PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=476-HM-DI7)

Interfaces in PDB 5yi6 crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 1.85 Å

CRISPR ASSOCIATED PROTEIN CAS6

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`74`	`24`	`12602`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`68`	`22`	`12895`	`640.0`	`-2.6`	`0.369`	`7`	`9`	`0`	`0.083`
	`2`		B	`67`	`21`	`12606`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`66`	`21`	`12828`	`603.2`	`-2.5`	`0.374`	`10`	`9`	`0`	`0.083`
	*Average:*													`621.6`	`-2.5`	`0.372`	`9`	`9`	`0`	`0.083`
2	`3`		C	`59`	`16`	`12895`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`57`	`15`	`12606`	`543.9`	`-5.3`	`0.177`	`6`	`2`	`0`	`0.088`
	`4`		A	`56`	`15`	`12828`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`57`	`15`	`12602`	`541.6`	`-4.7`	`0.218`	`6`	`2`	`0`	`0.088`
	*Average:*													`542.8`	`-5.0`	`0.197`	`6`	`2`	`0`	`0.088`
3	`5`		C	`22`	`9`	`12895`	`x`	C	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`26`	`8`	`12895`	`205.9`	`-2.0`	`0.277`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		A	`30`	`10`	`12828`	`x`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`22`	`9`	`12828`	`196.5`	`-1.8`	`0.311`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`201.2`	`-1.9`	`0.294`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		C	`25`	`5`	`12895`	`◊`	A	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`22`	`6`	`12828`	`192.5`	`-1.5`	`0.284`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	`8`		C	`22`	`6`	`12895`	`◊`	A	-x+1,y,-z	`2_655`	`25`	`5`	`12828`	`188.8`	`-1.5`	`0.284`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`190.7`	`-1.5`	`0.284`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
5	`9`		B	`23`	`8`	`12606`	`◊`	D	x-1/2,y-1/2,z	`3_445`	`19`	`5`	`12602`	`178.5`	`-1.4`	`0.366`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
6	`10`		B	`16`	`8`	`12606`	`◊`	D	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`16`	`8`	`12602`	`140.9`	`2.5`	`0.816`	`4`	`6`	`0`	`0.000`
7	`11`		[GOL]C:301	`6`	`1`	`217`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`22`	`8`	`12895`	`110.6`	`-0.6`	`0.487`	`3`	`0`	`0`	`0.032`
	`12`		[GOL]A:301	`6`	`1`	`218`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`12828`	`107.7`	`-0.5`	`0.481`	`2`	`0`	`0`	`0.032`
	`13`		[GOL]D:301	`6`	`1`	`219`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`20`	`7`	`12602`	`106.7`	`-0.5`	`0.489`	`1`	`0`	`0`	`0.032`
	`14`		[GOL]B:301	`6`	`1`	`219`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`12606`	`100.8`	`-0.2`	`0.492`	`2`	`0`	`0`	`0.032`
	*Average:*													`106.4`	`-0.5`	`0.487`	`2`	`0`	`0`	`0.032`
8	`15`		D	`8`	`2`	`12602`	`◊`	D	-x+2,y,-z+1	`2_756`	`8`	`2`	`12602`	`101.4`	`2.4`	`0.883`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
9	`16`		[PO4]C:308	`5`	`1`	`188`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`12895`	`101.1`	`-6.9`	`0.610`	`1`	`0`	`0`	`0.078`
10	`17`		[PO4]A:308	`5`	`1`	`189`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`12828`	`100.6`	`-6.8`	`0.612`	`1`	`0`	`0`	`0.073`
11	`18`		[PO4]C:307	`5`	`1`	`188`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`14`	`5`	`12895`	`86.9`	`-4.9`	`0.812`	`2`	`0`	`0`	`0.061`
12	`19`		[PO4]A:307	`5`	`1`	`189`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`12828`	`85.3`	`-4.7`	`0.815`	`2`	`0`	`0`	`0.056`
13	`20`		[PO4]D:304	`5`	`1`	`189`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`12602`	`84.3`	`-3.0`	`0.952`	`4`	`0`	`0`	`0.048`
14	`21`		[PO4]D:307	`5`	`1`	`189`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`12602`	`83.6`	`-4.7`	`0.823`	`2`	`0`	`0`	`0.056`
15	`22`		[PO4]D:306	`5`	`1`	`188`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`14`	`7`	`12602`	`83.5`	`-4.9`	`0.752`	`2`	`0`	`0`	`0.058`
16	`23`		[PO4]B:305	`5`	`1`	`190`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`12606`	`81.8`	`-4.5`	`0.780`	`1`	`0`	`0`	`0.053`
17	`24`		[PO4]B:307	`5`	`1`	`189`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`4`	`12606`	`81.6`	`-4.4`	`0.832`	`2`	`0`	`0`	`0.056`
18	`25`		[PO4]B:306	`4`	`1`	`189`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`14`	`8`	`12606`	`80.6`	`-4.3`	`0.745`	`2`	`0`	`0`	`0.055`
19	`26`		[PO4]B:304	`5`	`1`	`189`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`12606`	`80.5`	`-3.3`	`0.946`	`4`	`0`	`0`	`0.054`
20	`27`		C	`9`	`3`	`12895`	`◊`	D	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`11`	`4`	`12602`	`80.4`	`-0.2`	`0.532`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`28`		B	`9`	`3`	`12606`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`8`	`3`	`12828`	`65.0`	`0.1`	`0.564`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`72.7`	`-0.1`	`0.548`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`29`		[PO4]D:305	`5`	`1`	`190`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`3`	`12602`	`80.3`	`-4.7`	`0.744`	`1`	`0`	`0`	`0.052`
22	`30`		[PO4]D:303	`5`	`1`	`189`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`12602`	`79.9`	`-3.0`	`0.932`	`4`	`0`	`0`	`0.048`
23	`31`		[PO4]C:304	`5`	`1`	`189`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`12895`	`79.6`	`-3.3`	`0.884`	`2`	`0`	`0`	`0.044`
24	`32`		[PO4]C:305	`5`	`1`	`189`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`12895`	`77.0`	`-4.3`	`0.769`	`2`	`0`	`0`	`0.055`
25	`33`		[PO4]A:305	`5`	`1`	`189`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`12828`	`76.5`	`-4.2`	`0.778`	`2`	`0`	`0`	`0.051`
26	`34`		[PO4]A:304	`5`	`1`	`188`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`12828`	`76.2`	`-2.8`	`0.894`	`3`	`0`	`0`	`0.041`
27	`35`		[PO4]A:303	`5`	`1`	`188`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`12828`	`76.1`	`-3.1`	`0.901`	`4`	`0`	`0`	`0.049`
28	`36`		[PO4]C:303	`5`	`1`	`187`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`12895`	`75.2`	`-3.0`	`0.902`	`3`	`0`	`0`	`0.046`
29	`37`		[PO4]B:303	`5`	`1`	`189`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`12606`	`74.0`	`-2.8`	`0.931`	`2`	`0`	`0`	`0.039`
30	`38`		[PO4]A:306	`5`	`1`	`188`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`5`	`12828`	`70.5`	`-3.3`	`0.836`	`1`	`0`	`0`	`0.038`
31	`39`		[PO4]A:302	`5`	`1`	`189`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`12828`	`70.3`	`-3.6`	`0.798`	`3`	`0`	`0`	`0.049`
32	`40`		[PO4]D:302	`5`	`1`	`188`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`12602`	`70.0`	`-3.5`	`0.800`	`4`	`0`	`0`	`0.053`
33	`41`		[PO4]B:302	`5`	`1`	`188`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`12606`	`69.6`	`-3.5`	`0.793`	`3`	`0`	`0`	`0.051`
34	`42`		[PO4]C:302	`5`	`1`	`188`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`12895`	`69.2`	`-3.6`	`0.798`	`3`	`0`	`0`	`0.052`
35	`43`		[PO4]C:306	`5`	`1`	`189`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`12895`	`68.3`	`-3.3`	`0.851`	`1`	`0`	`0`	`0.039`
36	`44`		B	`5`	`2`	`12606`	`◊`	[PO4]D:305	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`4`	`1`	`190`	`55.7`	`-2.6`	`0.888`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
37	`45`		[PO4]B:305	`5`	`1`	`190`	`◊`	D	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`5`	`2`	`12602`	`54.8`	`-2.6`	`0.882`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
38	`46`		[PO4]C:305	`4`	`1`	`189`	`◊`	C	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`7`	`2`	`12895`	`47.7`	`-2.8`	`0.649`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
39	`47`		A	`7`	`2`	`12828`	`◊`	[PO4]A:305	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`4`	`1`	`189`	`44.3`	`-2.6`	`0.705`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`48`		[PO4]C:303	`4`	`1`	`187`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12602`	`43.9`	`-1.5`	`0.932`	`2`	`0`	`0`	`0.024`
41	`49`		[PO4]A:303	`4`	`1`	`188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12606`	`43.2`	`-1.4`	`0.932`	`3`	`0`	`0`	`0.028`
42	`50`		[PO4]B:303	`4`	`1`	`189`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`12828`	`40.6`	`-0.5`	`0.945`	`1`	`0`	`0`	`0.010`
43	`51`		B	`3`	`2`	`12606`	`◊`	B	-x+1,y,-z+1	`2_656`	`3`	`2`	`12606`	`40.4`	`0.5`	`0.776`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`52`		[PO4]D:303	`4`	`1`	`189`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`12895`	`40.0`	`-0.7`	`0.945`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
45	`53`		[PO4]C:302	`3`	`1`	`188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`12606`	`37.1`	`-0.7`	`0.909`	`2`	`0`	`0`	`0.017`
46	`54`		[PO4]D:304	`4`	`1`	`189`	`f`	[PO4]D:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`189`	`36.6`	`-3.2`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.032`
47	`55`		A	`3`	`2`	`12828`	`◊`	[PO4]D:302	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`1`	`188`	`36.3`	`-0.7`	`0.912`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
48	`56`		[PO4]B:304	`4`	`1`	`189`	`f`	[PO4]B:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`189`	`36.2`	`-3.2`	`0.973`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
49	`57`		[PO4]A:302	`3`	`1`	`189`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`2`	`12602`	`35.0`	`-0.6`	`0.962`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
50	`58`		[GOL]B:301	`3`	`1`	`219`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`12895`	`34.9`	`-0.2`	`0.454`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`59`		[GOL]A:301	`2`	`1`	`218`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`4`	`2`	`12602`	`19.8`	`0.1`	`0.651`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		A	`3`	`2`	`12828`	`◊`	[GOL]D:301	x-1,y,z-1	`1_454`	`2`	`1`	`219`	`19.1`	`0.2`	`0.674`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`61`		[GOL]C:301	`2`	`1`	`217`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`12606`	`18.3`	`0.2`	`0.695`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`23.0`	`0.1`	`0.619`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`62`		A	`7`	`3`	`12828`	`◊`	[PO4]A:306	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`188`	`34.7`	`-2.3`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`63`		[GOL]A:301	`5`	`1`	`218`	`◊`	[GOL]D:301	x-1,y,z-1	`1_454`	`5`	`1`	`219`	`34.7`	`-0.0`	`0.634`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
	`64`		[GOL]C:301	`5`	`1`	`217`	`◊`	[GOL]B:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`219`	`33.8`	`-0.1`	`0.556`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
	*Average:*													`34.3`	`-0.1`	`0.595`	`2`	`0`	`0`	`0.011`
53	`65`		[PO4]B:302	`3`	`1`	`188`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`12895`	`34.0`	`-0.6`	`0.958`	`2`	`0`	`0`	`0.016`
54	`66`		[PO4]A:302	`4`	`1`	`189`	`f`	[GOL]A:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`218`	`31.7`	`-1.4`	`0.810`	`2`	`0`	`0`	`0.023`
55	`67`		[PO4]B:302	`4`	`1`	`188`	`f`	[GOL]B:301	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`219`	`31.6`	`-1.4`	`0.854`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
56	`68`		[PO4]C:304	`4`	`1`	`189`	`f`	[PO4]C:303	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`187`	`30.9`	`-2.9`	`0.934`	`0`	`0`	`0`	`0.030`
57	`69`		[PO4]D:302	`4`	`1`	`188`	`f`	[GOL]D:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`219`	`30.4`	`-1.2`	`0.818`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
58	`70`		[PO4]A:304	`4`	`1`	`188`	`f`	[PO4]A:303	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`188`	`30.1`	`-2.8`	`0.934`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
59	`71`		[PO4]C:302	`4`	`1`	`188`	`f`	[GOL]C:301	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`217`	`30.0`	`-1.3`	`0.821`	`1`	`0`	`0`	`0.019`
60	`72`		[PO4]C:306	`3`	`1`	`189`	`f`	[PO4]C:305	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`189`	`29.3`	`-2.7`	`0.982`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
61	`73`		[PO4]C:306	`3`	`1`	`189`	`◊`	C	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`5`	`4`	`12895`	`29.2`	`-2.0`	`0.565`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
62	`74`		[PO4]A:306	`4`	`1`	`188`	`f`	[PO4]A:305	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`189`	`29.0`	`-2.7`	`0.982`	`0`	`0`	`0`	`0.027`
63	`75`		[PO4]B:304	`3`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]A:304	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`188`	`25.8`	`-2.4`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.024`
64	`76`		[PO4]B:303	`4`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]A:304	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`188`	`25.8`	`-2.4`	`0.934`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
65	`77`		[PO4]D:304	`2`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]C:304	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`189`	`24.0`	`-2.5`	`0.976`	`0`	`0`	`0`	`0.025`
66	`78`		[PO4]D:304	`3`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]C:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`187`	`21.1`	`-1.9`	`0.995`	`0`	`0`	`0`	`0.019`
67	`79`		[PO4]B:304	`3`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]A:303	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`188`	`21.0`	`-2.0`	`0.995`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
68	`80`		[PO4]D:303	`4`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]C:304	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`189`	`20.7`	`-2.0`	`0.995`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
69	`81`		[PO4]A:308	`3`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]A:305	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`3`	`1`	`189`	`20.2`	`-1.9`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
70	`82`		[PO4]A:308	`1`	`1`	`189`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`4_545`	`5`	`2`	`12828`	`18.5`	`-1.3`	`0.601`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
71	`83`		[PO4]A:302	`3`	`1`	`189`	`◊`	[GOL]D:301	x-1,y,z-1	`1_454`	`2`	`1`	`219`	`17.8`	`-0.6`	`0.863`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
72	`84`		[PO4]C:305	`3`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]C:308	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`4`	`1`	`188`	`17.1`	`-1.6`	`0.995`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
73	`85`		[PO4]A:304	`3`	`1`	`188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`12606`	`16.5`	`-0.4`	`0.964`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
74	`86`		[PO4]C:304	`3`	`1`	`189`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`12602`	`16.5`	`-0.4`	`0.966`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
75	`87`		C	`5`	`2`	`12895`	`◊`	[PO4]C:308	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`1`	`1`	`188`	`16.0`	`-1.0`	`0.628`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
76	`88`		[PO4]C:302	`4`	`1`	`188`	`◊`	[GOL]B:301	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`219`	`15.8`	`-0.5`	`0.865`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
77	`89`		[PO4]B:302	`3`	`1`	`188`	`◊`	[GOL]C:301	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`217`	`14.8`	`-0.5`	`0.863`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
78	`90`		[GOL]A:301	`2`	`1`	`218`	`◊`	[PO4]D:302	x-1,y,z-1	`1_454`	`3`	`1`	`188`	`14.1`	`-0.5`	`0.863`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
79	`91`		[PO4]B:305	`3`	`1`	`190`	`◊`	[PO4]D:305	-x+3/2,y-1/2,-z+1	`4_646`	`3`	`1`	`190`	`13.4`	`-1.2`	`0.992`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
80	`92`		[PO4]A:302	`1`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]D:302	x-1,y,z-1	`1_454`	`1`	`1`	`188`	`8.9`	`-0.9`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
81	`93`		[PO4]C:302	`1`	`1`	`188`	`◊`	[PO4]B:302	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`188`	`8.5`	`-0.9`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.010`
82	`94`		[PO4]B:303	`2`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]A:303	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`188`	`2.4`	`-0.2`	`0.876`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
83	`95`		[PO4]D:303	`1`	`1`	`189`	`◊`	[PO4]C:303	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`187`	`2.2`	`-0.2`	`0.800`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
84	`96`		[PO4]B:304	`1`	`1`	`189`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12828`	`0.1`	`-0.0`	`0.722`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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