triangle PDBeMotif: 1cyb  
  coner Sequences coner   coner 3D motifs coner   coner Ligand environment coner   coner Ligand bonds coner
   
coner
   Search  |  PDB header search  |  Upload PDB file  |  Molecule binding  |  Pair bonds  |  Motif binding  |  3D environment  |  Motif inclusion  
coner
AstexViewer TM
Download original PDB file
Download xml file
Classification immunosuppressant    | release date: Mon, Feb 24, 1992
Title nmr studies of (u-13c)cyclosporin a bound to cyclophilin: bo conformation and portions of cyclosporin involved in bindin
Authors S.W.FESIK
Method SOLUTION NMR
PDBe Citation   
Small molecules:    search ABA ABA binding statistics ABA   search SAR SAR binding statistics SAR   search DAL DAL binding statistics DAL   search MVA MVA binding statistics MVA   search MLE MLE binding statistics MLE   search BMT BMT binding statistics BMT
Ligand bond colours:   *  covalent   *  ionic   *  hydrogen   *  electrostatic   *  van-der-waals   *  plane-atom   *  plane-plane   *  undefined  - Click here to show 5Å bonds
Chain A sequence:
VXA
Residue colours:  hydrophilic   hydrophobic   intermediate 
Assembly 1  model: 1     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 2     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 3     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|**
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 4     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|**
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 5     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|**
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 6     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..***
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 7     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 8     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..|**
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 9     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..|**
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 10     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 11     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..***
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 12     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|**
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 13     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..*  
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*  
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|  
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|**
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..|**
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 14     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..|**
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 15     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 16     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|**
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..|**
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 17     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 18     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|* 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 19     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..||*
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

Assembly 1  model: 20     View the assembly/model: ( JMolViewer Download PDB file RasMol script viewer AstexViewer™@MSD-EBI )
Motif search   chain:    Sequence numbers: 
   Using:   φ/ψ    residues code    secondary structures   
 coordinates of:  Cαs Side-chain
 
      View the fragment: rasmol script JMol viewer
chain A : CYCLOSPORIN A
member of: NOR:searchNOR00033
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 8A  ..** 
JMol viewer RasMol script viewer  SAR 7A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  ABA 6A  ..|| 
JMol viewer RasMol script viewer  BMT 5A  ..*
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 3A  ..|**
JMol viewer RasMol script viewer  MLE 2A  ..|||
JMol viewer RasMol script viewer  DAL 1A  ..|**
sec str:  .....
sequence :  ..VLA
seq num:  ..9  

   New search    1cyb:  Sequences  |  3D motifs  |  Ligand environment  |   Ligand bonds   |  SPICE view  |  PDB  |  XML