CLA 6007 a BCR 6044 a CLA 6025 c CLA 6029 c CLA
6030 c CLA 6031 c BCR 6054 c DGD 6055 c
|
|
9 |
 |
1.42 |
1.70 |
104.2 |
1.69 |
0.88 |
2.9 |
68 |
2 |
0 |
3 |
17 |
18 |
3 |
0 |
CLA 6006 a PQ9 6043 a LHG 6063 a CLA 6028 c CLA
6032 c DGD 6056 c DGD 6057 c CLA 6004 d BCR 6050
d MGE 6059 d CLA 6034 k BCR 6051 k UNK 5004 n UNK
5008 n
|
|
10 |
 |
2.49 |
3.48 |
104.2 |
0.52 |
0.59 |
9.7 |
71 |
6 |
4 |
2 |
14 |
11 |
6 |
0 |
CLA 1024 B BCR 1048 B CLA 6007 a BCR 6044 a CLA
6025 c CLA 6029 c CLA 6030 c CLA 6031 c BCR 6054
c DGD 6055 c BCR 1046 t
|
|
11 |
 |
2.37 |
4.59 |
105.1 |
0.25 |
0.20 |
8.6 |
75 |
3 |
6 |
5 |
21 |
10 |
1 |
0 |
CLA 1007 A BCR 1044 A CLA 1025 C CLA 1029 C CLA
1030 C CLA 1031 C BCR 1054 C DGD 1055 C
|
|
12 |
|
1.43 |
1.72 |
112.0 |
1.46 |
0.76 |
4.3 |
67 |
6 |
0 |
3 |
17 |
19 |
3 |
0 |
CLA 6006 a PQ9 6043 a LHG 6063 a CLA 6025 c CLA
6029 c CLA 6030 c CLA 6031 c CLA 6032 c CLA 6033
c CLA 6035 c CLA 6036 c BCR 6054 c DGD 6056 c DGD
6057 c CLA 6004 d BCR 6050 d MGE 6059 d CLA 6034
k BCR 6051 k UNK 5004 n UNK 5008 n
|
|
13 |
|
3.65 |
4.88 |
112.0 |
1.13 |
0.72 |
11.9 |
71 |
10 |
1 |
1 |
24 |
14 |
2 |
1 |
CLA 1010 B CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA
1014 B CLA 1015 B CLA 1016 B CLA 1018 B CLA 1019
B CLA 1020 B CLA 1021 B CLA 1022 B BCR 1045 B BCR
1047 B MGE 1060 B CLA 1008 D CLA 1017 H BCR 1049
H MGE 1061 L
|
|
14 |
|
3.00 |
3.23 |
121.5 |
1.11 |
0.54 |
7.6 |
71 |
7 |
4 |
3 |
27 |
13 |
1 |
1 |
CLA 1010 B CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA
1014 B CLA 1015 B CLA 1016 B CLA 1018 B CLA 1019
B CLA 1020 B CLA 1021 B CLA 1022 B BCR 1045 B BCR
1047 B CLA 1008 D CLA 1017 H BCR 1049 H MGE 1061
L BCR 1046 t
|
|
15 |
|
2.63 |
2.64 |
132.8 |
0.80 |
0.60 |
11.7 |
73 |
11 |
2 |
4 |
24 |
16 |
2 |
1 |
CLA 1010 B CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA
1014 B CLA 1015 B CLA 1016 B CLA 1018 B CLA 1019
B CLA 1020 B CLA 1021 B CLA 1022 B BCR 1045 B BCR
1047 B DGD 1058 B MGE 1060 B CLA 1017 H BCR 1049
H MGE 1061 L
|
|
16 |
|
1.32 |
2.15 |
146.3 |
-1.41 |
-0.31 |
19.9 |
82 |
12 |
9 |
11 |
12 |
5 |
2 |
0 |
HEM 1041 V
|
|
17 |
|
2.55 |
3.32 |
154.6 |
1.68 |
0.81 |
6.8 |
71 |
8 |
0 |
0 |
29 |
17 |
3 |
1 |
CLA 1010 B CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA
1014 B CLA 1016 B CLA 1018 B CLA 1020 B CLA 1024
B BCR 1048 B CLA 1008 D CLA 1017 H BCR 1049 H CLA
6007 a BCR 6044 a CLA 6025 c CLA 6029 c CLA 6030
c CLA 6031 c BCR 6054 c DGD 6055 c
|
|
18 |
|
1.09 |
0.94 |
162.3 |
-1.47 |
-0.34 |
17.8 |
79 |
14 |
11 |
15 |
16 |
5 |
13 |
2 |
HEM 6041 v
|
|
19 |
|
1.24 |
1.35 |
165.2 |
-1.21 |
-0.25 |
17.9 |
79 |
17 |
9 |
19 |
24 |
8 |
8 |
0 |
HEM 6041 v
|
|
20 |
|
1.21 |
1.22 |
168.8 |
0.89 |
0.50 |
7.7 |
72 |
8 |
4 |
8 |
34 |
14 |
6 |
1 |
BCR 6046 T CLA 6010 b CLA 6011 b CLA 6012 b CLA
6013 b CLA 6014 b CLA 6015 b CLA 6016 b CLA 6018
b CLA 6019 b CLA 6020 b CLA 6021 b CLA 6022 b BCR
6045 b BCR 6047 b CLA 6008 d CLA 6017 h BCR 6049
h MGE 6061 l
|
|
21 |
|
1.32 |
1.54 |
176.0 |
-1.46 |
-0.49 |
17.1 |
82 |
11 |
13 |
21 |
14 |
4 |
10 |
0 |
HEM 6041 v
|
|
22 |
|
2.49 |
2.65 |
178.3 |
1.13 |
0.53 |
6.8 |
75 |
9 |
1 |
6 |
25 |
18 |
3 |
1 |
CLA 1010 B CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA
1014 B CLA 1016 B CLA 1018 B CLA 1020 B CLA 1024
B BCR 1048 B DGD 1058 B CLA 1017 H BCR 1049 H CLA
6007 a BCR 6044 a CLA 6025 c CLA 6029 c CLA 6030
c CLA 6031 c BCR 6054 c DGD 6055 c
|
|
23 |
|
2.04 |
3.44 |
181.2 |
1.51 |
0.77 |
5.9 |
72 |
7 |
4 |
4 |
40 |
23 |
2 |
0 |
CLA 1003 A CLA 1006 A PHO 1038 A PQ9 1043 A CLA
1012 B CLA 1015 B CLA 1019 B CLA 1021 B CLA 1022
B BCR 1045 B BCR 1047 B MGE 1060 B DGD 1057 C CLA
1004 D CLA 1005 D PHO 1039 D PQ9 1042 D BCR 1050
D MGE 1059 D MGE 1062 D HEM 1040 F MGE 1061 L BCR
1046 t
|
|
24 |
|
3.16 |
5.39 |
185.3 |
1.31 |
0.80 |
7.0 |
73 |
8 |
4 |
7 |
38 |
26 |
6 |
0 |
CLA 1024 B BCR 1048 B CLA 6003 a CLA 6006 a PHO
6038 a PQ9 6043 a BCR 6044 a CLA 6028 c CLA 6032
c DGD 6056 c DGD 6057 c CLA 6004 d CLA 6005 d PHO
6039 d PQ9 6042 d BCR 6050 d MGE 6059 d MGE 6062
d CLA 6034 k BCR 6051 k MGE 6061 l BCR 1046 t
|
|
25 |
|
1.70 |
1.74 |
220.8 |
2.02 |
0.86 |
4.5 |
70 |
8 |
0 |
1 |
51 |
28 |
3 |
1 |
CLA 1010 B CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA
1014 B CLA 1016 B CLA 1018 B CLA 1020 B CLA 1021
B CLA 1023 B CLA 1024 B BCR 1048 B CLA 1008 D CLA
1017 H BCR 1049 H CLA 6003 a CLA 6006 a PHO 6038
a PQ9 6043 a BCR 6044 a DGD 6057 c CLA 6004 d CLA
6005 d PHO 6039 d PQ9 6042 d BCR 6050 d MGE 6059
d MGE 6062 d MGE 6061 l UNK 5004 n UNK 5008 n BCR
1046 t
|
|
26 |
|
1.33 |
1.33 |
236.8 |
1.93 |
0.84 |
5.5 |
72 |
10 |
0 |
5 |
52 |
23 |
5 |
1 |
CLA 1003 A CLA 1006 A PHO 1038 A PQ9 1043 A BCR
1044 A DGD 1057 C CLA 1004 D CLA 1005 D PHO 1039
D PQ9 1042 D BCR 1050 D MGE 1059 D MGE 1062 D MGE
1061 L BCR 6046 T BCR 6048 T CLA 6010 b CLA 6011
b CLA 6012 b CLA 6013 b CLA 6014 b CLA 6016 b CLA
6018 b CLA 6020 b CLA 6021 b CLA 6023 b CLA 6024
b CLA 6008 d CLA 6017 h BCR 6049 h
|
|
27 |
|
2.59 |
2.65 |
241.1 |
1.74 |
0.82 |
5.3 |
73 |
11 |
1 |
6 |
53 |
32 |
3 |
1 |
CLA 1010 B CLA 1011 B CLA 1012 B CLA 1013 B CLA
1014 B CLA 1016 B CLA 1018 B CLA 1020 B CLA 1021
B CLA 1023 B CLA 1024 B BCR 1048 B DGD 1058 B CLA
1017 H BCR 1049 H CLA 6003 a CLA 6006 a PHO 6038
a PQ9 6043 a BCR 6044 a CLA 6028 c CLA 6032 c DGD
6056 c DGD 6057 c CLA 6004 d CLA 6005 d PHO 6039
d PQ9 6042 d BCR 6050 d MGE 6059 d MGE 6062 d CLA
6034 k BCR 6051 k MGE 6061 l BCR 1046 t
|
|
28 |
|
2.42 |
4.41 |
242.9 |
2.09 |
0.98 |
3.9 |
71 |
8 |
1 |
6 |
60 |
35 |
6 |
1 |
CLA 1007 A BCR 1044 A CLA 1025 C CLA 1029 C CLA
1030 C CLA 1031 C BCR 1054 C DGD 1055 C IOD 1066
T BCR 6046 T CLA 6003 a CLA 6006 a PHO 6038 a PQ9
6043 a CLA 6012 b CLA 6015 b CLA 6019 b CLA 6021
b CLA 6022 b BCR 6045 b BCR 6047 b MGE 6060 b CLA
6028 c CLA 6032 c DGD 6056 c DGD 6057 c CLA 6004
d CLA 6005 d PHO 6039 d PQ9 6042 d BCR 6050 d MGE
6059 d MGE 6062 d CLA 6034 k BCR 6051 k MGE 6061 l
|
|
29 |
|
1.31 |
1.26 |
259.8 |
-0.54 |
-0.07 |
13.2 |
79 |
19 |
9 |
33 |
27 |
16 |
11 |
0 |
CLA 6010 b CLA 6016 b DGD 6058 b CLA 6008 d CLA
6017 h HEM 6041 v
|
 |
30 |
|
1.18 |
1.23 |
321.7 |
1.73 |
0.77 |
4.9 |
72 |
11 |
5 |
8 |
79 |
44 |
8 |
1 |
CLA 1007 A BCR 1044 A CLA 1025 C CLA 1029 C CLA
1030 C CLA 1031 C BCR 1054 C DGD 1055 C IOD 1066
T BCR 6046 T CLA 6003 a CLA 6006 a PHO 6038 a PQ9
6043 a LHG 6063 a CLA 6012 b CLA 6015 b CLA 6019
b CLA 6021 b CLA 6022 b BCR 6045 b BCR 6047 b MGE
6060 b CLA 6032 c CLA 6033 c CLA 6035 c DGD 6057
c CLA 6004 d CLA 6005 d PHO 6039 d PQ9 6042 d BCR
6050 d MGE 6059 d MGE 6062 d CLA 6034 k BCR 6051
k BCR 6052 k MGE 6061 l
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
 |
|
|
 |
Residue-type_colouring |
 |
|
|
|
Positive
|
Negative
|
Neutral
|
Aliphatic
|
Aromatic
|
Pro & Gly
|
Cysteine
|
|
H,K,R
|
D,E
|
S,T,N,Q
|
A,V,L,I,M
|
F,Y,W
|
P,G
|
C
|
|
|
|
MOLE 2.0 program