PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=839-6P-4NG)

Interfaces in PDB 3jpt crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.15 Å

TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE BETA WITH A DIDEOXY TERMINATED PRIMER AND 2'-DEOXYGUANOSINE 5'-BETA, GAMMA-FLUORO CHLORO METHYLENE TRIPHOSPHATE

Interfaces

##		Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
`1`		T	`77`	`8`	`3774`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`81`	`27`	`17060`	`684.4`	`-3.6`	`0.487`	`12`	`0`	`0`	`0.081`
`2`		T	`45`	`10`	`3774`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`43`	`9`	`2187`	`429.4`	`-6.2`	`0.519`	`24`	`0`	`0`	`1.000`
`3`		D	`36`	`3`	`1376`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`42`	`17`	`17060`	`365.5`	`-7.1`	`0.395`	`10`	`0`	`0`	`0.130`
`4`		[GFC]A:338	`32`	`1`	`613`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`51`	`19`	`17060`	`310.6`	`2.2`	`0.699`	`7`	`0`	`0`	`0.011`
`5`		T	`23`	`5`	`3774`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`25`	`5`	`1376`	`231.4`	`-3.7`	`0.553`	`16`	`0`	`0`	`1.000`
`6`		P	`26`	`3`	`2187`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`30`	`17`	`17060`	`230.7`	`-6.4`	`0.207`	`4`	`0`	`0`	`0.100`
`7`		A	`26`	`9`	`17060`	`x`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`26`	`10`	`17060`	`223.4`	`-2.5`	`0.210`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`8`		A	`28`	`7`	`17060`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`22`	`7`	`17060`	`220.2`	`1.8`	`0.747`	`6`	`1`	`0`	`0.000`
`9`		A	`18`	`7`	`17060`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`26`	`10`	`17060`	`204.5`	`4.1`	`0.914`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
`10`		A	`28`	`9`	`17060`	`◊`	P	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`22`	`2`	`2187`	`196.4`	`1.8`	`0.559`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
`11`		A	`19`	`8`	`17060`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`17`	`2`	`3774`	`162.9`	`0.3`	`0.604`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
`12`		A	`16`	`8`	`17060`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`16`	`6`	`17060`	`133.7`	`3.0`	`0.874`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
`13`		[DOC]P:10	`9`	`1`	`426`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`9`	`17060`	`119.0`	`0.7`	`0.397`	`2`	`0`	`0`	`0.002`
`14`		A	`14`	`6`	`17060`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`10`	`3`	`17060`	`111.1`	`-1.2`	`0.359`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`15`		[DOC]P:10	`14`	`1`	`426`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`15`	`1`	`2187`	`111.1`	`2.5`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`16`		D	`15`	`1`	`1376`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`10`	`3`	`17060`	`108.7`	`2.5`	`0.869`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`17`		[DOC]P:10	`13`	`1`	`426`	`◊`	[GFC]A:338	x,y,z	`1_555`	`17`	`1`	`613`	`92.9`	`2.6`	`0.536`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`18`		[CL]A:344	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`8`	`17060`	`75.8`	`-12.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.150`
`19`		[GFC]A:338	`8`	`1`	`613`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`10`	`2`	`3774`	`75.2`	`1.0`	`0.639`	`3`	`0`	`0`	`0.003`
`20`		[CL]A:345	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`17060`	`68.5`	`-9.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.115`
`21`		T	`12`	`2`	`3774`	`◊`	A	x,y,z-1	`1_554`	`8`	`3`	`17060`	`65.4`	`-1.2`	`0.400`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`22`		[CL]A:343	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`17060`	`63.8`	`-9.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.120`
`23`		[DOC]P:10	`5`	`1`	`426`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`3774`	`60.9`	`0.2`	`0.450`	`3`	`0`	`0`	`0.072`
`24`		[NA]A:342	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`17060`	`59.0`	`-9.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.113`
`25`		[NA]A:341	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`17060`	`56.8`	`-8.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.106`
`26`		A	`7`	`2`	`17060`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`9`	`2`	`3774`	`51.6`	`-1.6`	`0.418`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
`27`		[NA]A:340	`1`	`1`	`125`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`17060`	`38.3`	`-5.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.070`
`28`		[NA]A:341	`1`	`1`	`125`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2187`	`35.1`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.064`
`29`		D	`4`	`1`	`1376`	`◊`	T	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`4`	`1`	`3774`	`33.2`	`0.0`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`30`		[NA]A:342	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`1376`	`31.9`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.052`
`31`		[MG]A:339	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`17060`	`31.0`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.050`
`32`		[MG]A:339	`1`	`1`	`98`	`f`	[GFC]A:338	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`613`	`30.5`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
`33`		[NA]A:340	`1`	`1`	`125`	`f`	[GFC]A:338	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`613`	`29.8`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
`34`		[DOC]P:10	`6`	`1`	`426`	`◊`	[NA]A:340	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`26.0`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.023`
`35`		A	`5`	`3`	`17060`	`◊`	T	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`3774`	`20.5`	`-1.0`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`36`		[CL]A:343	`1`	`1`	`125`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`1376`	`15.0`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
`37`		[NA]A:340	`1`	`1`	`125`	`f`	[MG]A:339	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`14.6`	`-2.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.036`
`38`		[CL]A:345	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3774`	`7.3`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
`39`		A	`1`	`1`	`17060`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`1`	`1`	`17060`	`4.8`	`-0.2`	`0.337`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`40`		A	`1`	`1`	`17060`	`◊`	P	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`2187`	`3.2`	`-0.1`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
`41`		[CL]A:343	`1`	`1`	`125`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`3774`	`3.1`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
`42`		A	`1`	`1`	`17060`	`x`	A	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`17060`	`2.0`	`0.1`	`0.768`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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