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L-peptide linking C3 H7 N O3 105.093 y SERINE L-peptide linking C4 H9 N O3 119.119 y THREONINE L-peptide linking C11 H12 N2 O2 204.225 y TRYPTOPHAN L-peptide linking C9 H11 N O3 181.189 y TYROSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 117.146 y VALINE L-peptide linking N 1 N N N 2 S C N 3 N C N 4 N O N 5 N C N 6 N O N 7 N H N 8 N H N 9 N H N 10 N H N 11 N H N 12 N H N 13 N H N 14 N N N 15 S C N 16 N C N 17 N O N 18 N C N 19 N C N 20 N C N 21 N N N 22 N C N 23 N N N 24 N N N 25 N O N 26 N H N 27 N H N 28 N H N 29 N H N 30 N H N 31 N H N 32 N H N 33 N H N 34 N H N 35 N H N 36 N H N 37 N H N 38 N H N 39 N H N 40 N H N 41 N N N 42 S C N 43 N C N 44 N O N 45 N C N 46 N C N 47 N O N 48 N N N 49 N O N 50 N H N 51 N H N 52 N H N 53 N H N 54 N H N 55 N H N 56 N H N 57 N H N 58 N N N 59 S C N 60 N C N 61 N O N 62 N C N 63 N C N 64 N O N 65 N O N 66 N O N 67 N H N 68 N H N 69 N H N 70 N H N 71 N H N 72 N H N 73 N H N 74 N N N 75 R C N 76 N C N 77 N O N 78 N C N 79 N S N 80 N O N 81 N H N 82 N H N 83 N H 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N H N 286 N H N 287 N N N 288 S C N 289 N C N 290 N O N 291 N C N 292 N O N 293 N O N 294 N H N 295 N H N 296 N H N 297 N H N 298 N H N 299 N H N 300 N H N 301 N N N 302 S C N 303 N C N 304 N O N 305 R C N 306 N O N 307 N C N 308 N O N 309 N H N 310 N H N 311 N H N 312 N H N 313 N H N 314 N H N 315 N H N 316 N H N 317 N H N 318 N N N 319 S C N 320 N C N 321 N O N 322 N C Y 323 N C Y 324 N C Y 325 N C Y 326 N N Y 327 N C Y 328 N C Y 329 N C Y 330 N C Y 331 N C N 332 N O N 333 N H N 334 N H N 335 N H N 336 N H N 337 N H N 338 N H N 339 N H N 340 N H N 341 N H N 342 N H N 343 N H N 344 N H N 345 N N N 346 S C N 347 N C N 348 N O N 349 N C Y 350 N C Y 351 N C Y 352 N C Y 353 N C Y 354 N C Y 355 N C N 356 N O N 357 N O N 358 N H N 359 N H N 360 N H N 361 N H N 362 N H N 363 N H N 364 N H N 365 N H N 366 N H N 367 N H N 368 N H N 369 N N N 370 S C N 371 N C N 372 N O N 373 N C N 374 N C N 375 N C N 376 N O N 377 N H N 378 N H N 379 N H N 380 N H N 381 N H N 382 N H N 383 N H N 384 N H N 385 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83 N sing N 84 N sing N 85 N sing N 86 N sing N 87 N sing N 88 N sing N 89 N doub N 90 N sing N 91 N sing N 92 N sing N 93 N sing N 94 N sing N 95 N sing N 96 N sing N 97 N doub N 98 N sing N 99 N sing N 100 N sing N 101 N sing N 102 N sing N 103 N sing N 104 N sing N 105 N sing N 106 N sing N 107 N sing N 108 N doub N 109 N sing N 110 N sing N 111 N sing N 112 N sing N 113 N sing N 114 N sing N 115 N sing N 116 N doub N 117 N sing N 118 N sing N 119 N sing N 120 N sing N 121 N sing N 122 N sing N 123 N sing N 124 N sing N 125 N sing N 126 N doub N 127 N sing N 128 N sing N 129 N sing N 130 N sing N 131 N sing N 132 N sing N 133 N sing N 134 N sing N 135 N doub N 136 N sing N 137 N sing N 138 N sing N 139 N sing Y 140 N sing Y 141 N doub Y 142 N doub N 143 N sing Y 144 N sing N 145 N sing Y 146 N sing N 147 N sing N 148 N sing N 149 N sing N 150 N sing N 151 N sing N 152 N sing N 153 N sing N 154 N sing N 155 N sing N 156 N doub N 157 N sing N 158 N sing N 159 N sing N 160 N sing N 161 N sing N 162 N sing N 163 N sing N 164 N sing N 165 N sing N 166 N sing N 167 N sing N 168 N sing N 169 N sing N 170 N sing N 171 N sing N 172 N sing N 173 N sing N 174 N sing N 175 N sing N 176 N sing N 177 N doub N 178 N sing N 179 N sing N 180 N sing N 181 N sing N 182 N sing N 183 N sing N 184 N sing N 185 N sing N 186 N sing N 187 N sing N 188 N sing N 189 N sing N 190 N sing N 191 N sing N 192 N sing N 193 N sing N 194 N sing N 195 N sing N 196 N sing N 197 N sing N 198 N doub N 199 N sing N 200 N sing N 201 N sing N 202 N sing N 203 N sing N 204 N sing N 205 N sing N 206 N sing N 207 N sing N 208 N sing N 209 N sing N 210 N sing N 211 N sing N 212 N sing N 213 N sing N 214 N sing N 215 N sing N 216 N sing N 217 N sing N 218 N sing N 219 N sing N 220 N sing N 221 N sing N 222 N doub N 223 N sing N 224 N sing N 225 N sing N 226 N sing N 227 N sing N 228 N sing N 229 N sing N 230 N sing N 231 N sing N 232 N sing N 233 N sing N 234 N sing N 235 N sing N 236 N sing N 237 N sing N 238 N sing N 239 N sing N 240 N sing N 241 N doub N 242 N sing N 243 N sing N 244 N sing N 245 N sing Y 246 N doub Y 247 N sing Y 248 N sing N 249 N sing Y 250 N doub N 251 N sing Y 252 N doub N 253 N sing Y 254 N sing N 255 N sing N 256 N sing N 257 N sing N 258 N sing N 259 N sing N 260 N sing N 261 N sing N 262 N sing N 263 N sing N 264 N doub N 265 N sing N 266 N sing N 267 N sing N 268 N sing N 269 N sing N 270 N sing N 271 N sing N 272 N sing N 273 N sing N 274 N sing N 275 N sing N 276 N sing N 277 N sing N 278 N sing N 279 N sing N 280 N sing N 281 N doub N 282 N sing N 283 N sing N 284 N sing N 285 N sing N 286 N sing N 287 N sing N 288 N sing N 289 N sing N 290 N sing N 291 N sing N 292 N sing N 293 N sing N 294 N doub N 295 N sing N 296 N sing N 297 N sing N 298 N sing N 299 N sing N 300 N sing N 301 N sing N 302 N sing N 303 N sing N 304 N sing N 305 N sing N 306 N sing N 307 N sing N 308 N sing N 309 N sing N 310 N doub N 311 N sing N 312 N sing N 313 N sing N 314 N sing Y 315 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pdb_00006vyv RIGID BODY FIT 6VYV 9559 6.33 FSC 0.143 CUT-OFF POINT 7.5 1 PHASE FLIPPING ONLY 1,2 Ross river virus (strain T48) 0 RECOMBINANT VIRUS 11032 Ross river virus (strain T48) BHK-21 10036 Mesocricetus auratus PARTICLE 1 1 SINGLE PARTICLE 30.0 GATAN K2 BASE (4k x 4k) 300 100 NITROGEN FIELD EMISSION GUN FLOOD BEAM FEI TITAN KRIOS BRIGHT FIELD 2.7 18000 1 COPPER C-flat 6VYV I PARTICLE SELECTION 1 Appion 2.2 IMAGE ACQUISITION 1 Leginon MASKING CTF CORRECTION 1 CTFFIND LAYERLINE INDEXING DIFFRACTION INDEXING MODEL FITTING 1 EMfit OTHER INITIAL EULER ASSIGNMENT 1 FINAL EULER ASSIGNMENT 1 jspr CLASSIFICATION 1 RECONSTRUCTION 1 jspr MODEL REFINEMENT 1 PHENIX 3 NO NO NO YES NO YES STRAIN VIRION ETHANE 6VYV 85 GATAN CRYOPLUNGE 3 42719.906 E1 glycoprotein 3.4.21.90 UNP residues 817-1209 4 man polymer 38240.188 E2 glycoprotein 3.4.21.90 UNP residues 335-675 4 man polymer 23743.719 Fab CHK-265 heavy chain 4 man polymer 22888.404 Fab CHK-265 light chain 4 man polymer no no YEHTATIPNVVGFPYKAHIERNGFSPMTLQLEVVETSWEPTLNLEYITCEYKTVVPSPFIKCCGTSECSSKEQPDYQCKV YTGVYPFMWGGAYCFCDSENTQLSEAYVDRSDVCKHDHASAYKAHTASLKATIRISYGTINQTTEAFVNGEHAVNVGGSK FIFGPISTAWSPFDNKIVVYKDDVYNQDFPPYGSGQPGRFGDIQSRTVESKDLYANTALKLSRPSPGVVHVPYTPTPSGF KYWLKEKGSSLNTKAPFGCKIKTNPVRAMDCAVGSIPVSMDIPDSAFTRVVDAPAVTDLSCQVVVCTHSSDFGGVATLSY KTDKPGKCAVHSHSNVATLQEATVDVKEDGKVTVHFSTASASPAFKVSVCDAKTTCTAACEPPKDHIVPYGAS YEHTATIPNVVGFPYKAHIERNGFSPMTLQLEVVETSWEPTLNLEYITCEYKTVVPSPFIKCCGTSECSSKEQPDYQCKV YTGVYPFMWGGAYCFCDSENTQLSEAYVDRSDVCKHDHASAYKAHTASLKATIRISYGTINQTTEAFVNGEHAVNVGGSK FIFGPISTAWSPFDNKIVVYKDDVYNQDFPPYGSGQPGRFGDIQSRTVESKDLYANTALKLSRPSPGVVHVPYTPTPSGF KYWLKEKGSSLNTKAPFGCKIKTNPVRAMDCAVGSIPVSMDIPDSAFTRVVDAPAVTDLSCQVVVCTHSSDFGGVATLSY KTDKPGKCAVHSHSNVATLQEATVDVKEDGKVTVHFSTASASPAFKVSVCDAKTTCTAACEPPKDHIVPYGAS A,B,C,D polypeptide(L) no no SVTEHFNVYKATRPYLAYCADCGDGYFCYSPVAIEKIRDEAPDGMLKIQVSAQIGLDKAGTHAHTKIRYMAGHDVQESKR DSLRVYTSAACSIHGTMGHFIVAHCPPGDYLKVSFEDADSHVKACKVQYKHDPLPVGREKFVVRPHFGVELPCTSYQLTT 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I,J,K,L polypeptide(L) no no QAVVTQESALTTSPGETVTLTCRSNIGAVTSSNCANWVQEKPDHFFTGLIGDTNNRRSGVPARFSGSLIGDKAALTITGA QTEDEAIYFCALWYNNLWVFGGGTKLTVLGQPKSSPSVTLFPPSSEELETNKATLVCTITDFYPGVVTVDWKVDGTPVTQ GMETTQPSKQSNNKYMASSYLTLTARAWERHSSYSCQVTHEGHTVEKSLSR QAVVTQESALTTSPGETVTLTCRSNIGAVTSSNCANWVQEKPDHFFTGLIGDTNNRRSGVPARFSGSLIGDKAALTITGA QTEDEAIYFCALWYNNLWVFGGGTKLTVLGQPKSSPSVTLFPPSSEELETNKATLVCTITDFYPGVVTVDWKVDGTPVTQ GMETTQPSKQSNNKYMASSYLTLTARAWERHSSYSCQVTHEGHTVEKSLSR M,N,O,P polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n RRV T48 Syrian golden hamster sample 1 393 11032 Ross river virus (strain T48) 10036 Mesocricetus auratus Biological sequence RRV T48 Syrian golden hamster sample 1 341 11032 Ross river virus 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TYR 398 P CZ TYR 180 1 Y 1 P OH TYR 398 P OH TYR 180 1 Y 1 P CB LEU 399 P CB LEU 181 1 Y 1 P CG LEU 399 P CG LEU 181 1 Y 1 P CD1 LEU 399 P CD1 LEU 181 1 Y 1 P CD2 LEU 399 P CD2 LEU 181 1 Y 1 P CB THR 400 P CB THR 182 1 Y 1 P OG1 THR 400 P OG1 THR 182 1 Y 1 P CG2 THR 400 P CG2 THR 182 1 Y 1 P CB LEU 401 P CB LEU 183 1 Y 1 P CG LEU 401 P CG LEU 183 1 Y 1 P CD1 LEU 401 P CD1 LEU 183 1 Y 1 P CD2 LEU 401 P CD2 LEU 183 1 Y 1 P CB THR 402 P CB THR 184 1 Y 1 P OG1 THR 402 P OG1 THR 184 1 Y 1 P CG2 THR 402 P CG2 THR 184 1 Y 1 P CB ALA 403 P CB ALA 185 1 Y 1 P CB ARG 404 P CB ARG 186 1 Y 1 P CG ARG 404 P CG ARG 186 1 Y 1 P CD ARG 404 P CD ARG 186 1 Y 1 P NE ARG 404 P NE ARG 186 1 Y 1 P CZ ARG 404 P CZ ARG 186 1 Y 1 P NH1 ARG 404 P NH1 ARG 186 1 Y 1 P NH2 ARG 404 P NH2 ARG 186 1 Y 1 P CB ALA 405 P CB ALA 187 1 Y 1 P CB TRP 406 P CB TRP 188 1 Y 1 P CG TRP 406 P CG TRP 188 1 Y 1 P CD1 TRP 406 P CD1 TRP 188 1 Y 1 P CD2 TRP 406 P CD2 TRP 188 1 Y 1 P NE1 TRP 406 P NE1 TRP 188 1 Y 1 P CE2 TRP 406 P CE2 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1 P CE1 TYR 412 P CE1 TYR 194 1 Y 1 P CE2 TYR 412 P CE2 TYR 194 1 Y 1 P CZ TYR 412 P CZ TYR 194 1 Y 1 P OH TYR 412 P OH TYR 194 1 Y 1 P CB SER 413 P CB SER 195 1 Y 1 P OG SER 413 P OG SER 195 1 Y 1 P CB CYS 414 P CB CYS 196 1 Y 1 P SG CYS 414 P SG CYS 196 1 Y 1 P CB GLN 415 P CB GLN 197 1 Y 1 P CG GLN 415 P CG GLN 197 1 Y 1 P CD GLN 415 P CD GLN 197 1 Y 1 P OE1 GLN 415 P OE1 GLN 197 1 Y 1 P NE2 GLN 415 P NE2 GLN 197 1 Y 1 P CB VAL 416 P CB VAL 198 1 Y 1 P CG1 VAL 416 P CG1 VAL 198 1 Y 1 P CG2 VAL 416 P CG2 VAL 198 1 Y 1 P CB THR 417 P CB THR 199 1 Y 1 P OG1 THR 417 P OG1 THR 199 1 Y 1 P CG2 THR 417 P CG2 THR 199 1 Y 1 P CB HIS 418 P CB HIS 200 1 Y 1 P CG HIS 418 P CG HIS 200 1 Y 1 P ND1 HIS 418 P ND1 HIS 200 1 Y 1 P CD2 HIS 418 P CD2 HIS 200 1 Y 1 P CE1 HIS 418 P CE1 HIS 200 1 Y 1 P NE2 HIS 418 P NE2 HIS 200 1 Y 1 P CB GLU 419 P CB GLU 201 1 Y 1 P CG GLU 419 P CG GLU 201 1 Y 1 P CD GLU 419 P CD GLU 201 1 Y 1 P OE1 GLU 419 P OE1 GLU 201 1 Y 1 P OE2 GLU 419 P OE2 GLU 201 1 Y 1 P CB HIS 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PHE 311 312 -132.11 1 E E GLY HIS 72 73 141.77 1 E E HIS ASP 73 74 -132.07 1 E E SER HIS 120 121 148.81 1 E E HIS VAL 121 122 146.84 1 E E PRO PRO 172 173 -139.85 1 E E ILE ASP 222 223 -141.24 1 E E GLN PHE 236 237 -136.25 1 E E PRO THR 291 292 -149.04 1 F F GLY HIS 72 73 139.86 1 F F HIS ASP 73 74 -141.74 1 F F PRO PRO 172 173 -130.96 1 F F GLN PHE 236 237 -145.12 1 F F THR SER 238 239 -116.86 1 G G GLY HIS 72 73 139.07 1 G G HIS ASP 73 74 -135.18 1 G G ARG PRO 144 145 -149.52 1 G G ILE ASP 222 223 -145.33 1 G G ASP GLN 246 247 -142.34 1 H H THR GLU 3 4 149.72 1 H H GLY HIS 72 73 140.92 1 H H HIS ASP 73 74 -140.15 1 H H THR PRO 171 172 -140.09 1 H H THR SER 211 212 144.65 1 H H ILE ASP 222 223 -148.19 1 I I GLY TYR 26 27 148.11 1 I I THR PHE 28 29 146.86 1 I I PHE ILE 101 102 -131.77 1 J J SER GLY 25 26 -148.68 1 J J ILE TYR 51 52 142.82 1 J J PHE ILE 101 102 -128.18 1 K K PHE ILE 101 102 -134.43 1 L L PRO THR 58 59 148.08 1 L L PHE ILE 101 102 -136.08 1 P P ASP HIS 261 262 146.90 1 19.18 2.50 121.70 140.88 N N N C N CA THR GLN GLN 383 384 384 Y 1 A GLU 35 -34.38 128.42 1 A GLU 39 53.81 72.62 1 A CYS 63 64.18 63.37 1 A TYR 85 -107.83 76.94 1 A SER 104 -174.01 135.63 1 A SER 128 -170.96 143.07 1 A ALA 169 -91.20 55.47 1 A ASP 183 -160.05 111.84 1 A TYR 192 -69.39 90.97 1 A ARG 206 -72.78 -74.56 1 A LEU 213 177.62 169.96 1 A ALA 215 -172.48 124.94 1 A THR 263 -79.72 -167.80 1 A ASN 264 -25.54 -54.66 1 A MET 269 -69.05 96.23 1 A ASP 284 -92.42 34.88 1 A HIS 308 -90.42 -66.48 1 A SER 310 -83.52 -155.66 1 A ALA 364 -114.97 -164.35 1 B GLU 35 -48.01 151.80 1 B SER 37 -35.09 129.21 1 B TYR 46 -33.71 120.13 1 B GLU 72 75.96 31.72 1 B TYR 81 -69.50 96.89 1 B TYR 85 -109.22 73.17 1 B GLN 102 -104.96 76.78 1 B GLU 105 -101.40 -167.53 1 B HIS 125 -129.04 -164.87 1 B THR 132 -103.58 75.80 1 B ALA 146 -175.51 -172.21 1 B ALA 169 -90.17 47.10 1 B TRP 170 -68.18 99.50 1 B LYS 181 -26.84 -54.24 1 B TYR 214 -85.22 -158.60 1 B ASN 216 -145.12 19.92 1 B PRO 232 -76.90 23.43 1 B TYR 233 -68.62 98.77 1 B LYS 254 -103.04 50.27 1 B PHE 257 82.73 -1.90 1 B THR 263 -77.13 -161.63 1 B ASP 270 73.95 45.38 1 B ASP 298 61.28 63.63 1 B THR 307 -79.94 -169.61 1 B HIS 308 -61.80 -71.33 1 B SER 310 -79.26 -156.55 1 B SER 362 -108.72 69.19 1 B ALA 372 178.39 -176.25 1 C GLU 35 -47.54 -178.06 1 C SER 37 -33.03 129.13 1 C GLU 99 -93.41 57.09 1 C HIS 125 -128.03 -166.42 1 C SER 128 -140.70 -158.58 1 C TRP 170 -68.65 95.33 1 C ASP 182 -104.31 47.50 1 C ASP 183 177.17 155.79 1 C SER 194 -95.57 39.45 1 C LEU 213 -170.03 146.86 1 C THR 217 -101.54 -169.32 1 C GLU 246 -94.87 30.34 1 C THR 263 -68.18 -176.78 1 C ASP 270 68.90 62.41 1 C ALA 272 -91.33 47.85 1 C GLN 302 -155.65 86.30 1 C VAL 304 -121.95 -64.04 1 C SER 310 -82.81 -156.35 1 C ALA 316 -127.19 -168.55 1 C HIS 333 -95.87 52.62 1 C ASP 349 63.51 69.98 1 C SER 357 -174.09 -177.46 1 C THR 358 -170.22 -172.68 1 C ALA 361 -94.25 -61.38 1 C LYS 366 -99.58 57.60 1 C LYS 384 -98.25 -62.17 1 D THR 6 -161.68 115.53 1 D HIS 18 -100.23 71.71 1 D THR 36 -141.19 47.54 1 D SER 37 -38.61 136.37 1 D GLU 39 49.82 70.73 1 D TYR 46 -39.75 149.17 1 D CYS 63 81.47 14.90 1 D ALA 92 -114.56 -162.27 1 D LYS 115 -132.38 -35.01 1 D HIS 118 -127.18 -167.53 1 D HIS 125 -119.32 -164.68 1 D GLN 142 -168.03 -169.61 1 D SER 167 -92.02 33.88 1 D SER 194 -118.47 55.08 1 D PRO 224 -79.75 -167.90 1 D VAL 231 -101.75 77.40 1 D PHE 257 80.39 4.54 1 D THR 263 -74.98 -165.42 1 D ASN 264 -29.35 -53.24 1 D SER 309 -175.73 -169.88 1 D SER 310 -79.04 -159.03 1 D PHE 312 -44.01 -71.68 1 D ASP 349 61.39 67.14 1 D THR 358 -176.12 138.05 1 D SER 362 -111.39 55.94 1 D CYS 370 -33.87 -29.36 1 D ALA 372 -171.44 -168.91 1 D ALA 378 -166.02 -169.13 1 D ALA 392 -140.66 33.79 1 E CYS 28 -177.85 -179.70 1 E ALA 52 -113.59 -168.84 1 E LYS 66 -117.03 79.81 1 E ASP 74 -57.00 178.74 1 E SER 88 83.95 12.99 1 E ALA 89 178.24 157.05 1 E HIS 99 -93.97 34.29 1 E ALA 103 178.28 176.54 1 E ALA 118 80.96 6.34 1 E HIS 146 -170.47 129.47 1 E THR 163 -174.15 128.58 1 E GLU 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-120.20 -168.53 1 F ARG 195 -173.85 -168.72 1 F THR 213 -163.76 -165.67 1 F THR 219 79.64 -5.27 1 F ASP 223 71.25 82.64 1 F GLN 224 89.78 1.79 1 F ALA 228 -170.30 132.97 1 F ASP 233 82.02 8.12 1 F PHE 237 -54.15 -71.44 1 F THR 238 -153.47 29.05 1 F SER 239 -36.54 114.44 1 F ARG 244 -96.25 49.43 1 F PHE 258 59.45 75.49 1 F VAL 263 -173.22 144.90 1 F ALA 301 -86.14 -158.67 1 F GLU 308 -170.79 137.22 1 F TRP 309 -103.09 76.10 1 F ASP 311 -116.20 53.41 1 F SER 314 -115.69 -169.54 1 G GLU 4 -100.98 78.14 1 G TYR 15 -172.20 130.66 1 G ALA 17 -124.38 -161.48 1 G LYS 36 -163.28 -163.86 1 G GLU 40 -104.98 47.16 1 G LEU 56 174.76 162.99 1 G ALA 63 179.02 167.99 1 G ASP 74 -53.01 -177.97 1 G THR 87 -85.56 32.36 1 G SER 88 84.87 6.25 1 G ALA 89 176.83 174.50 1 G CYS 105 178.69 175.83 1 G ALA 118 77.23 -7.88 1 G SER 120 -175.32 -177.24 1 G HIS 121 -68.58 -73.88 1 G LYS 130 -69.79 98.68 1 G TYR 156 -68.87 93.46 1 G THR 163 -164.34 111.20 1 G ASP 164 -121.49 -52.23 1 G GLU 165 -129.91 -158.13 1 G THR 171 62.19 77.41 1 G LYS 189 -103.58 69.25 1 G LYS 215 -164.43 -169.01 1 G THR 219 77.67 -7.40 1 G ASP 223 72.15 78.08 1 G GLN 224 89.74 13.36 1 G ARG 244 -119.23 79.23 1 G THR 248 -68.02 92.94 1 G ARG 250 -177.00 143.24 1 G PHE 258 66.91 63.42 1 G GLU 302 -55.25 105.89 1 G TYR 306 -170.83 118.35 1 G ASP 311 -144.36 19.39 1 G PRO 319 -69.40 97.61 1 G ASN 331 86.08 12.42 1 H CYS 28 -171.35 -164.09 1 H ASP 74 -64.86 -166.09 1 H SER 88 83.82 4.53 1 H HIS 99 -96.67 33.20 1 H GLU 116 -142.35 35.26 1 H ASP 117 -86.52 45.21 1 H ALA 118 80.01 -6.70 1 H SER 120 179.19 171.84 1 H HIS 131 -163.49 115.81 1 H LEU 134 60.68 63.87 1 H LEU 158 -90.70 32.87 1 H HIS 170 -160.53 -167.86 1 H THR 171 62.92 72.13 1 H ILE 190 -68.93 99.87 1 H THR 211 173.92 149.91 1 H THR 219 71.78 33.13 1 H CYS 220 -162.48 110.37 1 H LYS 221 -92.25 -159.67 1 H ASP 223 75.82 83.35 1 H GLN 224 93.46 10.84 1 H ASP 233 88.05 6.54 1 H PHE 241 81.02 -4.97 1 H PHE 258 62.73 69.45 1 H CYS 265 -162.18 109.89 1 H GLU 281 -129.29 -164.43 1 H ASP 289 -151.13 -159.08 1 H SER 298 -68.51 94.66 1 H ASN 331 81.25 10.24 1 I GLU 16 -101.85 -169.58 1 I GLU 31 -143.64 -17.54 1 I SER 77 81.34 15.12 1 I GLU 89 -96.36 42.06 1 I ALA 92 -169.24 -168.78 1 I TYR 100 -175.22 128.99 1 I PHE 101 63.65 82.45 1 I ILE 102 -35.00 -11.32 1 I ALA 118 -134.67 -158.01 1 I PRO 130 -75.08 -169.85 1 I THR 135 72.15 34.95 1 I THR 136 -105.58 76.43 1 I SER 139 -151.97 -158.21 1 I LEU 163 -104.61 42.79 1 I GLN 195 -117.68 -167.01 1 I SER 207 72.79 38.37 1 I LYS 209 -162.83 104.23 1 M ALA 227 -175.43 -172.27 1 M ASP 261 87.55 21.94 1 M HIS 262 81.48 0.37 1 M ASP 270 83.86 10.53 1 M ASN 272 -141.93 -2.21 1 M VAL 278 -86.13 -155.85 1 M ALA 292 -166.78 -162.12 1 M ASP 302 -97.62 41.41 1 M ALA 304 -162.89 -163.10 1 M LEU 315 175.80 169.22 1 M GLN 329 64.08 67.36 1 M SER 332 -178.70 149.62 1 M LEU 353 -69.64 99.57 1 M THR 377 -140.24 12.46 1 M ASN 391 78.53 50.55 1 J CYS 22 -163.52 118.04 1 J MET 48 -144.24 15.67 1 J SER 77 84.61 6.03 1 J ALA 92 -173.29 -177.28 1 J TYR 100 -174.99 147.06 1 J PHE 101 65.83 84.04 1 J ILE 102 -43.12 -7.23 1 J LYS 119 -78.23 -164.12 1 J THR 121 -174.32 132.51 1 J TYR 149 -125.40 -165.09 1 J ASN 159 83.95 -1.59 1 J SER 162 -132.45 -33.98 1 J LEU 163 -104.73 79.98 1 J SER 164 -141.90 17.54 1 J LEU 181 -169.67 -168.00 1 J THR 188 -79.89 -163.80 1 J SER 207 70.80 46.51 1 N ALA 227 -172.01 -174.93 1 N ARG 241 -113.62 -169.49 1 N CYS 252 65.14 70.70 1 N HIS 262 71.51 41.32 1 N ASP 270 80.04 14.96 1 N THR 271 74.87 -14.39 1 N SER 285 -167.96 -160.48 1 N ASP 289 -91.71 54.51 1 N GLN 329 61.06 72.00 1 N ASN 349 75.32 37.56 1 N ASP 359 83.14 16.67 1 N ASP 372 84.55 19.41 1 N PRO 375 -62.30 95.04 1 K TYR 27 -176.12 -177.05 1 K PHE 29 -89.15 40.47 1 K GLU 73 -102.58 67.74 1 K SER 77 67.50 67.67 1 K TYR 80 177.14 155.63 1 K ASN 85 61.94 63.04 1 K GLU 89 -99.98 39.16 1 K ASP 99 -100.77 71.15 1 K PHE 101 64.69 77.82 1 K ILE 102 -35.66 -13.33 1 K SER 116 177.30 170.57 1 K PRO 151 -87.02 -158.76 1 K LEU 163 -91.21 59.25 1 K LEU 181 -164.38 -167.92 1 K SER 207 70.92 43.21 1 K SER 216 -103.46 -169.21 1 O LEU 238 -69.31 96.55 1 O CYS 252 65.22 61.36 1 O HIS 262 72.55 39.56 1 O THR 271 83.96 22.13 1 O ASP 302 -92.34 33.05 1 O ASN 314 -130.99 -40.34 1 O GLN 329 62.26 69.58 1 O LYS 331 -76.92 -160.91 1 O SER 332 -122.72 -160.90 1 O ASN 349 74.47 37.89 1 O ASP 359 70.35 42.00 1 O ASP 372 82.62 18.40 1 O SER 397 -171.75 -174.25 1 O SER 413 -177.90 -166.32 1 L GLN 6 -128.62 -161.69 1 L SER 77 66.70 63.50 1 L ASN 85 64.23 61.51 1 L ASP 99 -162.13 -162.96 1 L PHE 101 64.61 82.80 1 L ILE 102 -30.26 -21.92 1 L ALA 118 -164.51 -169.92 1 L ASN 159 89.90 4.58 1 L SER 182 -169.66 -167.54 1 L SER 183 -172.43 -176.76 1 L VAL 185 -172.96 142.70 1 L HIS 203 -161.97 94.99 1 L SER 207 72.41 45.90 1 P GLN 224 -159.99 -150.33 1 P ASP 261 85.94 -1.69 1 P THR 271 77.06 -8.58 1 P ASN 272 -143.45 -4.78 1 P SER 285 -165.90 -164.76 1 P LYS 290 -161.42 -159.41 1 P ASN 314 -122.00 -63.32 1 P LEU 315 -179.34 148.13 1 P ASN 349 72.79 46.96 1 P PRO 362 -82.46 -150.17 1 P THR 377 -99.36 39.34 1 P ALA 395 -178.95 -178.18 1 P SER 397 -168.06 111.98 N Human mAbs broadly protect against infection of arthritiogenic alphaviruses by recognizing conserved elements of the MXR8 receptor binding domain 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 3 N N 4 N N 3 N N 4 N N 3 N N 4 N N 3 N N 4 N N A CYS 96 A CYS 96 HELX_P A SER 98 A SER 98 5 AA1 3 A SER 238 A SER 238 HELX_P A GLU 246 A GLU 246 1 AA2 9 B SER 238 B SER 238 HELX_P B GLU 246 B GLU 246 1 AA3 9 C SER 238 C SER 238 HELX_P C GLU 246 C GLU 246 1 AA4 9 C PRO 283 C PRO 283 HELX_P C PHE 287 C PHE 287 5 AA5 5 D GLY 239 D GLY 239 HELX_P D GLU 246 D GLU 246 1 AA6 8 E HIS 5 E HIS 5 HELX_P E ALA 11 E ALA 11 1 AA7 7 E ASP 81 E ASP 81 HELX_P E LEU 83 E LEU 83 5 AA8 3 F HIS 5 F HIS 5 HELX_P F ALA 11 F ALA 11 1 AA9 7 G PHE 6 G PHE 6 HELX_P G ALA 11 G ALA 11 1 AB1 6 G LYS 79 G LYS 79 HELX_P G ASP 81 G ASP 81 5 AB2 3 H HIS 5 H HIS 5 HELX_P H THR 12 H THR 12 1 AB3 8 I ILE 74 I ILE 74 HELX_P I SER 77 I SER 77 5 AB4 4 I TRP 158 I TRP 158 HELX_P I SER 165 I SER 165 5 AB5 8 M SER 342 J SER 124 HELX_P M GLU 347 J GLU 129 1 AB6 6 M ARG 404 J ARG 186 HELX_P M HIS 409 J HIS 191 1 AB7 6 N ALA 403 L ALA 185 HELX_P N HIS 409 L HIS 191 1 AB8 7 K TRP 158 M TRP 158 HELX_P K SER 162 M SER 162 5 AB9 5 O ARG 404 N ARG 186 HELX_P O HIS 409 N HIS 191 1 AC1 6 P SER 342 P SER 124 HELX_P P GLU 347 P GLU 129 1 AC2 6 VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM virus, monoclonal antibody, complex, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex A HIS 308 A HIS 308 1 A SER 309 A SER 309 -12.03 B HIS 308 B HIS 308 1 B SER 309 B SER 309 -4.19 C HIS 308 C HIS 308 1 C SER 309 C SER 309 9.81 D HIS 308 D HIS 308 1 D SER 309 D SER 309 -15.49 I PHE 150 I PHE 150 1 I PRO 151 I PRO 151 -2.38 I GLU 152 I GLU 152 1 I PRO 153 I PRO 153 13.64 I TRP 192 I TRP 192 1 I PRO 193 I PRO 193 2.09 M TYR 361 J TYR 143 1 M PRO 362 J PRO 144 0.35 J PHE 150 K PHE 150 1 J PRO 151 K PRO 151 -3.08 J GLU 152 K GLU 152 1 J PRO 153 K PRO 153 8.78 J TRP 192 K TRP 192 1 J PRO 193 K PRO 193 -7.17 N TYR 361 L TYR 143 1 N PRO 362 L PRO 144 -9.55 K PHE 150 M PHE 150 1 K PRO 151 M PRO 151 -0.37 K GLU 152 M GLU 152 1 K PRO 153 M PRO 153 10.86 K TRP 192 M TRP 192 1 K PRO 193 M PRO 193 -7.22 O TYR 361 N TYR 143 1 O PRO 362 N PRO 144 -1.77 L PHE 150 O PHE 150 1 L PRO 151 O PRO 151 -2.11 L GLU 152 O GLU 152 1 L PRO 153 O PRO 153 -3.74 L TRP 192 O TRP 192 1 L PRO 193 O PRO 193 -0.46 P TYR 361 P TYR 143 1 P PRO 362 P PRO 144 -8.82 POLS_RRVT UNP 1 817 P08491 YEHTATIPNVVGFPYKAHIERNGFSPMTLQLEVVETSWEPTLNLEYITCEYKTVVPSPFIKCCGTSECSSKEQPDYQCKV YTGVYPFMWGGAYCFCDSENTQLSEAYVDRSDVCKHDHASAYKAHTASLKATIRISYGTINQTTEAFVNGEHAVNVGGSK FIFGPISTAWSPFDNKIVVYKDDVYNQDFPPYGSGQPGRFGDIQSRTVESKDLYANTALKLSRPSPGVVHVPYTPTPSGF KYWLKEKGSSLNTKAPFGCKIKTNPVRAMDCAVGSIPVSMDIPDSAFTRVVDAPAVTDLSCQVVVCTHSSDFGGVATLSY KTDKPGKCAVHSHSNVATLQEATVDVKEDGKVTVHFSTASASPAFKVSVCDAKTTCTAACEPPKDHIVPYGAS POLS_RRVT UNP 2 335 P08491 SVTEHFNVYKATRPYLAYCADCGDGYFCYSPVAIEKIRDEAPDGMLKIQVSAQIGLDKAGTHAHTKIRYMAGHDVQESKR DSLRVYTSAACSIHGTMGHFIVAHCPPGDYLKVSFEDADSHVKACKVQYKHDPLPVGREKFVVRPHFGVELPCTSYQLTT APTDEEIDMHTPPDIPDRTLLSQTAGNVKITAGGRTIRYNCTCGRDNVGTTSTDKTINTCKIDQCHAAVTSHDKWQFTSP FVPRADQTARRGKVHVPFPLTNVTCRVPLARAPDVTYGKKEVTLRLHPDHPTLFSYRSLGAEPHPYEEWVDKFSERIIPV TEEGIEYQWGNNPPVRLWAQL 6VYV PDB 3 1 6VYV 6VYV PDB 4 1 6VYV 817 1209 6VYV 1 393 P08491 A 1 1 393 817 1209 6VYV 1 393 P08491 B 1 1 393 817 1209 6VYV 1 393 P08491 C 1 1 393 817 1209 6VYV 1 393 P08491 D 1 1 393 335 675 6VYV 1 341 P08491 E 2 1 341 335 675 6VYV 1 341 P08491 F 2 1 341 335 675 6VYV 1 341 P08491 G 2 1 341 335 675 6VYV 1 341 P08491 H 2 1 341 1 218 6VYV 1 218 6VYV I 3 1 218 219 429 6VYV 219 429 6VYV M 4 1 211 1 218 6VYV 1 218 6VYV J 3 1 218 219 429 6VYV 219 429 6VYV N 4 1 211 1 218 6VYV 1 218 6VYV K 3 1 218 219 429 6VYV 219 429 6VYV O 4 1 211 1 218 6VYV 1 218 6VYV L 3 1 218 219 429 6VYV 219 429 6VYV P 4 1 211 4 4 2 2 3 3 2 2 4 2 4 2 4 3 3 2 4 2 2 3 4 4 3 3 3 2 2 4 2 2 4 4 4 4 3 3 2 2 3 2 2 2 4 2 3 2 2 3 2 2 4 2 4 2 2 2 2 2 2 2 4 2 4 2 3 2 3 2 3 3 2 4 2 3 2 2 2 3 3 4 2 2 3 3 2 4 4 3 4 4 4 4 3 3 4 2 2 2 4 2 2 2 3 4 4 3 4 5 3 2 4 4 3 4 4 3 2 4 3 4 2 4 4 3 4 4 2 4 3 anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel A GLU 2 A GLU 2 A ALA 5 A ALA 5 A VAL 278 A VAL 278 A ASP 281 A ASP 281 A SER 159 A SER 159 A PHE 163 A PHE 163 A ASN 155 A ASN 155 A VAL 156 A VAL 156 A TYR 15 A TYR 15 A ILE 19 A ILE 19 A MET 27 A MET 27 A GLU 32 A GLU 32 A LYS 130 A LYS 130 A TYR 137 A TYR 137 A ILE 140 A ILE 140 A PHE 147 A PHE 147 A THR 53 A THR 53 A VAL 54 A VAL 54 A TYR 107 A TYR 107 A VAL 108 A VAL 108 A PHE 59 A PHE 59 A CYS 62 A CYS 62 A ASN 100 A ASN 100 A LEU 103 A LEU 103 A ALA 119 A ALA 119 A LYS 123 A LYS 123 A LYS 176 A LYS 176 A TYR 180 A TYR 180 A ASP 183 A ASP 183 A TYR 185 A TYR 185 A THR 297 A THR 297 A VAL 305 A VAL 305 A GLY 314 A GLY 314 A LYS 321 A LYS 321 A GLY 350 A GLY 350 A PHE 356 A PHE 356 A GLY 326 A GLY 326 A ALA 329 A ALA 329 A THR 343 A THR 343 A VAL 346 A VAL 346 A PHE 365 A PHE 365 A SER 368 A SER 368 A LYS 373 A LYS 373 A CYS 376 A CYS 376 B HIS 3 B HIS 3 B THR 4 B THR 4 B SER 279 B SER 279 B ASP 281 B ASP 281 B SER 159 B SER 159 B PHE 161 B PHE 161 B VAL 154 B VAL 154 B VAL 156 B VAL 156 B ILE 7 B ILE 7 B PRO 8 B PRO 8 B SER 275 B SER 275 B ILE 276 B ILE 276 B TYR 15 B TYR 15 B ILE 19 B ILE 19 B MET 27 B MET 27 B GLU 32 B GLU 32 B LYS 130 B LYS 130 B TYR 137 B TYR 137 B ILE 140 B ILE 140 B PHE 147 B PHE 147 B PHE 24 B PHE 24 B SER 25 B SER 25 B THR 288 B THR 288 B ARG 289 B ARG 289 B ASN 43 B ASN 43 B GLU 45 B GLU 45 B SER 120 B SER 120 B LYS 123 B LYS 123 B LYS 176 B LYS 176 B TYR 180 B TYR 180 B ASP 183 B ASP 183 B TYR 185 B TYR 185 B LYS 52 B LYS 52 B VAL 54 B VAL 54 B TYR 107 B TYR 107 B ASP 109 B ASP 109 B ASP 75 B ASP 75 B TYR 76 B TYR 76 B PHE 59 B PHE 59 B ILE 60 B ILE 60 B GLN 102 B GLN 102 B SER 104 B SER 104 B LYS 79 B LYS 79 B TYR 81 B TYR 81 B LYS 260 B LYS 260 B LYS 262 B LYS 262 B ARG 267 B ARG 267 B MET 269 B MET 269 B VAL 296 B VAL 296 B CYS 301 B CYS 301 B VAL 315 B VAL 315 B THR 322 B THR 322 B GLY 350 B GLY 350 B SER 357 B SER 357 B THR 338 B THR 338 B LEU 339 B LEU 339 B LYS 327 B LYS 327 B ALA 329 B ALA 329 B THR 343 B THR 343 B ASP 345 B ASP 345 B PHE 365 B PHE 365 B VAL 367 B VAL 367 B THR 374 B THR 374 B CYS 376 B CYS 376 C GLU 2 C GLU 2 C PRO 8 C PRO 8 C SER 275 C SER 275 C ASP 281 C ASP 281 C LYS 160 C LYS 160 C PHE 161 C PHE 161 C TYR 15 C TYR 15 C GLU 20 C GLU 20 C PRO 26 C PRO 26 C VAL 34 C VAL 34 C LYS 130 C LYS 130 C TYR 137 C TYR 137 C 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