PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=795-HM-BOB)

Interfaces in PDB 5xii crystal.
Space symmetry group: P 1. Resolution: 2.17 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF TOXOPLASMA GONDII PROLYL-TRNA SYNTHETASE (TGPRS) IN COMPLEX WITH INHIBITOR 6

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`255`	`66`	`21860`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`272`	`70`	`21456`	`2538.8`	`-24.5`	`0.108`	`37`	`13`	`0`	`0.401`
	`2`		C	`254`	`66`	`21712`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`253`	`67`	`22075`	`2450.7`	`-26.5`	`0.092`	`38`	`12`	`0`	`0.401`
	*Average:*													`2494.8`	`-25.5`	`0.100`	`38`	`13`	`0`	`0.401`
2	`3`		A	`39`	`11`	`22075`	`◊`	C	x-1,y,z	`1_455`	`53`	`13`	`21712`	`386.1`	`-6.9`	`0.136`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		B	`19`	`6`	`21456`	`◊`	D	x-1,y,z	`1_455`	`24`	`7`	`21860`	`195.6`	`-2.7`	`0.278`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`290.9`	`-4.8`	`0.207`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
3	`5`		[ANP]B:1001	`30`	`1`	`588`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`58`	`20`	`21456`	`370.2`	`1.4`	`0.769`	`9`	`0`	`0`	`0.054`
	`6`		[ANP]C:1001	`29`	`1`	`590`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`62`	`22`	`21712`	`362.0`	`1.3`	`0.774`	`9`	`0`	`0`	`0.054`
	`7`		[ANP]D:1001	`30`	`1`	`576`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`58`	`21`	`21860`	`357.7`	`2.0`	`0.776`	`8`	`0`	`0`	`0.054`
	`8`		[ANP]A:1001	`31`	`1`	`589`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`59`	`22`	`22075`	`355.8`	`1.0`	`0.767`	`10`	`0`	`0`	`0.054`
	*Average:*													`361.4`	`1.4`	`0.772`	`9`	`0`	`0`	`0.054`
4	`9`		[86X]B:1004	`23`	`1`	`524`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`50`	`18`	`21456`	`346.4`	`-10.7`	`0.325`	`2`	`0`	`0`	`0.241`
	`10`		[86X]D:1004	`23`	`1`	`525`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`51`	`18`	`21860`	`344.6`	`-11.6`	`0.226`	`1`	`0`	`0`	`0.241`
	`11`		[86X]A:1004	`23`	`1`	`518`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`54`	`18`	`22075`	`340.9`	`-12.2`	`0.217`	`3`	`0`	`0`	`0.241`
	`12`		[86X]C:1004	`23`	`1`	`520`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`53`	`18`	`21712`	`340.0`	`-12.6`	`0.233`	`2`	`0`	`0`	`0.241`
	*Average:*													`343.0`	`-11.8`	`0.250`	`2`	`0`	`0`	`0.241`
5	`13`		A	`36`	`11`	`22075`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`45`	`13`	`21860`	`319.8`	`-2.9`	`0.399`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
6	`14`		D	`34`	`11`	`21860`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`47`	`15`	`22075`	`308.7`	`-2.3`	`0.473`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
7	`15`		B	`36`	`12`	`21456`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`32`	`10`	`22075`	`287.1`	`-0.8`	`0.598`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
8	`16`		B	`33`	`13`	`21456`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`33`	`9`	`21456`	`279.8`	`-1.0`	`0.445`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`17`		A	`34`	`12`	`22075`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`29`	`9`	`22075`	`277.6`	`-0.4`	`0.517`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`278.7`	`-0.7`	`0.481`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
9	`18`		C	`30`	`15`	`21712`	`◊`	D	x,y,z-1	`1_554`	`28`	`11`	`21860`	`236.3`	`0.7`	`0.695`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
10	`19`		D	`12`	`5`	`21860`	`◊`	C	x,y-1,z+1	`1_546`	`19`	`8`	`21712`	`129.4`	`0.3`	`0.679`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
11	`20`		[EDO]B:1005	`4`	`1`	`185`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`20`	`4`	`21456`	`111.5`	`3.7`	`0.542`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`21`		[EDO]A:1007	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`19`	`4`	`22075`	`109.8`	`3.6`	`0.509`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`22`		[EDO]B:1007	`4`	`1`	`184`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`21456`	`102.1`	`3.3`	`0.502`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
14	`23`		[EDO]A:1005	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`22075`	`101.8`	`3.3`	`0.518`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`24`		[EDO]B:1006	`4`	`1`	`185`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`21456`	`97.0`	`1.7`	`0.217`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`25`		[EDO]A:1006	`4`	`1`	`183`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`6`	`22075`	`94.6`	`3.5`	`0.508`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`26`		[EDO]A:1009	`4`	`1`	`185`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`22075`	`94.5`	`1.5`	`0.189`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
18	`27`		[CL]D:1009	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`21860`	`84.3`	`-11.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.142`
	`28`		[CL]B:1008	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`8`	`21456`	`80.5`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.142`
	*Average:*													`82.4`	`-10.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.142`
19	`29`		[EDO]A:1008	`4`	`1`	`184`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`22075`	`83.5`	`2.4`	`0.299`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`30`		[EDO]D:1005	`4`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`21860`	`81.3`	`2.1`	`0.292`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`31`		[EDO]D:1006	`4`	`1`	`186`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`21860`	`80.8`	`2.2`	`0.238`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
22	`32`		[86X]C:1004	`8`	`1`	`520`	`f`	[ANP]C:1001	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`590`	`78.5`	`-2.5`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
	`33`		[86X]A:1004	`7`	`1`	`518`	`f`	[ANP]A:1001	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`589`	`77.4`	`-2.2`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
	`34`		[86X]D:1004	`8`	`1`	`525`	`f`	[ANP]D:1001	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`576`	`74.9`	`-2.8`	`0.355`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
	`35`		[86X]B:1004	`10`	`1`	`524`	`f`	[ANP]B:1001	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`588`	`71.6`	`-3.2`	`0.333`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
	*Average:*													`75.6`	`-2.7`	`0.340`	`0`	`0`	`0`	`0.042`
23	`36`		[CL]D:1010	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`15`	`3`	`21860`	`74.4`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
	`37`		[CL]C:1005	`1`	`1`	`125`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`3`	`21712`	`72.7`	`-8.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
	*Average:*													`73.5`	`-9.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.079`
24	`38`		A	`13`	`5`	`22075`	`◊`	D	x-1,y,z-1	`1_454`	`10`	`5`	`21860`	`72.8`	`-0.1`	`0.609`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`39`		[CL]D:1007	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`21860`	`72.2`	`-10.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.066`
26	`40`		[CL]D:1008	`1`	`1`	`125`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`21860`	`65.0`	`-8.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.057`
27	`41`		[EDO]A:1010	`3`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`21712`	`61.0`	`0.8`	`0.209`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`42`		[EDO]A:1010	`4`	`1`	`184`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`22075`	`60.3`	`2.1`	`0.921`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
29	`43`		[EDO]D:1006	`3`	`1`	`186`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`21456`	`52.6`	`0.5`	`0.438`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`44`		B	`6`	`3`	`21456`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`8`	`4`	`21712`	`52.4`	`-0.5`	`0.379`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`45`		[EDO]A:1006	`3`	`1`	`183`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`21860`	`49.1`	`0.7`	`0.722`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`46`		[CL]B:1009	`1`	`1`	`125`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`21456`	`48.8`	`-6.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.043`
33	`47`		[MG]B:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`6`	`21456`	`46.5`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
	`48`		[MG]D:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`21860`	`43.4`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
	`49`		[MG]C:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`21712`	`42.6`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
	`50`		[MG]A:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`22075`	`41.3`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
	*Average:*													`43.5`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
34	`51`		A	`5`	`1`	`22075`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`2`	`21712`	`42.6`	`-0.4`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`52`		[MG]A:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]A:1001	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`589`	`34.8`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
	`53`		[MG]C:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]C:1001	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`590`	`34.2`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
	`54`		[MG]D:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]D:1001	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`576`	`33.7`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
	`55`		[MG]B:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]B:1001	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`588`	`32.5`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
	*Average:*													`33.8`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.085`
36	`56`		[MG]A:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]A:1001	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`589`	`32.4`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	`57`		[MG]B:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]B:1001	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`588`	`31.5`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	`58`		[MG]D:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]D:1001	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`576`	`30.5`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	`59`		[MG]C:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	[ANP]C:1001	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`590`	`30.5`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
	*Average:*													`31.2`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.058`
37	`60`		[MG]B:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`21456`	`28.4`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
	`61`		[MG]D:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`21860`	`22.9`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
	`62`		[MG]A:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`22075`	`21.9`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
	`63`		[MG]C:1002	`1`	`1`	`98`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`21712`	`21.7`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
	*Average:*													`23.7`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.034`
38	`64`		[CL]B:1009	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`22075`	`19.1`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`65`		[EDO]A:1007	`2`	`1`	`184`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`21712`	`18.8`	`-0.1`	`0.350`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`66`		[86X]D:1004	`3`	`1`	`525`	`f`	[MG]D:1003	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.8`	`-0.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`67`		[86X]B:1004	`3`	`1`	`524`	`f`	[MG]B:1003	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.4`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`68`		[86X]C:1004	`2`	`1`	`520`	`f`	[MG]C:1003	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.3`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	`69`		[86X]A:1004	`2`	`1`	`518`	`f`	[MG]A:1003	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`11.8`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
	*Average:*													`12.3`	`-0.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.014`
41	`70`		[EDO]B:1005	`1`	`1`	`185`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`21860`	`12.6`	`-0.0`	`0.425`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`71`		B	`1`	`1`	`21456`	`◊`	C	x,y-1,z+1	`1_546`	`1`	`1`	`21712`	`11.3`	`-0.4`	`0.193`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`72`		A	`1`	`1`	`22075`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`21456`	`9.2`	`-0.0`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`73`		[EDO]A:1005	`1`	`1`	`184`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`21860`	`9.1`	`0.5`	`0.895`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`74`		B	`1`	`1`	`21456`	`◊`	A	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`22075`	`8.3`	`-0.3`	`0.243`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`75`		[CL]D:1008	`1`	`1`	`125`	`f`	[CL]D:1007	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`125`	`8.1`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.011`
47	`76`		[CL]D:1010	`1`	`1`	`125`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`21456`	`3.5`	`-0.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	`77`		[CL]C:1005	`1`	`1`	`125`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`22075`	`1.5`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`2.5`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
48	`78`		[MG]B:1002	`1`	`1`	`98`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`22075`	`2.1`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`79`		[MG]A:1003	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:1002	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`0.1`	`-0.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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