3qxp: Sequences

PDBeMotif: 3qxp

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Enzyme:	2.7.11.22
Classification:	transferase/transferase inhibitor \| release date: Wed, Mar 2, 2011
Title:	cdk2 in complex with inhibitor rc-3-89
Authors:	A.BECKER, E.SCHONBRUNN, H.HAN, R.ALAM, S.BETZI
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 1.75Å)

PDBe Citation

Small molecules:

X64

EDO

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

- Click here to show 5Å bonds

Chain A sequence:
GPLGSPEFMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHT
ENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAF
GVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTS
MPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

View the assembly/model: (

)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

chain A : CYCLIN-DEPENDENT KINASE 2 member of: CATH:1.10.510.10/3.30.200.20, GENE3D:G3DSA_1.10.510.10/G3DSA_3.30.200.20, PANTHER:PTHR24056/PTHR24056_SF168, PFAM:PF00069, PROSITE PATTERNS:PS00107/PS00108, PROSITE PROFILES:PS50011, SMART:SM00220, SUPERFAMILY:SSF56112, UniProt:P24941
`X64` `300A`	`.. * * * * .. * ******* * ** * **`
`EDO` `299A`	`.. \| \| \| \| .. \| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \| \|\| * * *`
`sec str:`	`.....eeeeeeeee...eeeeeeee.....eeeeeee.......hhhhhhhhhhhhhh.......eeeeeee..eeeeeee...eehhhhhhhh.....hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.......hhh.eee.....eee..........................hhhhhh......hhhhhhhhhhhhhhhhhh.......hhhhhhhhhhhhhh........hhhhh.............hhhhh....hhhhhhhhhhhh........hhhhhhhhhhhh...........`
`sequence :`	`..MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIR..TEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL`
`seq num:`	..1 11 21 31 ..41 51 61 71 81 91 101 111 121 131 141 151 161 171 181 191 201 211 221 231 241 251 261 271 281 291
`CAMP_PHOSPHO_SITE`	`..\| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\| \| .. \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| *^ \| \| \| \| \|`
`PKC_PHOSPHO_SITE`	`..\| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\| \| .. \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \|^\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \|\| ^ \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| ^** \| \| \| \|`
`CK2_PHOSPHO_SITE`	`..\| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \|\|\| \| ..\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|^* \| \| \|\| \| \| ^* \| \| ^* \| \|\|\|^***\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|`
`TYR_PHOSPHO_SITE`	`..\| \| \|\|******^\| \| \|\|\| \| .. \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|`
`MYRISTYL`	`..\| \| \|\| \| \| \| \| \|\|\| \| .. ^*** \| \|\| \| \| \| \|\| ^* \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| ^* \|\| \| \| \| \| \|\| \| ^*** \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|`
`PROTEIN_KINASE_ATP`	`..\| \| \|\| ************************ .. \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|`
`PROTEIN_KINASE_ST`	..\| \| \|\| \| \| \| \|\|\| .. \| \|\| \| \| \| \|\| \| **^****** \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|
`alphabetamotif`	..\| \| \|\| \| \| \| \|\|\| .. *** \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| *** \| \| \| \|
`asxmotif`	..\| \| \|\| \| \| *****\| .. \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|
`asxturn`	..\| \| \|\| \| \| \| \| \| .. \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \|*** \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|
`betabulge`	..\| \| \| \| \| \| \| .. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|
`betabulgeloop`	..\| \| \| \| ****** .. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|
`betaturn`	..** \| \| \| \| .. *** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ** \| \|
`nest`	..\| \| \| \| * .. \| \| * * \|\| \|\| * \|\| \| * \| \|\| \| \| * \| \| *** \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|
`niche`	..** .. \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| ******* * ******** **
`ststaple`	`.. .. \| \| \| \| \| \|*** * ***`
`stturn`	`.. .. \| \| \| \| ***`
`Catalytic site`	`.. .. * * * *`

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