3qtz: Sequences

PDBeMotif: 3qtz

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Enzyme:	2.7.11.22
Classification:	transferase/transferase inhibitor \| release date: Wed, Feb 23, 2011
Title:	cdk2 in complex with inhibitor rc-2-36
Authors:	A.BECKER, E.SCHONBRUNN, H.HAN, R.ALAM, S.BETZI
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 2.00Å)

PDBe Citation

Small molecules:

X42

EDO

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

- Click here to show 5Å bonds

Chain A sequence:
GPLGSPEFMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHT
ENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAF
GVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTS
MPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

View the assembly/model: (

)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

chain A : CYCLIN-DEPENDENT KINASE 2 member of: CATH:1.10.510.10/3.30.200.20, GENE3D:G3DSA_1.10.510.10/G3DSA_3.30.200.20, PANTHER:PTHR24056/PTHR24056_SF168, PFAM:PF00069, PROSITE PATTERNS:PS00107/PS00108, PROSITE PROFILES:PS50011, SMART:SM00220, SUPERFAMILY:SSF56112, UniProt:P24941
`X42` `453A`	`.. * * * * * .. * ******* * * * *`
`EDO` `452A`	`.. \| \| \| \| \| .. \| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \| \| * * *`
`EDO` `451A`	.. \| \| \| \| \| .. \| \|\|\|\|\|\|\| * \| \| \| \| \| \| *
`sec str:`	`.....eeeeeeeee...eeeeeeee.....eeeeeee.......hhhhhhhhhhhhh........eeeee.....eeeeee...eehhhhhhhh.....hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.......hhh.eee.....eee..........................hhhhhh......hhhhhhhhhhhhhhhhhh.......hhhhhhhhhhhhhh........hhhhh.............hhhhh....hhhhhhhhhhhh........hhhhhhhhhhhh...........`
`sequence :`	`..MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIR..TEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL`
`seq num:`	..1 11 21 31 ..41 51 61 71 81 91 101 111 121 131 141 151 161 171 181 191 201 211 221 231 241 251 261 271 281 291
`CAMP_PHOSPHO_SITE`	`..\| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| .. \|\| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| *^ \|\|\| \|\|\| \|\| \|`
`PKC_PHOSPHO_SITE`	`..\| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| .. \|\| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\|^\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| ^ \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| ^**\|\| \|\|\| \|\| \|`
`CK2_PHOSPHO_SITE`	`..\| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| ..\| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|^* \| \| \| \| \| ^* \| \| ^* \| \|\|\|^***\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|`
`TYR_PHOSPHO_SITE`	`..\| \| \|\|******^ \| \|\| \| \| .. \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|`
`MYRISTYL`	`..\| \| \|\| \| \| \|\| \| \| .. ^*** \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| ^* \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| ^* \|\| \| \| \| \| \|\| \| ^*** \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|`
`PROTEIN_KINASE_ATP`	`..\| \| \|\| ************************ .. \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|`
`PROTEIN_KINASE_ST`	`..\| \| \|\| \| \|\| \| .. \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \|\|**^****** \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|`
`alphabetamotif`	`..\| \| \|\| \| \|\| \| .. ******* \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| *** \|\| \|\|\| \|\| \|`
`asxmotif`	`..\| \| \|\| \| \|\| \| .. \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| ***** \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|`
`asxturn`	`..\| \| \|\| *\| \| .. \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| * \| \|*** \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|`
`betabulge`	..\| \| \| \| \| .. \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|
`betabulgeloop`	..\| \| ****** .. \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|
`betaturn`	`..\| \| \| \| .. ****** \| \| \| \| \| *\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| **\| \| \| \| \| \| \| *********`
`nest`	..\| \| * .. \| \| \| \| \| \| * * \|\| \|\| * \|\| \| * \| \|\| \| * \| \| *** \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|
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