3oot: Sequences

PDBeMotif: 3oot

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Enzyme:	3.4.23.15
Classification:	hydrolase \| release date: Tue, Aug 31, 2010
Title:	crystal structure analysis of renin-indole-piperazin inhibit complexes
Authors:	Z.BOCSKEI
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 2.55Å)

PDBe Citation

Small molecules:

NAG

SSR

Modified residues:

ASN

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

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Chains A,B sequence:
LTLGNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELT
LRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSF
YYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIE
KLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFI
RKFYTEFDRRNNRIGFALAR

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

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)

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chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

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chain A : RENIN member of: GENE3D:G3DSA_2.40.70.10, PANTHER:PTHR13683/PTHR13683_SF77, PFAM:PF00026, PRINTS:PEPSIN, PROSITE PATTERNS:PS00141, SUPERFAMILY:SSF50630, UniProt:P00797
`SSR` `327A`	.. * * * * * * * * *** *
`NAG` `367A`	.. \| \| \| * \| \| * \| \| \| \|\|\| \|
`sec str:`	`......eeeeeeee...eeeeeeee....eeeeeeee.....eeee.......hhhhhhh...hhhhh...eeeeeeeeee....eeeeeeeeeeeee..eeeeeeeeeeee.hhhhhh.....eeee..hhhhhhhhh.hhhhhhhhh......eeeeee...........eeeee.......eeeeeeeee.......eeee..eee..........eeeee......eeehhhhhhhhhhhhh.ee....eeee..hhhhh..eeeee..eeeeehhhhhee........eeee.eee..........eeehhhhhhheeeeee....eeeeeee.`
`sequence :`	`..GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR`
`seq num:`	..-2 8 18 28 38 46 56 66 76 86 96 107 117 127 137 147 157 163 173 183 193 203 213 223 233 244 254 264 274 280 290 300 310 320
`ASN_GLYCOSYLATION`	..\|^*\| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| ^* \|\|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|
`PKC_PHOSPHO_SITE`	..\| \| \| \|\|\| ^\| \|\|\|\| \| \| ^\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| ^ \|\|\| ^\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\| ^**\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|
`CK2_PHOSPHO_SITE`	..\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \|\| ^* \| \| \| \|\| ^* ^*\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| ^* \|\| \|
`MYRISTYL`	..^*** \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|^* \| ^* ^* \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| ^* \| \| \| \|\|\|\| ^*** \| \| \| \|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|
`ASP_PROTEASE`	.. \| \|\|\| *^**** \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ^*******\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|
`alphabetamotif`	.. \| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|***\| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| * \| ***\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|
`asxturn`	.. \| \|\|\| *\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| * \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| *\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| *\| \|
`betabulge`	.. \| \|\|\| \|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| ** \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
`betabulgeloop`	.. ***** \|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
`betaturn`	.. **\| \|\| \| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| ** \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
`gammaturn`	.. \| \| \|\| \| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|***\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
`nest`	.. * \|\| \| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| *
`niche`	.. **** **** *** \| * **** * * \| \| ** **
`stmotif`	.. \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| ***** \| \| \|
`stturn`	.. \|\| \| * * \| \|\| *****
`Catalytic site`	`.. ** * * **`

Assembly 2

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)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

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chain B : RENIN member of: GENE3D:G3DSA_2.40.70.10, PANTHER:PTHR13683/PTHR13683_SF77, PFAM:PF00026, PRINTS:PEPSIN, PROSITE PATTERNS:PS00141, SUPERFAMILY:SSF50630, UniProt:P00797
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`NAG` `367B`	.. \| \| \| * \| \| * \| \| \| \| \| \|
`sec str:`	`......eeeeeeee...eeeeeeee....eeeeeeee.....eeee.......hhhhhh....hhhhh...eeeeeeeeee....eeeeeeeeeeeee..eeeeeeeeeeee.hhhhhh.....eeee..hhhhhhhhh.hhhhhhhhh......eeeeee...........eeeee.......eeeeeeeee.......eeee..eee..eeee....eeeee......eeehhhhhhhhhhhhh.ee....eeee..hhhhh..eeeee..eeeeehhhhhh.........eee..eee..........eeehhhhhhheeeeee....eeeeeee.`
`sequence :`	`..GNTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR`
`seq num:`	..-2 8 18 28 38 46 56 66 76 86 96 107 117 127 137 147 157 163 173 183 193 203 213 223 233 244 254 264 274 280 290 300 310 320
`ASN_GLYCOSYLATION`	..\|^*\| \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \|\|\| ^* \|\|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|
`PKC_PHOSPHO_SITE`	..\| \| \| \|\|\| ^\| \|\|\|\| \| \| ^\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| ^ \|\|\| ^\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| ^**\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|
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`MYRISTYL`	..^*** \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \| \| \|^* \| ^* ^* \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| ^*\| \| \| \| \|\|\|\| ^*** \| \| \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|
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`alphabetamotif`	.. \| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|*****\| \|\|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|
`asxturn`	.. \| \|\|\| *\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| * \| \| * \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| **\| \|
`betabulge`	.. \| \|\|\| \|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| ** \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
`betabulgeloop`	.. ***** \|\| \| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
`betaturn`	.. **\| \|\| \| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| ** \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
`nest`	.. * \|\| \| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| *
`niche`	.. **** **** *** \| * **** * ** * ** \| \| ** **
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`Catalytic site`	`.. ** * * **`

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