data_IZB
#
_chem_comp.id IZB
_chem_comp.name
N-[(1S)-1-(1H-BENZIMIDAZOL-2-YL)-2-{4-[(5S)-1,1-DIOXIDO-3-OXOISOTHIAZOLIDIN-5-YL]PHENYL}ETHYL]-4-METHYL-3,4-DIHYDRO-2H-1,4-BENZOXAZINE-7-SULFONAMIDE
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C27 H27 N5 O6 S2"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2006-05-21
_chem_comp.pdbx_modified_date 2011-06-04
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 581.663
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code IZB
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 2CNH
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site EBI
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
IZB C1 C1 C 0 1 N N S N N N 19.489 16.662 81.406 -5.953 0.725 -0.712 C1 IZB 1
IZB C2 C2 C 0 1 N N N N N N 20.821 17.190 80.950 -6.024 1.853 0.352 C2 IZB 2
IZB C3 C3 C 0 1 N N N N N N 21.893 16.394 81.600 -6.645 1.298 1.598 C3 IZB 3
IZB N4 N4 N 0 1 N N N N N N 21.501 15.185 82.017 -7.361 0.167 1.507 N4 IZB 4
IZB S5 S5 S 0 1 N N N N N N 19.776 14.917 81.651 -7.307 -0.351 -0.086 S5 IZB 5
IZB O6 O6 O 0 1 N N N N N N 18.972 14.443 82.962 -8.575 0.032 -0.599 O6 IZB 6
IZB O7 O7 O 0 1 N N N N N N 19.642 14.086 80.252 -6.903 -1.709 0.023 O7 IZB 7
IZB O9 O9 O 0 1 N N N N N N 23.044 16.768 81.770 -6.503 1.858 2.664 O9 IZB 8
IZB C11 C11 C 0 1 Y N N N N N 18.284 16.922 80.528 -4.623 0.017 -0.676 C11 IZB 9
IZB C12 C12 C 0 1 Y N N N N N 18.417 16.897 79.069 -3.855 -0.069 -1.822 C12 IZB 10
IZB C13 C13 C 0 1 Y N N N N N 17.235 17.107 78.229 -2.635 -0.718 -1.789 C13 IZB 11
IZB C14 C14 C 0 1 Y N N N N N 15.924 17.344 78.856 -2.183 -1.282 -0.610 C14 IZB 12
IZB C15 C15 C 0 1 Y N N N N N 15.799 17.371 80.312 -2.954 -1.201 0.534 C15 IZB 13
IZB C16 C16 C 0 1 Y N N N N N 16.972 17.161 81.147 -4.172 -0.547 0.502 C16 IZB 14
IZB C21 C21 C 0 1 N N N N N N 14.713 17.590 77.999 -0.853 -1.989 -0.574 C21 IZB 15
IZB C22 C22 C 0 1 N N S N N N 14.133 18.990 78.231 0.248 -0.988 -0.219 C22 IZB 16
IZB N45 N45 N 0 1 N N N N N N 12.810 19.065 77.595 0.367 0.007 -1.288 N45 IZB 17
IZB S1 S1 S 0 1 N N N N N N 11.716 20.383 78.011 0.743 1.577 -0.919 S1 IZB 18
IZB O1 O1 O 0 1 N N N N N N 10.245 19.786 77.509 0.836 2.254 -2.165 O1 IZB 19
IZB O2 O2 O 0 1 N N N N N N 11.834 20.658 79.659 -0.117 1.939 0.152 O2 IZB 20
IZB C17 C17 C 0 1 Y N N N N N 17.985 23.544 76.394 5.716 -3.510 -0.016 C17 IZB 21
IZB C19 C19 C 0 1 Y N N N N N 17.479 22.845 77.599 5.007 -2.500 -0.633 C19 IZB 22
IZB C23 C23 C 0 1 Y N N N N N 16.506 21.739 77.455 3.670 -2.307 -0.316 C23 IZB 23
IZB C4 C4 C 0 1 Y N N N N N 16.042 21.337 76.121 3.048 -3.140 0.630 C4 IZB 24
IZB C5 C5 C 0 1 Y N N N N N 16.542 22.031 74.917 3.786 -4.157 1.241 C5 IZB 25
IZB C6 C6 C 0 1 Y N N N N N 17.516 23.138 75.054 5.102 -4.332 0.917 C6 IZB 26
IZB N11 N11 N 0 1 Y N N N N N 15.876 20.926 78.417 2.701 -1.417 -0.735 N11 IZB 27
IZB C25 C25 C 0 1 Y N N N N N 15.058 20.061 77.658 1.558 -1.717 -0.062 C25 IZB 28
IZB N13 N13 N 0 1 Y N N N N N 15.129 20.273 76.262 1.761 -2.721 0.740 N13 IZB 29
IZB C18 C18 C 0 1 N N N N N N 15.212 25.606 77.133 6.982 1.442 -0.883 C18 IZB 30
IZB O3 O3 O 0 1 N N N N N N 14.207 24.899 77.854 5.766 1.908 -1.456 O3 IZB 31
IZB C24 C24 C 0 1 Y N N N N N 13.582 23.957 77.136 4.756 1.745 -0.564 C24 IZB 32
IZB C26 C26 C 0 1 Y N N N N N 13.430 24.059 75.680 4.944 1.594 0.801 C26 IZB 33
IZB N5 N5 N 0 1 N N N N N N 14.066 25.109 74.992 6.203 1.577 1.410 N5 IZB 34
IZB C27 C27 C 0 1 N N N N N N 14.703 26.156 75.807 7.175 2.139 0.469 C27 IZB 35
IZB C7 C7 C 0 1 Y N N N N N 13.046 22.801 77.844 3.461 1.736 -1.080 C7 IZB 36
IZB C8 C8 C 0 1 Y N N N N N 12.301 21.782 77.111 2.372 1.584 -0.248 C8 IZB 37
IZB C9 C9 C 0 1 Y N N N N N 12.075 21.927 75.668 2.560 1.438 1.114 C9 IZB 38
IZB C10 C10 C 0 1 Y N N N N N 12.630 23.073 74.956 3.837 1.442 1.635 C10 IZB 39
IZB C20 C20 C 0 1 N N N N N N 14.230 25.033 73.538 6.134 2.504 2.548 C20 IZB 40
IZB H1 H1 H 0 1 N N N N N N 19.186 17.212 82.309 -6.172 1.104 -1.710 H1 IZB 41
IZB H2C1 1H2C H 0 0 N N N N N N 20.920 18.250 81.227 -5.019 2.214 0.572 H2C1 IZB 42
IZB H2C2 2H2C H 0 0 N N N N N N 20.902 17.101 79.857 -6.632 2.675 -0.026 H2C2 IZB 43
IZB H4 H4 H 0 1 N N N N N N 22.095 14.521 82.472 -7.827 -0.274 2.235 H4 IZB 44
IZB H12 H12 H 0 1 N N N N N N 19.382 16.725 78.615 -4.207 0.372 -2.743 H12 IZB 45
IZB H13 H13 H 0 1 N N N N N N 17.325 17.088 77.153 -2.034 -0.785 -2.684 H13 IZB 46
IZB H15 H15 H 0 1 N N N N N N 14.836 17.547 80.768 -2.602 -1.641 1.455 H15 IZB 47
IZB H16 H16 H 0 1 N N N N N N 16.879 17.181 82.223 -4.772 -0.480 1.398 H16 IZB 48
IZB H211 1H21 H 0 0 N N N N N N 13.945 16.849 78.266 -0.647 -2.425 -1.552 H211 IZB 49
IZB H212 2H21 H 0 0 N N N N N N 15.003 17.498 76.942 -0.882 -2.779 0.176 H212 IZB 50
IZB H22 H22 H 0 1 N N N N N N 14.038 19.171 79.312 -0.004 -0.488 0.717 H22 IZB 51
IZB H45 H45 H 0 1 N N N N N N 12.977 19.140 76.612 0.226 -0.254 -2.211 H45 IZB 52
IZB H17 H17 H 0 1 N N N N N N 18.697 24.350 76.496 6.757 -3.661 -0.261 H17 IZB 53
IZB H19 H19 H 0 1 N N N N N N 17.819 23.142 78.580 5.491 -1.863 -1.359 H19 IZB 54
IZB H5 H5 H 0 1 N N N N N N 16.198 21.732 73.938 3.317 -4.803 1.968 H5 IZB 55
IZB H6 H6 H 0 1 N N N N N N 17.883 23.648 74.175 5.669 -5.119 1.392 H6 IZB 56
IZB H11 H11 H 0 1 N N N N N N 15.983 20.955 79.411 2.815 -0.709 -1.389 H11 IZB 57
IZB H181 1H18 H 0 0 N N N N N N 16.026 24.900 76.913 7.815 1.684 -1.543 H181 IZB 58
IZB H182 2H18 H 0 0 N N N N N N 15.555 26.449 77.751 6.930 0.364 -0.736 H182 IZB 59
IZB H271 1H27 H 0 0 N N N N N N 15.562 26.553 75.247 7.006 3.210 0.359 H271 IZB 60
IZB H272 2H27 H 0 0 N N N N N N 13.963 26.943 76.012 8.187 1.961 0.834 H272 IZB 61
IZB H7 H7 H 0 1 N N N N N N 13.200 22.699 78.908 3.309 1.850 -2.143 H7 IZB 62
IZB H9 H9 H 0 1 N N N N N N 11.499 21.186 75.134 1.709 1.321 1.769 H9 IZB 63
IZB H10 H10 H 0 1 N N N N N N 12.450 23.192 73.898 3.981 1.327 2.700 H10 IZB 64
IZB H201 1H20 H 0 0 N N N N N N 14.781 24.117 73.279 5.708 3.452 2.219 H201 IZB 65
IZB H202 2H20 H 0 0 N N N N N N 14.792 25.911 73.186 5.505 2.075 3.328 H202 IZB 66
IZB H203 3H20 H 0 0 N N N N N N 13.241 25.014 73.057 7.136 2.673 2.941 H203 IZB 67
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
IZB C1 C2 SING N N 1
IZB C1 S5 SING N N 2
IZB C1 C11 SING N N 3
IZB C1 H1 SING N N 4
IZB C2 C3 SING N N 5
IZB C2 H2C1 SING N N 6
IZB C2 H2C2 SING N N 7
IZB C3 N4 SING N N 8
IZB C3 O9 DOUB N N 9
IZB N4 S5 SING N N 10
IZB N4 H4 SING N N 11
IZB S5 O6 DOUB N N 12
IZB S5 O7 DOUB N N 13
IZB C11 C12 DOUB Y N 14
IZB C11 C16 SING Y N 15
IZB C12 C13 SING Y N 16
IZB C12 H12 SING N N 17
IZB C13 C14 DOUB Y N 18
IZB C13 H13 SING N N 19
IZB C14 C15 SING Y N 20
IZB C14 C21 SING N N 21
IZB C15 C16 DOUB Y N 22
IZB C15 H15 SING N N 23
IZB C16 H16 SING N N 24
IZB C21 C22 SING N N 25
IZB C21 H211 SING N N 26
IZB C21 H212 SING N N 27
IZB C22 N45 SING N N 28
IZB C22 C25 SING N N 29
IZB C22 H22 SING N N 30
IZB N45 S1 SING N N 31
IZB N45 H45 SING N N 32
IZB S1 O1 DOUB N N 33
IZB S1 O2 DOUB N N 34
IZB S1 C8 SING N N 35
IZB C17 C19 DOUB Y N 36
IZB C17 C6 SING Y N 37
IZB C17 H17 SING N N 38
IZB C19 C23 SING Y N 39
IZB C19 H19 SING N N 40
IZB C23 C4 DOUB Y N 41
IZB C23 N11 SING Y N 42
IZB C4 C5 SING Y N 43
IZB C4 N13 SING Y N 44
IZB C5 C6 DOUB Y N 45
IZB C5 H5 SING N N 46
IZB C6 H6 SING N N 47
IZB N11 C25 SING Y N 48
IZB N11 H11 SING N N 49
IZB C25 N13 DOUB Y N 50
IZB C18 O3 SING N N 51
IZB C18 C27 SING N N 52
IZB C18 H181 SING N N 53
IZB C18 H182 SING N N 54
IZB O3 C24 SING N N 55
IZB C24 C26 DOUB Y N 56
IZB C24 C7 SING Y N 57
IZB C26 N5 SING N N 58
IZB C26 C10 SING Y N 59
IZB N5 C27 SING N N 60
IZB N5 C20 SING N N 61
IZB C27 H271 SING N N 62
IZB C27 H272 SING N N 63
IZB C7 C8 DOUB Y N 64
IZB C7 H7 SING N N 65
IZB C8 C9 SING Y N 66
IZB C9 C10 DOUB Y N 67
IZB C9 H9 SING N N 68
IZB C10 H10 SING N N 69
IZB C20 H201 SING N N 70
IZB C20 H202 SING N N 71
IZB C20 H203 SING N N 72
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
IZB SMILES ACDLabs 10.04 O=C6NS(=O)(=O)C(c1ccc(cc1)CC(c2nc3ccccc3n2)NS(=O)(=O)c5ccc4N(C)CCOc4c5)C6
IZB SMILES_CANONICAL CACTVS 3.341 CN1CCOc2cc(ccc12)[S](=O)(=O)N[C@@H](Cc3ccc(cc3)[C@@H]4CC(=O)N[S]4(=O)=O)c5[nH]c6ccccc6n5
IZB SMILES CACTVS 3.341 CN1CCOc2cc(ccc12)[S](=O)(=O)N[CH](Cc3ccc(cc3)[CH]4CC(=O)N[S]4(=O)=O)c5[nH]c6ccccc6n5
IZB SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 CN1CCOc2c1ccc(c2)S(=O)(=O)N[C@@H](Cc3ccc(cc3)[C@@H]4CC(=O)NS4(=O)=O)c5[nH]c6ccccc6n5
IZB SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 CN1CCOc2c1ccc(c2)S(=O)(=O)NC(Cc3ccc(cc3)C4CC(=O)NS4(=O)=O)c5[nH]c6ccccc6n5
IZB InChI InChI 1.03 InChI=1S/C27H27N5O6S2/c1-32-12-13-38-24-15-19(10-11-23(24)32)39(34,35)30-22(27-28-20-4-2-3-5-21(20)29-27)14-17-6-8-18(9-7-17)25-16-26(33)31-40(25,36)37/h2-11,15,22,25,30H,12-14,16H2,1H3,(H,28,29)(H,31,33)/t22-,25-/m0/s1
IZB InChIKey InChI 1.03 QNAGNPUNGCBSIJ-DHLKQENFSA-N
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
IZB "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 10.04 N-[(1S)-1-(1H-benzimidazol-2-yl)-2-{4-[(5S)-1,1-dioxido-3-oxoisothiazolidin-5-yl]phenyl}ethyl]-4-methyl-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazine-7-sulfonamide
IZB "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 N-[(1S)-1-(1H-benzimidazol-2-yl)-2-[4-[(5S)-1,1,3-trioxo-1,2-thiazolidin-5-yl]phenyl]ethyl]-4-methyl-2,3-dihydro-1,4-benzoxazine-7-sulfonamide
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
IZB 'Create component' 2006-05-21 EBI
IZB 'Modify descriptor' 2011-06-04 RCSB
#
loop_
_software.name
_software.version
_software.description
rdkit 2025.03.3 'Core functionality.'
pdbeccdutils 1.0.0 'Wrapper to provide 2D templates and molecular fragments.'
#
loop_
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.atom_id
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.element
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_x
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_y
_pdbe_chem_comp_atom_depiction.pdbx_ordinal
IZB C1 C 6.866 -2.693 1
IZB C2 C 5.495 -2.083 2
IZB C3 C 4.492 -3.198 3
IZB N4 N 5.242 -4.497 4
IZB S5 S 6.709 -4.185 5
IZB O6 O 7.021 -5.652 6
IZB O7 O 8.201 -4.342 7
IZB O9 O 3.000 -3.041 8
IZB C11 C 8.165 -1.943 9
IZB C12 C 9.464 -2.693 10
IZB C13 C 10.763 -1.943 11
IZB C14 C 10.763 -0.443 12
IZB C15 C 9.464 0.307 13
IZB C16 C 8.165 -0.443 14
IZB C21 C 12.062 0.307 15
IZB C22 C 12.062 1.807 16
IZB N45 N 13.361 2.557 17
IZB S1 S 14.660 1.807 18
IZB O1 O 13.910 0.507 19
IZB O2 O 15.410 3.106 20
IZB C17 C 6.901 5.652 21
IZB C19 C 8.401 5.652 22
IZB C23 C 9.151 4.353 23
IZB C4 C 8.401 3.054 24
IZB C5 C 6.901 3.054 25
IZB C6 C 6.151 4.353 26
IZB N11 N 10.608 4.040 27
IZB C25 C 10.763 2.557 28
IZB N13 N 9.401 1.949 29
IZB C18 C 21.257 1.088 30
IZB O3 O 19.898 1.859 31
IZB C24 C 18.557 1.057 32
IZB C26 C 18.557 -0.443 33
IZB N5 N 19.898 -1.245 34
IZB C27 C 21.257 -0.475 35
IZB C7 C 17.258 1.807 36
IZB C8 C 15.959 1.057 37
IZB C9 C 15.959 -0.443 38
IZB C10 C 17.258 -1.193 39
IZB C20 C 19.881 -2.745 40
#
loop_
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.comp_id
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_1
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_2
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.value_order
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.bond_dir
_pdbe_chem_comp_bond_depiction.pdbx_ordinal
IZB C1 C2 SINGLE NONE 1
IZB C1 S5 SINGLE NONE 2
IZB C1 C11 SINGLE BEGINWEDGE 3
IZB C2 C3 SINGLE NONE 4
IZB C3 N4 SINGLE NONE 5
IZB C3 O9 DOUBLE NONE 6
IZB N4 S5 SINGLE NONE 7
IZB S5 O6 DOUBLE NONE 8
IZB S5 O7 DOUBLE NONE 9
IZB C11 C12 DOUBLE NONE 10
IZB C11 C16 SINGLE NONE 11
IZB C12 C13 SINGLE NONE 12
IZB C13 C14 DOUBLE NONE 13
IZB C14 C15 SINGLE NONE 14
IZB C14 C21 SINGLE NONE 15
IZB C15 C16 DOUBLE NONE 16
IZB C22 C21 SINGLE BEGINWEDGE 17
IZB C22 N45 SINGLE NONE 18
IZB C22 C25 SINGLE NONE 19
IZB N45 S1 SINGLE NONE 20
IZB S1 O1 DOUBLE NONE 21
IZB S1 O2 DOUBLE NONE 22
IZB S1 C8 SINGLE NONE 23
IZB C17 C19 DOUBLE NONE 24
IZB C17 C6 SINGLE NONE 25
IZB C19 C23 SINGLE NONE 26
IZB C23 C4 DOUBLE NONE 27
IZB C23 N11 SINGLE NONE 28
IZB C4 C5 SINGLE NONE 29
IZB C4 N13 SINGLE NONE 30
IZB C5 C6 DOUBLE NONE 31
IZB N11 C25 SINGLE NONE 32
IZB C25 N13 DOUBLE NONE 33
IZB C18 O3 SINGLE NONE 34
IZB C18 C27 SINGLE NONE 35
IZB O3 C24 SINGLE NONE 36
IZB C24 C26 DOUBLE NONE 37
IZB C24 C7 SINGLE NONE 38
IZB C26 N5 SINGLE NONE 39
IZB C26 C10 SINGLE NONE 40
IZB N5 C27 SINGLE NONE 41
IZB N5 C20 SINGLE NONE 42
IZB C7 C8 DOUBLE NONE 43
IZB C8 C9 SINGLE NONE 44
IZB C9 C10 DOUBLE NONE 45
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_name
_pdbe_chem_comp_substructure.id
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_type
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_smiles
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchis
_pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchikeys
IZB MurckoScaffold S1 scaffold 'O=C1C[C@@H](c2ccc(C[C@H](NS(=O)(=O)c3ccc4c(c3)OCCN4)c3nc4ccccc4[nH]3)cc2)S(=O)(=O)N1' InChI=1S/C26H25N5O6S2/c32-25-15-24(39(35,36)31-25)17-7-5-16(6-8-17)13-22(26-28-19-3-1-2-4-20(19)29-26)30-38(33,34)18-9-10-21-23(14-18)37-12-11-27-21/h1-10,14,22,24,27,30H,11-13,15H2,(H,28,29)(H,31,32)/t22-,24-/m0/s1 RCXGKSOBDTXXJR-UPVQGACJSA-N
IZB amide F1 fragment CC(N)=O InChI=1S/C2H5NO/c1-2(3)4/h1H3,(H2,3,4) DLFVBJFMPXGRIB-UHFFFAOYSA-N
IZB benzimidazole F2 fragment 'c1ccc2[nH]cnc2c1' InChI=1S/C7H6N2/c1-2-4-7-6(3-1)8-5-9-7/h1-5H,(H,8,9) HYZJCKYKOHLVJF-UHFFFAOYSA-N
IZB imidazole F3 fragment 'c1c[nH]cn1' InChI=1S/C3H4N2/c1-2-5-3-4-1/h1-3H,(H,4,5) RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N
IZB phenyl F4 fragment c1ccccc1 InChI=1S/C6H6/c1-2-4-6-5-3-1/h1-6H UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N
IZB Z133621020 F5 fragment CNS(=O)(=O)Cc1ccccc1 InChI=1S/C8H11NO2S/c1-9-12(10,11)7-8-5-3-2-4-6-8/h2-6,9H,7H2,1H3 NYLBABUQWKLNCW-UHFFFAOYSA-N
IZB Z45617795 F6 fragment CS(=O)(=O)NCCc1ccccc1 InChI=1S/C9H13NO2S/c1-13(11,12)10-8-7-9-5-3-2-4-6-9/h2-6,10H,7-8H2,1H3 JGDDFCYMSLNOGJ-UHFFFAOYSA-N
#
loop_
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.comp_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.atom_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_id
_pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_ordinal
IZB C1 S1 1
IZB C2 S1 1
IZB C3 S1 1
IZB N4 S1 1
IZB S5 S1 1
IZB O6 S1 1
IZB O7 S1 1
IZB O9 S1 1
IZB C11 S1 1
IZB C12 S1 1
IZB C13 S1 1
IZB C14 S1 1
IZB C15 S1 1
IZB C16 S1 1
IZB C21 S1 1
IZB C22 S1 1
IZB N45 S1 1
IZB S1 S1 1
IZB O1 S1 1
IZB O2 S1 1
IZB C17 S1 1
IZB C19 S1 1
IZB C23 S1 1
IZB C4 S1 1
IZB C5 S1 1
IZB C6 S1 1
IZB N11 S1 1
IZB C25 S1 1
IZB N13 S1 1
IZB C18 S1 1
IZB O3 S1 1
IZB C24 S1 1
IZB C26 S1 1
IZB N5 S1 1
IZB C27 S1 1
IZB C7 S1 1
IZB C8 S1 1
IZB C9 S1 1
IZB C10 S1 1
IZB N4 F1 1
IZB C3 F1 1
IZB O9 F1 1
IZB C2 F1 1
IZB C23 F2 1
IZB N11 F2 1
IZB C25 F2 1
IZB N13 F2 1
IZB C4 F2 1
IZB C5 F2 1
IZB C6 F2 1
IZB C17 F2 1
IZB C19 F2 1
IZB C23 F3 1
IZB C4 F3 1
IZB N13 F3 1
IZB C25 F3 1
IZB N11 F3 1
IZB C11 F4 1
IZB C12 F4 1
IZB C13 F4 1
IZB C14 F4 1
IZB C15 F4 1
IZB C16 F4 1
IZB C17 F4 2
IZB C19 F4 2
IZB C23 F4 2
IZB C4 F4 2
IZB C5 F4 2
IZB C6 F4 2
IZB C24 F4 3
IZB C26 F4 3
IZB C10 F4 3
IZB C9 F4 3
IZB C8 F4 3
IZB C7 F4 3
IZB C3 F5 1
IZB N4 F5 1
IZB S5 F5 1
IZB O6 F5 1
IZB O7 F5 1
IZB C1 F5 1
IZB C11 F5 1
IZB C12 F5 1
IZB C13 F5 1
IZB C14 F5 1
IZB C15 F5 1
IZB C16 F5 1
IZB C8 F6 1
IZB S1 F6 1
IZB O1 F6 1
IZB O2 F6 1
IZB N45 F6 1
IZB C22 F6 1
IZB C21 F6 1
IZB C14 F6 1
IZB C13 F6 1
IZB C12 F6 1
IZB C11 F6 1
IZB C16 F6 1
IZB C15 F6 1
#
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.comp_id IZB
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.exactmw 581.140
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.amw 581.676
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.lipinskiHBA 11
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.lipinskiHBD 3
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumRotatableBonds 8
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHBD 3
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHBA 8
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeavyAtoms 40
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAtoms 67
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeteroatoms 13
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAmideBonds 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.FractionCSP3 0.259
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumRings 6
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAromaticRings 4
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAliphaticRings 2
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSaturatedRings 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeterocycles 3
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAromaticHeterocycles 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSaturatedHeterocycles 1
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAliphaticHeterocycles 2
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSpiroAtoms 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumBridgeheadAtoms 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAtomStereoCenters 2
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumUnspecifiedAtomStereoCenters 0
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.labuteASA 269.328
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.tpsa 150.560
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.CrippenClogP 1.001
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.CrippenMR 145.062
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi0v 20.635
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi1v 13.195
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi2v 7.184
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi3v 7.184
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi4v 4.921
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi0n 46.002
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi1n 23.657
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi2n 4.813
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi3n 4.813
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi4n 3.129
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.hallKierAlpha -3.940
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa1 9.569
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa2 9.911
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa3 5.026
_pdbe_chem_comp_rdkit_properties.Phi 2.371
#
loop_
_pdbe_chem_comp_external_mappings.comp_id
_pdbe_chem_comp_external_mappings.source
_pdbe_chem_comp_external_mappings.resource
_pdbe_chem_comp_external_mappings.resource_id
IZB UniChem ZINC ZINC000014952802
IZB UniChem PubChem 9549201
IZB UniChem BindingDb 13475
#
loop_
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.comp_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.atom_id
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_x_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_y_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_z_rdkit
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_method
_pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_ordinal
IZB C1 -2.636 -3.260 1.279 ETKDGv3 1
IZB C2 -1.330 -4.085 1.440 ETKDGv3 2
IZB C3 -1.363 -5.230 0.467 ETKDGv3 3
IZB N4 -2.560 -5.401 -0.271 ETKDGv3 4
IZB S5 -3.674 -4.181 0.152 ETKDGv3 5
IZB O6 -4.866 -4.765 0.856 ETKDGv3 6
IZB O7 -4.093 -3.386 -1.053 ETKDGv3 7
IZB O9 -0.388 -6.015 0.327 ETKDGv3 8
IZB C11 -2.380 -1.853 0.780 ETKDGv3 9
IZB C12 -1.699 -1.623 -0.360 ETKDGv3 10
IZB C13 -1.496 -0.243 -0.847 ETKDGv3 11
IZB C14 -1.985 0.801 -0.155 ETKDGv3 12
IZB C15 -2.724 0.552 1.106 ETKDGv3 13
IZB C16 -2.911 -0.698 1.545 ETKDGv3 14
IZB C21 -1.771 2.214 -0.640 ETKDGv3 15
IZB C22 -0.301 2.658 -0.482 ETKDGv3 16
IZB N45 0.064 2.850 0.935 ETKDGv3 17
IZB S1 1.730 2.427 1.207 ETKDGv3 18
IZB O1 2.600 2.977 0.111 ETKDGv3 19
IZB O2 2.179 3.022 2.512 ETKDGv3 20
IZB C17 0.839 7.458 -3.990 ETKDGv3 21
IZB C19 1.054 6.130 -3.925 ETKDGv3 22
IZB C23 0.522 5.404 -2.761 ETKDGv3 23
IZB C4 -0.143 6.014 -1.807 ETKDGv3 24
IZB C5 -0.393 7.464 -1.853 ETKDGv3 25
IZB C6 0.082 8.155 -2.906 ETKDGv3 26
IZB N11 0.612 4.025 -2.469 ETKDGv3 27
IZB C25 -0.086 3.947 -1.221 ETKDGv3 28
IZB N13 -0.550 5.090 -0.804 ETKDGv3 29
IZB C18 2.172 -3.655 -0.975 ETKDGv3 30
IZB O3 2.385 -2.247 -0.935 ETKDGv3 31
IZB C24 2.206 -1.517 0.244 ETKDGv3 32
IZB C26 2.126 -2.152 1.431 ETKDGv3 33
IZB N5 2.311 -3.589 1.482 ETKDGv3 34
IZB C27 2.758 -4.305 0.278 ETKDGv3 35
IZB C7 2.111 -0.045 0.174 ETKDGv3 36
IZB C8 1.887 0.673 1.285 ETKDGv3 37
IZB C9 1.734 -0.021 2.582 ETKDGv3 38
IZB C10 1.854 -1.352 2.657 ETKDGv3 39
IZB C20 2.220 -4.317 2.751 ETKDGv3 40
IZB H1 -3.152 -3.219 2.264 ETKDGv3 41
IZB H2C1 -0.425 -3.469 1.261 ETKDGv3 42
IZB H2C2 -1.270 -4.497 2.471 ETKDGv3 43
IZB H4 -2.733 -6.154 -0.973 ETKDGv3 44
IZB H12 -1.303 -2.445 -0.944 ETKDGv3 45
IZB H13 -0.950 -0.088 -1.769 ETKDGv3 46
IZB H15 -3.117 1.383 1.678 ETKDGv3 47
IZB H16 -3.456 -0.861 2.466 ETKDGv3 48
IZB H211 -2.436 2.917 -0.090 ETKDGv3 49
IZB H212 -2.064 2.263 -1.713 ETKDGv3 50
IZB H22 0.334 1.884 -0.961 ETKDGv3 51
IZB H45 -0.495 2.218 1.551 ETKDGv3 52
IZB H17 1.215 8.025 -4.831 ETKDGv3 53
IZB H19 1.599 5.613 -4.703 ETKDGv3 54
IZB H5 -0.943 7.958 -1.063 ETKDGv3 55
IZB H6 -0.084 9.222 -2.971 ETKDGv3 56
IZB H11 1.067 3.264 -3.020 ETKDGv3 57
IZB H181 2.647 -4.077 -1.885 ETKDGv3 58
IZB H182 1.079 -3.855 -1.018 ETKDGv3 59
IZB H271 3.867 -4.267 0.226 ETKDGv3 60
IZB H272 2.441 -5.370 0.309 ETKDGv3 61
IZB H7 2.219 0.442 -0.787 ETKDGv3 62
IZB H9 1.528 0.548 3.479 ETKDGv3 63
IZB H10 1.742 -1.830 3.620 ETKDGv3 64
IZB H201 2.417 -5.401 2.612 ETKDGv3 65
IZB H202 2.972 -3.922 3.466 ETKDGv3 66
IZB H203 1.203 -4.203 3.180 ETKDGv3 67
#