data_M7G
#
_chem_comp.id M7G
_chem_comp.name "7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE"
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C11 H18 N5 O11 P2"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 1
_chem_comp.pdbx_initial_date 1999-07-08
_chem_comp.pdbx_modified_date 2024-02-21
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces MDG
_chem_comp.formula_weight 458.235
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 1EJ1
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site RCSB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
M7G PA PA P 0 1 N N N N N N 4.418 11.773 14.326 -3.923 0.620 -0.367 PA M7G 1
M7G O1A O1A O 0 1 N N N N N N 4.950 11.847 12.934 -3.792 -0.038 -1.686 O1A M7G 2
M7G O2A O2A O 0 1 N N N N N N 4.818 10.458 14.881 -4.841 1.934 -0.512 O2A M7G 3
M7G O3A O3A O 0 1 N N N N N N 5.080 12.946 15.243 -4.606 -0.399 0.676 O3A M7G 4
M7G "O5'" "O5'" O 0 1 N N N N N N 2.779 11.869 14.344 -2.465 1.040 0.171 "O5'" M7G 5
M7G PB PB P 0 1 N N N N N N 4.651 14.509 15.233 -5.803 -1.471 0.571 PB M7G 6
M7G O1B O1B O 0 1 N N N N N N 4.732 15.083 13.864 -5.649 -2.263 -0.669 O1B M7G 7
M7G O2B O2B O 0 1 N N N N N N 5.611 15.230 16.108 -5.757 -2.454 1.845 O2B M7G 8
M7G O3B O3B O 0 1 N N N N N N 3.265 14.672 15.747 -7.215 -0.697 0.541 O3B M7G 9
M7G "C5'" "C5'" C 0 1 N N N N N N 2.039 12.541 13.352 -1.562 1.854 -0.581 "C5'" M7G 10
M7G "C4'" "C4'" C 0 1 N N R N N N 0.814 11.828 12.892 -0.274 2.059 0.218 "C4'" M7G 11
M7G "O4'" "O4'" O 0 1 N N N N N N 1.216 10.800 11.925 0.421 0.809 0.356 "O4'" M7G 12
M7G "C3'" "C3'" C 0 1 N N S N N N 0.143 10.948 13.900 0.662 3.023 -0.537 "C3'" M7G 13
M7G "O3'" "O3'" O 0 1 N N N N N N -0.626 11.721 14.854 0.933 4.181 0.255 "O3'" M7G 14
M7G "C2'" "C2'" C 0 1 N N R N N N -0.812 10.162 12.968 1.957 2.201 -0.754 "C2'" M7G 15
M7G "O2'" "O2'" O 0 1 N N N N N N -1.840 11.016 12.387 3.115 3.009 -0.538 "O2'" M7G 16
M7G "C1'" "C1'" C 0 1 N N R N N N 0.231 9.736 11.939 1.833 1.107 0.336 "C1'" M7G 17
M7G N9 N9 N 0 1 Y N N N N N 1.103 8.581 12.346 2.606 -0.081 -0.036 N9 M7G 18
M7G C8 C8 C 0 1 Y N N N N N 2.255 8.468 13.018 2.147 -1.152 -0.747 C8 M7G 19
M7G N7 N7 N 1 1 Y N N N N N 2.546 7.200 13.107 3.101 -2.024 -0.895 N7 M7G 20
M7G CM7 CM7 C 0 1 N N N N N N 3.715 6.625 13.762 2.980 -3.300 -1.604 CM7 M7G 21
M7G C5 C5 C 0 1 Y N N N N N 1.539 6.346 12.451 4.225 -1.567 -0.291 C5 M7G 22
M7G C6 C6 C 0 1 N N N N N N 1.359 5.107 12.262 5.536 -2.076 -0.133 C6 M7G 23
M7G O6 O6 O 0 1 N N N N N N 2.153 4.183 12.691 5.846 -3.158 -0.601 O6 M7G 24
M7G N1 N1 N 0 1 N N N N N N 0.186 4.886 11.550 6.435 -1.332 0.548 N1 M7G 25
M7G C2 C2 C 0 1 N N N N N N -0.681 5.853 11.090 6.077 -0.123 1.066 C2 M7G 26
M7G N2 N2 N 0 1 N N N N N N -1.753 5.491 10.421 7.012 0.611 1.753 N2 M7G 27
M7G N3 N3 N 0 1 N N N N N N -0.476 7.133 11.294 4.863 0.361 0.927 N3 M7G 28
M7G C4 C4 C 0 1 Y N N N N N 0.663 7.369 12.000 3.921 -0.317 0.260 C4 M7G 29
M7G HOA2 HOA2 H 0 0 N N N N N N 5.313 9.976 14.229 -4.970 2.417 0.316 HOA2 M7G 30
M7G HOB2 HOB2 H 0 0 N N N N N N 6.063 15.895 15.602 -6.451 -3.127 1.849 HOB2 M7G 31
M7G HOB3 HOB3 H 0 0 N N N N N N 2.733 15.107 15.091 -7.384 -0.156 1.325 HOB3 M7G 32
M7G "H5'1" "H5'1" H 0 0 N N N N N N 1.734 13.518 13.756 -1.330 1.361 -1.525 "H5'1" M7G 33
M7G "H5'2" "H5'2" H 0 0 N N N N N N 2.694 12.692 12.481 -2.025 2.820 -0.780 "H5'2" M7G 34
M7G "H4'" "H4'" H 0 1 N N N N N N 0.094 12.532 12.448 -0.509 2.463 1.203 "H4'" M7G 35
M7G "H3'" "H3'" H 0 1 N N N N N N 0.859 10.271 14.389 0.225 3.309 -1.493 "H3'" M7G 36
M7G "HO3'" "HO3'" H 0 0 N N N N N N -1.038 11.135 15.478 1.518 4.822 -0.171 "HO3'" M7G 37
M7G "H2'" "H2'" H 0 1 N N N N N N -1.238 9.291 13.487 1.974 1.759 -1.750 "H2'" M7G 38
M7G "HO2'" "HO2'" H 0 0 N N N N N N -2.403 10.497 11.824 3.188 3.762 -1.140 "HO2'" M7G 39
M7G "H1'" "H1'" H 0 1 N N N N N N -0.225 9.572 10.952 2.159 1.490 1.303 "H1'" M7G 40
M7G H81 H81 H 0 1 N N N N N N 2.840 9.283 13.416 1.143 -1.260 -1.129 H81 M7G 41
M7G HM71 HM71 H 0 0 N N N N N N 3.685 5.529 13.672 3.234 -3.158 -2.655 HM71 M7G 42
M7G HM72 HM72 H 0 0 N N N N N N 4.629 7.007 13.283 3.661 -4.028 -1.162 HM72 M7G 43
M7G HM73 HM73 H 0 0 N N N N N N 3.714 6.905 14.826 1.956 -3.665 -1.524 HM73 M7G 44
M7G HN1 HN1 H 0 1 N N N N N N -0.051 3.935 11.353 7.340 -1.660 0.669 HN1 M7G 45
M7G HN21 HN21 H 0 0 N N N N N N -2.388 6.185 10.082 7.912 0.267 1.864 HN21 M7G 46
M7G HN22 HN22 H 0 0 N N N N N N -1.933 4.522 10.252 6.772 1.473 2.128 HN22 M7G 47
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
M7G PA O1A DOUB N N 1
M7G PA O2A SING N N 2
M7G PA O3A SING N N 3
M7G PA "O5'" SING N N 4
M7G O2A HOA2 SING N N 5
M7G O3A PB SING N N 6
M7G "O5'" "C5'" SING N N 7
M7G PB O1B DOUB N N 8
M7G PB O2B SING N N 9
M7G PB O3B SING N N 10
M7G O2B HOB2 SING N N 11
M7G O3B HOB3 SING N N 12
M7G "C5'" "C4'" SING N N 13
M7G "C5'" "H5'1" SING N N 14
M7G "C5'" "H5'2" SING N N 15
M7G "C4'" "O4'" SING N N 16
M7G "C4'" "C3'" SING N N 17
M7G "C4'" "H4'" SING N N 18
M7G "O4'" "C1'" SING N N 19
M7G "C3'" "O3'" SING N N 20
M7G "C3'" "C2'" SING N N 21
M7G "C3'" "H3'" SING N N 22
M7G "O3'" "HO3'" SING N N 23
M7G "C2'" "O2'" SING N N 24
M7G "C2'" "C1'" SING N N 25
M7G "C2'" "H2'" SING N N 26
M7G "O2'" "HO2'" SING N N 27
M7G "C1'" N9 SING N N 28
M7G "C1'" "H1'" SING N N 29
M7G N9 C8 SING Y N 30
M7G N9 C4 SING Y N 31
M7G C8 N7 DOUB Y N 32
M7G C8 H81 SING N N 33
M7G N7 CM7 SING N N 34
M7G N7 C5 SING Y N 35
M7G CM7 HM71 SING N N 36
M7G CM7 HM72 SING N N 37
M7G CM7 HM73 SING N N 38
M7G C5 C6 SING N N 39
M7G C5 C4 DOUB Y N 40
M7G C6 O6 DOUB N N 41
M7G C6 N1 SING N N 42
M7G N1 C2 SING N N 43
M7G N1 HN1 SING N N 44
M7G C2 N2 SING N N 45
M7G C2 N3 DOUB N N 46
M7G N2 HN21 SING N N 47
M7G N2 HN22 SING N N 48
M7G N3 C4 SING N N 49
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
M7G SMILES ACDLabs 12.01 O=P(O)(O)OP(=O)(O)OCC1OC(n2c[n+](C)c3c2N=C(N)NC3=O)C(O)C1O
M7G InChI InChI 1.06 InChI=1S/C11H17N5O11P2/c1-15-3-16(8-5(15)9(19)14-11(12)13-8)10-7(18)6(17)4(26-10)2-25-29(23,24)27-28(20,21)22/h3-4,6-7,10,17-18H,2H2,1H3,(H5-,12,13,14,19,20,21,22,23,24)/p+1/t4-,6-,7-,10-/m1/s1
M7G InChIKey InChI 1.06 SBASPRRECYVBRF-KQYNXXCUSA-O
M7G SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 C[n+]1cn([C@@H]2O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O)c3N=C(N)NC(=O)c13
M7G SMILES CACTVS 3.385 C[n+]1cn([CH]2O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]2O)c3N=C(N)NC(=O)c13
M7G SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 C[n+]1cn(c2c1C(=O)NC(=N2)N)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O
M7G SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 C[n+]1cn(c2c1C(=O)NC(=N2)N)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
M7G "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "7-methylguanosine 5'-(trihydrogen diphosphate)"
M7G "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-7-methyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-7-ium-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
M7G 'Create component' 1999-07-08 RCSB
M7G 'Modify descriptor' 2011-06-04 RCSB
M7G 'Other modification' 2024-02-21 RCSB
#
loop_
_software.name
_software.version
_software.description
rdkit 2025.03.3 'Core functionality.'
pdbeccdutils 1.0.0 'Wrapper to provide 2D templates and molecular fragments.'
#
loop_
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.atom_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.element
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_x
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_y
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.pdbx_ordinal
M7G PA P 14.817 3.175 1
M7G O1A O 15.697 1.960 2
M7G O2A O 13.938 4.391 3
M7G O3A O 16.032 4.055 4
M7G "O5'" O 13.602 2.296 5
M7G PB P 17.401 3.442 6
M7G O1B O 18.771 2.830 7
M7G O2B O 18.014 4.812 8
M7G O3B O 16.789 2.073 9
M7G "C5'" C 12.233 2.908 10
M7G "C4'" C 11.018 2.029 11
M7G "O4'" O 11.015 0.529 12
M7G "C3'" C 9.592 2.495 13
M7G "O3'" O 9.131 3.922 14
M7G "C2'" C 8.708 1.283 15
M7G "O2'" O 7.208 1.285 16
M7G "C1'" C 9.588 0.068 17
M7G N9 N 9.122 -1.358 18
M7G C8 C 9.997 -2.565 19
M7G N7 N 9.122 -3.772 20
M7G CM7 C 9.588 -5.198 21
M7G C5 C 7.702 -3.315 22
M7G C6 C 6.404 -4.065 23
M7G O6 O 6.404 -5.565 24
M7G N1 N 5.104 -3.315 25
M7G C2 C 5.104 -1.815 26
M7G N2 N 3.805 -1.065 27
M7G N3 N 6.404 -1.065 28
M7G C4 C 7.702 -1.815 29
#
loop_
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_1
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_2
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.value_order
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.bond_dir
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.pdbx_ordinal
M7G PA O1A DOUBLE NONE 1
M7G PA O2A SINGLE BEGINWEDGE 2
M7G PA O3A SINGLE NONE 3
M7G PA "O5'" SINGLE NONE 4
M7G O3A PB SINGLE NONE 5
M7G "O5'" "C5'" SINGLE NONE 6
M7G PB O1B DOUBLE NONE 7
M7G PB O2B SINGLE NONE 8
M7G PB O3B SINGLE NONE 9
M7G "C4'" "C5'" SINGLE BEGINWEDGE 10
M7G "C4'" "O4'" SINGLE NONE 11
M7G "C4'" "C3'" SINGLE NONE 12
M7G "O4'" "C1'" SINGLE NONE 13
M7G "C3'" "O3'" SINGLE BEGINDASH 14
M7G "C3'" "C2'" SINGLE NONE 15
M7G "C2'" "O2'" SINGLE BEGINDASH 16
M7G "C2'" "C1'" SINGLE NONE 17
M7G "C1'" N9 SINGLE BEGINWEDGE 18
M7G N9 C8 SINGLE NONE 19
M7G N9 C4 SINGLE NONE 20
M7G C8 N7 DOUBLE NONE 21
M7G N7 CM7 SINGLE NONE 22
M7G N7 C5 SINGLE NONE 23
M7G C5 C6 SINGLE NONE 24
M7G C5 C4 DOUBLE NONE 25
M7G C6 O6 DOUBLE NONE 26
M7G C6 N1 SINGLE NONE 27
M7G N1 C2 SINGLE NONE 28
M7G C2 N2 SINGLE NONE 29
M7G C2 N3 DOUBLE NONE 30
M7G N3 C4 SINGLE NONE 31
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_name
_pdbe_chem_comp_substructure.id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_type
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_smiles
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchis
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchikeys
M7G MurckoScaffold S1 scaffold 'O=c1[nH]cnc2c1[nH+]cn2[C@H]1CCCO1' InChI=1S/C9H10N4O2/c14-9-7-8(10-4-11-9)13(5-12-7)6-2-1-3-15-6/h4-6H,1-3H2,(H,10,11,14)/p+1/t6-/m1/s1 JBXHFRZBULGPSC-ZCFIWIBFSA-O
M7G imidazole F1 fragment 'c1c[nH]cn1' InChI=1S/C3H4N2/c1-2-5-3-4-1/h1-3H,(H,4,5) RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N
M7G phosphate F2 fragment O=P(O)(O)O InChI=1S/H3O4P/c1-5(2,3)4/h(H3,1,2,3,4) NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N
M7G purine F3 fragment 'c1ncc2[nH]cnc2n1' InChI=1S/C5H4N4/c1-4-5(8-2-6-1)9-3-7-4/h1-3H,(H,6,7,8,9) KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N
M7G pyrimidine F4 fragment c1cncnc1 InChI=1S/C4H4N2/c1-2-5-4-6-3-1/h1-4H CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N
M7G ribose F5 fragment OCC1OCC(O)C1O InChI=1S/C5H10O4/c6-1-4-5(8)3(7)2-9-4/h3-8H,1-2H2 KZVAAIRBJJYZOW-UHFFFAOYSA-N
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.atom_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_ordinal
M7G "C4'" S1 1
M7G "O4'" S1 1
M7G "C3'" S1 1
M7G "C2'" S1 1
M7G "C1'" S1 1
M7G N9 S1 1
M7G C8 S1 1
M7G N7 S1 1
M7G C5 S1 1
M7G C6 S1 1
M7G O6 S1 1
M7G N1 S1 1
M7G C2 S1 1
M7G N3 S1 1
M7G C4 S1 1
M7G C5 F1 1
M7G C4 F1 1
M7G N9 F1 1
M7G C8 F1 1
M7G N7 F1 1
M7G O2A F2 1
M7G PA F2 1
M7G O1A F2 1
M7G O3A F2 1
M7G "O5'" F2 1
M7G O3A F2 2
M7G PB F2 2
M7G O1B F2 2
M7G O2B F2 2
M7G O3B F2 2
M7G N7 F3 1
M7G C8 F3 1
M7G N9 F3 1
M7G C4 F3 1
M7G C5 F3 1
M7G C6 F3 1
M7G N1 F3 1
M7G C2 F3 1
M7G N3 F3 1
M7G C5 F4 1
M7G C6 F4 1
M7G N1 F4 1
M7G C2 F4 1
M7G N3 F4 1
M7G C4 F4 1
M7G "C2'" F5 1
M7G "C3'" F5 1
M7G "C4'" F5 1
M7G "O4'" F5 1
M7G "C1'" F5 1
M7G "C5'" F5 1
M7G "O5'" F5 1
M7G "O3'" F5 1
M7G "O2'" F5 1
#
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.comp_id M7G
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.exactmw 458.047
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.amw 458.237
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.lipinskiHBA 16
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.lipinskiHBD 8
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumRotatableBonds 13
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHBD 7
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHBA 14
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeavyAtoms 29
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAtoms 47
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeteroatoms 18
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAmideBonds 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.FractionCSP3 0.545
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumRings 3
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAromaticRings 2
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAliphaticRings 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSaturatedRings 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeterocycles 3
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAromaticHeterocycles 2
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSaturatedHeterocycles 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAliphaticHeterocycles 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSpiroAtoms 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumBridgeheadAtoms 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAtomStereoCenters 5
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumUnspecifiedAtomStereoCenters 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.labuteASA 186.394
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.tpsa 243.560
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.CrippenClogP -2.932
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.CrippenMR 87.850
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi0v 14.910
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi1v 9.566
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi2v 4.831
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi3v 4.831
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi4v 3.251
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi0n 31.121
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi1n 15.028
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi2n 2.916
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi3n 2.916
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi4n 1.943
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.hallKierAlpha -1.710
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa1 8.434
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa2 7.519
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa3 4.565
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.Phi 2.187
#
loop_
_pdbe_chem_comp_external_mappings.comp_id
_pdbe_chem_comp_external_mappings.source
_pdbe_chem_comp_external_mappings.resource
_pdbe_chem_comp_external_mappings.resource_id
M7G UniChem ChEBI 63730
M7G UniChem ZINC ZINC000015521877
M7G UniChem HMDB HMDB0059613
M7G UniChem 'PubChem TPHARMA' 16780940
M7G UniChem PubChem 135460973
M7G UniChem Nikkaji J1.069.312H
M7G UniChem BRENDA 16632
M7G UniChem BRENDA 16633
M7G UniChem BRENDA 175837
M7G UniChem BRENDA 233603
M7G UniChem BRENDA 48767
M7G UniChem BRENDA 6929
M7G UniChem BRENDA 85332
#
loop_
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.comp_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.atom_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_x_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_y_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_z_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_method
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_ordinal
M7G PA 3.325 1.388 0.254 ETKDGv3 1
M7G O1A 4.446 0.451 -0.146 ETKDGv3 2
M7G O2A 3.976 2.884 0.706 ETKDGv3 3
M7G O3A 2.217 1.602 -1.024 ETKDGv3 4
M7G "O5'" 2.487 0.738 1.589 ETKDGv3 5
M7G PB 3.089 2.093 -2.402 ETKDGv3 6
M7G O1B 3.901 3.335 -2.109 ETKDGv3 7
M7G O2B 4.117 0.853 -2.924 ETKDGv3 8
M7G O3B 1.990 2.446 -3.638 ETKDGv3 9
M7G "C5'" 2.068 -0.569 1.265 ETKDGv3 10
M7G "C4'" 0.927 -0.979 2.200 ETKDGv3 11
M7G "O4'" -0.142 -0.070 2.064 ETKDGv3 12
M7G "C3'" 0.419 -2.383 1.886 ETKDGv3 13
M7G "O3'" 1.097 -3.343 2.655 ETKDGv3 14
M7G "C2'" -1.055 -2.296 2.230 ETKDGv3 15
M7G "O2'" -1.343 -2.852 3.493 ETKDGv3 16
M7G "C1'" -1.348 -0.789 2.204 ETKDGv3 17
M7G N9 -2.249 -0.447 1.102 ETKDGv3 18
M7G C8 -3.321 0.503 1.177 ETKDGv3 19
M7G N7 -3.637 0.996 0.017 ETKDGv3 20
M7G CM7 -4.584 2.079 -0.225 ETKDGv3 21
M7G C5 -2.725 0.421 -0.913 ETKDGv3 22
M7G C6 -2.432 0.812 -2.292 ETKDGv3 23
M7G O6 -3.152 1.632 -2.920 ETKDGv3 24
M7G N1 -1.272 0.228 -2.902 ETKDGv3 25
M7G C2 -0.437 -0.665 -2.132 ETKDGv3 26
M7G N2 0.742 -1.219 -2.714 ETKDGv3 27
M7G N3 -0.745 -0.954 -0.895 ETKDGv3 28
M7G C4 -1.922 -0.406 -0.285 ETKDGv3 29
M7G HOA2 4.537 2.686 1.498 ETKDGv3 30
M7G HOB2 3.527 0.064 -3.026 ETKDGv3 31
M7G HOB3 1.445 1.624 -3.734 ETKDGv3 32
M7G "H5'1" 2.919 -1.273 1.398 ETKDGv3 33
M7G "H5'2" 1.696 -0.645 0.217 ETKDGv3 34
M7G "H4'" 1.290 -0.935 3.252 ETKDGv3 35
M7G "H3'" 0.532 -2.613 0.801 ETKDGv3 36
M7G "HO3'" 0.830 -4.230 2.296 ETKDGv3 37
M7G "H2'" -1.653 -2.841 1.466 ETKDGv3 38
M7G "HO2'" -0.805 -2.367 4.173 ETKDGv3 39
M7G "H1'" -1.828 -0.483 3.161 ETKDGv3 40
M7G H81 -3.773 0.825 2.107 ETKDGv3 41
M7G HM71 -4.034 3.038 -0.327 ETKDGv3 42
M7G HM72 -5.306 2.161 0.616 ETKDGv3 43
M7G HM73 -5.154 1.880 -1.155 ETKDGv3 44
M7G HN1 -1.022 0.466 -3.888 ETKDGv3 45
M7G HN21 1.361 -1.850 -2.158 ETKDGv3 46
M7G HN22 1.002 -0.994 -3.699 ETKDGv3 47
#