3dc6: Sequences

PDBeMotif: 3dc6

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Enzyme:	1.15.1.1
Classification:	oxidoreductase \| release date: Tue, Jun 3, 2008
Title:	crystal structure of a manganese superoxide dismutases from caenorhabditis elegans
Authors:	C.H.TRINH, E.E.STEWART, G.J.HUNTER, S.E.V.PHILLIPS, T.HUNTER
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 1.80Å)

PDBe Citation

Small molecules:

SO4

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

- Click here to show 5Å bonds

Chains A,C sequence:
MKHSLPDLPYDYADLEPVISHEIMQLHHQKHHATYVNNLNQIEEKLHEAVSKGNVKEAIALQPALKFNGGGHINHSIFWT
NLAKDGGEPSAELLTAIKSDFGSLDNLQKQLSASTVAVQGSGWGWLGYCPKGKILKVATCANQDPLEATTGLVPLFGIDV
WEHAYYLQYKNVRPDYVNAIWKIANWKNVSERFAKAQQ

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

View the assembly/model: (

)

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chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

chain A : SUPEROXIDE DISMUTASE [MN] 1 member of: CATH:1.10.287.990, GENE3D:G3DSA_1.10.287.990, PANTHER:PTHR11404/PTHR11404_SF6, PFAM:PF00081/PF02777, PIRSF:PIRSF000349, PRINTS:MNSODISMTASE, PROSITE PATTERNS:PS00088, SUPERFAMILY:SSF46609/SSF54719, UniProt:P31161
`SO4` `200A`	`.. ** *`
`SO4` `199A`	`.. \|\| * * * \|`
`MN` `198A`	`.. \|\| \| \| * \| \| * * *`
`sec str:`	`....................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh........hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh....eeeeeeee....eeeeeeee...hhhhhhh.eeeeeee.hhhhhhhhhh.hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.`
`sequence :`	`..KHSLPDLPYDYADLEPVISHEIMQLHHQKHHATYVNNLNQIEEKLHEAVSKGNVKEAIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLAKDGGEPSAELLTAIKSDFGSLDNLQKQLSASTVAVQGSGWGWLGYCPKGKILKVATCANQDPLEATTGLVPLFGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYVNAIWKIANWKNVSERFAKAQQ`
`seq num:`	`..1 11 21 31 41 51 61 71 81 91 101 111 121 131 141 151 161 171 181 191`
`ASN_GLYCOSYLATION`	`.. \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| ^* \| \| \| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\| ^*\|`
`PKC_PHOSPHO_SITE`	`.. \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\| ^**`
`CK2_PHOSPHO_SITE`	`.. ^*** \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\|`
`MYRISTYL`	`.. \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| ^*** \| \| ^* \| ^* \| \| ^*** \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\|`
`SOD_MN`	`.. \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \|\| ^*^* \|\| \|\|`
`alphabetamotif`	`.. \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| *****`
`asxturn`	`.. \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \|\| *** \| \|\| \|\|`
`betabulge`	`.. \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| ** \| \| \| \|\| \|\|`
`betaturn`	`.. \| \| \|\| \| \| \| \|**\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| **\|`
`nest`	`.. \| \| \|\| \| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \| \| * \| \|\|\| \|*** \| \| \| \|`
`niche`	`.. *****\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| **`
`schellmannloop`	`.. \| \| \| \| ****** \| \| \| \| \|\| \|\| \|`
`stmotif`	`.. *** \| \| * *** \|\| \|\| \|`
`ststaple`	`.. *** **** \|`
`stturn`	`.. ***`

chain C : SUPEROXIDE DISMUTASE [MN] 1 member of: CATH:1.10.287.990, GENE3D:G3DSA_1.10.287.990, PANTHER:PTHR11404/PTHR11404_SF6, PFAM:PF00081/PF02777, PIRSF:PIRSF000349, PRINTS:MNSODISMTASE, PROSITE PATTERNS:PS00088, SUPERFAMILY:SSF46609/SSF54719, UniProt:P31161
`SO4` `199C`	`.. ** *`
`MN` `198C`	`.. \|\| * \| * * *`
`sec str:`	`.....................hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh........hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh....eeeeeeee....eeeeeeee...hhhhhhh.eeeeeee.hhhhhhhhhh.hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.`
`sequence :`	`..MKHSLPDLPYDYADLEPVISHEIMQLHHQKHHATYVNNLNQIEEKLHEAVSKGNVKEAIALQPALKFNGGGHINHSIFWTNLAKDGGEPSAELLTAIKSDFGSLDNLQKQLSASTVAVQGSGWGWLGYCPKGKILKVATCANQDPLEATTGLVPLFGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYVNAIWKIANWKNVSERFAKAQQ`
`seq num:`	`..0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190`
`ASN_GLYCOSYLATION`	`.. \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| ^* \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| ^*\|`
`PKC_PHOSPHO_SITE`	`.. \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| ^**`
`CK2_PHOSPHO_SITE`	`.. ^*** \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \|`
`MYRISTYL`	`.. \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| ^*** \| \| ^* \| \|^* \| \|\| \| ^*** \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \|`
`SOD_MN`	`.. \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| ^*^* \| \|`
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`asxturn`	`.. \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\| *** \| \| \|`
`betabulge`	`.. \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| ** \| \| \| \| \|`
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`nest`	`.. \| \| \| \| \| \| * \| \| \| \| * \| \|\| \| * \| \| \| * \| \| \| \|`
`niche`	`.. ***** \| \| \| \| \| \| \| \| * \| \| \| * **`
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`ststaple`	`.. *** * * *** \|`
`stturn`	`.. ***`

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