PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=394-6M-L70)

Interfaces in PDB 4qwc crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.40 Å

TERNARY CRYSTAL STRUCTURES OF A Y-FAMILY DNA POLYMERASE DPO4 FROM SULFOLOBUS SOLFATARICUS IN COMPLEX WITH DNA AND L-DCDP

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`95`	`9`	`3688`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`105`	`39`	`18005`	`908.4`	`-13.6`	`0.385`	`21`	`0`	`0`	`0.473`
2	`2`		F	`90`	`9`	`3720`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`101`	`35`	`17895`	`868.2`	`-13.1`	`0.436`	`18`	`0`	`0`	`0.408`
3	`3`		C	`55`	`13`	`3688`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`50`	`12`	`2825`	`530.0`	`-7.9`	`0.578`	`32`	`0`	`0`	`0.973`
4	`4`		F	`54`	`13`	`3720`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`46`	`12`	`2828`	`521.6`	`-8.2`	`0.601`	`32`	`0`	`0`	`0.952`
5	`5`		E	`60`	`8`	`2828`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`62`	`20`	`17895`	`503.7`	`-11.2`	`0.350`	`11`	`0`	`0`	`0.323`
6	`6`		B	`58`	`8`	`2825`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`61`	`23`	`18005`	`488.6`	`-7.9`	`0.425`	`15`	`0`	`0`	`0.393`
7	`7`		A	`31`	`10`	`18005`	`x`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`3_445`	`32`	`10`	`18005`	`295.1`	`3.6`	`0.820`	`4`	`5`	`0`	`0.000`
	`8`		D	`28`	`9`	`17895`	`x`	D	x-1/2,-y-1/2,-z-1	`3_444`	`30`	`10`	`17895`	`240.5`	`2.2`	`0.755`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`267.8`	`2.9`	`0.787`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
8	`9`		D	`28`	`9`	`17895`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`33`	`9`	`18005`	`293.2`	`-4.0`	`0.162`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		D	`31`	`9`	`17895`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`29`	`9`	`18005`	`283.7`	`-4.8`	`0.109`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`288.5`	`-4.4`	`0.136`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
9	`11`		[LTP]D:405	`22`	`1`	`513`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`43`	`18`	`17895`	`264.5`	`3.3`	`0.208`	`7`	`0`	`0`	`0.003`
	`12`		[LTP]A:405	`22`	`1`	`507`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`42`	`18`	`18005`	`251.0`	`3.0`	`0.197`	`7`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`257.7`	`3.2`	`0.203`	`7`	`0`	`0`	`0.003`
10	`13`		C	`30`	`4`	`3688`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`4_544`	`31`	`10`	`17895`	`263.9`	`-0.2`	`0.580`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		F	`24`	`4`	`3720`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`4_544`	`26`	`9`	`18005`	`216.9`	`0.6`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`240.4`	`0.2`	`0.556`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		B	`19`	`2`	`2825`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`4_544`	`22`	`7`	`17895`	`193.2`	`0.4`	`0.622`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
12	`16`		E	`18`	`2`	`2828`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`4_544`	`20`	`7`	`18005`	`181.8`	`-1.0`	`0.460`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`17`		D	`26`	`10`	`17895`	`x`	D	-x,y-1/2,-z-1/2	`4_544`	`22`	`6`	`17895`	`180.3`	`-1.0`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`18`		A	`26`	`10`	`18005`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`4_545`	`22`	`5`	`18005`	`177.2`	`-1.3`	`0.386`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`178.8`	`-1.2`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		[DOC]B:101	`15`	`1`	`429`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`15`	`1`	`2825`	`118.3`	`1.9`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[DOC]E:101	`14`	`1`	`434`	`cf`	E	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`2828`	`112.4`	`0.7`	`0.476`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		[ACT]A:403	`4`	`1`	`183`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`18005`	`95.9`	`-0.6`	`0.561`	`0`	`0`	`0`	`0.017`
17	`22`		[DOC]B:101	`10`	`1`	`429`	`◊`	[LTP]A:405	x,y,z	`1_555`	`11`	`1`	`507`	`91.9`	`4.1`	`0.286`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`23`		[DOC]B:101	`7`	`1`	`429`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`3688`	`82.8`	`0.5`	`0.470`	`4`	`0`	`0`	`0.058`
19	`24`		[ACT]D:404	`4`	`1`	`182`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`17895`	`82.5`	`0.1`	`0.701`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`25`		[ACT]A:404	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`9`	`18005`	`77.3`	`0.4`	`0.676`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`26`		[DOC]E:101	`9`	`1`	`434`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`3720`	`72.7`	`0.6`	`0.482`	`3`	`0`	`0`	`0.032`
22	`27`		[LTP]A:405	`6`	`1`	`507`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`3688`	`68.8`	`0.6`	`0.374`	`4`	`0`	`0`	`0.024`
23	`28`		[DOC]E:101	`7`	`1`	`434`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`17895`	`68.0`	`-2.3`	`0.226`	`2`	`0`	`0`	`0.064`
24	`29`		D	`9`	`3`	`17895`	`◊`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`13`	`6`	`18005`	`66.7`	`2.2`	`0.834`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
25	`30`		[LTP]D:405	`6`	`1`	`513`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`3720`	`66.4`	`0.9`	`0.376`	`3`	`0`	`0`	`0.009`
26	`31`		[DOC]E:101	`8`	`1`	`434`	`◊`	[LTP]D:405	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`513`	`59.7`	`2.4`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`32`		[DOC]B:101	`5`	`1`	`429`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`18005`	`50.9`	`-1.9`	`0.231`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
28	`33`		F	`7`	`2`	`3720`	`◊`	D	x-1/2,-y-1/2,-z-1	`3_444`	`3`	`1`	`17895`	`50.3`	`0.6`	`0.685`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`34`		F	`4`	`1`	`3720`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`6`	`2`	`18005`	`41.4`	`-1.2`	`0.422`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`35`		C	`3`	`1`	`3688`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`17895`	`19.7`	`-0.3`	`0.529`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`30.6`	`-0.7`	`0.475`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		[CA]D:402	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`17895`	`31.9`	`-6.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.161`
	`37`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`18005`	`29.4`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.161`
	*Average:*													`30.7`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.161`
31	`38`		[CA]D:401	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`17895`	`31.8`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.110`
32	`39`		[CA]A:401	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`18005`	`29.4`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
	`40`		[CA]D:403	`1`	`1`	`85`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17895`	`29.1`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
	*Average:*													`29.2`	`-6.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.167`
33	`41`		[ACT]A:404	`4`	`1`	`183`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2825`	`27.7`	`-1.2`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.051`
34	`42`		[LTP]D:405	`3`	`1`	`513`	`f`	[CA]D:403	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`27.3`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.215`
	`43`		[LTP]A:405	`3`	`1`	`507`	`f`	[CA]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`26.3`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.215`
	`44`		[LTP]D:405	`5`	`1`	`513`	`f`	[CA]D:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`24.9`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.215`
	`45`		[LTP]A:405	`5`	`1`	`507`	`f`	[CA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`23.2`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.215`
	*Average:*													`25.4`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.215`
35	`46`		[DOC]E:101	`3`	`1`	`434`	`f`	[ACT]D:404	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`182`	`16.0`	`-0.7`	`0.407`	`0`	`0`	`0`	`0.172`
36	`47`		[CA]D:401	`1`	`1`	`85`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`2828`	`14.5`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
37	`48`		[CA]D:403	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]D:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`12.3`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.074`
38	`49`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`f`	[CA]A:401	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`11.9`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.097`
39	`50`		[DOC]B:101	`3`	`1`	`429`	`◊`	[CA]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`85`	`10.0`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.035`
40	`51`		A	`1`	`1`	`18005`	`◊`	D	x-1/2,-y-1/2,-z	`3_445`	`3`	`1`	`17895`	`8.7`	`0.2`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`52`		D	`1`	`1`	`17895`	`◊`	E	x-1/2,-y-1/2,-z-1	`3_444`	`1`	`1`	`2828`	`3.9`	`-0.3`	`0.270`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`53`		D	`1`	`1`	`17895`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z-1/2	`4_544`	`1`	`1`	`18005`	`2.2`	`0.0`	`0.604`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`54`		A	`1`	`1`	`18005`	`◊`	B	x-1/2,-y-1/2,-z	`3_445`	`1`	`1`	`2825`	`1.3`	`-0.0`	`0.449`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`55`		[DOC]B:101	`1`	`1`	`429`	`f`	[ACT]A:404	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`183`	`0.5`	`-0.0`	`0.408`	`0`	`0`	`0`	`0.002`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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