data_N6E
#
_chem_comp.id N6E
_chem_comp.name "N6-Methyladenosine 5'-triphosphate"
_chem_comp.type non-polymer
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C11 H18 N5 O13 P3"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2019-11-14
_chem_comp.pdbx_modified_date 2020-09-18
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 521.208
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code N6E
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6TFE
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site PDBE
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
N6E C1 C5 C 0 1 Y N N N N N 22.934 -6.577 14.781 5.662 -1.534 -0.454 C1 N6E 1
N6E C2 C6 C 0 1 Y N N N N N 23.486 -5.394 14.297 6.854 -2.232 -0.195 C2 N6E 2
N6E C3 C2 C 0 1 Y N N N N N 21.647 -4.241 15.116 7.072 -1.056 1.780 C3 N6E 3
N6E C4 C4 C 0 1 Y N N N N N 21.679 -6.513 15.438 5.235 -0.578 0.484 C4 N6E 4
N6E C5 C8 C 0 1 Y N N N N N 22.269 -8.687 15.468 3.814 -0.677 -1.199 C5 N6E 5
N6E C6 C1* C 0 1 N N R N N N 20.307 -8.153 16.493 3.247 0.982 0.615 C6 N6E 6
N6E C7 C2* C 0 1 N N R N N N 19.443 -8.977 15.708 3.728 2.386 0.187 C7 N6E 7
N6E C8 C3* C 0 1 N N S N N N 19.587 -10.348 16.163 2.425 3.204 0.048 C8 N6E 8
N6E C9 C4* C 0 1 N N R N N N 19.881 -10.278 17.601 1.310 2.197 0.408 C9 N6E 9
N6E C10 C5* C 0 1 N N N N N N 20.562 -11.475 18.114 0.080 2.426 -0.473 C10 N6E 10
N6E C11 CAA C 0 1 N N N N N N 25.283 -4.123 13.039 8.571 -3.898 -0.798 C11 N6E 11
N6E N1 N1 N 0 1 Y N N N N N 22.822 -4.267 14.474 7.516 -1.960 0.924 N1 N6E 12
N6E N2 N3 N 0 1 Y N N N N N 21.109 -5.356 15.557 5.966 -0.373 1.575 N2 N6E 13
N6E N3 N6 N 0 1 N N N N N N 24.779 -5.373 13.600 7.327 -3.180 -1.085 N3 N6E 14
N6E N4 N7 N 0 1 Y N N N N N 23.311 -8.056 14.811 4.750 -1.544 -1.456 N4 N6E 15
N6E N5 N9 N 0 1 Y N N N N N 21.455 -7.757 15.752 4.069 -0.055 -0.014 N5 N6E 16
N6E O1 O2* O 0 1 N N N N N N 18.069 -8.521 15.944 4.571 2.954 1.192 O1 N6E 17
N6E O2 O3* O 0 1 N N N N N N 18.348 -11.058 15.907 2.422 4.302 0.963 O2 N6E 18
N6E O3 O4* O 0 1 N N N N N N 20.728 -8.990 17.775 1.885 0.899 0.142 O3 N6E 19
N6E O4 O5* O 0 1 N N N N N N 19.939 -11.724 19.366 -0.978 1.565 -0.047 O4 N6E 20
N6E O5 OAU O 0 1 N N N N N N 20.306 -14.136 20.222 -2.261 1.290 -2.203 O5 N6E 21
N6E O6 OAW O 0 1 N N N N N N 20.185 -12.503 21.788 -3.156 2.956 -0.531 O6 N6E 22
N6E O7 OAX O 0 1 N N N N N N 22.311 -12.574 20.408 -3.317 0.367 -0.105 O7 N6E 23
N6E O8 OAY O 0 1 N N N N N N 22.933 -12.666 22.879 -4.191 -1.595 -1.621 O8 N6E 24
N6E O9 OBA O 0 1 N N N N N N 24.595 -13.256 21.424 -5.562 0.491 -1.251 O9 N6E 25
N6E O10 OBB O 0 1 N N N N N N 22.602 -14.910 21.677 -5.344 -1.107 0.690 O10 N6E 26
N6E O11 OBC O 0 1 N N N N N N 22.350 -16.132 23.986 -7.895 -0.582 1.050 O11 N6E 27
N6E O12 OBE O 0 1 N N N N N N 20.524 -16.271 22.540 -7.140 -2.652 -0.181 O12 N6E 28
N6E O13 OBF O 0 1 N N N N N N 20.995 -14.293 23.634 -6.776 -2.597 2.316 O13 N6E 29
N6E P1 PAV P 0 1 N N N N N N 20.673 -12.741 20.440 -2.425 1.539 -0.753 P1 N6E 30
N6E P2 PAZ P 0 1 N N N N N N 23.149 -13.354 21.598 -4.624 -0.441 -0.586 P2 N6E 31
N6E P3 PBD P 0 1 N N N N N N 21.637 -15.405 22.928 -6.796 -1.754 0.944 P3 N6E 32
N6E H1 H21 H 0 1 N N N N N N 21.140 -3.300 15.272 7.642 -0.865 2.677 H1 N6E 33
N6E H2 H81 H 0 1 N N N N N N 22.171 -9.739 15.690 2.962 -0.479 -1.833 H2 N6E 34
N6E H3 H1*1 H 0 1 N N N N N N 19.760 -7.263 16.839 3.278 0.884 1.700 H3 N6E 35
N6E H4 H2*1 H 0 1 N N N N N N 19.692 -8.898 14.639 4.253 2.336 -0.766 H4 N6E 36
N6E H5 H3*1 H 0 1 N N N N N N 20.419 -10.836 15.635 2.303 3.558 -0.975 H5 N6E 37
N6E H6 H4*1 H 0 1 N N N N N N 18.939 -10.140 18.152 1.044 2.286 1.462 H6 N6E 38
N6E H7 H5*2 H 0 1 N N N N N N 20.420 -12.326 17.432 -0.240 3.465 -0.388 H7 N6E 39
N6E H8 H5*1 H 0 1 N N N N N N 21.638 -11.285 18.245 0.331 2.207 -1.511 H8 N6E 40
N6E H9 HAA2 H 0 1 N N N N N N 26.257 -4.302 12.560 9.391 -3.184 -0.713 H9 N6E 41
N6E H10 HAA1 H 0 1 N N N N N N 24.571 -3.743 12.292 8.467 -4.445 0.140 H10 N6E 42
N6E H11 HAA3 H 0 1 N N N N N N 25.401 -3.382 13.843 8.781 -4.599 -1.606 H11 N6E 43
N6E H12 H61 H 0 1 N N N N N N 24.710 -6.023 12.843 6.834 -3.370 -1.898 H12 N6E 44
N6E H13 H2*2 H 0 1 N N N N N N 17.977 -7.624 15.646 4.853 3.859 1.003 H13 N6E 45
N6E H14 H3*2 H 0 1 N N N N N N 18.431 -11.957 16.201 3.140 4.935 0.820 H14 N6E 46
N6E H15 H1 H 0 1 N N N N N N 19.783 -13.295 22.124 -3.296 3.185 0.398 H15 N6E 47
N6E H16 H2 H 0 1 N N N N N N 23.766 -12.362 23.220 -3.575 -2.243 -1.253 H16 N6E 48
N6E H17 H3 H 0 1 N N N N N N 21.917 -16.962 24.147 -7.733 0.045 1.768 H17 N6E 49
N6E H18 H4 H 0 1 N N N N N N 20.055 -14.428 23.650 -7.620 -3.016 2.533 H18 N6E 50
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
N6E C11 N3 SING N N 1
N6E N3 C2 SING N N 2
N6E C2 N1 DOUB Y N 3
N6E C2 C1 SING Y N 4
N6E N1 C3 SING Y N 5
N6E C1 N4 SING Y N 6
N6E C1 C4 DOUB Y N 7
N6E N4 C5 DOUB Y N 8
N6E C3 N2 DOUB Y N 9
N6E C4 N2 SING Y N 10
N6E C4 N5 SING Y N 11
N6E C5 N5 SING Y N 12
N6E C7 O1 SING N N 13
N6E C7 C8 SING N N 14
N6E C7 C6 SING N N 15
N6E N5 C6 SING N N 16
N6E O2 C8 SING N N 17
N6E C8 C9 SING N N 18
N6E C6 O3 SING N N 19
N6E C9 O3 SING N N 20
N6E C9 C10 SING N N 21
N6E C10 O4 SING N N 22
N6E O4 P1 SING N N 23
N6E O5 P1 DOUB N N 24
N6E O7 P1 SING N N 25
N6E O7 P2 SING N N 26
N6E P1 O6 SING N N 27
N6E O9 P2 DOUB N N 28
N6E P2 O10 SING N N 29
N6E P2 O8 SING N N 30
N6E O10 P3 SING N N 31
N6E O12 P3 DOUB N N 32
N6E P3 O13 SING N N 33
N6E P3 O11 SING N N 34
N6E C3 H1 SING N N 35
N6E C5 H2 SING N N 36
N6E C6 H3 SING N N 37
N6E C7 H4 SING N N 38
N6E C8 H5 SING N N 39
N6E C9 H6 SING N N 40
N6E C10 H7 SING N N 41
N6E C10 H8 SING N N 42
N6E C11 H9 SING N N 43
N6E C11 H10 SING N N 44
N6E C11 H11 SING N N 45
N6E N3 H12 SING N N 46
N6E O1 H13 SING N N 47
N6E O2 H14 SING N N 48
N6E O6 H15 SING N N 49
N6E O8 H16 SING N N 50
N6E O11 H17 SING N N 51
N6E O13 H18 SING N N 52
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
N6E InChI InChI 1.03 InChI=1S/C11H18N5O13P3/c1-12-9-6-10(14-3-13-9)16(4-15-6)11-8(18)7(17)5(27-11)2-26-31(22,23)29-32(24,25)28-30(19,20)21/h3-5,7-8,11,17-18H,2H2,1H3,(H,22,23)(H,24,25)(H,12,13,14)(H2,19,20,21)/t5-,7-,8-,11-/m1/s1
N6E InChIKey InChI 1.03 LCQWKKZWHQFOAH-IOSLPCCCSA-N
N6E SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 CNc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]3O
N6E SMILES CACTVS 3.385 CNc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]3O
N6E SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 CNc1c2c(ncn1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O
N6E SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 CNc1c2c(ncn1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O
#
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id N6E
_pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME"
_pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits"
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
"[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[6-(methylamino)purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
N6E 'Create component' 2019-11-14 PDBE
N6E 'Initial release' 2020-09-23 RCSB
#
loop_
_software.name
_software.version
_software.description
rdkit 2025.03.3 'Core functionality.'
pdbeccdutils 1.0.0 'Wrapper to provide 2D templates and molecular fragments.'
#
loop_
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.atom_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.element
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_x
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_y
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.pdbx_ordinal
N6E C1 C 5.598 -2.940 1
N6E C2 C 4.299 -3.690 2
N6E C3 C 3.000 -1.440 3
N6E C4 C 5.598 -1.440 4
N6E C5 C 7.893 -2.190 5
N6E C6 C 7.483 0.443 6
N6E C7 C 6.604 1.658 7
N6E C8 C 7.487 2.870 8
N6E C9 C 8.913 2.404 9
N6E C10 C 10.129 3.283 10
N6E C11 C 3.000 -5.940 11
N6E N1 N 3.000 -2.940 12
N6E N2 N 4.299 -0.690 13
N6E N3 N 4.299 -5.190 14
N6E N4 N 7.018 -3.397 15
N6E N5 N 7.018 -0.983 16
N6E O1 O 5.104 1.660 17
N6E O2 O 7.027 4.297 18
N6E O3 O 8.911 0.904 19
N6E O4 O 11.498 2.671 20
N6E O5 O 13.592 2.335 21
N6E O6 O 11.833 4.766 22
N6E O7 O 13.928 4.430 23
N6E O8 O 14.684 2.448 24
N6E O9 O 15.909 5.187 25
N6E O10 O 16.666 3.205 26
N6E O11 O 17.002 5.300 27
N6E O12 O 19.096 4.964 28
N6E O13 O 18.761 2.870 29
N6E P1 P 12.713 3.550 30
N6E P2 P 15.297 3.817 31
N6E P3 P 17.881 4.085 32
#
loop_
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_1
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_2
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.value_order
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.bond_dir
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.pdbx_ordinal
N6E C11 N3 SINGLE NONE 1
N6E N3 C2 SINGLE NONE 2
N6E C2 N1 DOUBLE NONE 3
N6E C2 C1 SINGLE NONE 4
N6E N1 C3 SINGLE NONE 5
N6E C1 N4 SINGLE NONE 6
N6E C1 C4 DOUBLE NONE 7
N6E N4 C5 DOUBLE NONE 8
N6E C3 N2 DOUBLE NONE 9
N6E C4 N2 SINGLE NONE 10
N6E C4 N5 SINGLE NONE 11
N6E C5 N5 SINGLE NONE 12
N6E C7 O1 SINGLE BEGINDASH 13
N6E C7 C8 SINGLE NONE 14
N6E C7 C6 SINGLE NONE 15
N6E C6 N5 SINGLE BEGINWEDGE 16
N6E C8 O2 SINGLE BEGINDASH 17
N6E C8 C9 SINGLE NONE 18
N6E C6 O3 SINGLE NONE 19
N6E C9 O3 SINGLE NONE 20
N6E C9 C10 SINGLE BEGINWEDGE 21
N6E C10 O4 SINGLE NONE 22
N6E O4 P1 SINGLE NONE 23
N6E O5 P1 DOUBLE NONE 24
N6E O7 P1 SINGLE NONE 25
N6E O7 P2 SINGLE NONE 26
N6E P1 O6 SINGLE BEGINWEDGE 27
N6E O9 P2 DOUBLE NONE 28
N6E P2 O10 SINGLE NONE 29
N6E P2 O8 SINGLE BEGINWEDGE 30
N6E O10 P3 SINGLE NONE 31
N6E O12 P3 DOUBLE NONE 32
N6E P3 O13 SINGLE NONE 33
N6E P3 O11 SINGLE NONE 34
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_name
_pdbe_chem_comp_substructure.id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_type
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_smiles
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchis
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchikeys
N6E MurckoScaffold S1 scaffold 'c1ncc2ncn([C@H]3CCCO3)c2n1' InChI=1S/C9H10N4O/c1-2-8(14-3-1)13-6-12-7-4-10-5-11-9(7)13/h4-6,8H,1-3H2/t8-/m1/s1 DAKONNSVCLKUJN-MRVPVSSYSA-N
N6E adenine F1 fragment 'Nc1ncnc2nc[nH]c12' InChI=1S/C5H5N5/c6-4-3-5(9-1-7-3)10-2-8-4/h1-2H,(H3,6,7,8,9,10) GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N
N6E imidazole F2 fragment 'c1c[nH]cn1' InChI=1S/C3H4N2/c1-2-5-3-4-1/h1-3H,(H,4,5) RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N
N6E phosphate F3 fragment O=P(O)(O)O InChI=1S/H3O4P/c1-5(2,3)4/h(H3,1,2,3,4) NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N
N6E purine F4 fragment 'c1ncc2[nH]cnc2n1' InChI=1S/C5H4N4/c1-4-5(8-2-6-1)9-3-7-4/h1-3H,(H,6,7,8,9) KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N
N6E pyrimidine F5 fragment c1cncnc1 InChI=1S/C4H4N2/c1-2-5-4-6-3-1/h1-4H CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N
N6E ribose F6 fragment OCC1OCC(O)C1O InChI=1S/C5H10O4/c6-1-4-5(8)3(7)2-9-4/h3-8H,1-2H2 KZVAAIRBJJYZOW-UHFFFAOYSA-N
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.atom_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_ordinal
N6E C1 S1 1
N6E C2 S1 1
N6E C3 S1 1
N6E C4 S1 1
N6E C5 S1 1
N6E C6 S1 1
N6E C7 S1 1
N6E C8 S1 1
N6E C9 S1 1
N6E N1 S1 1
N6E N2 S1 1
N6E N4 S1 1
N6E N5 S1 1
N6E O3 S1 1
N6E N1 F1 1
N6E C2 F1 1
N6E C1 F1 1
N6E C4 F1 1
N6E N2 F1 1
N6E C3 F1 1
N6E N5 F1 1
N6E C5 F1 1
N6E N4 F1 1
N6E N3 F1 1
N6E C1 F2 1
N6E C4 F2 1
N6E N5 F2 1
N6E C5 F2 1
N6E N4 F2 1
N6E O4 F3 1
N6E P1 F3 1
N6E O5 F3 1
N6E O7 F3 1
N6E O6 F3 1
N6E O7 F3 2
N6E P2 F3 2
N6E O9 F3 2
N6E O10 F3 2
N6E O8 F3 2
N6E O10 F3 3
N6E P3 F3 3
N6E O12 F3 3
N6E O13 F3 3
N6E O11 F3 3
N6E N4 F4 1
N6E C5 F4 1
N6E N5 F4 1
N6E C4 F4 1
N6E C1 F4 1
N6E C2 F4 1
N6E N1 F4 1
N6E C3 F4 1
N6E N2 F4 1
N6E C1 F5 1
N6E C2 F5 1
N6E N1 F5 1
N6E C3 F5 1
N6E N2 F5 1
N6E C4 F5 1
N6E C7 F6 1
N6E C8 F6 1
N6E C9 F6 1
N6E O3 F6 1
N6E C6 F6 1
N6E C10 F6 1
N6E O4 F6 1
N6E O2 F6 1
N6E O1 F6 1
#
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.comp_id N6E
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.exactmw 521.011
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.amw 521.209
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.lipinskiHBA 18
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.lipinskiHBD 7
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumRotatableBonds 16
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHBD 7
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHBA 18
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeavyAtoms 32
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAtoms 50
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeteroatoms 21
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAmideBonds 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.FractionCSP3 0.545
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumRings 3
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAromaticRings 2
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAliphaticRings 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSaturatedRings 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeterocycles 3
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAromaticHeterocycles 2
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSaturatedHeterocycles 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAliphaticHeterocycles 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSpiroAtoms 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumBridgeheadAtoms 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAtomStereoCenters 6
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumUnspecifiedAtomStereoCenters 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.labuteASA 203.661
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.tpsa 265.140
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.CrippenClogP -1.979
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.CrippenMR 97.580
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi0v 17.068
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi1v 11.553
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi2v 6.488
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi3v 6.488
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi4v 4.602
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi0n 32.385
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi1n 15.568
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi2n 2.974
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi3n 2.974
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi4n 1.926
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.hallKierAlpha -1.360
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa1 10.497
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa2 9.117
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa3 5.759
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.Phi 2.991
#
loop_
_pdbe_chem_comp_external_mappings.comp_id
_pdbe_chem_comp_external_mappings.source
_pdbe_chem_comp_external_mappings.resource
_pdbe_chem_comp_external_mappings.resource_id
N6E UniChem ZINC ZINC000049774268
N6E UniChem SureChEMBL SCHEMBL624619
N6E UniChem BindingDb 50318030
N6E UniChem BRENDA 157489
N6E UniChem BRENDA 26039
N6E UniChem BRENDA 44565
N6E UniChem BRENDA 78489
N6E UniChem BRENDA 92041
N6E UniChem ChemicalBook CB33141312
N6E UniChem 'PubChem TPHARMA' 117643067
N6E UniChem PubChem 23279502
N6E UniChem Nikkaji J580.134F
#
loop_
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.comp_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.atom_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_x_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_y_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_z_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_method
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_ordinal
N6E C1 -4.214 0.532 -0.419 ETKDGv3 1
N6E C2 -5.377 1.201 0.181 ETKDGv3 2
N6E C3 -5.933 -0.928 1.154 ETKDGv3 3
N6E C4 -4.014 -0.739 -0.199 ETKDGv3 4
N6E C5 -2.281 0.111 -1.255 ETKDGv3 5
N6E C6 -1.958 -2.262 -0.261 ETKDGv3 6
N6E C7 -1.034 -2.792 -1.362 ETKDGv3 7
N6E C8 0.321 -2.243 -0.978 ETKDGv3 8
N6E C9 0.178 -1.991 0.525 ETKDGv3 9
N6E C10 0.935 -0.739 0.980 ETKDGv3 10
N6E C11 -6.760 3.283 0.559 ETKDGv3 11
N6E N1 -6.181 0.481 0.920 ETKDGv3 12
N6E N2 -4.890 -1.514 0.629 ETKDGv3 13
N6E N3 -5.618 2.597 -0.032 ETKDGv3 14
N6E N4 -3.104 1.106 -1.095 ETKDGv3 15
N6E N5 -2.768 -1.140 -0.739 ETKDGv3 16
N6E O1 -1.045 -4.201 -1.400 ETKDGv3 17
N6E O2 1.345 -3.164 -1.254 ETKDGv3 18
N6E O3 -1.189 -1.845 0.846 ETKDGv3 19
N6E O4 2.310 -0.897 0.724 ETKDGv3 20
N6E O5 3.172 0.404 2.833 ETKDGv3 21
N6E O6 2.370 1.906 0.845 ETKDGv3 22
N6E O7 4.743 0.442 0.755 ETKDGv3 23
N6E O8 4.248 2.323 -1.256 ETKDGv3 24
N6E O9 3.731 -0.210 -1.600 ETKDGv3 25
N6E O10 6.253 0.407 -1.576 ETKDGv3 26
N6E O11 7.193 1.843 0.645 ETKDGv3 27
N6E O12 7.019 2.922 -1.737 ETKDGv3 28
N6E O13 8.901 1.155 -1.401 ETKDGv3 29
N6E P1 3.138 0.470 1.322 ETKDGv3 30
N6E P2 4.711 0.725 -0.927 ETKDGv3 31
N6E P3 7.317 1.619 -1.030 ETKDGv3 32
N6E H1 -6.610 -1.495 1.779 ETKDGv3 33
N6E H2 -1.311 0.233 -1.717 ETKDGv3 34
N6E H3 -2.644 -3.074 0.070 ETKDGv3 35
N6E H4 -1.335 -2.416 -2.365 ETKDGv3 36
N6E H5 0.495 -1.292 -1.535 ETKDGv3 37
N6E H6 0.569 -2.867 1.090 ETKDGv3 38
N6E H7 0.751 -0.605 2.071 ETKDGv3 39
N6E H8 0.528 0.139 0.429 ETKDGv3 40
N6E H9 -7.704 2.820 0.201 ETKDGv3 41
N6E H10 -6.709 3.215 1.666 ETKDGv3 42
N6E H11 -6.751 4.354 0.264 ETKDGv3 43
N6E H12 -4.957 3.145 -0.628 ETKDGv3 44
N6E H13 -0.796 -4.538 -0.499 ETKDGv3 45
N6E H14 2.198 -2.658 -1.232 ETKDGv3 46
N6E H15 1.687 2.080 1.540 ETKDGv3 47
N6E H16 4.561 2.848 -0.477 ETKDGv3 48
N6E H17 7.503 0.989 1.038 ETKDGv3 49
N6E H18 9.006 0.262 -0.986 ETKDGv3 50
#