spacer
spacer

PDBsum entry 1vsp

Go to PDB code: 
Top Page protein dna_rna Protein-protein interface(s) pores links
Pore analysis for: 1vsp calculated with MOLE 2.0 PDB id
1vsp
Pores calculated on whole structure Pores calculated excluding ligands

View options
MOLEonline 2.0 manipulation
and
visualization
with HETATM:
without HETATM:
 
34 pores, coloured by radius 34 pores, coloured by radius 34 pores, coloured as in
list below
Pores are connected internal spaces going through the structure. Only pores longer than 25 Å are shown.
Pores
Free R
Length
HPathy
HPhob
Polar
Rel Mut
Residue..type
Ligands
Radius
1 2.34 2.34 92.4 -0.54 -0.79 5.0 83 1 0 0 0 0 0 0  G 853 w G 854 w G 855 w C 856 w C 857 w U 858 w G
859 w A 866 w C 867 w U 868 w U 877 w A 878 w G
879 w C 889 w A 890 w G 892 w A 900 w A 901 w C
902 w C 903 w C 914 w C 915 w G 916 w A 917 w A
918 w A 2298 w G 2299 w G 2300 w G 2308 w A 2309
w G 2318 w G 2319 w A 2320 w G 2321 w G 2331 w U
2332 w A 13 x C 68 x G 69 x C 70 x C 94 x U 95 x
G 96 x G 97 x G 98 x
2 2.16 2.16 137.7 0.36 -0.35 3.4 73 0 1 0 10 2 1 0  C 32 w A 320 w G 325 w G 326 w A 331 w A 332 w G
333 w G 997 w C 998 w U 999 w C 1150 w G 1151 w C
1152 w U 1159 w G 1160 w C 1161 w G 1162 w G 1163
w G 1164 w U 1165 w C 1166 w A 1177 w C 1178 w C
1179 w C 1180 w C 1181 w A 1182 w A 1194 w G 1195
w C 1196 w G 1197 w U 1198 w U 1199 w C 1200 w C
1201 w A 1204 w U 1205 w G 1206 w C 1207 w G 1223
w C 1224 w G 1238 w G 1239 w U 1240 w A 1241 w A
1242 w G 1243 w G 1244 w G 1245 w
3 2.62 3.72 142.2 0.22 -0.33 4.8 75 3 1 0 13 2 2 0  U 33 w C 34 w G 89 w U 90 w A 91 w G 92 w C 106 w
C 107 w A 320 w G 325 w G 326 w A 332 w G 333 w G
439 w G 440 w U 441 w G 442 w C 444 w G 446 w U
475 w G 476 w A 479 w A 480 w G 481 w A 482 w C
1201 w A 1204 w U 1205 w G 1206 w C 1207 w G 1239
w U 1240 w
4 2.37 2.37 149.1 0.07 -0.35 6.3 74 3 1 0 10 2 1 0  C 32 w A 320 w G 325 w G 326 w A 331 w A 332 w G
333 w A 841 w G 842 w G 845 w C 846 w U 930 w G
931 w G 932 w A 933 w G 934 w U 1167 w G 1168 w A
1182 w G 1193 w A 1194 w G 1195 w C 1196 w G 1197
w U 1198 w U 1199 w C 1200 w C 1201 w A 1204 w U
1205 w G 1206 w C 1207 w G 1238 w G 1239 w U 1240
w A 1241 w A 1242 w G 1244 w G 1245 w
5 1.97 1.97 154.4 -0.94 -0.75 8.6 76 5 1 2 2 1 1 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 525 w A 526 w A 528 w A 529
w G 530 w G 533 w G 539 w G 556 w U 557 w G 558 w
G 559 w C 560 w G 561 w G 978 w G 979 w A 980 w A
981 w A 1000 w A 1001 w G 1002 w G 1003 w C 1004
w C 1008 w A 1009 w C 1135 w G 1136 w C 1145 w C
1146 w C 1147 w G 1149 w C 1150 w G 2037 w G 2038
w U 2797 w C 2896 w U 2897 w U 2898 w G 2899 w
6 2.32 2.32 159.8 -0.78 -0.71 8.6 80 6 0 0 3 0 1 0  C 32 w U 33 w C 34 w G 89 w U 90 w A 91 w G 92 w
C 106 w G 325 w G 326 w G 439 w G 440 w U 441 w G
442 w C 444 w G 446 w U 475 w G 476 w A 479 w A
480 w G 481 w A 482 w A 841 w G 842 w G 845 w C
846 w U 930 w G 931 w G 932 w A 933 w G 934 w U
1167 w G 1168 w G 1169 w A 1182 w G 1193 w A 1194
w G 1195 w C 1196 w G 1197 w U 1198 w U 1199 w C
1200 w C 1201 w A 1204 w G 1239 w U 1240 w A 1241
w A 1242 w G 1244 w G 1245 w
7 2.52 2.54 179.0 -0.88 -0.75 8.7 78 5 1 2 3 1 0 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 12 w A 13 w A 14 w G 16 w G
17 w C 18 w C 19 w C 20 w A 21 w C 22 w G 23 w G
24 w U 25 w G 27 w A 91 w G 92 w A 479 w A 480 w
G 481 w A 482 w A 492 w G 493 w G 494 w U 504 w G
506 w A 507 w G 508 w C 509 w U 511 w G 512 w A
513 w A 514 w G 518 w U 519 w G 520 w G 521 w G
522 w C 523 w U 524 w C 541 w C 542 w C 1217 w U
1234 w U 2797 w A 2799 w A 2801 w G 2802 w C 2803
w C 2896 w U 2897 w U 2898 w G 2899 w
8 1.81 1.79 212.1 -0.76 -0.71 7.7 76 5 2 3 3 3 1 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 12 w A 13 w A 14 w G 521 w
G 522 w C 523 w C 541 w C 542 w G 1443 w G 1444 w
A 1444 w i:B A 1460 w U 1629 w G 1630 w A 1652 w
C 1734 w U 1735 w C 2007 w G 2624 w G 2625 w C
2690 w C 2691 w C 2692 w A 2693 w G 2694 w C 2695
w U 2696 w U 2698 w C 2699 w C 2700 w C 2704 w A
2705 w G 2706 w G 2707 w G 2708 w G 2709 w U 2797
w A 2799 w A 2801 w G 2802 w C 2803 w C 2804 w A
2813 w C 2815 w C 2816 w G 2817 w G 2818 w G 2819
w G 2822 w G 2825 w A 2826 w G 2838 w G 2839 w G
2872 w C 2888 w C 2889 w C 2896 w U 2897 w U 2898
w G 2899 w
9 1.89 1.89 205.5 -0.45 -0.80 4.0 77 2 1 0 0 0 0 0  G 979 w A 980 w A 1000 w A 1001 w G 1002 w G 1003
w C 1004 w G 1025 w U 1026 w C 1145 w C 1146 w C
1147 w G 1149 w C 1150 w G 1839 w G 1840 w G 1903
w G 1904 w C 1905 w G 1906 w G 1907 w C 1908 w C
1909 w G 1910 w A 1918 w A 1927 w U 1963 w G 1964
w A 1966 w C 1967 w G 2027 w U 2028 w U 2076 w G
2251 w G 2252 w G 2253 w C 2254 w G 2255 w G 2436
w U 2437 w A 2451 w C 2452 w A 2453 w G 2454 w G
2455 w C 2456 w U 2457 w G 2489 w G 2490 w U 2492
w G 2494 w G 2495 w C 2594 w G 2595 w U 2596 w A
2600 w C 2601 w A 2602 w G 2603 w G 86 x G 87 x C
88 x C 94 x
10 2.08 2.15 207.3 -1.08 -0.73 11.2 73 7 1 2 2 1 0 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 12 w A 13 w A 14 w G 16 w G
17 w C 18 w C 19 w C 20 w A 21 w C 22 w A 514 w G
518 w U 519 w G 520 w G 521 w G 522 w C 523 w U
524 w C 541 w C 542 w A 841 w G 842 w G 845 w C
846 w U 930 w G 931 w G 932 w A 933 w G 934 w U
1167 w G 1168 w A 1182 w G 1193 w A 1194 w G 1195
w C 1196 w G 1197 w U 1198 w A 1214 w G 1215 w G
1216 w C 1217 w C 1218 w G 1229 w C 1230 w U 1240
w A 1241 w A 1242 w G 1244 w G 1245 w U 2797 w A
2799 w A 2801 w G 2802 w C 2803 w C 2896 w U 2897
w U 2898 w G 2899 w
11 2.13 2.13 214.8 -1.12 -0.64 14.7 81 11 6 1 5 0 3 0  C 998 w U 999 w A 1000 w A 1001 w G 1002 w G 1003
w C 1004 w U 1012 w C 1013 w U 1014 w A 1142 w i:
B C 1142 w A 1143 w G 1144 w C 1146 w C 1147 w A
1148 w G 1149 w C 1150 w G 1151 w C 1152 w U 2650
w C 2651 w G 2668 w G 2669 w A 2670 w A 2671 w G
2672 w G 2673 w G 2729 w C 2730 w A 2734 w G 2735
w G 2736 w G 2737 w A 2758 w G 2759 w C 2760 w G
2761 w G 2762 w G 2763 w
12 2.28 2.81 227.1 -0.73 -0.76 7.3 90 4 0 2 1 0 0 0  G 823 w A 824 w C 825 w G 836 w C 837 w U 839 w C
840 w A 841 w G 842 w G 845 w C 846 w C 923 w U
930 w G 931 w G 932 w A 933 w G 934 w C 935 w C
936 w U 937 w U 1167 w G 1168 w G 1169 w A 1182 w
G 1839 w G 1840 w G 1903 w G 1904 w C 1905 w G
1906 w G 1907 w C 1908 w C 1909 w G 1910 w A 1918
w A 1927 w U 1963 w G 1964 w A 1966 w C 1967 w U
2076 w G 2246 w C 2254 w G 2255 w G 2256 w U 2257
w C 2258 w G 2259 w U 2272 w A 2274 w C 2275 w G
2279 w G 2280 w C 2281 w C 2355 w C 2356 w G 2358
w U 2423 w A 2425 w A 2426 w G 2436 w C 2594 w G
2595 w U 2596 w
13 2.13 2.13 231.0 -0.85 -0.72 7.8 76 6 4 3 3 2 0 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 12 w A 13 w A 14 w G 521 w
G 522 w C 523 w C 541 w C 542 w C 1996 w C 2512 w
G 2513 w G 2545 w C 2620 w A 2621 w C 2622 w G
2623 w G 2624 w G 2625 w C 2628 w A 2632 w G 2633
w G 2641 w G 2642 w G 2643 w G 2644 w U 2650 w C
2651 w A 2671 w G 2672 w G 2673 w G 2674 w C 2676
w G 2677 w C 2678 w U 2726 w G 2727 w U 2728 w G
2729 w C 2730 w G 2731 w C 2773 w C 2774 w A 2775
w G 2777 w A 2778 w U 2797 w A 2799 w A 2801 w G
2802 w C 2803 w C 2804 w G 2812 w A 2813 w C 2827
w C 2888 w C 2889 w C 2896 w U 2897 w U 2898 w G
2899 w
14 2.14 2.10 231.4 -0.16 -0.51 5.5 73 2 2 2 11 3 1 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 12 w A 13 w A 14 w G 16 w G
17 w C 18 w C 19 w C 20 w A 21 w C 22 w G 23 w G
308 w A 311 w A 320 w G 325 w G 326 w G 327 w U
328 w A 330 w A 331 w A 332 w G 333 w A 501 w A
502 w A 503 w U 504 w A 513 w A 514 w G 518 w U
519 w G 520 w G 521 w G 522 w C 523 w U 524 w C
541 w C 542 w A 1204 w U 1205 w G 1206 w C 1207 w
A 1210 w G 1212 w C 1217 w C 1233 w U 1234 w G
1235 w G 1236 w A 1237 w G 1238 w G 1239 w U 2797
w A 2799 w A 2801 w G 2802 w C 2803 w C 2896 w U
2897 w U 2898 w G 2899 w
15 2.85 4.11 221.9 -0.64 -0.67 7.6 78 8 1 1 6 2 3 0  C 34 w G 36 w A 38 w C 39 w G 54 w U 67 w G 68 w
G 89 w U 90 w A 91 w G 92 w A 181 w C 238 w U 239
w C 433 w U 434 w C 435 w C 436 w G 452 w G 458 w
U 475 w G 476 w A 479 w A 480 w G 481 w A 482 w A
590 w C 591 w G 592 w G 593 w U 594 w C 595 w G
596 w A 608 w A 609 w i:A G 622 w G 623 w U 654 w
G 656 w U 657 w C 658 w C 659 w U 847 w G 848 w A
849 w U 851 w G 852 w G 853 w G 919 w G 920 w G
921 w U 922 w C 923 w C 924 w G 934 w C 935 w C
936 w U 937 w C 2355 w U 2357 w C 94 x U 95 x G
96 x G 97 x
16 1.93 1.93 232.8 -0.37 -0.73 4.1 72 1 1 2 3 2 0 0  G 836 w C 837 w U 839 w C 840 w A 841 w G 842 w G
845 w C 846 w C 850 w G 919 w G 920 w G 921 w U
922 w C 923 w U 930 w G 931 w G 932 w A 933 w G
934 w C 935 w C 936 w U 937 w G 950 w C 967 w G
968 w C 985 w C 986 w U 1026 w U 1167 w G 1168 w
G 1169 w A 1182 w U 2028 w G 2029 w A 2268 w A
2269 w G 2270 w C 2355 w C 2356 w U 2457 w G 2458
w A 2459 w U 2460 w C 2461 w U 2462 w C 2463 w C
2464 w G 2481 w G 2482 w C 2483 w G 2485 w G 2486
w G 2487 w A 2488 w G 2489 w C 2520 w G 2535 w G
2536 w U 2537 w C 2538 w U 2563 w A 2564 w A 2565
w A 2566 w C 2648 w U 2649 w U 2650 w C 2651 w G
81 x G 82 x G 83 x C 84 x G 85 x G 86 x G 87 x C
88 x G 89 x i:A
17 2.60 3.89 254.4 -0.37 -0.50 8.7 78 8 2 2 13 3 1 0  C 40 w C 237 w C 238 w U 239 w A 320 w A 324 w G
325 w A 332 w G 333 w A 432 w U 441 w G 442 w C
591 w G 592 w G 593 w U 594 w C 595 w G 596 w A
608 w G 609 w i:B A 609 w i:A U 613 w U 614 w G
615 w A 616 w G 622 w G 623 w U 654 w G 656 w U
657 w C 658 w C 659 w U 847 w G 848 w A 849 w U
851 w G 852 w G 853 w G 919 w G 920 w G 921 w U
922 w C 923 w C 924 w G 934 w C 935 w C 936 w U
937 w C 1201 w C 1202 w A 1204 w U 1205 w G 1206
w C 1207 w G 1239 w U 1240 w C 2355 w U 2357 w U
95 x G 96 x G 97 x
18 1.98 1.98 261.4 -0.12 -0.56 4.4 73 2 1 0 11 2 2 0  U 33 w C 34 w G 89 w U 90 w C 106 w A 320 w G 325
w G 326 w A 332 w G 333 w G 439 w G 440 w U 441 w
G 442 w C 444 w G 446 w C 455 w C 456 w A 460 w C
461 w A 471 w A 472 w G 474 w U 475 w G 476 w G
481 w A 507 w G 508 w C 509 w C 1201 w A 1204 w U
1205 w G 1206 w C 1207 w G 1239 w U 1240 w C 1290
w C 1291 w C 1304 w C 1305 w C 1314 w C 1315 w A
1322 w U 1323 w A 1331 w G 1332 w C 1333 w G 1334
w G 1388 w G 1389 w U 1394 w G 1440 w G 1441 w G
1442 w G 1443 w G 1444 w A 1444 w i:B A 1460 w C
1463 w C 1464 w G 1465 w G 1466 w C 1537 w G 1538
w C 1604 w A 1609 w C 1615 w A 1616 w U 1629 w G
1630 w C 1640 w A 1641 w G 1642 w G 1643 w C 1644
w G 1647 w C 1734 w U 1735 w U 2698 w C 2699 w C
2700 w C 2704 w
19 1.94 1.94 279.1 -0.64 -0.76 6.3 77 5 0 0 1 0 1 0  C 32 w U 33 w C 34 w G 89 w U 90 w C 106 w G 325
w G 326 w G 439 w G 440 w U 441 w G 442 w C 444 w
G 446 w C 455 w C 456 w A 460 w C 461 w A 471 w A
472 w G 474 w U 475 w G 476 w G 481 w A 507 w G
508 w C 509 w A 841 w G 842 w G 845 w C 846 w U
930 w G 931 w G 932 w A 933 w G 934 w U 1167 w G
1168 w G 1169 w A 1182 w G 1193 w A 1194 w G 1195
w C 1196 w G 1197 w U 1198 w U 1199 w C 1200 w C
1201 w A 1204 w G 1239 w U 1240 w A 1241 w A 1242
w G 1244 w G 1245 w C 1290 w C 1291 w C 1304 w C
1305 w C 1314 w C 1315 w A 1322 w U 1323 w A 1331
w G 1332 w C 1333 w G 1334 w G 1388 w G 1389 w U
1394 w G 1440 w G 1441 w G 1442 w G 1443 w G 1444
w A 1444 w i:B A 1460 w C 1463 w C 1464 w G 1465
w G 1466 w C 1537 w G 1538 w C 1604 w A 1609 w C
1615 w A 1616 w U 1629 w G 1630 w C 1640 w A 1641
w G 1642 w G 1643 w C 1644 w G 1647 w C 1734 w U
1735 w U 2698 w C 2699 w C 2700 w C 2704 w
20 2.31 2.31 285.9 -0.54 -0.77 5.0 72 5 0 0 0 1 0 0  A 528 w A 529 w G 530 w G 559 w C 560 w G 744 w G
745 w C 749 w C 754 w C 755 w C 756 w G 978 w G
979 w A 980 w A 981 w A 1000 w A 1001 w G 1002 w
G 1003 w C 1004 w C 1008 w A 1009 w C 1135 w G
1136 w C 1145 w C 1146 w C 1147 w G 1149 w C 1150
w A 1268 w A 1269 w A 1272 w U 1273 w A 1274 w C
1298 w A 1302 w C 1304 w C 1305 w C 1314 w C 1315
w G 1332 w G 1388 w G 1389 w U 1394 w G 1440 w G
1441 w G 1442 w G 1443 w G 1444 w A 1444 w i:B A
1460 w C 1463 w C 1464 w G 1465 w G 1466 w C 1537
w G 1538 w C 1604 w G 1606 w A 1608 w A 1609 w A
1610 w A 1618 w G 1619 w U 1629 w G 1630 w A 1637
w C 1640 w A 1641 w G 1642 w G 1643 w C 1644 w G
1645 w C 1646 w C 1656 w C 1657 w C 1658 w U 1659
w C 1734 w U 1735 w G 2003 w G 2004 w A 2005 w G
2037 w G 2038 w C 2040 w U 2041 w A 2042 w C 2043
w G 2046 w U 2047 w G 2048 w G 2049 w C 2050 w U
2613 w A 2614 w U 2615 w C 2616 w C 2617 w G 2618
w C 2619 w C 2620 w C 2622 w G 2640 w G 2641 w U
2698 w C 2699 w C 2700 w C 2704 w U 2712 w G 2777
w A 2778 w U 2779 w G 2780 w C 94 x
21 1.23 1.22 294.7 -0.38 -0.40 9.8 76 13 5 4 18 5 2 0  C 40 w C 237 w C 238 w U 239 w A 320 w A 324 w G
325 w A 332 w G 333 w A 432 w U 441 w G 442 w C
591 w G 592 w G 593 w U 594 w C 595 w G 596 w A
608 w G 609 w i:B A 609 w i:A U 613 w U 614 w G
615 w A 616 w G 622 w G 623 w U 654 w G 656 w U
657 w C 658 w C 659 w C 936 w U 937 w C 1201 w C
1202 w A 1204 w U 1205 w G 1206 w C 1207 w G 1239
w U 1240 w C 2292 w C 2293 w A 2336 w A 2352 w G
2353 w G 2354 w C 2356 w C 2363 w C 2364 w G 2365
w A 2376 w A 2377 w A 2378 w C 2380 w C 2381 w G
2382 w G 2383 w G 2384 w C 2385 w
22 2.16 2.16 298.5 -0.40 -0.55 7.4 78 6 1 1 11 2 2 0  C 40 w C 184 w U 185 w G 186 w C 201 w U 202 w A
204 w G 205 w U 206 w C 236 w C 237 w C 238 w G
254 w A 255 w A 320 w A 324 w G 325 w A 332 w G
333 w G 379 w G 381 w G 382 w U 383 w C 385 w G
386 w U 387 w G 388 w A 432 w C 433 w U 441 w G
442 w A 590 w G 609 w i:B U 613 w U 614 w G 615 w
A 616 w C 1201 w C 1202 w A 1204 w U 1205 w G
1206 w C 1207 w G 1239 w U 1240 w G 1839 w G 1840
w U 1841 w U 1851 w C 1852 w A 1853 w A 1854 w G
1891 w C 1892 w C 1893 w G 1903 w G 1904 w C 1905
w G 1906 w G 1907 w C 1908 w C 1909 w G 1910 w A
1918 w A 1927 w U 1963 w G 1964 w A 1966 w C 1967
w U 2076 w C 2078 w G 2235 w C 2236 w C 2594 w G
2595 w U 2596 w
23 1.70 1.70 297.6 -0.62 -0.66 8.6 77 8 3 1 9 1 1 0  C 151 w G 152 w C 153 w U 164 w U 185 w G 186 w U
206 w G 219 w G 220 w U 235 w C 236 w C 237 w C
238 w U 239 w G 240 w G 254 w A 255 w G 382 w U
383 w U 384 w C 393 w A 394 w U 395 w G 424 w G
425 w C 591 w G 592 w G 593 w U 594 w C 595 w G
596 w G 622 w G 623 w U 654 w G 656 w U 657 w C
658 w C 659 w G 836 w C 837 w U 839 w C 840 w A
841 w G 842 w G 845 w C 846 w U 930 w G 931 w G
932 w A 933 w G 934 w C 935 w C 936 w U 937 w U
1167 w G 1168 w G 1169 w A 1182 w A 1360 w G 1361
w G 1364 w U 1372 w A 1373 w G 1488 w U 1489 w A
1490 w G 1491 w G 1492 w C 1493 w A 1494 w A 1495
w A 1496 w G 1500 w C 1501 w C 1502 w G 1816 w C
2209 w G 2211 w A 2212 w
24 3.08 3.08 317.5 -0.57 -0.68 7.9 75 6 3 1 6 1 1 0  U 185 w G 186 w U 206 w G 219 w G 220 w U 235 w C
236 w C 237 w C 238 w U 239 w G 240 w G 254 w A
255 w A 270 w i:B G 270 w i:S A 371 w G 372 w G
382 w U 383 w U 384 w C 393 w A 394 w U 395 w G
400 w A 401 w A 402 w U 403 w G 424 w G 425 w C
591 w G 592 w G 593 w U 594 w C 595 w G 596 w G
622 w G 623 w U 654 w G 656 w U 657 w C 658 w C
659 w G 836 w C 837 w U 839 w C 840 w A 841 w G
842 w G 845 w C 846 w U 930 w G 931 w G 932 w A
933 w G 934 w C 935 w C 936 w U 937 w U 1167 w G
1168 w G 1169 w A 1182 w G 2090 w G 2093 w G 2094
w U 2096 w C 2097 w U 2098 w U 2099 w G 2100 w G
2101 w U 2102 w C 2103 w C 2105 w C 2107 w C 2108
w U 2109 w A 2119 w G 2120 w G 2121 w U 2122 w G
2123 w G 2124 w G 2125 w A 2171 w U 2172 w A 2173
w C 2174 w C 2175 w A 2176 w C 2177 w C 2178 w C
2179 w U 2180 w G 2182 w C 2183 w G 2184 w C 2185
w G 2186 w C 2188 w U 2189 w G 2190 w
25 1.48 1.39 322.2 -0.54 -0.59 8.4 76 8 6 2 11 1 3 0  U 185 w G 186 w U 206 w G 219 w G 220 w U 235 w C
236 w C 237 w C 238 w U 239 w G 240 w G 254 w A
255 w A 270 w i:B G 270 w i:S A 371 w G 372 w G
382 w U 383 w U 384 w C 393 w A 394 w U 395 w G
400 w A 401 w A 402 w U 403 w G 424 w G 425 w C
591 w G 592 w G 593 w U 594 w C 595 w G 596 w G
622 w G 623 w U 654 w G 656 w U 657 w C 658 w C
659 w G 836 w C 837 w U 839 w C 840 w A 841 w G
842 w G 845 w C 846 w U 930 w G 931 w G 932 w A
933 w G 934 w C 935 w C 936 w U 937 w U 1167 w G
1168 w G 1169 w A 1182 w G 1857 w G 1858 w A 1859
w G 1860 w C 2103 w G 2104 w C 2105 w G 2106 w C
2107 w G 2184 w C 2185 w G 2186 w G 2187 w C 2188
w U 2189 w
26 1.44 1.56 332.8 -0.36 -0.48 8.5 77 9 7 2 20 2 4 0  C 40 w C 184 w U 185 w G 186 w U 206 w G 219 w G
220 w U 235 w C 236 w C 237 w C 238 w G 254 w A
255 w A 270 w i:B G 270 w i:S A 320 w A 324 w G
325 w A 332 w G 333 w A 371 w G 372 w G 382 w U
383 w U 384 w C 393 w A 394 w U 395 w G 400 w A
401 w A 402 w U 403 w G 424 w G 425 w A 432 w C
433 w U 441 w G 442 w A 590 w G 609 w i:B U 613 w
U 614 w G 615 w A 616 w C 1201 w C 1202 w A 1204
w U 1205 w G 1206 w C 1207 w G 1239 w U 1240 w G
1857 w G 1858 w A 1859 w G 1860 w C 2103 w G 2104
w C 2105 w G 2106 w C 2107 w G 2184 w C 2185 w G
2186 w G 2187 w C 2188 w U 2189 w
27 2.52 2.96 328.1 -0.37 -0.54 8.1 76 8 4 1 15 2 2 0  C 40 w C 184 w U 185 w G 186 w U 206 w G 219 w G
220 w U 235 w C 236 w C 237 w C 238 w G 254 w A
255 w A 270 w i:B G 270 w i:S A 320 w A 324 w G
325 w A 332 w G 333 w A 371 w G 372 w G 382 w U
383 w U 384 w C 393 w A 394 w U 395 w G 400 w A
401 w A 402 w U 403 w G 424 w G 425 w A 432 w C
433 w U 441 w G 442 w A 590 w G 609 w i:B U 613 w
U 614 w G 615 w A 616 w C 1201 w C 1202 w A 1204
w U 1205 w G 1206 w C 1207 w G 1239 w U 1240 w G
2090 w G 2093 w G 2094 w U 2096 w C 2097 w U 2098
w U 2099 w G 2100 w G 2101 w U 2102 w C 2103 w C
2105 w C 2107 w C 2108 w U 2109 w A 2119 w G 2120
w G 2121 w U 2122 w G 2123 w G 2124 w G 2125 w A
2171 w U 2172 w A 2173 w C 2174 w C 2175 w A 2176
w C 2177 w C 2178 w C 2179 w U 2180 w G 2182 w C
2183 w G 2184 w C 2185 w G 2186 w C 2188 w U 2189
w G 2190 w
28 2.56 2.53 336.6 -0.60 -0.75 5.1 70 3 3 2 1 2 0 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 12 w A 13 w A 14 w G 521 w
G 522 w C 523 w C 541 w C 542 w G 1839 w G 1840 w
G 1903 w G 1904 w C 1905 w G 1906 w G 1907 w C
1908 w C 1909 w G 1910 w A 1918 w A 1927 w U 1963
w G 1964 w A 1966 w C 1967 w U 2076 w G 2252 w G
2253 w C 2254 w G 2255 w G 2436 w U 2437 w U 2491
w U 2492 w U 2493 w G 2494 w G 2509 w C 2510 w C
2512 w G 2513 w G 2545 w U 2546 w U 2547 w U 2554
w U 2555 w C 2556 w C 2568 w G 2569 w G 2570 w C
2573 w C 2594 w G 2595 w U 2596 w A 2600 w C 2601
w A 2602 w G 2603 w C 2620 w A 2621 w C 2622 w G
2623 w G 2624 w G 2625 w C 2628 w A 2632 w G 2633
w G 2641 w G 2642 w G 2643 w G 2644 w G 2677 w C
2678 w C 2773 w C 2774 w A 2775 w G 2777 w A 2778
w U 2797 w A 2799 w A 2801 w G 2802 w C 2803 w C
2804 w G 2812 w A 2813 w C 2827 w C 2888 w C 2889
w C 2896 w U 2897 w U 2898 w G 2899 w
29 1.70 1.70 340.2 -0.54 -0.77 4.9 80 3 1 2 2 1 1 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 12 w A 13 w A 14 w G 521 w
G 522 w C 523 w C 541 w C 542 w G 744 w G 745 w C
749 w C 754 w C 755 w C 756 w A 1265 w G 1266 w U
1267 w A 1268 w A 1269 w A 1272 w U 1273 w A 1274
w C 1298 w A 1302 w C 1304 w C 1305 w C 1314 w C
1315 w G 1332 w G 1380 w G 1382 w C 1383 w C 1386
w C 1387 w G 1388 w G 1389 w U 1394 w U 1396 w G
1425 w G 1480 w U 1481 w G 1484 w G 1485 w A 1486
w G 1487 w G 1488 w U 1489 w A 1490 w G 1491 w U
1497 w C 1498 w C 1499 w G 1500 w C 1501 w C 1502
w C 1513 w U 1514 w C 1515 w U 1516 w G 1517 w C
1537 w G 1538 w G 1555 w C 1556 w C 1557 w G 1559
w C 1574 w C 1575 w C 1577 w C 1604 w G 1606 w A
1608 w A 1609 w A 1610 w A 1618 w G 1619 w G 1624
w C 1625 w A 1637 w G 1643 w C 1644 w G 1645 w C
1646 w C 1657 w C 1658 w U 1659 w G 2003 w G 2004
w A 2005 w C 2008 w G 2046 w U 2047 w G 2048 w G
2049 w U 2613 w A 2614 w U 2615 w G 2624 w G 2625
w U 2712 w U 2797 w A 2799 w A 2801 w G 2802 w C
2803 w C 2804 w A 2813 w C 2824 w G 2825 w A 2826
w C 2888 w C 2889 w C 2896 w U 2897 w U 2898 w G
2899 w
30 2.42 2.61 387.2 -0.73 -0.64 7.6 75 6 3 3 4 3 1 0  U 9 w G 10 w G 11 w U 12 w A 13 w A 14 w G 521 w
G 522 w C 523 w C 541 w C 542 w U 868 w G 869 w U
877 w A 878 w G 879 w C 889 w A 890 w G 892 w A
899 w A 900 w A 901 w G 2300 w G 2308 w A 2309 w
U 2460 w C 2461 w U 2462 w C 2463 w C 2464 w G
2481 w G 2482 w C 2483 w G 2484 w C 2510 w C 2512
w G 2513 w C 2520 w U 2537 w C 2538 w G 2545 w U
2546 w U 2547 w G 2548 w G 2549 w C 2556 w G 2557
w C 2558 w C 2559 w A 2566 w G 2567 w C 2620 w A
2621 w C 2622 w G 2623 w G 2624 w G 2625 w C 2628
w A 2632 w G 2633 w G 2641 w G 2642 w G 2643 w G
2644 w G 2677 w C 2678 w C 2773 w C 2774 w A 2775
w G 2777 w A 2778 w U 2797 w A 2799 w A 2801 w G
2802 w C 2803 w C 2804 w G 2812 w A 2813 w C 2827
w C 2888 w C 2889 w C 2896 w U 2897 w U 2898 w G
2899 w
31 1.51 2.25 29.5 3.03 0.94 1.8 69 1 0 0 11 1 0 0  
32 1.53 2.25 30.8 2.58 1.19 3.1 73 2 1 0 11 2 0 0  
33 1.57 3.80 37.0 3.05 0.93 3.6 76 0 2 0 14 0 1 0  
34 1.67 3.31 38.2 2.75 1.08 4.3 77 1 3 0 15 1 1 0  

Residue-type_colouring
Positive Negative Neutral Aliphatic Aromatic Pro & Gly Cysteine
H,K,R D,E S,T,N,Q A,V,L,I,M F,Y,W P,G C

Acknowledgement
Pores were calculated by MOLE 2.0 program version 2.5.13.11.08 and visualized using Pymol 0.97rc.
spacer
spacer