PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=147-HK-16C)

Interfaces in PDB 5kh3 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 1.60 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF FRAGMENT (3-(5-CHLORO-1,3-BENZOTHIAZOL-2-YL) PROPANOIC ACID) BOUND IN THE UBIQUITIN BINDING POCKET OF THE HDAC6 ZINC-FINGER DOMAIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		A	`41`	`11`	`5546`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`39`	`11`	`5546`	`344.1`	`-2.5`	`0.535`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
2	`2`		A	`31`	`9`	`5546`	`x`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`33`	`13`	`5546`	`283.4`	`-7.3`	`0.085`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
3	`3`		A	`38`	`11`	`5546`	`x`	A	-x+1/2,-y,z-1/2	`2_554`	`25`	`9`	`5546`	`277.3`	`-3.2`	`0.425`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`4`		[6U6]A:1317	`15`	`1`	`393`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`37`	`10`	`5546`	`227.1`	`2.1`	`0.748`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
5	`5`		A	`8`	`2`	`5546`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`13`	`6`	`5546`	`97.4`	`-1.4`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`6`		[UNX]A:1304	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`14`	`9`	`5546`	`78.5`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
7	`7`		[UNX]A:1315	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`6`	`5546`	`74.2`	`-5.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.009`
8	`8`		[UNX]A:1313	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`5546`	`69.1`	`-4.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
9	`9`		[UNX]A:1305	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`5546`	`58.0`	`-3.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
10	`10`		A	`10`	`3`	`5546`	`f`	[6U6]A:1317	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`5`	`1`	`393`	`56.4`	`-3.3`	`0.440`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
11	`11`		[UNX]A:1308	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`5546`	`54.8`	`-3.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
12	`12`		[UNX]A:1307	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`5546`	`52.4`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.007`
13	`13`		[UNX]A:1311	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`5546`	`51.4`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
14	`14`		[UNX]A:1316	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`5546`	`47.7`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
15	`15`		[UNX]A:1314	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`7`	`5`	`5546`	`47.3`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
16	`16`		[UNX]A:1314	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`5546`	`42.5`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`17`		[UNX]A:1306	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1/2	`3_645`	`5`	`2`	`5546`	`38.3`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`18`		[UNX]A:1309	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`5546`	`38.2`	`-2.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	`19`		[UNX]A:1310	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`5546`	`30.9`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
	*Average:*													`34.6`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.006`
19	`20`		[UNX]A:1306	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`5546`	`37.5`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
20	`21`		[UNX]A:1312	`1`	`1`	`129`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`5546`	`36.7`	`-2.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
21	`22`		[UNX]A:1308	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`6`	`2`	`5546`	`34.8`	`-2.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		A	`3`	`2`	`5546`	`◊`	[UNX]A:1312	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`31.0`	`-2.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[UNX]A:1310	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:1309	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`29.6`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
24	`25`		A	`2`	`1`	`5546`	`◊`	[UNX]A:1311	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`129`	`26.2`	`-1.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		[UNX]A:1305	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`4`	`2`	`5546`	`25.2`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`27`		[UNX]A:1312	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:1310	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`24.7`	`-2.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
27	`28`		[UNX]A:1316	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:1307	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`24.2`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.004`
28	`29`		A	`6`	`4`	`5546`	`◊`	[UNX]A:1310	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`21.9`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`30`		A	`4`	`3`	`5546`	`◊`	[UNX]A:1309	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`8.0`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`15.0`	`-1.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`31`		[UNX]A:1316	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1310	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`19.3`	`-1.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`32`		[UNX]A:1312	`1`	`1`	`129`	`f`	[UNX]A:1309	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`16.7`	`-1.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
31	`33`		[UNX]A:1316	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1309	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`15.9`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`34`		[UNX]A:1314	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1305	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`129`	`14.5`	`-1.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`35`		[UNX]A:1316	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`5546`	`9.9`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`36`		[UNX]A:1316	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1312	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`7.0`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`37`		[UNX]A:1305	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`5546`	`6.9`	`-0.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[UNX]A:1314	`1`	`1`	`129`	`f`	[ZN]A:1301	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`1`	`1`	`98`	`6.9`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
37	`39`		[UNX]A:1307	`1`	`1`	`129`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`2`	`1`	`5546`	`6.1`	`-0.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`40`		[UNX]A:1307	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1310	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`5.9`	`-0.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`41`		[ZN]A:1303	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x-1/2,-y-1/2,-z	`4_445`	`2`	`1`	`5546`	`3.0`	`-1.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
40	`42`		[UNX]A:1307	`1`	`1`	`129`	`◊`	[UNX]A:1309	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`1`	`1`	`129`	`1.7`	`-0.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

Protein Data Bank
in Europe