triangle PDBeMotif: 4fs5  
  coner Sequences coner   coner 3D motifs coner   coner Ligand environment coner   coner Ligand bonds coner
   
coner
   Search  |  PDB header search  |  Upload PDB file  |  Molecule binding  |  Pair bonds  |  Motif binding  |  3D environment  |  Motif inclusion  
coner
AstexViewer TM
Download original PDB file
Download xml file
Download structure factors file
Classification dna    | release date: Tue, Jun 26, 2012
Title crystal structure of the z-dna hexamer cgcgcg at 500 mm mgcl
Authors T.CHATAKE, T.SUNAMI
Method X-RAY DIFFRACTION (resolution: 1.30Å)
PDBe Citation   
Small molecules:    search MG MG binding statistics MG   search CL CL binding statistics CL
Ligand bond colours:   *  covalent   *  ionic   *  hydrogen   *  electrostatic   *  van-der-waals   *  plane-atom   *  plane-plane   *  undefined  - Click here to show 5Å bonds
Residue colours:  hydrophilic   hydrophobic   intermediate 
Assembly 1     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : DNA (5'-D(*CP*GP*CP*GP*CP*G)-3')
JMol viewer RasMol script viewer  MG 101B  ..      
JMol viewer RasMol script viewer  CL 111A  ..   ** 
JMol viewer RasMol script viewer  CL 110A  .. **|| 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 109A  .. |||| 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 108A  .. ||*
JMol viewer RasMol script viewer  MG 107A  .. ||*
JMol viewer RasMol script viewer  MG 106A  .. |*|| 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 105A  .. |*|| 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 104A  .. |||* 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 103A  .. |||* 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 102A  .. *||| 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 101A  .. *||| 
sec str:  ........
sequence :  ..CGCGCG
seq num:  ..1     

chain B : DNA (5'-D(*CP*GP*CP*GP*CP*G)-3')
JMol viewer RasMol script viewer  CL 103B  ..   ** 
JMol viewer RasMol script viewer  CL 102B  .. **|| 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 101B  .. |||| 
JMol viewer RasMol script viewer  MG 109A  .. |||| 
sec str:  ........
sequence :  ..CGCGCG
seq num:  ..7     

   New search    4fs5:  Sequences  |  3D motifs  |  Ligand environment  |   Ligand bonds   |  SPICE view  |  PDB  |  XML  |  Structure factors