1lbi: Sequences

PDBeMotif: 1lbi

		Sequences				3D motifs				Ligand environment				Ligand bonds

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Classification:	transcription regulation \| release date: Sat, Feb 17, 1996
Title:	lac repressor
Authors:	G.CHANG, H.C.PACE, M.A.KERCHER, M.LEWIS, N.C.HORTON, P.LU
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 2.70Å)

PDBe Citation

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

- Click here to show 5Å bonds

Chains A,B,C,D sequence:
MKPVTLYDVAEYAGVSYQTVSRVVNQASHVSAKTREKVEAAMAELNYIPNRVAQQLAGKQSLLIGVATSSLALHAPSQIV
AAIKSRADQLGASVVVSMVERSGVEACKTAVHNLLAQRVSGLIINYPLDDQDAIAVEAACTNVPALFLDVSDQTPINSII
FSHEDGTRLGVEHLVALGHQQIALLAGPLSSVSARLRLAGWHKYLTRNQIQPIAEREGDWSAMSGFQQTMQMLNEGIVPT
AMLVANDQMALGAMRAITESGLRVGADISVVGYDDTEDSSCYIPPLTTIKQDFRLLGQTSVDRLLQLSQGQAVKGNQLLP
VSLVKRKTTLAPNTQTASPRALADSLMQLARQVSRLESGQ

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

View the assembly/model: (

)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

chain A : LAC REPRESSOR member of: CATH:3.40.50.2300, GENE3D:G3DSA_1.10.260.40/G3DSA_3.40.50.2300, PANTHER:PTHR30146/PTHR30146_SF30, PFAM:PF00356/PF13377, PRINTS:HTHLACI, PROSITE PATTERNS:PS00356, PROSITE PROFILES:PS50932, SMART:SM00354, SUPERFAMILY:SSF47413/SSF53822, UniProt:P03023
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`CAMP_PHOSPHO_SITE`	.. \| \|\|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| *^\| \| \| \| \|\| \| \|
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`CK2_PHOSPHO_SITE`	.. \| \|\|\| \| ^* \| \| ^* ^* \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|^\|\|\|\| \| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \|\|\| \| \| \|\| \|\|\| \|\| \| \| ^ \| \| \| \| \| \| \| \|\| ^*
`MYRISTYL`	`.. ^***\| \| \| \| \| \|^* \| \| \| ^* \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|^* \| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \|^* ^* \|^*** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|`
`HTH_LACI_1`	.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \|\|\| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|
`alphabetamotif`	.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| *** \| \|\|\| * \| \| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ***
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`betaturn`	.. \| \| \| \| \| \| \| ** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| **
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`ststaple`	`.. \| \| *** * * * ***`
`stturn`	`.. ***`

chain B : LAC REPRESSOR member of: CATH:3.40.50.2300, GENE3D:G3DSA_1.10.260.40/G3DSA_3.40.50.2300, PANTHER:PTHR30146/PTHR30146_SF30, PFAM:PF00356/PF13377, PRINTS:HTHLACI, PROSITE PATTERNS:PS00356, PROSITE PROFILES:PS50932, SMART:SM00354, SUPERFAMILY:SSF47413/SSF53822, UniProt:P03023
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`CK2_PHOSPHO_SITE`	.. \| \| \| ^* \|\|\| ^* ^* \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| ^\|\| \| \| \|\|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \|\|\| \|\| \| \|\| \|\| \| ^ \| \| \| \| \| \| \| \| \| ^*
`MYRISTYL`	`.. ^*** \| \| \|\| \|\|\| ^* \| \| ^* \| \|\| \| \| \| ^* \| \|\|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|^* ^* \|^*** \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|`
`HTH_LACI_1`	.. \| \| \|\| \|\|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\|\| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|
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`nest`	.. \| \| \| * * \| \| \| \| * \| \| * * \| * * \| \| \| \| \| \| \| \| * \| \| \| \|
`niche`	.. \| \| \| \| ** \| \| \| \| \| \| \| \| ** \| \| \| \|
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`ststaple`	.. *** * * * * ***

chain C : LAC REPRESSOR member of: CATH:3.40.50.2300, GENE3D:G3DSA_1.10.260.40/G3DSA_3.40.50.2300, PANTHER:PTHR30146/PTHR30146_SF30, PFAM:PF00356/PF13377, PRINTS:HTHLACI, PROSITE PATTERNS:PS00356, PROSITE PROFILES:PS50932, SMART:SM00354, SUPERFAMILY:SSF47413/SSF53822, UniProt:P03023
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`sequence :`	`..LLIGVATSSLALHAPSQIVAAIKSRADQLGASVVVSMVERSGVEACKTAVHNLLAQRVSGLIINYPLDDQDAIAVEAACTNVPALFLDVSDQTPINSIIFSHEDGTRLGVEHLVALGHQQIALLAGPLSSVSARLRLAGWHKYLTRNQIQPIAEREGDWSAMSGFQQTMQMLNEGIVPTAMLVANDQMALGAMRAITESGLRVGADISVVGYDDTEDSSCYIPPLTTIKQDFRLLGQTSVDRLLQLSQGQAVKGNQLLPVSLVKRKTTLAPNTQTASPRALADSLMQLARQVSRLE`
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