3h60: Sequences

PDBeMotif: 3h60

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Enzyme:	3.1.3.16
Classification:	hydrolase \| release date: Thu, Apr 23, 2009
Title:	catalytic domain of human serine/threonine phosphatase 5 (pp5c)with two mn2+ atoms
Authors:	C.LUCHINAT, E.TALLURI, I.BERTINI, M.FRAGAI, V.CALDERONE
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 2.00Å)

PDBe Citation

Small molecules:

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

- Click here to show 5Å bonds

Chains A,B sequence:
YSGPKLEDGKVTISFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQVKEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTHGQFYDLLNIFE
LNGLPSETNPYIFNGDFVDRGSFSVEVILTLFGFKLLYPDHFHLLRGNHETDNMNQIYGFEGEVKAKYTAQMYELFSEVF
EWLPLAQCINGKVLIMHGGLFSEDGVTLDDIRKIERNRQPPDSGPMCDLLWSDPQPQNGRSISKRGVSCQFGPDVTKAFL
EENNLDYIIRSHEVKAEGYEVAHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLQGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYA

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

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)

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chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

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chain A : SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 5 member of: CATH:3.60.21.10, GENE3D:G3DSA_3.60.21.10, PANTHER:PTHR11668/PTHR11668_SF12, PFAM:PF00149/PF08321, PIRSF:PIRSF033096, PRINTS:STPHPHTASE, PROSITE PATTERNS:PS00125, SMART:SM00156, SUPERFAMILY:SSF56300, UniProt:P53041
`MN` `501A`	`.. * * *`
`MN` `500A`	`.. \| \| \| * *`
`sec str:`	`.............hhhhhhhhhhhhhh....hhhhhhhhhhhhhhhhhh...eeee......eeeee.....hhhhhhhhhhhhh.......eeee........hhhhhhhhhhhhhhhh...eeee.....hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh....eeee...eeee..........hhhhhhhh.........hhhhhhhhhee.....eee......eeehhhhhhhhhhhhh..eeee........eeeehhh.eeee....hhhhh....eeeeeee..eeeeeeeee..............`
`sequence :`	`..YSGPKLEDGKVTISFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQVKEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTHGQFYDLLNIFELNGLPSETNPYIFNGDFVDRGSFSVEVILTLFGFKLLYPDHFHLLRGNHETDNMNQIYGFEGEVKAKYTAQMYELFSEVFEWLPLAQCINGKVLIMHGGLFSEDGVTLDDIRKIERNRQPPDSGPMCDLLWSDPQPQNGRSISKRGVSCQFGPDVTKAFLEENNLDYIIRSHEVKAEGYEVAHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLQGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYA`
`seq num:`	..176 186 196 206 216 226 236 246 256 266 276 286 296 306 316 326 336 346 356 366 376 386 396 406 416 426 436 446 456 466 476 486
`PKC_PHOSPHO_SITE`	.. \|\| \|\|\| \| \|\|\|\| \| ^\|^ \| \| \| \|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| ^** \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \|\|
`CK2_PHOSPHO_SITE`	.. \|\| \|\|\| \| \|\|^* ^* \| \| \| \| \|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|^***\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \|\|
`MYRISTYL`	.. \|\| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\| \| ^*** \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| ^* \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \|^*** \| \| \| \| \|\|
`SER_THR_PHOSPHATASE`	.. \|\| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\|\| \|\| \|\| ****** \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|
`betaturn`	.. \|**\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| **
`gammaturn`	.. \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| *** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|
`nest`	.. \| * \| \|\| \| \| \| * \| \| \| *\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \| \| \| * * \| * * *** \| \| *
`niche`	.. \| \| ***** \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| * \| \| \| ***
`schellmannloop`	`.. ****** \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|`
`stmotif`	`.. \| \| *** \|\| \|\| \| *** \| \| \|`
`stturn`	`.. * * \|\| \|\| \| *** \|`
`Catalytic site`	`.. * * *`

Assembly 2

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)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

chain B : SERINE/THREONINE-PROTEIN PHOSPHATASE 5 member of: CATH:3.60.21.10, GENE3D:G3DSA_3.60.21.10, PANTHER:PTHR11668/PTHR11668_SF12, PFAM:PF00149/PF08321, PIRSF:PIRSF033096, PRINTS:STPHPHTASE, PROSITE PATTERNS:PS00125, SMART:SM00156, SUPERFAMILY:SSF56300, UniProt:P53041
`MN` `501B`	`.. * * *`
`MN` `500B`	`.. \| \| \| * *`
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`sequence :`	`..YSGPKLEDGKVTISFMKELMQWYKDQKKLHRKCAYQILVQVKEVLSKLSTLVETTLKETEKITVCGDTHGQFYDLLNIFELNGLPSETNPYIFNGDFVDRGSFSVEVILTLFGFKLLYPDHFHLLRGNHETDNMNQIYGFEGEVKAKYTAQMYELFSEVFEWLPLAQCINGKVLIMHGGLFSEDGVTLDDIRKIERNRQPPDSGPMCDLLWSDPQPQNGRSISKRGVSCQFGPDVTKAFLEENNLDYIIRSHEVKAEGYEVAHGGRCVTVFSAPNYCDQMGNKASYIHLQGSDLRPQFHQFTAVPHPNVKPMAYA`
`seq num:`	..176 186 196 206 216 226 236 246 256 266 276 286 296 306 316 326 336 346 356 366 376 386 396 406 416 426 436 446 456 466 476 486
`PKC_PHOSPHO_SITE`	.. \|\| \|\|\| \| \|\|\|\| \| ^\|^ \| \| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| ^** \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|
`CK2_PHOSPHO_SITE`	.. \|\| \|\|\| \| \|\|^* ^* \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|^***\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|
`MYRISTYL`	.. \|\| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| ^*** \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| ^* \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \|^*** \| \| \| \| \| \| \|\|
`SER_THR_PHOSPHATASE`	.. \|\| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| ****** \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|
`betaturn`	.. \|**\| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| **
`gammaturn`	.. \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| * \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| * \| \|
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`niche`	.. \| \| ***** \|\| \|\| \| \| \| \| \| * \| \| \| ***
`schellmannloop`	`.. ****** \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|`
`stmotif`	`.. \| \| \|\| \|\| \| *** *** \| \| \| \| \|`
`ststaple`	`.. \| \| \|\| \|\| \| ***** \| \| \|`
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`Catalytic site`	`.. * * *`

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