PDBsum entry 2qnh Go to PDB code:  Pore analysis for: 2qnh calculated with MOLE 2.0 PDB id 2qnh Pores calculated on whole structure Pores calculated excluding ligands View options MOLEonline 2.0 manipulation and visualization with HETATM: without HETATM:   30 pores, coloured by radius 30 pores, coloured by radius 30 pores, coloured as in list below Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown. Pores Free R Length HPathy HPhob Polar Rel Mut Residue..type Ligands Radius 1 2.82 2.95 63.7 -0.95 -0.68 11.4 80 4 0 1 1 0 0 0  G 104 y G 105 y C 106 y A 134 y C 135 y C 136 y C 137 y G 138 y G 139 y G 142 y C 150 y G 166 y G 167 y C 174 y C 175 y C 218 y C 219 y G 220 y C 221 y U 222 y U 223 y C 224 y G 324 y A 325 y C 1448 y C 1449 y C 1459 y 2 1.56 1.54 85.8 0.67 -0.01 8.7 79 6 1 0 12 0 1 0  C 1242 y C 1243 y C 1244 y A 1245 y C 1246 y U 1247 y C 1267 y A 1288 y A 1289 y G 1290 y G 1291 y U 1292 y G 1293 y G 1294 y G 1295 y C 1296 y 3 1.63 1.63 97.0 -0.68 -0.70 7.5 83 2 0 2 1 0 0 0  G 61 y U 62 y C 63 y G 64 y G 69 y C 74 y C 75 y C 77 y G 78 y U 86 y A 87 y C 88 y U 89 y C 90 y C 91 y U 93 y G 95 y G 96 y U 97 y C 99 y A 101 y G 102 y C 103 y C 150 y A 151 y A 152 y C 163 y U 164 y C 165 y G 166 y G 167 y C 1448 y C 1449 y C 1459 y 4 2.60 2.60 108.8 -0.60 -0.75 5.0 86 2 0 1 2 0 0 0  G 107 y G 108 y A 109 y C 110 y U 118 y A 120 y G 122 y A 134 y C 135 y C 136 y C 137 y G 138 y G 139 y G 142 y C 218 y C 219 y G 220 y G 230 y G 231 y G 232 y C 233 y U 252 y G 265 y G 284 y A 313 y G 319 y C 320 y A 325 y G 326 y A 327 y C 328 y G 378 y C 379 y G 380 y C 381 y A 382 y G 1421 y G 1422 y C 1424 y U 1425 y C 1426 y A 1428 y G 1469 y G 1470 y G 1471 y U 1472 y A 1473 y G 1475 y 5 2.20 2.20 110.4 -0.28 -0.71 4.1 60 1 0 0 2 0 0 0  U 118 y A 120 y G 122 y C 150 y A 151 y C 163 y U 164 y C 165 y G 166 y G 167 y U 252 y G 265 y G 284 y A 313 y C 314 y A 315 y G 316 y G 317 y G 318 y G 319 y C 320 y C 328 y G 333 y C 334 y C 335 y C 336 y G 348 y A 349 y G 350 y G 351 y G 1422 y C 1424 y U 1425 y C 1426 y A 1428 y C 1448 y C 1449 y C 1459 y G 1469 y G 1470 y G 1471 y U 1472 y A 1473 y G 1475 y 6 2.73 2.73 111.2 -0.43 -0.76 3.8 73 1 0 1 1 0 0 0  U 65 y G 68 y G 69 y C 74 y C 75 y C 77 y G 78 y G 79 y U 86 y A 87 y C 88 y U 89 y C 90 y C 91 y G 92 y U 93 y G 95 y G 138 y G 139 y G 142 y G 199 y G 200 y C 201 y U 208 y U 209 y U 210 y C 218 y C 219 y G 220 y C 381 y A 382 y C 455 y C 456 y G 466 y G 467 y 7 1.56 1.56 126.8 -0.87 -0.48 7.5 81 0 0 0 0 0 0 0  U 6 2 U 7 2 U 8 2 A 9 2 U 12 2 C 13 2 A 14 2 A 23 2 G 24 2 C 25 2 U 39 2 C 40 2 A 67 2 U 68 2 A 9 3 U 678 y C 679 y C 680 y C 681 y G 682 y G 683 y A 684 y G 688 y G 690 y G 691 y U 692 y A 694 y A 695 y C 699 y G 700 y A 702 y G 703 y A 704 y U 705 y A 706 y G 799 y 8 1.49 1.49 134.2 -0.47 -0.71 5.1 83 0 0 0 0 0 0 0  U 6 2 U 7 2 U 8 2 A 9 2 U 12 2 C 13 2 A 14 2 G 24 2 C 25 2 G 26 2 C 27 2 C 28 2 A 29 2 G 30 2 A 31 2 C 32 2 U 33 2 A 36 2 A 37 2 A 38 2 A 67 2 U 68 2 A 695 y A 696 y U 697 y G 700 y A 787 y U 788 y G 941 y G 942 y A 1238 y A 1239 y U 1240 y G 1241 y C 1242 y C 1243 y G 1290 y G 1291 y U 1292 y G 1293 y G 1294 y G 1295 y C 1296 y C 1336 y G 1337 y G 1338 y A 1339 y A 1340 y U 1341 y U 1351 y C 1352 y C 40 z C 41 z 9 1.51 1.51 143.3 -0.62 -0.76 6.1 69 0 0 0 0 0 0 0  U 6 2 U 7 2 U 8 2 A 9 2 U 12 2 C 13 2 A 14 2 G 24 2 C 25 2 G 26 2 G 34 2 A 35 2 A 36 2 A 37 2 A 38 2 A 67 2 U 68 2 A 1 3 A 9 3 A 10 3 A 12 3 A 13 3 A 695 y A 696 y U 697 y G 700 y A 787 y U 788 y A 790 y G 926 y G 928 y G 929 y C 930 y G 1082 y U 1083 y U 1086 y G 1087 y G 1089 y U 1381 y C 1382 y C 1383 y C 1384 y C 1389 y U 1390 y U 1391 y C 1535 y C 1536 y U 33 z A 37 z A 38 z C 39 z C 40 z 10 2.10 2.14 152.5 -0.67 -0.71 7.5 71 4 1 1 2 0 1 0  A 50 y A 51 y G 52 y A 116 y G 117 y C 241 y C 242 y A 243 y G 286 y U 287 y A 288 y G 317 y C 337 y A 338 y C 564 y G 567 y G 568 y C 569 y G 821 y C 822 y G 823 y C 824 y G 825 y C 826 y U 827 y G 829 y U 850 y G 851 y G 852 y U 870 y U 871 y A 872 y A 873 y G 874 y C 877 y C 882 y C 883 y U 884 y A 907 y A 908 y G 1421 y G 1422 y G 1423 y C 1424 y U 1425 y G 1470 y G 1471 y U 1472 y A 1473 y G 1475 y C 1479 y G 1480 y 11 2.22 2.22 157.9 -0.46 -0.75 5.0 72 4 0 0 1 0 0 0  A 50 y A 51 y G 52 y A 116 y G 117 y C 241 y C 242 y A 243 y G 286 y U 287 y A 288 y G 317 y C 337 y A 338 y A 572 y A 573 y A 574 y G 575 y G 576 y G 577 y A 759 y G 760 y A 814 y A 815 y C 866 y G 867 y G 881 y C 882 y C 883 y U 884 y G 887 y G 890 y U 905 y G 906 y A 907 y A 908 y G 916 y G 917 y A 918 y A 919 y U 920 y G 1082 y U 1391 y G 1392 y U 1393 y A 1394 y G 1421 y G 1422 y G 1423 y C 1424 y U 1425 y G 1470 y G 1471 y U 1472 y A 1473 y G 1475 y C 1479 y G 1480 y C 1509 y G 1511 y G 1529 y 12 1.16 1.16 169.9 -0.62 -0.73 5.9 69 0 0 0 0 0 0 0  U 6 2 U 7 2 U 8 2 A 9 2 U 12 2 C 13 2 A 14 2 G 24 2 C 25 2 G 26 2 G 34 2 A 35 2 A 36 2 A 37 2 A 38 2 A 67 2 U 68 2 A 12 3 A 13 3 A 695 y A 696 y U 697 y G 700 y A 787 y U 788 y A 790 y C 924 y G 925 y G 926 y G 933 y A 935 y 5MC 967 y A 968 y C 1063 y U 1065 y C 1066 y A 1110 y A 1111 y C 1112 y G 1156 y A 1157 y C 1158 y U 1159 y A 1183 y G 1184 y G 1185 y G 1186 y G 1187 y C 1189 y U 1345 y C 1384 y G 1385 y G 1386 y 5MC 1400 y U 33 z C 34 z A 37 z A 38 z C 39 z C 40 z 13 2.43 2.43 169.9 -0.95 -0.68 9.9 75 8 1 1 2 0 4 0  U 5 y G 6 y U 118 y A 119 y A 120 y C 121 y G 238 y U 239 y C 240 y U 252 y C 277 y G 278 y G 281 y A 282 y C 283 y G 284 y G 292 y G 293 y U 294 y U 296 y G 297 y G 299 y A 300 y G 301 y G 302 y G 319 y G 610 y A 611 y C 612 y G 630 y G 1421 y G 1422 y C 1424 y U 1425 y C 1426 y A 1428 y G 1469 y G 1470 y G 1471 y U 1472 y A 1473 y G 1475 y 14 2.44 2.62 186.9 -0.99 -0.67 11.6 71 13 1 0 1 2 2 0  C 18 3 U 14 y G 15 y A 16 y C 23 y U 24 y A 50 y A 51 y G 52 y A 116 y G 117 y G 286 y U 287 y A 288 y G 317 y C 337 y A 338 y U 421 y C 422 y U 512 y C 513 y C 514 y C 525 y C 526 y 7MG 527 y C 528 y U 534 y G 885 y A 908 y A 909 y U 911 y C 912 y A 913 y A 996 y A 1046 y U 1205 y G 1206 y 2MG 1207 y C 1208 y C 1397 y G 1421 y G 1422 y G 1423 y C 1424 y U 1425 y G 1470 y G 1471 y U 1472 y A 1473 y G 1475 y C 1479 y G 1480 y 15 2.12 2.12 193.4 -0.48 -0.74 5.5 68 5 0 0 2 0 0 0  U 118 y A 119 y A 120 y C 121 y G 122 y C 150 y A 151 y C 163 y U 164 y C 165 y G 166 y G 167 y G 238 y U 239 y C 240 y C 241 y C 242 y A 243 y U 252 y G 265 y C 277 y G 278 y G 281 y A 282 y C 283 y G 284 y A 313 y C 314 y A 315 y G 316 y G 317 y G 318 y G 319 y C 320 y C 328 y G 333 y C 334 y C 335 y C 336 y G 348 y A 349 y G 350 y G 351 y A 572 y A 573 y A 574 y G 575 y G 576 y G 577 y A 759 y G 760 y A 814 y A 815 y C 866 y G 867 y G 881 y C 882 y G 887 y G 890 y U 905 y G 916 y G 917 y A 918 y A 919 y U 920 y G 1082 y U 1391 y G 1392 y U 1393 y A 1394 y C 1448 y C 1449 y C 1459 y C 1509 y G 1511 y G 1529 y 16 1.54 2.94 197.8 -0.23 -0.45 5.2 76 0 0 0 0 0 0 0  U 6 2 U 7 2 U 8 2 A 9 2 U 12 2 C 13 2 A 14 2 G 24 2 C 25 2 G 26 2 C 27 2 C 28 2 A 29 2 G 30 2 C 32 2 A 36 2 A 37 2 A 38 2 A 67 2 U 68 2 A 695 y A 696 y U 697 y G 700 y A 787 y U 788 y G 945 y A 946 y U 1301 y U 1307 y U 1330 y G 1331 y A 1332 y A 1333 y G 1334 y C 1335 y G 1337 y G 1338 y A 1339 y C 40 z C 41 z A 43 z 17 1.62 1.62 199.7 -0.74 -0.74 7.7 73 0 0 0 0 0 0 0  U 6 2 U 7 2 U 8 2 A 9 2 U 12 2 C 13 2 A 14 2 G 24 2 C 25 2 G 26 2 A 38 2 A 67 2 U 68 2 U 14 3 G 15 3 C 17 3 C 18 3 U 14 y G 15 y A 16 y U 421 y C 422 y U 512 y C 513 y C 514 y C 526 y 7MG 527 y C 528 y U 534 y A 695 y A 696 y U 697 y G 700 y A 787 y U 788 y A 790 y G 791 y A 913 y A 914 y A 996 y A 1046 y U 1205 y G 1206 y 2MG 1207 y C 1208 y C 1397 y C 1403 y 5MC 1404 y G 1405 y G 1491 y A 1493 y G 1494 y U 1495 y C 1496 y G 1497 y U 1498 y U 24 z C 25 z G 26 z U 27 z U 36 z A 37 z A 38 z C 39 z C 40 z 18 0.68 0.68 206.6 -1.15 -0.74 12.5 80 9 5 1 1 0 3 0  U 118 y A 119 y A 120 y C 121 y G 238 y U 239 y C 240 y U 252 y C 277 y G 278 y G 281 y A 282 y C 283 y G 284 y G 292 y G 293 y U 294 y C 295 y U 296 y G 297 y G 299 y A 300 y G 301 y G 302 y G 319 y G 610 y A 611 y C 612 y A 614 y C 615 y G 616 y G 617 y A 621 y A 622 y G 625 y U 626 y G 627 y G 628 y G 1421 y G 1422 y C 1424 y U 1425 y C 1426 y A 1428 y G 1469 y G 1470 y G 1471 y U 1472 y A 1473 y G 1475 y 19 2.12 2.12 206.5 -0.53 -0.68 6.9 68 5 1 1 4 0 1 0  A 50 y A 51 y A 116 y G 117 y U 118 y C 150 y A 151 y C 163 y U 164 y C 165 y G 166 y G 167 y C 241 y C 242 y A 243 y G 286 y U 287 y A 288 y A 313 y C 314 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