1z83: Sequences

PDBeMotif: 1z83

		Sequences				3D motifs				Ligand environment				Ligand bonds

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Enzyme:	2.7.4.3
Classification:	transferase \| release date: Tue, Mar 29, 2005
Title:	crystal structure of human ak1a in complex with ap5a
Authors:	A., A.JANSSON, A.SCHREURS, F.VON DELFT, G.BUNKOCZI, M.SUNDSTROM, P.FILIPPAKOPOULOS, S.KNAPP, STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM (SGC
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 1.90Å)

PDBe Citation

Small molecules:

SO4

AP5

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

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Chains A,B,C sequence:
SMEEKLKKTNIIFVVGGPGSGKGTQCEKIVQKYGYTHLSTGDLLRSEVSSGSARGKKLSEIMEKGQLVPLETVLDMLRDA
MVAKVNTSKGFLIDGYPREVQQGEEFERRIGQPTLLLYVDAGPETMTQRLLKRGETSGRVDDNEETIKKRLETYYKATEP
VIAFYEKRGIVRKVNAEGSVDSVFSQVCTHLDALLN

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

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)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

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chain A : ADENYLATE KINASE 1 member of: CATH:3.40.50.300, GENE3D:G3DSA_3.40.50.300, HAMAP:MF_00235/MF_03171, PANTHER:PTHR23359/PTHR23359_SF59, PFAM:PF00406, PRINTS:ADENYLTKNASE, PROSITE PATTERNS:PS00113, SUPERFAMILY:SSF52540, TIGRFAMS:TIGR01360, UniProt:P00568
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`MYRISTYL`	`.. \|\| \| ^***\|\| \| \| \| \| \|^*\| \| \| \| \| \|\| \| \|\| \| \|\| \| \| \|\|\| \| \|\|\|\| \| \|^***`
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Assembly 2

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chain B : ADENYLATE KINASE 1 member of: CATH:3.40.50.300, GENE3D:G3DSA_3.40.50.300, HAMAP:MF_00235/MF_03171, PANTHER:PTHR23359/PTHR23359_SF59, PFAM:PF00406, PRINTS:ADENYLTKNASE, PROSITE PATTERNS:PS00113, SUPERFAMILY:SSF52540, TIGRFAMS:TIGR01360, UniProt:P00568
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Assembly 3

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)

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Sequence numbers:

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chain C : ADENYLATE KINASE 1 member of: CATH:3.40.50.300, GENE3D:G3DSA_3.40.50.300, HAMAP:MF_00235/MF_03171, PANTHER:PTHR23359/PTHR23359_SF59, PFAM:PF00406, PRINTS:ADENYLTKNASE, PROSITE PATTERNS:PS00113, SUPERFAMILY:SSF52540, TIGRFAMS:TIGR01360, UniProt:P00568
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`sequence :`	`..SMEEKLKKTNIIFVVGGPGSGKGTQCEKIVQKYGYTHLSTGDLLRSEVSSGSARGKKLSEIMEKGQLVPLETVLDMLRDAMVAKVNTSKGFLIDGYPREVQQGEEFERRIGQPTLLLYVDAGPETMTQRLLKRGETSGRVDDNEETIKKRLETYYKATEPVIAFYEKRGIVRKVNAEGSVDSVFSQVCTHLDALL`
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