PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=278-HK-M6F)

Interfaces in PDB 6f4x crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.69 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF H. PYLORI PURINE NUCLEOSIDE PHOSPHORYLASE IN COMPLEX WITH PO4 AND FORMYCIN A

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`169`	`44`	`10881`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`174`	`45`	`11183`	`1716.0`	`-18.7`	`0.204`	`28`	`8`	`0`	`1.000`
	`2`		D	`171`	`45`	`11254`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`166`	`44`	`11092`	`1711.9`	`-18.0`	`0.200`	`27`	`8`	`0`	`1.000`
	`3`		E	`165`	`45`	`10879`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`167`	`45`	`10992`	`1666.1`	`-19.8`	`0.175`	`27`	`8`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1698.0`	`-18.8`	`0.193`	`27`	`8`	`0`	`1.000`
2	`4`		E	`181`	`46`	`10879`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`177`	`42`	`11092`	`1684.2`	`-27.7`	`0.037`	`4`	`0`	`0`	`0.872`
	`5`		F	`177`	`44`	`10881`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`178`	`48`	`10992`	`1677.6`	`-26.6`	`0.052`	`4`	`0`	`0`	`0.872`
	`6`		D	`165`	`40`	`11254`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`164`	`40`	`11183`	`1557.7`	`-26.2`	`0.024`	`4`	`0`	`0`	`0.872`
	*Average:*													`1639.9`	`-26.8`	`0.038`	`4`	`0`	`0`	`0.872`
3	`7`		A	`58`	`14`	`11183`	`◊`	D	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`47`	`13`	`11254`	`477.2`	`1.6`	`0.848`	`6`	`3`	`0`	`0.000`
4	`8`		F	`46`	`12`	`10881`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`42`	`15`	`11183`	`357.7`	`-2.3`	`0.584`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
5	`9`		C	`34`	`13`	`10992`	`◊`	E	-x,y-1/2,-z-1/2	`3_544`	`24`	`7`	`10879`	`278.4`	`-2.1`	`0.490`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`10`		[FMC]D:301	`19`	`1`	`410`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`38`	`16`	`11254`	`278.2`	`0.3`	`0.383`	`3`	`0`	`0`	`0.079`
	`11`		[FMC]B:301	`19`	`1`	`410`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`39`	`17`	`11092`	`277.0`	`0.3`	`0.402`	`3`	`0`	`0`	`0.079`
	`12`		[FMC]F:301	`19`	`1`	`410`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`38`	`15`	`10881`	`270.4`	`0.2`	`0.417`	`2`	`0`	`0`	`0.079`
	`13`		[FMC]A:301	`19`	`1`	`409`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`42`	`16`	`11183`	`254.4`	`-0.2`	`0.387`	`3`	`0`	`0`	`0.079`
	`14`		[FMC]E:302	`19`	`1`	`405`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`42`	`16`	`10879`	`238.3`	`0.0`	`0.448`	`4`	`0`	`0`	`0.079`
	*Average:*													`263.7`	`0.1`	`0.407`	`3`	`0`	`0`	`0.079`
7	`15`		[FMC]C:302	`19`	`1`	`407`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`40`	`16`	`10992`	`240.3`	`-0.1`	`0.429`	`5`	`0`	`0`	`0.061`
8	`16`		F	`23`	`6`	`10881`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`5`	`10879`	`219.9`	`-2.4`	`0.361`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`17`		E	`25`	`9`	`10879`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z-1/2	`3_644`	`23`	`8`	`11092`	`189.1`	`0.7`	`0.734`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
10	`18`		A	`20`	`7`	`11183`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`6`	`11254`	`160.8`	`-0.4`	`0.485`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
11	`19`		A	`18`	`5`	`11183`	`◊`	F	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`19`	`4`	`10881`	`156.2`	`0.9`	`0.777`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
12	`20`		C	`11`	`4`	`10992`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`7`	`10879`	`128.6`	`0.9`	`0.748`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
13	`21`		[EDO]D:302	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`16`	`9`	`11254`	`113.8`	`4.6`	`0.756`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
14	`22`		[EDO]A:303	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`11183`	`105.1`	`3.4`	`0.527`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
15	`23`		[EDO]F:302	`4`	`1`	`186`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`10881`	`101.2`	`2.5`	`0.288`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`24`		C	`11`	`4`	`10992`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`11183`	`100.0`	`1.0`	`0.807`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`25`		E	`9`	`4`	`10879`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`11254`	`99.0`	`1.1`	`0.810`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`26`		C	`11`	`5`	`10992`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11092`	`98.8`	`1.0`	`0.812`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`27`		B	`11`	`5`	`11092`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`11183`	`94.8`	`0.8`	`0.765`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		F	`10`	`4`	`10881`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`10879`	`94.6`	`1.2`	`0.828`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`29`		F	`10`	`5`	`10881`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`11254`	`93.6`	`1.2`	`0.816`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`96.8`	`1.0`	`0.806`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`30`		[EDO]B:302	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`11092`	`97.3`	`2.6`	`0.501`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`31`		[EDO]A:306	`4`	`1`	`182`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`6`	`11183`	`92.7`	`2.7`	`0.420`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`32`		[PO4]A:302	`5`	`1`	`189`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`10`	`11183`	`86.8`	`-4.6`	`0.824`	`4`	`0`	`0`	`0.197`
20	`33`		[EDO]A:305	`4`	`1`	`186`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`11183`	`85.7`	`2.5`	`0.305`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`34`		[EDO]A:307	`4`	`1`	`185`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`11183`	`82.1`	`2.6`	`0.291`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`35`		[PO4]C:301	`5`	`1`	`189`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`10992`	`79.0`	`-5.4`	`0.781`	`9`	`0`	`0`	`0.240`
23	`36`		[PO4]E:301	`5`	`1`	`188`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`19`	`8`	`10879`	`77.5`	`-5.4`	`0.767`	`9`	`0`	`0`	`0.211`
24	`37`		[EDO]E:303	`4`	`1`	`184`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`10879`	`74.1`	`1.5`	`0.219`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`38`		[EDO]A:304	`4`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`11254`	`71.9`	`1.8`	`0.218`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`39`		[EDO]C:303	`4`	`1`	`185`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`10881`	`71.4`	`1.7`	`0.212`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`40`		[EDO]D:304	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`11254`	`71.3`	`2.4`	`0.305`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`41`		[EDO]A:304	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11183`	`68.8`	`2.5`	`0.930`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
29	`42`		[EDO]C:303	`4`	`1`	`185`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`10992`	`68.6`	`2.6`	`0.947`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
30	`43`		[EDO]D:303	`4`	`1`	`184`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`11254`	`68.5`	`2.0`	`0.284`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
31	`44`		[FMC]B:301	`6`	`1`	`410`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10879`	`66.8`	`0.1`	`0.453`	`2`	`0`	`0`	`0.017`
	`45`		[FMC]F:301	`6`	`1`	`410`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10992`	`66.4`	`1.2`	`0.615`	`2`	`0`	`0`	`0.017`
	`46`		[FMC]D:301	`6`	`1`	`410`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11183`	`64.9`	`0.5`	`0.508`	`2`	`0`	`0`	`0.017`
	`47`		[FMC]A:301	`6`	`1`	`409`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11254`	`61.9`	`1.0`	`0.578`	`2`	`0`	`0`	`0.017`
	*Average:*													`65.0`	`0.7`	`0.538`	`2`	`0`	`0`	`0.017`
32	`48`		A	`13`	`6`	`11183`	`f`	[EDO]D:304	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`184`	`66.7`	`1.9`	`0.862`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
33	`49`		[FMC]E:302	`6`	`1`	`405`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`11092`	`61.8`	`0.5`	`0.541`	`2`	`0`	`0`	`0.018`
	`50`		[FMC]C:302	`6`	`1`	`407`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10881`	`61.4`	`0.2`	`0.492`	`2`	`0`	`0`	`0.018`
	*Average:*													`61.6`	`0.3`	`0.517`	`2`	`0`	`0`	`0.018`
34	`51`		[EDO]E:303	`4`	`1`	`184`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`10992`	`50.7`	`1.1`	`0.774`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
35	`52`		D	`4`	`2`	`11254`	`x`	D	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`7`	`2`	`11254`	`47.9`	`0.4`	`0.709`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`53`		[PO4]A:302	`4`	`1`	`189`	`cf`	[FMC]A:301	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`409`	`47.5`	`-3.2`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
37	`54`		[PO4]C:301	`4`	`1`	`189`	`cf`	[FMC]C:302	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`407`	`43.5`	`-2.7`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
38	`55`		[PO4]E:301	`4`	`1`	`188`	`cf`	[FMC]E:302	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`405`	`42.1`	`-2.6`	`0.478`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
39	`56`		[EDO]E:303	`4`	`1`	`184`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`10881`	`38.3`	`0.4`	`0.583`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`57`		[EDO]D:303	`3`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`11092`	`36.6`	`0.6`	`0.809`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`58`		[PO4]A:302	`4`	`1`	`189`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11254`	`34.3`	`-0.5`	`0.956`	`2`	`0`	`0`	`0.044`
42	`59`		A	`6`	`3`	`11183`	`◊`	B	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`11092`	`34.2`	`0.3`	`0.728`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`60`		[PO4]E:301	`4`	`1`	`188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11092`	`31.1`	`-0.5`	`0.972`	`2`	`0`	`0`	`0.031`
44	`61`		[EDO]A:307	`2`	`1`	`185`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`11254`	`28.5`	`0.7`	`0.883`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
45	`62`		[PO4]C:301	`4`	`1`	`189`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`10881`	`28.0`	`-0.4`	`0.968`	`2`	`0`	`0`	`0.034`
46	`63`		[EDO]A:306	`2`	`1`	`182`	`f`	D	x-1/2,-y+1/2,-z	`4_455`	`3`	`2`	`11254`	`27.9`	`0.1`	`0.631`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`64`		C	`3`	`1`	`10992`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`1`	`11092`	`10.2`	`-0.0`	`0.620`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`65`		C	`2`	`1`	`10992`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`3`	`2`	`11254`	`9.6`	`-0.1`	`0.578`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`66`		[EDO]A:307	`1`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11092`	`4.1`	`0.1`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`67`		F	`1`	`1`	`10881`	`f`	[EDO]A:303	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`185`	`3.4`	`0.1`	`0.648`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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