PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=494-HM-6L1)

Interfaces in PDB 6oo2

VPS4 WITH CYCLIC PEPTIDE BOUND IN THE CENTRAL PORE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2				interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`196`	`67`	`17711`	`◊`	C	`204`	`51`	`17600`	`1948.0`	`-11.9`	`0.196`	`18`	`3`	`0`	`0.000`
	`2`		C	`211`	`65`	`17600`	`◊`	D	`203`	`50`	`17480`	`1941.0`	`-9.3`	`0.393`	`16`	`10`	`0`	`0.000`
	`3`		A	`199`	`66`	`17835`	`◊`	B	`207`	`50`	`17711`	`1928.8`	`-6.0`	`0.399`	`22`	`11`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`1939.3`	`-9.0`	`0.329`	`19`	`8`	`0`	`0.000`
2	`4`		D	`203`	`69`	`17480`	`◊`	E	`204`	`51`	`17182`	`1947.4`	`-12.7`	`0.202`	`11`	`2`	`0`	`0.000`
3	`5`		A	`47`	`10`	`17835`	`◊`	G	`35`	`10`	`1895`	`343.2`	`-2.2`	`0.560`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		C	`49`	`18`	`17600`	`◊`	[ADP]C:501	`27`	`1`	`546`	`334.4`	`-4.4`	`0.481`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		D	`52`	`22`	`17480`	`◊`	[ADP]D:501	`27`	`1`	`560`	`333.7`	`-3.9`	`0.477`	`9`	`0`	`0`	`0.000`
	`8`		E	`52`	`19`	`17182`	`◊`	[ADP]E:501	`27`	`1`	`549`	`332.7`	`-4.4`	`0.504`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
	`9`		B	`52`	`20`	`17711`	`◊`	[ADP]B:501	`27`	`1`	`541`	`327.6`	`-4.4`	`0.472`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`332.1`	`-4.3`	`0.484`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
5	`10`		A	`50`	`18`	`17835`	`◊`	[ADP]A:501	`27`	`1`	`532`	`321.7`	`-4.0`	`0.550`	`8`	`0`	`0`	`0.000`
6	`11`		B	`35`	`8`	`17711`	`◊`	G	`27`	`8`	`1895`	`272.2`	`-3.9`	`0.350`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`12`		P	`35`	`17`	`2530`	`◊`	Q	`40`	`18`	`3075`	`268.1`	`-6.5`	`0.946`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		R	`35`	`17`	`2520`	`◊`	S	`37`	`17`	`2572`	`262.1`	`-6.7`	`0.925`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`14`		N	`34`	`17`	`2500`	`◊`	O	`37`	`16`	`3070`	`261.8`	`-6.6`	`0.924`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		H	`35`	`17`	`2521`	`◊`	I	`37`	`16`	`3077`	`260.3`	`-6.5`	`0.932`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		L	`34`	`17`	`2522`	`◊`	M	`37`	`16`	`3072`	`260.2`	`-6.5`	`0.927`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		J	`35`	`17`	`2513`	`◊`	K	`38`	`17`	`3079`	`259.1`	`-6.5`	`0.937`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`261.9`	`-6.6`	`0.932`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`18`		A	`19`	`8`	`17835`	`◊`	I	`29`	`9`	`3077`	`260.2`	`-2.8`	`0.781`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`19`		B	`6`	`3`	`17711`	`◊`	K	`10`	`4`	`3079`	`81.5`	`-0.6`	`0.742`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`20`		D	`6`	`4`	`17480`	`◊`	O	`9`	`6`	`3070`	`52.8`	`0.0`	`0.832`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`131.5`	`-1.1`	`0.785`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
9	`21`		C	`29`	`8`	`17600`	`◊`	G	`27`	`9`	`1895`	`258.4`	`-3.8`	`0.223`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
10	`22`		D	`31`	`7`	`17480`	`◊`	G	`25`	`8`	`1895`	`236.4`	`-5.0`	`0.251`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
11	`23`		A	`27`	`9`	`17835`	`◊`	H	`18`	`8`	`2521`	`229.3`	`-4.1`	`0.442`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`24`		B	`21`	`8`	`17711`	`◊`	J	`15`	`7`	`2513`	`173.3`	`-4.1`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`201.3`	`-4.1`	`0.367`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`25`		E	`23`	`9`	`17182`	`◊`	P	`16`	`7`	`2530`	`195.5`	`-3.2`	`0.529`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
13	`26`		D	`23`	`8`	`17480`	`◊`	N	`17`	`8`	`2500`	`195.0`	`-4.1`	`0.367`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		C	`19`	`8`	`17600`	`◊`	L	`16`	`7`	`2522`	`179.1`	`-3.2`	`0.458`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`187.0`	`-3.7`	`0.412`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`28`		E	`16`	`4`	`17182`	`◊`	G	`17`	`6`	`1895`	`148.1`	`-2.7`	`0.287`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`29`		A	`14`	`4`	`17835`	`◊`	S	`13`	`6`	`2572`	`131.3`	`0.0`	`0.847`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`30`		C	`13`	`4`	`17600`	`◊`	K	`12`	`5`	`3079`	`120.8`	`-0.6`	`0.774`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`31`		D	`11`	`4`	`17480`	`◊`	M	`10`	`5`	`3072`	`112.9`	`-0.0`	`0.812`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`32`		B	`15`	`4`	`17711`	`◊`	I	`9`	`5`	`3077`	`112.7`	`-0.6`	`0.698`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`115.4`	`-0.4`	`0.761`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`33`		E	`8`	`3`	`17182`	`◊`	Q	`10`	`6`	`3075`	`99.1`	`-3.2`	`0.168`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`34`		E	`11`	`4`	`17182`	`◊`	[ADP]D:501	`8`	`1`	`560`	`77.0`	`-0.7`	`0.616`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
19	`35`		B	`21`	`10`	`17711`	`◊`	[BEF]B:502	`4`	`1`	`182`	`73.1`	`1.9`	`0.633`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`36`		C	`20`	`10`	`17600`	`◊`	[BEF]C:502	`4`	`1`	`181`	`71.5`	`1.7`	`0.616`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
	`37`		A	`20`	`10`	`17835`	`◊`	[BEF]A:502	`4`	`1`	`181`	`69.7`	`1.7`	`0.620`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`70.6`	`1.7`	`0.618`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
21	`38`		A	`6`	`1`	`17835`	`◊`	E	`8`	`2`	`17182`	`69.1`	`-0.4`	`0.487`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`39`		C	`12`	`4`	`17600`	`◊`	[ADP]B:501	`5`	`1`	`541`	`64.9`	`-1.3`	`0.500`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		D	`11`	`4`	`17480`	`◊`	[ADP]C:501	`6`	`1`	`546`	`64.6`	`-1.7`	`0.517`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`64.8`	`-1.5`	`0.508`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
23	`41`		B	`9`	`4`	`17711`	`◊`	[ADP]A:501	`8`	`1`	`532`	`64.8`	`-0.8`	`0.642`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
24	`42`		E	`6`	`2`	`17182`	`◊`	O	`7`	`3`	`3070`	`49.1`	`0.5`	`0.863`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`43`		D	`10`	`5`	`17480`	`◊`	[MG]D:502	`1`	`1`	`98`	`44.0`	`-5.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`44`		C	`13`	`6`	`17600`	`◊`	[MG]C:503	`1`	`1`	`98`	`33.2`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`45`		B	`12`	`6`	`17711`	`◊`	[MG]B:503	`1`	`1`	`98`	`32.7`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		A	`11`	`6`	`17835`	`◊`	[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`31.8`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`35.4`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`47`		[ADP]B:501	`4`	`1`	`541`	`◊`	[BEF]B:502	`4`	`1`	`182`	`42.0`	`-2.1`	`0.252`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		[ADP]C:501	`4`	`1`	`546`	`◊`	[BEF]C:502	`4`	`1`	`181`	`41.8`	`-2.2`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`41.9`	`-2.1`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`49`		[ADP]A:501	`4`	`1`	`532`	`◊`	[BEF]A:502	`4`	`1`	`181`	`41.1`	`-2.1`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`50`		B	`7`	`3`	`17711`	`◊`	[BEF]A:502	`4`	`1`	`181`	`39.0`	`1.3`	`0.554`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`51`		C	`6`	`3`	`17600`	`◊`	[BEF]B:502	`3`	`1`	`182`	`37.9`	`1.1`	`0.355`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`52`		D	`9`	`3`	`17480`	`◊`	[BEF]C:502	`3`	`1`	`181`	`37.6`	`0.9`	`0.339`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`37.7`	`1.0`	`0.347`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
30	`53`		C	`4`	`3`	`17600`	`◊`	M	`5`	`3`	`3072`	`36.2`	`-1.2`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`54`		[ADP]D:501	`4`	`1`	`560`	`◊`	[MG]D:502	`1`	`1`	`98`	`30.5`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[ADP]C:501	`4`	`1`	`546`	`◊`	[MG]C:503	`1`	`1`	`98`	`28.1`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`56`		[ADP]B:501	`4`	`1`	`541`	`◊`	[MG]B:503	`1`	`1`	`98`	`27.4`	`-4.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`57`		[ADP]A:501	`4`	`1`	`532`	`◊`	[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`24.8`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`27.7`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`58`		[BEF]C:502	`2`	`1`	`181`	`◊`	[MG]C:503	`1`	`1`	`98`	`20.9`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[BEF]A:502	`2`	`1`	`181`	`◊`	[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`20.8`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[BEF]B:502	`2`	`1`	`182`	`◊`	[MG]B:503	`1`	`1`	`98`	`20.3`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`20.7`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`61`		B	`7`	`5`	`17711`	`◊`	[MG]A:503	`1`	`1`	`98`	`16.4`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`62`		E	`3`	`2`	`17182`	`◊`	[MG]D:502	`1`	`1`	`98`	`12.4`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`63`		C	`2`	`2`	`17600`	`◊`	[MG]B:503	`1`	`1`	`98`	`11.7`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		D	`3`	`2`	`17480`	`◊`	[MG]C:503	`1`	`1`	`98`	`7.3`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*											`12.0`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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