data_DOJ # _chem_comp.id DOJ _chem_comp.name "N-{(3S,4S)-1-benzyl-3-[(1S)-1-hydroxyethoxy]piperidin-4-yl}-N'-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C22 H26 F3 N3 O3" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2017-11-01 _chem_comp.pdbx_modified_date 2018-09-21 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 437.455 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code DOJ _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6BG3 _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DOJ FBC F1 F 0 1 N N N N N N 14.826 -13.461 -2.699 -7.180 1.482 -1.306 FBC DOJ 1 DOJ CBB C1 C 0 1 N N N N N N 14.694 -12.144 -2.490 -5.891 0.939 -1.349 CBB DOJ 2 DOJ FBD F2 F 0 1 N N N N N N 14.711 -11.956 -1.150 -5.926 -0.295 -2.006 FBD DOJ 3 DOJ FBE F3 F 0 1 N N N N N N 13.465 -11.801 -2.897 -5.041 1.811 -2.039 FBE DOJ 4 DOJ CAZ C2 C 0 1 Y N N N N N 15.778 -11.381 -3.195 -5.380 0.746 0.055 CAZ DOJ 5 DOJ CBA C3 C 0 1 Y N N N N N 15.758 -11.307 -4.594 -4.117 0.225 0.264 CBA DOJ 6 DOJ CAY C4 C 0 1 Y N N N N N 16.772 -10.785 -2.460 -6.172 1.096 1.133 CAY DOJ 7 DOJ CAX C5 C 0 1 Y N N N N N 17.772 -10.084 -3.146 -5.706 0.921 2.423 CAX DOJ 8 DOJ CAW C6 C 0 1 Y N N N N N 17.757 -9.992 -4.543 -4.447 0.396 2.639 CAW DOJ 9 DOJ CAV C7 C 0 1 Y N N N N N 16.749 -10.596 -5.243 -3.647 0.048 1.559 CAV DOJ 10 DOJ NAU N1 N 0 1 N N N N N N 16.798 -10.482 -6.658 -2.369 -0.480 1.774 NAU DOJ 11 DOJ CAS C8 C 0 1 N N N N N N 15.683 -10.726 -7.494 -1.374 -0.212 0.905 CAS DOJ 12 DOJ OAT O1 O 0 1 N N N N N N 14.594 -11.004 -7.114 -1.560 0.565 -0.011 OAT DOJ 13 DOJ NAR N2 N 0 1 N N N N N N 16.044 -10.628 -8.848 -0.173 -0.806 1.053 NAR DOJ 14 DOJ CAQ C9 C 0 1 N N S N N N 14.913 -10.662 -9.817 0.909 -0.515 0.108 CAQ DOJ 15 DOJ CAE C10 C 0 1 N N S N N N 15.135 -11.330 -11.022 1.892 -1.688 0.079 CAE DOJ 16 DOJ CAF C11 C 0 1 N N N N N N 14.447 -10.978 -12.318 3.050 -1.353 -0.863 CAF DOJ 17 DOJ OAD O2 O 0 1 N N N N N N 15.527 -12.709 -10.859 1.221 -2.861 -0.388 OAD DOJ 18 DOJ CAB C12 C 0 1 N N S N N N 16.742 -13.306 -11.236 1.744 -4.080 0.144 CAB DOJ 19 DOJ OAC O3 O 0 1 N N N N N N 16.694 -14.667 -10.972 3.084 -4.264 -0.317 OAC DOJ 20 DOJ CAA C13 C 0 1 N N N N N N 17.859 -12.612 -10.448 0.879 -5.252 -0.322 CAA DOJ 21 DOJ CAP C14 C 0 1 N N N N N N 14.516 -9.260 -10.038 1.648 0.751 0.551 CAP DOJ 22 DOJ CAO C15 C 0 1 N N N N N N 13.346 -9.202 -11.034 2.814 1.016 -0.405 CAO DOJ 23 DOJ NAG N3 N 0 1 N N N N N N 13.758 -9.683 -12.321 3.727 -0.136 -0.395 NAG DOJ 24 DOJ CAH C16 C 0 1 N N N N N N 12.840 -9.589 -13.218 4.928 0.139 -1.195 CAH DOJ 25 DOJ CAI C17 C 0 1 Y N N N N N 12.178 -8.206 -13.337 5.725 1.239 -0.542 CAI DOJ 26 DOJ CAJ C18 C 0 1 Y N N N N N 10.881 -7.953 -12.800 6.697 0.929 0.390 CAJ DOJ 27 DOJ CAK C19 C 0 1 Y N N N N N 10.312 -6.677 -12.903 7.428 1.938 0.989 CAK DOJ 28 DOJ CAL C20 C 0 1 Y N N N N N 11.007 -5.661 -13.503 7.185 3.258 0.655 CAL DOJ 29 DOJ CAM C21 C 0 1 Y N N N N N 12.309 -5.904 -14.042 6.213 3.568 -0.277 CAM DOJ 30 DOJ CAN C22 C 0 1 Y N N N N N 12.858 -7.156 -13.951 5.487 2.558 -0.880 CAN DOJ 31 DOJ HBA1 H1 H 0 0 N N N N N N 14.979 -11.799 -5.157 -3.497 -0.044 -0.578 HBA1 DOJ 32 DOJ HAY1 H2 H 0 0 N N N N N N 16.783 -10.855 -1.382 -7.157 1.508 0.966 HAY1 DOJ 33 DOJ HAX1 H3 H 0 0 N N N N N N 18.566 -9.608 -2.590 -6.328 1.195 3.263 HAX1 DOJ 34 DOJ HAW1 H4 H 0 0 N N N N N N 18.533 -9.450 -5.062 -4.084 0.260 3.647 HAW1 DOJ 35 DOJ HAU1 H5 H 0 0 N N N N N N 17.663 -10.216 -7.084 -2.199 -1.038 2.549 HAU1 DOJ 36 DOJ HAR1 H6 H 0 0 N N N N N N 16.996 -10.541 -9.142 -0.025 -1.425 1.784 HAR1 DOJ 37 DOJ HAQ1 H7 H 0 0 N N N N N N 14.073 -11.156 -9.306 0.492 -0.364 -0.888 HAQ1 DOJ 38 DOJ HAE1 H8 H 0 0 N N N N N N 16.125 -10.912 -11.259 2.277 -1.865 1.083 HAE1 DOJ 39 DOJ HAF1 H9 H 0 0 N N N N N N 13.704 -11.760 -12.534 3.760 -2.181 -0.875 HAF1 DOJ 40 DOJ HAF2 H10 H 0 0 N N N N N N 15.206 -10.963 -13.114 2.665 -1.190 -1.869 HAF2 DOJ 41 DOJ HAB1 H11 H 0 0 N N N N N N 16.924 -13.136 -12.307 1.738 -4.033 1.233 HAB1 DOJ 42 DOJ HAC1 H12 H 0 0 N N N N N N 17.516 -15.069 -11.227 3.166 -4.315 -1.279 HAC1 DOJ 43 DOJ HAA3 H13 H 0 0 N N N N N N 17.863 -11.538 -10.685 1.277 -6.182 0.084 HAA3 DOJ 44 DOJ HAA1 H14 H 0 0 N N N N N N 17.687 -12.749 -9.370 -0.144 -5.111 0.030 HAA1 DOJ 45 DOJ HAA2 H15 H 0 0 N N N N N N 18.829 -13.052 -10.723 0.885 -5.298 -1.411 HAA2 DOJ 46 DOJ HAP2 H16 H 0 0 N N N N N N 15.370 -8.698 -10.444 0.962 1.598 0.532 HAP2 DOJ 47 DOJ HAP1 H17 H 0 0 N N N N N N 14.205 -8.813 -9.082 2.029 0.615 1.563 HAP1 DOJ 48 DOJ HAO1 H18 H 0 0 N N N N N N 13.003 -8.161 -11.129 2.429 1.166 -1.414 HAO1 DOJ 49 DOJ HAO2 H19 H 0 0 N N N N N N 12.521 -9.827 -10.661 3.351 1.908 -0.084 HAO2 DOJ 50 DOJ HAH1 H21 H 0 0 N N N N N N 12.055 -10.322 -12.980 5.537 -0.763 -1.257 HAH1 DOJ 51 DOJ HAH2 H22 H 0 0 N N N N N N 13.289 -9.836 -14.191 4.635 0.448 -2.198 HAH2 DOJ 52 DOJ HAJ1 H23 H 0 0 N N N N N N 10.336 -8.748 -12.312 6.886 -0.102 0.650 HAJ1 DOJ 53 DOJ HAK1 H24 H 0 0 N N N N N N 9.323 -6.494 -12.508 8.187 1.696 1.717 HAK1 DOJ 54 DOJ HAL1 H25 H 0 0 N N N N N N 10.571 -4.675 -13.569 7.756 4.047 1.123 HAL1 DOJ 55 DOJ HAM1 H26 H 0 0 N N N N N N 12.857 -5.105 -14.518 6.027 4.599 -0.541 HAM1 DOJ 56 DOJ HAN1 H27 H 0 0 N N N N N N 13.840 -7.333 -14.364 4.727 2.800 -1.608 HAN1 DOJ 57 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DOJ CAM CAN DOUB Y N 1 DOJ CAM CAL SING Y N 2 DOJ CAN CAI SING Y N 3 DOJ CAL CAK DOUB Y N 4 DOJ CAI CAH SING N N 5 DOJ CAI CAJ DOUB Y N 6 DOJ CAH NAG SING N N 7 DOJ CAK CAJ SING Y N 8 DOJ NAG CAF SING N N 9 DOJ NAG CAO SING N N 10 DOJ CAF CAE SING N N 11 DOJ CAB OAC SING N N 12 DOJ CAB OAD SING N N 13 DOJ CAB CAA SING N N 14 DOJ CAO CAP SING N N 15 DOJ CAE OAD SING N N 16 DOJ CAE CAQ SING N N 17 DOJ CAP CAQ SING N N 18 DOJ CAQ NAR SING N N 19 DOJ NAR CAS SING N N 20 DOJ CAS OAT DOUB N N 21 DOJ CAS NAU SING N N 22 DOJ NAU CAV SING N N 23 DOJ CAV CBA DOUB Y N 24 DOJ CAV CAW SING Y N 25 DOJ CBA CAZ SING Y N 26 DOJ CAW CAX DOUB Y N 27 DOJ CAZ CBB SING N N 28 DOJ CAZ CAY DOUB Y N 29 DOJ CAX CAY SING Y N 30 DOJ FBE CBB SING N N 31 DOJ FBC CBB SING N N 32 DOJ CBB FBD SING N N 33 DOJ CBA HBA1 SING N N 34 DOJ CAY HAY1 SING N N 35 DOJ CAX HAX1 SING N N 36 DOJ CAW HAW1 SING N N 37 DOJ NAU HAU1 SING N N 38 DOJ NAR HAR1 SING N N 39 DOJ CAQ HAQ1 SING N N 40 DOJ CAE HAE1 SING N N 41 DOJ CAF HAF1 SING N N 42 DOJ CAF HAF2 SING N N 43 DOJ CAB HAB1 SING N N 44 DOJ OAC HAC1 SING N N 45 DOJ CAA HAA3 SING N N 46 DOJ CAA HAA1 SING N N 47 DOJ CAA HAA2 SING N N 48 DOJ CAP HAP2 SING N N 49 DOJ CAP HAP1 SING N N 50 DOJ CAO HAO1 SING N N 51 DOJ CAO HAO2 SING N N 52 DOJ CAH HAH1 SING N N 53 DOJ CAH HAH2 SING N N 54 DOJ CAJ HAJ1 SING N N 55 DOJ CAK HAK1 SING N N 56 DOJ CAL HAL1 SING N N 57 DOJ CAM HAM1 SING N N 58 DOJ CAN HAN1 SING N N 59 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor DOJ SMILES ACDLabs 12.01 FC(F)(F)c1cccc(c1)NC(=O)NC2C(OC(O)C)CN(CC2)Cc3ccccc3 DOJ InChI InChI 1.03 InChI=1S/C22H26F3N3O3/c1-15(29)31-20-14-28(13-16-6-3-2-4-7-16)11-10-19(20)27-21(30)26-18-9-5-8-17(12-18)22(23,24)25/h2-9,12,15,19-20,29H,10-11,13-14H2,1H3,(H2,26,27,30)/t15-,19-,20-/m0/s1 DOJ InChIKey InChI 1.03 KGJIMOVTOXSTNJ-YSSFQJQWSA-N DOJ SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 C[C@@H](O)O[C@H]1CN(CC[C@@H]1NC(=O)Nc2cccc(c2)C(F)(F)F)Cc3ccccc3 DOJ SMILES CACTVS 3.385 C[CH](O)O[CH]1CN(CC[CH]1NC(=O)Nc2cccc(c2)C(F)(F)F)Cc3ccccc3 DOJ SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 C[C@@H](O)O[C@H]1CN(CC[C@@H]1NC(=O)Nc2cccc(c2)C(F)(F)F)Cc3ccccc3 DOJ SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 CC(O)OC1CN(CCC1NC(=O)Nc2cccc(c2)C(F)(F)F)Cc3ccccc3 # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier DOJ "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "N-{(3S,4S)-1-benzyl-3-[(1S)-1-hydroxyethoxy]piperidin-4-yl}-N'-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea" DOJ "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 1-[(3~{S},4~{S})-3-[(1~{S})-1-oxidanylethoxy]-1-(phenylmethyl)piperidin-4-yl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site DOJ 'Create component' 2017-11-01 RCSB DOJ 'Other modification' 2017-11-01 RCSB DOJ 'Initial release' 2018-09-26 RCSB # loop_ _software.name _software.version _software.description rdkit 2025.03.3 'Core functionality.' pdbeccdutils 1.0.0 'Wrapper to provide 2D templates and molecular fragments.' # loop_ _pdbe_chem_comp_atom_depiction.comp_id _pdbe_chem_comp_atom_depiction.atom_id _pdbe_chem_comp_atom_depiction.element _pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_x _pdbe_chem_comp_atom_depiction.model_Cartn_y _pdbe_chem_comp_atom_depiction.pdbx_ordinal DOJ FBC F 3.000 3.375 1 DOJ CBB C 4.299 4.125 2 DOJ FBD F 5.049 2.826 3 DOJ FBE F 3.549 5.424 4 DOJ CAZ C 5.598 4.875 5 DOJ CBA C 6.897 4.125 6 DOJ CAY C 5.598 6.375 7 DOJ CAX C 6.897 7.125 8 DOJ CAW C 8.196 6.375 9 DOJ CAV C 8.196 4.875 10 DOJ NAU N 9.495 4.125 11 DOJ CAS C 9.495 2.625 12 DOJ OAT O 8.196 1.875 13 DOJ NAR N 10.794 1.875 14 DOJ CAQ C 10.794 0.375 15 DOJ CAE C 12.093 -0.375 16 DOJ CAF C 12.093 -1.875 17 DOJ OAD O 13.392 0.375 18 DOJ CAB C 14.691 -0.375 19 DOJ OAC O 15.990 0.375 20 DOJ CAA C 14.691 -1.875 21 DOJ CAP C 9.495 -0.375 22 DOJ CAO C 9.495 -1.875 23 DOJ NAG N 10.794 -2.625 24 DOJ CAH C 10.794 -4.125 25 DOJ CAI C 9.495 -4.875 26 DOJ CAJ C 8.196 -4.125 27 DOJ CAK C 6.897 -4.875 28 DOJ CAL C 6.897 -6.375 29 DOJ CAM C 8.196 -7.125 30 DOJ CAN C 9.495 -6.375 31 # loop_ _pdbe_chem_comp_bond_depiction.comp_id _pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_1 _pdbe_chem_comp_bond_depiction.atom_id_2 _pdbe_chem_comp_bond_depiction.value_order _pdbe_chem_comp_bond_depiction.bond_dir _pdbe_chem_comp_bond_depiction.pdbx_ordinal DOJ CAM CAN DOUBLE NONE 1 DOJ CAM CAL SINGLE NONE 2 DOJ CAN CAI SINGLE NONE 3 DOJ CAL CAK DOUBLE NONE 4 DOJ CAI CAH SINGLE NONE 5 DOJ CAI CAJ DOUBLE NONE 6 DOJ CAH NAG SINGLE NONE 7 DOJ CAK CAJ SINGLE NONE 8 DOJ NAG CAF SINGLE NONE 9 DOJ NAG CAO SINGLE NONE 10 DOJ CAF CAE SINGLE NONE 11 DOJ CAB OAC SINGLE NONE 12 DOJ CAB OAD SINGLE NONE 13 DOJ CAB CAA SINGLE BEGINDASH 14 DOJ CAO CAP SINGLE NONE 15 DOJ CAE OAD SINGLE BEGINWEDGE 16 DOJ CAE CAQ SINGLE NONE 17 DOJ CAP CAQ SINGLE NONE 18 DOJ CAQ NAR SINGLE BEGINDASH 19 DOJ NAR CAS SINGLE NONE 20 DOJ CAS OAT DOUBLE NONE 21 DOJ CAS NAU SINGLE NONE 22 DOJ NAU CAV SINGLE NONE 23 DOJ CAV CBA SINGLE NONE 24 DOJ CAV CAW DOUBLE NONE 25 DOJ CBA CAZ DOUBLE NONE 26 DOJ CAW CAX SINGLE NONE 27 DOJ CAZ CBB SINGLE NONE 28 DOJ CAZ CAY SINGLE NONE 29 DOJ CAX CAY DOUBLE NONE 30 DOJ FBE CBB SINGLE NONE 31 DOJ FBC CBB SINGLE NONE 32 DOJ CBB FBD SINGLE NONE 33 # loop_ _pdbe_chem_comp_substructure.comp_id _pdbe_chem_comp_substructure.substructure_name _pdbe_chem_comp_substructure.id _pdbe_chem_comp_substructure.substructure_type _pdbe_chem_comp_substructure.substructure_smiles _pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchis _pdbe_chem_comp_substructure.substructure_inchikeys DOJ MurckoScaffold S1 scaffold O=C(Nc1ccccc1)NC1CCN(Cc2ccccc2)CC1 InChI=1S/C19H23N3O/c23-19(20-17-9-5-2-6-10-17)21-18-11-13-22(14-12-18)15-16-7-3-1-4-8-16/h1-10,18H,11-15H2,(H2,20,21,23) FBRUCPZAISLOOV-UHFFFAOYSA-N DOJ phenyl F1 fragment c1ccccc1 InChI=1S/C6H6/c1-2-4-6-5-3-1/h1-6H UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N DOJ Z1563512128 F2 fragment 'C[C@H](O)CNC(=O)Nc1ccccc1' InChI=1S/C10H14N2O2/c1-8(13)7-11-10(14)12-9-5-3-2-4-6-9/h2-6,8,13H,7H2,1H3,(H2,11,12,14)/t8-/m0/s1 XEAXHIGGZMUNSO-QMMMGPOBSA-N # loop_ _pdbe_chem_comp_substructure_mapping.comp_id _pdbe_chem_comp_substructure_mapping.atom_id _pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_id _pdbe_chem_comp_substructure_mapping.substructure_ordinal DOJ CAZ S1 1 DOJ CBA S1 1 DOJ CAY S1 1 DOJ CAX S1 1 DOJ CAW S1 1 DOJ CAV S1 1 DOJ NAU S1 1 DOJ CAS S1 1 DOJ OAT S1 1 DOJ NAR S1 1 DOJ CAQ S1 1 DOJ CAE S1 1 DOJ CAF S1 1 DOJ CAP S1 1 DOJ CAO S1 1 DOJ NAG S1 1 DOJ CAH S1 1 DOJ CAI S1 1 DOJ CAJ S1 1 DOJ CAK S1 1 DOJ CAL S1 1 DOJ CAM S1 1 DOJ CAN S1 1 DOJ CAZ F1 1 DOJ CBA F1 1 DOJ CAV F1 1 DOJ CAW F1 1 DOJ CAX F1 1 DOJ CAY F1 1 DOJ CAI F1 2 DOJ CAN F1 2 DOJ CAM F1 2 DOJ CAL F1 2 DOJ CAK F1 2 DOJ CAJ F1 2 DOJ CAF F2 1 DOJ CAE F2 1 DOJ OAD F2 1 DOJ CAQ F2 1 DOJ NAR F2 1 DOJ CAS F2 1 DOJ OAT F2 1 DOJ NAU F2 1 DOJ CAV F2 1 DOJ CBA F2 1 DOJ CAZ F2 1 DOJ CAY F2 1 DOJ CAX F2 1 DOJ CAW F2 1 # _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.comp_id DOJ _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.exactmw 437.193 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.amw 437.462 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.lipinskiHBA 6 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.lipinskiHBD 3 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumRotatableBonds 8 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHBD 3 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHBA 4 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeavyAtoms 31 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAtoms 57 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeteroatoms 9 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAmideBonds 2 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.FractionCSP3 0.409 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumRings 3 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAromaticRings 2 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAliphaticRings 1 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSaturatedRings 1 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumHeterocycles 1 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAromaticHeterocycles 0 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSaturatedHeterocycles 1 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAliphaticHeterocycles 1 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumSpiroAtoms 0 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumBridgeheadAtoms 0 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumAtomStereoCenters 3 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.NumUnspecifiedAtomStereoCenters 0 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.labuteASA 215.290 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.tpsa 73.830 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.CrippenClogP 3.335 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.CrippenMR 108.920 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi0v 14.700 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi1v 7.699 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi2v 2.943 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi3v 2.943 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi4v 1.812 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi0n 40.700 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi1n 20.501 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi2n 2.943 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi3n 2.943 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.chi4n 1.812 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.hallKierAlpha -2.620 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa1 6.693 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa2 10.125 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.kappa3 6.949 _pdbe_chem_comp_rdkit_properties.Phi 2.186 # _pdbe_chem_comp_external_mappings.comp_id DOJ _pdbe_chem_comp_external_mappings.source UniChem _pdbe_chem_comp_external_mappings.resource PubChem _pdbe_chem_comp_external_mappings.resource_id 134817512 # loop_ _pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.comp_id _pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.atom_id _pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_x_rdkit _pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_y_rdkit _pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.Cartn_z_rdkit _pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_method _pdbe_chem_comp_rdkit_conformer.rdkit_ordinal DOJ FBC 7.758 2.206 -0.408 ETKDGv3 1 DOJ CBB 7.408 1.390 0.652 ETKDGv3 2 DOJ FBD 6.639 2.115 1.547 ETKDGv3 3 DOJ FBE 8.558 0.980 1.302 ETKDGv3 4 DOJ CAZ 6.634 0.204 0.134 ETKDGv3 5 DOJ CBA 5.329 0.325 -0.174 ETKDGv3 6 DOJ CAY 7.328 -1.078 -0.150 ETKDGv3 7 DOJ CAX 6.657 -2.105 -0.682 ETKDGv3 8 DOJ CAW 5.220 -1.974 -0.990 ETKDGv3 9 DOJ CAV 4.571 -0.827 -0.732 ETKDGv3 10 DOJ NAU 3.175 -0.714 -1.055 ETKDGv3 11 DOJ CAS 2.239 0.060 -0.291 ETKDGv3 12 DOJ OAT 2.574 0.547 0.824 ETKDGv3 13 DOJ NAR 0.901 0.234 -0.778 ETKDGv3 14 DOJ CAQ -0.179 0.773 0.054 ETKDGv3 15 DOJ CAE -0.899 -0.375 0.781 ETKDGv3 16 DOJ CAF -2.096 0.181 1.578 ETKDGv3 17 DOJ OAD 0.014 -0.985 1.679 ETKDGv3 18 DOJ CAB -0.182 -2.387 1.767 ETKDGv3 19 DOJ OAC 0.185 -2.815 3.049 ETKDGv3 20 DOJ CAA 0.708 -3.094 0.746 ETKDGv3 21 DOJ CAP -1.165 1.561 -0.820 ETKDGv3 22 DOJ CAO -2.375 2.034 0.001 ETKDGv3 23 DOJ NAG -3.045 0.931 0.729 ETKDGv3 24 DOJ CAH -3.851 0.049 -0.143 ETKDGv3 25 DOJ CAI -5.118 0.745 -0.566 ETKDGv3 26 DOJ CAJ -5.307 1.128 -1.842 ETKDGv3 27 DOJ CAK -6.550 1.828 -2.231 ETKDGv3 28 DOJ CAL -7.490 2.087 -1.314 ETKDGv3 29 DOJ CAM -7.286 1.675 0.090 ETKDGv3 30 DOJ CAN -6.163 1.039 0.446 ETKDGv3 31 DOJ HBA1 4.831 1.277 -0.045 ETKDGv3 32 DOJ HAY1 8.384 -1.189 0.061 ETKDGv3 33 DOJ HAX1 7.168 -3.037 -0.892 ETKDGv3 34 DOJ HAW1 4.694 -2.819 -1.416 ETKDGv3 35 DOJ HAU1 2.795 -1.307 -1.827 ETKDGv3 36 DOJ HAR1 0.650 -0.214 -1.689 ETKDGv3 37 DOJ HAQ1 0.241 1.476 0.808 ETKDGv3 38 DOJ HAE1 -1.271 -1.082 0.001 ETKDGv3 39 DOJ HAF1 -2.620 -0.649 2.100 ETKDGv3 40 DOJ HAF2 -1.720 0.856 2.379 ETKDGv3 41 DOJ HAB1 -1.244 -2.690 1.590 ETKDGv3 42 DOJ HAC1 -0.470 -2.410 3.676 ETKDGv3 43 DOJ HAA3 1.773 -2.829 0.918 ETKDGv3 44 DOJ HAA1 0.591 -4.195 0.841 ETKDGv3 45 DOJ HAA2 0.426 -2.797 -0.285 ETKDGv3 46 DOJ HAP2 -0.648 2.450 -1.242 ETKDGv3 47 DOJ HAP1 -1.504 0.942 -1.678 ETKDGv3 48 DOJ HAO1 -3.093 2.554 -0.669 ETKDGv3 49 DOJ HAO2 -2.035 2.794 0.738 ETKDGv3 50 DOJ HAH1 -3.271 -0.298 -1.024 ETKDGv3 51 DOJ HAH2 -4.154 -0.867 0.409 ETKDGv3 52 DOJ HAJ1 -4.554 0.937 -2.596 ETKDGv3 53 DOJ HAK1 -6.696 2.132 -3.259 ETKDGv3 54 DOJ HAL1 -8.399 2.601 -1.598 ETKDGv3 55 DOJ HAM1 -8.047 1.888 0.829 ETKDGv3 56 DOJ HAN1 -6.018 0.741 1.477 ETKDGv3 57 #