PDBsum entry 2y0x

Pore analysis for: 2y0x calculated with

MOLE 2.0

PDB id

2y0x

Pores calculated on whole structure

Pores calculated excluding ligands

View options

MOLEonline 2.0 manipulation
and
visualization
with HETATM:

without HETATM:

30 pores, coloured by radius

30 pores, coloured as in
list below

Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown.

Pores

Free R

Length

HPathy

HPhob

Polar

Rel Mut

Residue..type

Ligands

Radius

1.86

70.9

-0.43

-0.80

3.7

C 47 A G 48 A A 53 A C 69 A C 76 A C 77 A A 78 A
G 79 A G 80 A G 81 A G 82 A G 102 A A 103 A U 104
A C 105 A C 106 A C 107 A U 108 A G 109 A G 110 A
A 111 A G 113 A G 175 A C 285 A C 286 A C 287 A C
288 A G 348 A G 349 A U 350 A G 351 A

2.78

86.8

-0.40

-0.80

3.4

G 701 A G 702 A G 1442 A G 1443 A G 1444 A C 1445
A i:A A 1445 A C 1446 A G 1447 A G 1448 A C 1450
A i:A G 1459 A G 1461 A C 1462 A C 1463 A C 1464
A C 1551 A G 1552 A U 1629 A G 1630 A A 1631 A i:
A A 1632 A G 1633 A C 1683 A C 1684 A C 1685 A C
1686 A G 1705 A U 1706 A G 1707 A C 1744 A C 1745
A C 1745 A i:A G 1746 A G 1747 A G 1747 A i:A C
2699 A C 2704 A

2.60

87.6

-0.98

-0.77

10.7

U 597 A G 598 A G 599 A G 600 A C 601 A C 654 A i:
Q C 654 A i:R G 654 A i:S C 654 A i:T A 841 A G
842 A C 844 A G 845 A C 846 A G 928 A U 930 A G
931 A A 933 A U 1167 A G 1168 A G 1169 A C 1181 A
A 1182 A G 1193 A A 1194 A

2.60

97.8

-0.39

-0.75

4.5

A 1276 A G 1277 A A 1278 A G 1279 A G 1280 A G
1281 A U 1282 A G 1283 A A 1286 A A 1287 A U 1288
A C 1289 A C 1290 A C 1291 A U 1292 A C 1293 A U
1294 A G 1442 A G 1443 A G 1444 A A 1445 A C 1445
A i:A C 1446 A G 1447 A G 1448 A G 1459 A G 1461
A C 1462 A C 1463 A C 1464 A G 1465 A G 1529 A G
1627 A G 1628 A C 1640 A A 1641 A G 1642 A G 1643
A C 1644 A G 1645 A C 2700 A C 2701 A

2.89

97.8

-0.42

-0.80

3.6

G 48 A U 50 A G 51 A A 53 A C 69 A C 76 A C 77 A
A 78 A G 79 A G 80 A G 81 A G 82 A G 102 A A 103
A U 104 A C 105 A C 106 A C 107 A U 108 A G 109 A
G 110 A A 111 A U 112 A G 113 A U 114 A C 115 A G
121 A G 131 A G 132 A C 142 A i:A A 142 A C 143 A
i:A G 143 A C 144 A G 145 A G 146 A U 147 A C
1350 A C 1407 A C 1408 A

2.78

102.9

-0.40

-0.80

3.4

C 1304 A G 1346 A C 1350 A G 1382 A C 1383 A A
1384 A C 1386 A C 1387 A G 1388 A U 1396 A U 1406
A C 1407 A C 1408 A U 1420 A A 1439 A G 1440 A G
1441 A G 1442 A G 1443 A G 1444 A C 1445 A i:A A
1445 A C 1446 A G 1447 A G 1448 A C 1450 A i:A G
1459 A G 1461 A C 1462 A C 1463 A C 1464 A G 1465
A G 1466 A C 1513 A U 1514 A G 1515 A G 1555 A C
1556 A C 1557 A G 1559 A G 1573 A C 1574 A G 1624
A C 1625 A A 1641 A

1.91

103.3

-0.40

-0.80

3.4

C 47 A G 48 A U 50 A G 51 A G 110 A A 111 A U 112
A G 113 A U 114 A C 115 A G 121 A G 131 A G 132 A
C 142 A i:A A 142 A G 143 A C 143 A i:A C 144 A G
145 A G 146 A U 147 A G 175 A C 285 A C 286 A C
287 A C 288 A G 348 A G 349 A U 350 A G 351 A C
1350 A C 1407 A C 1408 A U 1420 A

3.19

116.6

-0.40

-0.80

3.4

G 696 A C 697 A C 698 A A 699 A G 700 A G 701 A G
702 A U 762 A C 1350 A G 1381 A G 1382 A C 1383 A
A 1384 A U 1406 A C 1407 A C 1408 A U 1420 A G
1429 A C 1430 A U 1431 A C 1432 A U 1433 A C 1513
A U 1514 A G 1552 A A 1553 A A 1554 A G 1555 A C
1556 A C 1557 A G 1559 A G 1573 A C 1574 A A 1631
A i:A A 1632 A G 1633 A C 1683 A C 1684 A C 1685
A C 1686 A G 1705 A U 1706 A G 1707 A C 1745 A i:
A C 1745 A G 1746 A G 1747 A i:A G 1747 A

1.55

117.0

-0.60

-0.68

7.6

U 597 A G 598 A G 599 A G 600 A C 654 A i:T C 654
A i:P G 654 A i:H G 654 A i:O G 654 A i:S C 654 A
i:R G 654 A i:E C 654 A i:F C 654 A i:Q C 654 A i:
G A 654 A i:J C 654 A i:I A 841 A G 842 A G 843 A
C 844 A G 845 A C 846 A G 928 A U 930 A G 931 A A
933 A U 1167 A G 1168 A G 1169 A C 1181 A A 1182
A G 1193 A A 1194 A

1.92

2.03

135.9

-1.02

-0.66

12.7

G 596 A U 597 A G 598 A G 599 A G 600 A C 601 A C
654 A i:Q C 654 A i:R G 654 A i:S C 654 A i:T A
654 A i:U A 654 A i:V A 654 A G 842 A G 843 A C
936 A U 937 A G 2345 A G 2351 A A 2352 A G 2354 A
C 2356 A G 2362 A C 2363 A C 2364 A G 2365 A A
2366 A G 2367 A C 2368 A A 2369 A G 2371 A G 2372
A A 2378 A G 2379 A C 2380 A C 2381 A G 2382 A G
2383 A

2.60

136.0

-0.42

-0.77

4.3

A 1276 A G 1277 A A 1278 A G 1279 A G 1280 A G
1281 A U 1282 A G 1283 A A 1286 A A 1287 A U 1288
A C 1289 A C 1290 A C 1291 A U 1292 A C 1293 A U
1294 A G 1443 A C 1463 A C 1464 A G 1529 A G 1627
A G 1628 A G 1630 A C 1631 A A 1631 A i:A C 1640
A A 1641 A G 1642 A G 1643 A C 1644 A G 1645 A C
1683 A C 1684 A C 1685 A C 1686 A G 1705 A U 1706
A G 1707 A C 1708 A U 1709 A G 1746 A G 1747 A G
1747 A i:A G 2697 A U 2698 A C 2699 A C 2700 A C
2701 A C 2704 A

2.63

144.7

-0.41

-0.77

4.3

A 1276 A G 1277 A A 1278 A G 1279 A G 1280 A G
1281 A U 1282 A G 1283 A A 1286 A A 1287 A U 1288
A C 1289 A C 1290 A C 1291 A U 1292 A C 1293 A C
1304 A G 1346 A C 1350 A G 1382 A C 1383 A A 1384
A C 1386 A C 1387 A G 1388 A G 1389 A U 1396 A U
1406 A C 1407 A C 1408 A U 1420 A A 1439 A G 1440
A C 1513 A U 1514 A G 1515 A G 1527 A A 1528 A i:
A A 1528 A G 1529 A G 1537 A G 1538 A G 1555 A C
1556 A C 1557 A G 1559 A G 1573 A C 1574 A G 1624
A C 1625 A A 1641 A G 1642 A G 1643 A C 1644 A G
1645 A

2.46

155.0

-0.55

-0.74

6.2

C 34 A G 35 A U 67 A G 68 A C 69 A G 75 A C 76 A
C 77 A A 78 A G 79 A G 80 A G 81 A G 82 A G 102 A
A 103 A U 104 A C 105 A C 106 A C 107 A U 108 A G
325 A G 326 A G 437 A G 438 A G 440 A U 441 A G
442 A C 444 A G 446 A A 841 A G 842 A C 844 A G
845 A C 846 A G 928 A U 930 A G 931 A A 933 A U
1167 A G 1168 A G 1169 A C 1181 A A 1182 A G 1193
A A 1194 A G 1195 A C 1196 A G 1197 A U 1198 A U
1199 A C 1200 A C 1201 A C 1202 A G 1203 A A 1204
A U 1240 A A 1241 A A 1242 A G 1243 A G 1244 A G
1245 A

2.00

163.4

-1.16

-0.68

13.3

G 596 A U 597 A G 598 A G 599 A G 600 A C 601 A C
654 A i:Q C 654 A i:R G 654 A i:S C 654 A i:T A
654 A i:U A 654 A i:V A 654 A G 842 A G 843 A U
868 A G 869 A C 936 A U 937 A A 2278 A G 2279 A A
2322 A C 2324 A C 2326 A A 2327 A A 2328 A G 2329
A A 2352 A G 2354 A C 2356 A G 2362 A C 2363 A C
2364 A G 2384 A C 2385 A C 2386 A U 2387 A G 2389
A U 2390 A

1.85

181.1

-0.52

-0.75

5.8

C 34 A G 35 A C 47 A G 48 A A 53 A U 67 A G 68 A
C 69 A C 106 A C 107 A U 108 A G 109 A G 175 A C
285 A C 286 A C 287 A C 288 A G 325 A G 326 A A
347 A G 348 A G 349 A U 350 A G 351 A C 436 A G
437 A G 438 A G 440 A U 441 A G 442 A C 444 A G
446 A A 841 A G 842 A C 844 A G 845 A C 846 A G
928 A U 930 A G 931 A A 933 A U 1167 A G 1168 A G
1169 A C 1181 A A 1182 A G 1193 A A 1194 A G 1195
A C 1196 A G 1197 A U 1198 A U 1199 A C 1200 A C
1201 A C 1202 A G 1203 A A 1204 A U 1240 A A 1241
A A 1242 A G 1243 A G 1244 A G 1245 A

1.92

188.5

-0.73

-0.81

7.7

C 39 A C 40 A C 47 A G 48 A A 53 A G 54 A G 68 A
C 69 A U 108 A G 109 A G 175 A A 181 A A 182 A C
183 A A 207 A C 238 A U 239 A C 285 A C 286 A C
287 A C 288 A A 347 A G 348 A G 349 A U 350 A G
351 A C 433 A C 435 A C 436 A G 452 A G 458 A A
590 A C 591 A G 592 A G 593 A U 594 A C 595 A G
596 A U 597 A G 598 A G 599 A G 600 A C 601 A A
608 A A 609 A A 654 A i:U C 654 A i:T G 654 A i:S
C 654 A i:R C 654 A i:Q G 656 A U 657 A C 658 A C
659 A G 660 A G 668 A G 799 A

2.20

211.5

-0.90

-0.50

12.2

C 34 A G 35 A U 67 A G 68 A C 69 A G 75 A C 76 A
C 77 A A 78 A G 79 A G 80 A G 81 A G 82 A G 88 A
G 89 A U 90 A G 102 A A 103 A U 104 A C 105 A C
106 A C 107 A U 108 A G 437 A C 455 A C 456 A A
460 A C 461 A A 470 A A 471 A A 472 A G 473 A G
474 A U 475 A G 489 A G 491 A A 492 A G 493 A G
508 A G 1260 A G 1280 A G 1283 A G 1285 A A 1321
A A 1322 A U 1323 A G 1328 A C 1333 A G 1334 A A
1614 A A 1616 A

1.56

222.0

-0.56

-0.75

6.4

C 39 A C 40 A A 53 A G 54 A G 68 A C 69 A C 76 A
C 77 A A 78 A G 79 A G 80 A G 81 A G 82 A G 102 A
A 103 A U 104 A C 105 A C 106 A C 107 A U 108 A G
109 A G 110 A A 111 A A 181 A A 182 A C 183 A A
207 A C 238 A U 239 A C 433 A C 435 A C 436 A G
452 A G 458 A A 590 A C 591 A G 592 A G 593 A U
594 A C 595 A G 596 A U 597 A G 598 A G 599 A G
600 A A 608 A A 609 A G 654 A i:H C 654 A i:P C
654 A i:G G 654 A i:O G 654 A i:N A 654 A i:J A
654 A i:U C 654 A i:T G 654 A i:S C 654 A i:R G
654 A i:E C 654 A i:F C 654 A i:Q C 654 A i:I G
656 A U 657 A C 658 A C 659 A G 660 A G 668 A G
799 A

2.66

222.4

-0.72

-0.76

8.3

C 40 A A 119 A G 122 A G 123 A G 131 A G 132 A A
149 A C 150 A C 151 A G 152 A C 153 A U 185 A G
186 A G 187 A U 206 A G 219 A G 220 A U 235 A C
236 A C 237 A C 238 A U 239 A G 254 A A 255 A G
382 A U 383 A C 393 A A 394 A U 395 A G 424 A G
425 A C 433 A A 590 A C 591 A G 592 A G 593 A U
594 A C 595 A G 596 A U 597 A G 598 A G 599 A G
600 A C 601 A A 608 A A 609 A A 654 A i:U C 654 A
i:T G 654 A i:S C 654 A i:R C 654 A i:Q G 656 A U
657 A C 658 A C 659 A G 660 A C 1350 A C 1351 A G
1358 A A 1359 A G 1364 A A 1367 A G 1368 A G 1374
A C 1375 A C 1408 A U 1420 A

1.49

1.61

241.2

-1.14

-0.60

14.3

G 596 A U 597 A G 598 A G 599 A G 600 A C 601 A C
654 A i:Q C 654 A i:R G 654 A i:S C 654 A i:T A
654 A i:U A 654 A i:V A 654 A G 842 A G 843 A C
936 A U 937 A A 2288 A C 2295 A U 2296 A C 2313 A
C 2314 A G 2315 A C 2316 A C 2324 A G 2325 A C
2326 A G 2337 A G 2338 A G 2339 A A 2352 A G 2354
A C 2356 A G 2362 A C 2363 A C 2364 A G 2384 A C
2385 A C 2386 A U 2387 A G 2389 A U 2390 A C 30 B
C 31 B C 32 B G 33 B U 34 B U 35 B U 41 B C 43 B
G 44 B A 45 B A 46 B A 58 B A 59 B

1.91

2.02

243.6

-0.78

-0.74

8.7

C 39 A C 40 A C 47 A G 48 A A 53 A G 54 A G 68 A
C 69 A U 108 A G 109 A A 181 A A 182 A C 183 A A
207 A C 238 A U 239 A C 285 A C 286 A C 287 A C
288 A A 347 A G 348 A G 349 A U 350 A G 351 A C
433 A C 435 A C 436 A G 452 A G 458 A A 590 A C
591 A G 592 A G 593 A U 594 A C 595 A G 596 A U
597 A A 608 A A 609 A A 654 A i:V A 654 A G 656 A
U 657 A C 658 A C 659 A G 660 A G 668 A G 799 A C
936 A U 937 A G 2345 A G 2351 A A 2352 A G 2354 A
C 2356 A G 2362 A C 2363 A C 2364 A G 2365 A A
2366 A G 2367 A C 2368 A A 2369 A G 2371 A G 2372
A A 2378 A G 2379 A C 2380 A C 2381 A G 2382 A G
2383 A

1.93

256.0

-0.91

-0.74

9.8

C 39 A C 40 A A 53 A G 54 A G 68 A C 69 A C 76 A
C 77 A A 78 A G 79 A G 80 A G 81 A G 82 A G 102 A
A 103 A U 104 A C 105 A C 106 A C 107 A U 108 A G
109 A G 110 A A 111 A A 181 A A 182 A C 183 A A
207 A C 238 A U 239 A C 433 A C 435 A C 436 A G
452 A G 458 A A 590 A C 591 A G 592 A G 593 A U
594 A C 595 A G 596 A U 597 A A 608 A A 609 A A
654 A i:V A 654 A G 656 A U 657 A C 658 A C 659 A
G 660 A G 668 A G 799 A U 868 A G 869 A C 936 A U
937 A A 2278 A G 2279 A A 2322 A C 2324 A C 2326
A A 2327 A A 2328 A G 2329 A A 2352 A G 2354 A C
2356 A G 2362 A C 2363 A C 2364 A G 2384 A C 2385
A C 2386 A U 2387 A G 2389 A U 2390 A

2.00

1.99

268.2

-0.82

-0.69

9.1

A 821 A U 822 A G 836 A C 837 A U 847 A G 848 A A
849 A C 850 A U 922 A C 923 A C 924 A C 925 A C
935 A G 947 A G 948 A C 949 A G 950 A C 951 A A
960 A C 961 A U 963 A C 964 A C 965 A G 966 A C
967 A G 968 A U 969 A G 1022 A U 1023 A U 1026 A
A 1127 A A 1128 A U 1133 A G 1280 A G 1283 A G
1285 A C 2008 A G 2027 A U 2028 A G 2029 A G 2270
A C 2456 A U 2457 A G 2489 A A 2541 A A 2542 A G
2543 A G 2624 A G 2625 A G 2627 A G 2633 A G 2634
A C 2635 A U 2636 A U 2637 A G 2638 A G 2640 A G
2641 A G 2642 A G 2644 A G 2645 A U 2739 A C 2767
A C 2768 A C 2769 A G 2770 A C 2771 A C 2772 A C
2773 A C 2774 A A 2775 A G 2812 A A 2813 A C 2814
A C 2815 A C 2825 A A 2826 A C 2827 A C 2828 A C
88 B G 89 B

1.41

1.61

276.6

-0.83

-0.54

11.9

U 905 A G 906 A G 1022 A U 1023 A U 1026 A A 1027
A A 1028 A C 1119 A G 1120 A C 1121 A G 1122 A C
1123 A C 1124 A G 1125 A A 1126 A A 1127 A U 1133
A G 1280 A G 1283 A G 1285 A C 2008 A A 2541 A A
2542 A G 2543 A G 2624 A G 2625 A G 2627 A G 2633
A G 2634 A C 2635 A U 2636 A U 2637 A G 2638 A G
2640 A G 2641 A G 2642 A G 2644 A G 2645 A U 2739
A C 2767 A C 2768 A C 2769 A G 2770 A C 2771 A C
2772 A C 2773 A C 2774 A A 2775 A G 2812 A A 2813
A C 2814 A C 2815 A C 2825 A A 2826 A C 2827 A C
2828 A G 76 B U 77 B A 78 B G 87 B C 88 B G 89 B
A 90 B C 92 B G 93 B C 94 B A 100 B G 101 B A 102
B G 103 B U 104 B

2.04

2.03

295.3

-1.01

-0.70

10.9

A 13 A A 14 A G 16 A G 17 A C 18 A C 19 A C 20 A
A 21 A C 22 A G 23 A A 513 A A 514 A A 515 A C
517 A G 518 A U 519 A G 520 A G 521 A C 543 A A
547 A A 548 A U 597 A G 598 A G 599 A G 600 A C
601 A C 654 A i:T G 654 A i:S C 654 A i:R C 654 A
i:Q G 842 A G 843 A G 1164 A U 1165 A C 1166 A U
1167 A A 1177 A C 1178 A C 1179 A A 1194 A G 1195
A G 1216 A C 1217 A C 1218 A G 1219 A A 1220 A C
1221 A C 1221 A i:A C 1222 A G 1223 A G 1225 A G
1231 A G 1232 A C 1233 A U 1234 A G 1280 A G 1283
A G 1285 A C 2008 A G 2624 A G 2625 A G 2805 A A
2813 A C 2814 A C 2815 A C 2825 A A 2826 A C 2889
A G 2891 A

1.74

292.0

-0.62

-0.77

6.6

G 741 A U 757 A G 823 A A 824 A C 825 A A 829 A G
830 A G 859 A C 867 A U 868 A G 869 A U 913 A C
914 A A 945 A G 946 A C 965 A G 1661 A C 1662 A C
1672 A U 1673 A C 1675 A A 1676 A G 1678 A U 1679
A U 1680 A G 1681 A C 1684 A C 1685 A C 1686 A G
1705 A U 1706 A G 1747 A i:A G 1747 A G 1748 A A
1749 A A 1755 A G 1756 A U 1757 A A 1759 A C 1761
A A 1762 A G 1764 A C 1942 A U 1944 A U 1955 A U
1956 A A 1981 A C 1983 A G 1984 A C 2065 A C 2066
A G 2067 A G 2246 A A 2247 A C 2248 A U 2249 A G
2252 A G 2253 A G 2259 A C 2263 A C 2264 A A 2266
A G 2270 A G 2271 A U 2272 A A 2273 A A 2274 A A
2278 A G 2279 A G 2321 A A 2322 A A 2328 A G 2329
A G 2330 A G 2331 A U 2437 A U 2438 A U 2449 A U
2552 A G 2553 A U 2554 A G 2582 A A 2600 A C 2601
A A 2602 A G 2603 A U 2604 A U 2605 A C 2606 A G
2607 A U 2716 A

2.54

301.3

-0.46

-0.76

4.5

G 741 A U 757 A A 821 A U 822 A G 836 A C 837 A U
847 A G 848 A A 849 A C 850 A U 922 A C 923 A C
924 A C 925 A C 935 A G 947 A G 948 A C 949 A G
950 A C 951 A A 959 A A 960 A C 961 A U 963 A C
964 A C 965 A G 966 A C 967 A G 968 A U 969 A G
1661 A C 1662 A C 1672 A U 1673 A C 1675 A A 1676
A G 1678 A U 1679 A U 1680 A G 1681 A C 1684 A C
1685 A C 1686 A G 1705 A U 1706 A G 1747 A i:A G
1747 A G 1748 A A 1749 A A 1755 A G 1756 A U 1757
A A 1759 A C 1761 A A 1762 A G 1764 A C 1942 A U
1944 A U 1955 A U 1956 A A 1981 A C 1983 A G 1984
A G 2270 A U 2457 A G 2458 A A 2459 A U 2460 A C
2461 A U 2462 A C 2463 A C 2464 A C 2465 A C 2480
A G 2481 A G 2482 A C 2483 A G 2485 A G 2486 A G
2487 A U 2492 A U 2493 A C 2520 A U 2537 A C 2538
A U 2552 A G 2553 A U 2554 A U 2555 A C 2556 A G
2557 A G 2567 A C 2568 A G 2569 A G 2582 A A 2602
A G 2603 A U 2604 A U 2605 A C 2606 A G 2607 A U
2716 A C 88 B G 89 B

1.42

1.80

307.3

-0.72

-0.56

10.8

U 905 A G 906 A G 1022 A U 1023 A U 1026 A A 1027
A A 1028 A C 1119 A G 1120 A C 1121 A G 1122 A C
1123 A C 1124 A G 1125 A A 1126 A A 1127 A U 1133
A G 1443 A G 1444 A C 1445 A i:A A 1445 A C 1446
A G 1447 A G 1448 A C 1450 A i:A G 1459 A G 1461
A C 1462 A C 1463 A C 1464 A U 1629 A A 2541 A A
2542 A G 2543 A U 2636 A U 2637 A G 2638 A G 2640
A G 2641 A G 2642 A G 2644 A G 2645 A C 2690 A C
2691 A C 2692 A A 2693 A G 2694 A C 2695 A U 2696
A G 2697 A U 2698 A C 2699 A C 2700 A C 2704 A G
2707 A G 2708 A U 2739 A C 2767 A C 2768 A C 2769
A G 2770 A C 2771 A C 2772 A C 2773 A C 2774 A A
2775 A G 2819 A A 2820 A A 2821 A C 2827 A C 2828
A C 2829 A U 2836 A G 2837 A G 2838 A G 2839 A C
2840 A C 2841 A C 2871 A G 2872 A A 2873 A C 2874
A C 2875 A G 2876 A G 76 B U 77 B A 78 B G 87 B C
88 B G 89 B A 90 B C 92 B G 93 B C 94 B A 100 B G
101 B A 102 B G 103 B U 104 B

1.41

1.80

318.8

-0.52

-0.60

8.0

G 741 A U 757 A U 905 A G 906 A U 958 A A 959 A A
1028 A A 1029 A C 1119 A G 1120 A G 1661 A C 1662
A C 1672 A U 1673 A C 1675 A A 1676 A G 1678 A U
1679 A U 1680 A G 1681 A C 1684 A C 1685 A C 1686
A G 1705 A U 1706 A G 1747 A i:A G 1747 A G 1748
A A 1749 A A 1755 A G 1756 A U 1757 A A 1759 A C
1761 A A 1762 A G 1764 A C 1942 A U 1944 A U 1955
A U 1956 A A 1981 A C 1983 A G 1984 A A 2459 A U
2460 A C 2461 A U 2462 A C 2463 A C 2464 A C 2465
A C 2480 A G 2481 A G 2482 A C 2483 A G 2485 A G
2486 A G 2487 A U 2492 A U 2493 A C 2520 A U 2537
A C 2538 A U 2552 A G 2553 A U 2554 A U 2555 A C
2556 A G 2557 A G 2567 A C 2568 A G 2569 A G 2582
A A 2602 A G 2603 A U 2604 A U 2605 A C 2606 A G
2607 A U 2716 A G 76 B U 77 B A 78 B G 89 B A 90
B C 92 B G 93 B C 94 B A 100 B G 101 B A 102 B G
103 B U 104 B

1.32

463.9

-0.77

8.6

G 741 A C 755 A C 756 A U 757 A U 877 A A 878 A G
879 A G 880 A C 884 A C 886 A A 887 A C 889 A A
890 A G 892 A C 893 A C 894 A U 895 A A 896 A A
1050 A G 1051 A A 1073 A G 1074 A C 1075 A U 1090
A G 1091 A A 1103 A G 1115 A C 1116 A A 1272 A A
1274 A C 1298 A G 1299 A A 1302 A G 1303 A C 1304
A C 1305 A C 1315 A G 1332 A G 1388 A G 1389 A G
1440 A G 1441 A G 1442 A G 1443 A G 1444 A C 1445
A i:A A 1445 A C 1446 A G 1447 A G 1448 A C 1450
A i:A G 1459 A G 1461 A C 1462 A C 1463 A C 1464
A G 1465 A G 1466 A G 1526 A G 1527 A G 1537 A C
1605 A G 1606 A A 1608 A A 1609 A A 1610 A G 1619
A A 1637 A A 1641 A G 1642 A G 1643 A C 1644 A C
1646 A G 1661 A C 1672 A U 1673 A C 1675 A A 1676
A G 1678 A U 1679 A U 1680 A G 1681 A C 1761 A G
1764 A C 1942 A U 1944 A U 1955 A U 1956 A A 1981
A C 1983 A G 1984 A C 2461 A U 2462 A C 2463 A A
2469 A G 2470 A C 2471 A A 2476 A U 2492 A U 2493
A C 2520 A C 2521 A U 2522 A G 2523 A G 2525 A G
2526 A C 2527 A U 2528 A A 2530 A A 2533 A A 2534
A G 2535 A G 2536 A U 2537 A C 2538 A U 2552 A G
2553 A U 2554 A U 2555 A C 2556 A G 2557 A G 2567
A C 2568 A G 2569 A G 2582 A A 2602 A G 2603 A U
2604 A U 2605 A C 2606 A G 2607 A C 2666 A U 2712
A A 2712 A i:A G 2744 A C 2752 A A 2753 A U 2754 A

Residue-type_colouring

Positive	Negative	Neutral	Aliphatic	Aromatic	Pro & Gly	Cysteine
H,K,R	D,E	S,T,N,Q	A,V,L,I,M	F,Y,W	P,G	C

Acknowledgement

Pores were calculated by

MOLE 2.0 program version 2.5.13.11.08 and visualized using Pymol 0.97rc.