1b0f: Sequences

PDBeMotif: 1b0f

		Sequences				3D motifs				Ligand environment				Ligand bonds

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Enzyme:	3.4.21.37
Classification:	hydrolase \| release date: Mon, Nov 9, 1998
Title:	crystal structure of human neutrophil elastase with mdl 101,
Authors:	C.TARDIF, H.A.SCHREUDER, J.T.PELTON, N.P.PEET, W.A.METZ
Method:	X-RAY DIFFRACTION (resolution: 3.00Å)

PDBe Citation

Small molecules:

NAG

SEI

FUC

Modified residues:

ASN

Ligand bond colours:

covalent

ionic

hydrogen

electrostatic

van-der-waals

plane-atom

plane-plane

undefined

- Click here to show 5Å bonds

Chain A sequence:
IVGGRRARPHAWPFMVSLQLAGGHFCGATLIAPNFVMSAAHCVANVNVRAVRVVLGAHNLSRREPTRQVFAVQRIFEDGY
DPVNLLNDIVILQLNGSATINANVQVAQLPAQGRRLGNGVQCLAMGWGLLGRNRGIASVLQELNVTVVTSLCRRSNVCTL
VRGRQAGVCFGDSGSPLVCNGLIHGIASFVRGGCASGLYPDAFAPVAQFVNWIDSIIQ

Residue colours: hydrophilic hydrophobic intermediate

Assembly 1

View the assembly/model: (

)

Motif search

chain:

Sequence numbers:

Using:	φ/ψ residues code secondary structures
	coordinates of: Cαs Side-chain

View the fragment:

chain A : PROTEIN (ELASTASE) member of: CATH:2.40.10.10, GENE3D:G3DSA_2.40.10.10, PANTHER:PTHR24257/PTHR24257_SF16, PFAM:PF00089, PRINTS:CHYMOTRYPSIN, PROSITE PATTERNS:PS00134/PS00135, PROSITE PROFILES:PS50240, SMART:SM00020, SUPERFAMILY:SSF50494, UniProt:P08246
`SEI` `300A`	`.. * *** **`
`NAG` `413A`	`.. \|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|`
`NAG` `411A`	`.. \|\| \|\| * \| \|\|\|\|\| \|\|\|\|`
`FUC` `412A`	`.. * \|\| \|\| * \| \| \|\|\|\|\| **** \|\|\|\|`
`NAG` `403A`	`.. \| \|\| \|\| * * \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|`
`NAG` `401A`	`.. \| \|\| \|\| \| \| * * \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|`
`FUC` `402A`	`.. \| \|\| \|\| *** \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|`
`sec str:`	`................eeeeee..eeeeeeeeee..eeee.hhhh....hhheeeee............eeeeeeeeee............eeeee..........................eeeeee..............eeeeeeee.......eeeee...............eeee..eeeeeeee...........eeee.hhhhhhhhhhh..`
`sequence :`	`..IVGGRRARPHAWPFMVSLQLAGGHFCGATLIAPNFVMSAAHCVANVNVRAVRVVLGAHNLSRREPTRQVFAVQRIFEDGYDPVNLLNDIVILQLNGSATINANVQVAQLPAQGRRLGNGVQCLAMGWGLLGRNRGIASVLQELNVTVVTSLCRRSNVCTLVRGRQAGVCFGDSGSPLVCNGLIHGIASFVRGGCASGLYPDAFAPVAQFVNWIDSIIQ`
`seq num:`	`..16 26 36 47 57 65 74 84 95 105 115 125 135 145 156 167 185 193 205 217 226 236`
`ASN_GLYCOSYLATION`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| ^*\|\| \| \|\| \| \| \| \| ^* \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| ^***\| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|`
`PKC_PHOSPHO_SITE`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| ^**\| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|`
`CK2_PHOSPHO_SITE`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| ^*** \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|`
`TYR_PHOSPHO_SITE`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|******^ \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \| \|\|\| \|\| \| \|\|\|\|\| \| \|\|`
`MYRISTYL`	`.. ^*** \| \| \| ^* \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|\| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ^*\|\|\| \| ^* \|\| ^***\|\| \| \|\|`
`AMIDATION`	`.. ^* \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \|^* \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|`
`LEUCINE_ZIPPER`	`.. \| \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| ********************** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|`
`TRYPSIN_HIS`	`.. \| \| \| \| \| ***^ \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|`
`TRYPSIN_SER`	`.. \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| ****^*** \|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|\|`
`alphabetamotif`	`.. \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| *****`
`asxturn`	`.. \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| ***\| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\| \|\|\|\|\| \| \|`
`betabulge`	`.. \| \| \| \| \| \| \|\| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|\|\|\|\|\| ** \|\|\|\|\| \| \|`
`betaturn`	`.. \| \| \| ** \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| *** \|\|\|\|\| **`
`nest`	`.. * \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| * \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \| \|\|*\|\| ***`
`niche`	`.. ** \| \| * * \|\|* \|*`
`stturn`	`.. \| \| \|\|\|\|\|\| ***`
`Catalytic site`	`.. * * ******`

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