1prx: Sequences

PDBeMotif: 1prx

		Sequences				3D motifs				Ligand environment				Ligand bonds

Help About

Classification:	antioxidant \| release date: Fri, Apr 3, 1998
Title:	horf6 a novel human peroxidase enzyme
Authors:	C.-H.YANG, H.-J.CHOI, S.-E.RYU, S.G.RHEE, S.W.KANG
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 2.00Å)

PDBe Citation

Modified residues:

CSO

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

- Click here to show 5Å bonds

Chains A,B sequence:
MPGGLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHL
AWSKDINAYNSEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEI
LRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

View the assembly/model: (

)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

chain A : HORF6 member of: CATH:3.30.1020.10/3.40.30.10, GENE3D:G3DSA_3.30.1020.10/G3DSA_3.40.30.10, PANTHER:PTHR10681/PTHR10681_SF77, PFAM:PF00578/PF10417, PIRSF:PIRSF000239, PROSITE PROFILES:PS51352, SUPERFAMILY:SSF52833, UniProt:P30041
`sec str:`	`............eeee..eeeehhhhh...eeeeeee.....hhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.eeeeeee...hhhhhhhhhhhhhh............eee....hhhhh...................eeeee.....eeeeee........hhhhhhhhhhhhhhhhh.....................hhhhhhh.......................`
`sequence :`	`..LLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNSEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP`
`seq num:`	`..5 15 25 35 45 55 65 75 85 95 105 115 125 135 145 155 165 175 185 195 205 215`
`ASN_GLYCOSYLATION`	`.. \| \| ^*** \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\|`
`PKC_PHOSPHO_SITE`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \|\| \| \| \|\|\|\| ^ \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \|^ \| \| \| ^\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| ^\|`
`CK2_PHOSPHO_SITE`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| ^*\| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ^* \| \| \| ^*** \| \|\|`
`MYRISTYL`	`..*** \| \| ^* \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| ^*** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|`
`AMIDATION`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ^***`
`asxturn`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \| \|\|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \| *** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|`
`betaturn`	`.. \| \| \| \| \| \| \| ***\| \| \| \|\| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ** \| \| \| \|`
`gammaturn`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|* \| \|\|\|\| \|\|\|\| \| \| * \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|`
`nest`	`.. \| \| \| \| \| \| \| * \| \| * \| \| ** \| \| * \| \| \| \| \| * \| \| \| \| *`
`niche`	`.. ** \| \| \| \| \| * ** \| \| \| **`
`ststaple`	`.. \| \| *** * \| \| *******`
`stturn`	`.. * *`

chain B : HORF6 member of: CATH:3.30.1020.10/3.40.30.10, GENE3D:G3DSA_3.30.1020.10/G3DSA_3.40.30.10, PANTHER:PTHR10681/PTHR10681_SF77, PFAM:PF00578/PF10417, PIRSF:PIRSF000239, PROSITE PROFILES:PS51352, SUPERFAMILY:SSF52833, UniProt:P30041
`sec str:`	`...............eeee..eeeehhhhh...eeeeeee.....hhhhhhhhhhhhhhhhhhhh.eeeeeee...hhhhhhhhhhhhhh............eee....hhhhh................eeeee.....eeeeee........hhhhhhhhhhhhhhhhh.....................hhhhhhh....eee..........eee...`
`sequence :`	`..PGGLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNSEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAE..MPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP`
`seq num:`	`..2 12 22 32 42 52 62 72 82 92 102 112 ..127 137 147 157 167 177 187 197 207 217`
`ASN_GLYCOSYLATION`	`.. \|\|\|\| \| ^***\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| ..\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\|\|\|`
`PKC_PHOSPHO_SITE`	`.. \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\| ^ \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| ..\| \|^ \| \| \|\| \| ^\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| ^\|`
`CK2_PHOSPHO_SITE`	`.. \|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| ^* \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| ..\| \|\|\|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| ^* \| \| \| ^*** \| \|\|\|\|`
`MYRISTYL`	`.. \|^*** \| \|\|\| \|\| \| ^* \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| ..***\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|`
`AMIDATION`	`.. \| \|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\| \| ..\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ^***`
`asxturn`	`.. \| \|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\|* ..\| \|\| \| \| \| \|\| \| \| * \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|`
`betabulge`	`.. \| \|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\|\|\| \| \| \| \|\|\|\| \|\|\|\| ..\| \|\| \| \| \| ** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|`
`betaturn`	`.. \| \|\| \| **\| \| \| \| \|\|\| \| \| \|\| \|\|\|\| ..\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| **\|`
`gammaturn`	`.. \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|* \| \|\|\|\| \|\|\|\| ..**** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|`
`nest`	`.. \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| * \| * \| \| ** .. * \| \| \| \| * \| \| \| \| *`
`niche`	`.. ***** \| \| \| * \| \| \| \| * .. \| \| **`
`schellmannloop`	`.. \| \| \| \| \| ****** .. \| \|`
`stmotif`	`.. ***** \| \| .. \| \|`
`ststaple`	`.. \| \| *** .. ***`
`stturn`	`.. *** ..`

	New search	1prx:	Sequences	\|	3D motifs	\|	Ligand environment	\|	Ligand bonds	\|	SPICE view	\|	PDB	\|	XML