2g1o: Sequences

PDBeMotif: 2g1o

		Sequences				3D motifs				Ligand environment				Ligand bonds

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Enzyme:	3.4.23.15
Classification:	hydrolase \| release date: Tue, Feb 14, 2006
Title:	ketopiperazine-based renin inhibitors: optimization of the "
Authors:	D.D.HOLSWORTH, E.ZHANGA
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 2.70Å)

PDBe Citation

Small molecules:

NAG

2IG

Modified residues:

ASN

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

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Chains A,B sequence:
SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGT
VSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSE
NSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALG
AKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEF
DRRNNRIGFALAR

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

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chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

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chain A : RENIN member of: CATH:2.40.70.10, GENE3D:G3DSA_2.40.70.10, PANTHER:PTHR13683/PTHR13683_SF77, PFAM:PF00026, PRINTS:PEPSIN, PROSITE PATTERNS:PS00141, SUPERFAMILY:SSF50630, UniProt:P00797
`2IG` `885A`	`.. *** * * * * ** * * *** *`
`NAG` `985A`	`.. \|\|\| \| \| \| * \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\|\| \|`
`sec str:`	`...eeeeeee...eeeeeeee....eeeeeeee.....eeee.......hhhhhh....hhhhh...eeeeeeeeeee..eeeeeeeeeeeeee..eeeeeeeeeeee.hhhhhh.....eeee..hhhhhhhhh.hhhhhhhhh......eeeeee...........eeeee...hhh.eeeeeeeee.......eeeeeeeee..........eeee.......eeehhhhhhhhhhhhh.ee....eeee.hhh.....eeeee...eeeehhhhhh.........eee..eee..........eeehhhhhh.eeeeee....eeeeeee.`
`sequence :`	`..SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR`
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`PKC_PHOSPHO_SITE`	.. \| \|\|\| ^\| \|\|\|\| \| ^\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| ^ \|\|\| ^\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| ^**\| \| \| \| \| \| \|
`CK2_PHOSPHO_SITE`	.. \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| ^* \|\| \|\|\| \|\| \|\| ^* ^*\|\| \| \| \|\| \| \| ^* \| \|
`MYRISTYL`	.. \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|^*** \| ^* ^* \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| ^* \| \|\|\|\| ^*** \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`ASP_PROTEASE`	.. \| \|\|\| *^**** \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| ^******* \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`alphabetamotif`	.. \| \|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|***\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| * \| ***\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`asxturn`	.. \| \|\|\| *\| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| * \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| ***\| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`betabulgeloop`	.. ***** \|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`betaturn`	.. **\| \|\| \| \| \|\|\| \|* \| \| \| \| \| * \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \|\| * \| ** \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`gammaturn`	.. \| \| \|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| *** \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`nest`	.. * \|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| * \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| ***
`niche`	.. ** **** *** \| ** * ** * ** \| \| ** **
`schellmannloop`	.. \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| ****** \| \| \|
`stturn`	.. \|\| \| * * \| \|\| *****
`Catalytic site`	`.. ** * * **`

Assembly 2

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chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

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chain B : RENIN member of: CATH:2.40.70.10, GENE3D:G3DSA_2.40.70.10, PANTHER:PTHR13683/PTHR13683_SF77, PFAM:PF00026, PRINTS:PEPSIN, PROSITE PATTERNS:PS00141, SUPERFAMILY:SSF50630, UniProt:P00797
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`sec str:`	`...eeeeeee...eeeeeeee....eeeeeeee.....eeee.......hhhhhhh...hhhhh........eeeee....eeeeeeeeeeeee..eeeeeeeeeeee.hhhhhh.....eeee..hhhhhhhhh.hhhhhhhhh......eeeeee...........eeeee...hhhhh....eeee.......eeeeeeeee..eeee....eeeee......eeehhhhhhhhhhhhh.ee....eeee.hhhhhh..eeeee..eeeeehhhhhee........eeee.eee..........eeehhhhhhheeeeee....eeeeee..`
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`PKC_PHOSPHO_SITE`	.. \| \|\|\| ^\| \|\|\|\| \| \| ^\|\| \| \| \| \| \| ^ \|\|\| ^\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| ^**\| \| \| \| \| \| \|
`CK2_PHOSPHO_SITE`	.. \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \|\| ^* \| \| \| \|\| ^* ^*\|\| \| \| \|\| \| \| ^* \| \|
`MYRISTYL`	.. \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|^*** \| ^* ^* \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| ^* \| \| \| \|\|\|\| ^*** \| \| \| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`ASP_PROTEASE`	.. \| \|\|\| *^**** \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| ^*******\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`alphabetamotif`	.. \| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| *** \| ***\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`asxturn`	.. \| \|\|\| *\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| *\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
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`gammaturn`	.. \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| *** \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`nest`	.. * \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| * \|\| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| *
`niche`	.. \|\| * \| \| *** * \| **** * ** \| \| * ** \| \| ** **
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Assembly 3

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chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

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`MYRISTYL`	.. \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|^*** \| ^* ^* \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| ^* \| \|\|\|\| ^*** \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|
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`alphabetamotif`	.. \| \|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|***\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| * \| ***\| \| \| \|\| \| \| \| \|
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`betabulgeloop`	.. ***** \|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`betaturn`	.. **\| \|\| \| \| \|\|\| \|* \| \| \| \| \| * \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \|\| * \| ** \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`gammaturn`	.. \| \| \|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| *** \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`nest`	.. * \|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| * \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| ***
`niche`	.. ** **** *** \| ** * ** * ** \| \| ** **
`schellmannloop`	.. \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| ****** \| \| \|
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`sequence :`	`..SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR`
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`ASN_GLYCOSYLATION`	.. \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \|\|\| ^*** \|\|\|\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
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`ststaple`	.. \|\| \| \| \| \| \| \| ***** \|\| \| \|
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Assembly 4

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Sequence numbers:

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	coordinates of: Cαs Side-chain

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chain B : RENIN member of: CATH:2.40.70.10, GENE3D:G3DSA_2.40.70.10, PANTHER:PTHR13683/PTHR13683_SF77, PFAM:PF00026, PRINTS:PEPSIN, PROSITE PATTERNS:PS00141, SUPERFAMILY:SSF50630, UniProt:P00797
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`seq num:`	..3 13 23 33 43 53 63 73 83 93 103 113 123 133 143 153 163 173 183 193 203 213 223 233 243 253 263 273 283 293 303 313 323
`ASN_GLYCOSYLATION`	.. \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \| \| \|\|\| ^*** \|\|\|\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \|\| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
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`CK2_PHOSPHO_SITE`	.. \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \|\| ^* \| \| \| \|\| ^* ^*\|\| \| \| \|\| \| \| ^* \| \|
`MYRISTYL`	.. \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|^*** \| ^* ^* \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| ^* \| \| \| \|\|\|\| ^*** \| \| \| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`ASP_PROTEASE`	.. \| \|\|\| *^**** \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| ^*******\| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`alphabetamotif`	.. \| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \| *** \| ***\| \| \| \|\| \| \| \| \|
`asxturn`	.. \| \|\|\| *\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| *\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`betabulgeloop`	.. ***** \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`betaturn`	.. **\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| **** ** \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`gammaturn`	.. \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| *** \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
`nest`	.. * \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| * \|\| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| *
`niche`	.. \|\| * \| \| *** * \| **** * ** \| \| * ** \| \| ** **
`stmotif`	.. \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| ***** \| \|
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`stturn`	.. \|\| \| * * \| \|\| ***
`Catalytic site`	`.. ** * * **`

Assembly 5

View the assembly/model: (

)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

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`sequence :`	`..SSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSENSQSLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR`
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`ASN_GLYCOSYLATION`	.. \| \|\|\| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \|\|\| ^*** \|\|\|\| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|
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`MYRISTYL`	.. \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \| \| \| \|^*** \| ^* ^* \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| ^* \| \|\|\|\| ^*** \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \|
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`alphabetamotif`	.. \| \|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\| \|\|***\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\|\|\| \|\| \|\|\| * \| ***\| \| \| \|\| \| \| \| \|
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`betabulgeloop`	.. ***** \|\| \| \| \|\|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \|\| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \|
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