2quk: Sequences

PDBeMotif: 2quk

		Sequences				3D motifs				Ligand environment				Ligand bonds

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Enzyme:	6.1.1.2
Classification:	ligase \| release date: Mon, Aug 6, 2007
Title:	crystal structures of human tryptophanyl-trna synthetase in complex with atp(putative)
Authors:	J.P.DING, N.SHEN
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 2.80Å)

PDBe Citation

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

- Click here to show 5Å bonds

Chain A sequence:
MPNSEPASLLELFNSIATQGELVRSLKAGNASKDEIDSAVKMLVSLKMSYKAAAGEDYKADCPPGNPAPTSNHGPDATEA
EEDFVDPWTVQTSSAKGIDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIERATGQRPHHFLRRGIFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYT
GRGPSSEAMHVGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAYSYAVENAKDIIACGFDINKTFIFSDLDY
MGMSSGFYKNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKISFPAIQAAPSFSNSFPQIFRDRTDIQCLIPCAIDQDPYFRMT
RDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDTAKQIKTKVNKHAFSGGRDTIEEHRQFGGNCDVDVSF
MYLTFFLEDDDKLEQIRKDYTSGAMLTGELKKALIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRKLSFDFQHHHHHH

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

View the assembly/model: (

)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

chain A : TRYPTOPHANYL-TRNA SYNTHETASE member of: CATH:1.10.240.10/3.40.50.620, GENE3D:G3DSA_1.10.240.10/G3DSA_1.10.287.10/G3DSA_3.40.50.620, PANTHER:PTHR10055/PTHR10055_SF1, PFAM:PF00458/PF00579, PRINTS:TRNASYNTHTRP, PROSITE PATTERNS:PS00178/PS00762, PROSITE PROFILES:PS51185, SMART:SM00991, SUPERFAMILY:SSF47060/SSF52374, TIGRFAMS:TIGR00233, UniProt:P23381
`sec str:`	`......hhhhhhhhh.ee.hhhhhhhhhhhhh...hhhhhh..eeeeehhhhhhhhhhh...eeeeeee..........hhhhhhhhhhhhhhhh..eeeeehhhhhhhhh..hhhhhhhhhhhhhhhhhhh......eeeeehhhhhhhh.hhhhhhhhhhhh.hhhhhhh........hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.....eeeeeee..hhhhhhhhhhhhhhhh....eeeee..........................hhhhhhhhhhhh.......hhhhhhhhh.....hhhhhhhhhhh.hhhhhhhhhhhhhhh..hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.......`
`sequence :`	`..KGIDYDKLIVRFGSSKIDKELINRIERATGQRPHHFLRRGIFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHVGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEKYLWKDLTLDQAYSYAVENAKDIIACGFDINKTFIFSDLDYMGMSSGFYKNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKISFPAIQAAPSFSNSFPQIFRDRTDIQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDTAKQIKTKVNKHAFSGGRDTIEEHRQFGGNCDVDVSFMYLTFFLEDDDKLEQIRKDYTSGAMLTGELKKALIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRKLSFD`
`seq num:`	..96 106 116 126 136 146 156 166 176 186 196 206 216 226 236 246 256 266 276 286 296 306 316 326 336 346 356 366 376 386 396 406 416 426 436 446 456 466
`ASN_GLYCOSYLATION`	..\| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|^* \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| ^*\| \|\| \| \| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| \| \| \|\|
`CAMP_PHOSPHO_SITE`	..\| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| \| *^
`PKC_PHOSPHO_SITE`	..* \| \| \| ^ \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| ^\| \| \| \| ^ \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \|^ \| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| ^**
`CK2_PHOSPHO_SITE`	.. \| \| \| \|^* \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| ^* \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ^* \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| ^* \| \| \| \|\| \| \| \|^* \| \| \|\| \|\|\|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| ^* \| \|\| \| \| \| \|\|\| ^*** \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| \|
`MYRISTYL`	.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|^*** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| ^* \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|^* \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|^***\|\| \|\| \|\| \|\| \|
`AA_TRNA_LIGASE_I`	.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| *********** \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\| \|
`WHEP_TRS_1`	.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\| \|\| \|
`alphabetamotif`	.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| ***\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|*\|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|*** \|\| \|\| \|\| \|
`asxmotif`	.. \| \| \| \| *** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| *** \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\| \|
`asxturn`	.. * \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \|\| \|\| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| * \|\| \|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\| \|
`betaturn`	.. \| \| \| \| \| ** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| *** \| \| \| \|\| \| \| \| \| *** **** \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\| **\| \|\| \|
`gammaturn`	.. \| \| \| \| \| *** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\| \|
`nest`	.. * \| * * * \| \| * \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|** \| \| \|\| \|
`niche`	.. \| \| \| \| \| ** \| \| \| \| \| \| \| \| \| * ** ** \|\| \|\| \|**
`schellmannloop`	.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| ****** \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \|
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