PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=221-HM-676)

Interfaces in PDB 5i4d crystal.
Space symmetry group: P 21 21 2. Resolution: 1.75 Å

1.75 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF SUPERANTIGEN-LIKE PROTEIN, EXOTOXIN FROM STAPHYLOCOCCUS AUREUS, IN COMPLEX WITH SIALYL-LEWISX.

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		B	`42`	`8`	`10783`	`◊`	A	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`42`	`10`	`10616`	`331.3`	`-3.5`	`0.279`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`2`		A	`41`	`8`	`10616`	`◊`	B	x-1/2,-y+5/2,-z	`4_475`	`42`	`10`	`10783`	`321.9`	`-4.0`	`0.236`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`326.6`	`-3.8`	`0.258`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
2	`3`		B	`32`	`12`	`10783`	`◊`	A	x-1/2,-y+5/2,-z	`4_475`	`33`	`10`	`10616`	`282.1`	`-2.3`	`0.310`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
3	`4`		B	`23`	`9`	`10783`	`x`	B	x,y,z-1	`1_554`	`33`	`12`	`10783`	`225.5`	`1.7`	`0.721`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`5`		A	`27`	`11`	`10616`	`x`	A	x,y,z-1	`1_554`	`22`	`9`	`10616`	`190.6`	`0.9`	`0.679`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`208.1`	`1.3`	`0.700`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
4	`6`		[SIA]B:405	`15`	`1`	`436`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`10`	`10783`	`187.5`	`-1.3`	`0.385`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	`7`		[SIA]A:404	`15`	`1`	`437`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`24`	`8`	`10616`	`180.4`	`-1.3`	`0.363`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`183.9`	`-1.3`	`0.374`	`7`	`0`	`0`	`0.000`
5	`8`		[NAG]B:402	`15`	`1`	`369`	`f`	[NDG]B:401	x,y,z	`1_555`	`15`	`1`	`369`	`136.7`	`5.3`	`0.102`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
6	`9`		[PG4]B:406	`10`	`1`	`410`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`10783`	`134.8`	`1.5`	`0.183`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		[PG4]A:406	`9`	`1`	`388`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`10616`	`126.8`	`1.8`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`130.8`	`1.7`	`0.208`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		A	`11`	`3`	`10616`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`19`	`8`	`10783`	`129.7`	`0.2`	`0.626`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
8	`12`		A	`18`	`4`	`10616`	`◊`	[PG4]B:406	x-1/2,-y+5/2,-z	`4_475`	`9`	`1`	`410`	`126.1`	`3.7`	`0.307`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		B	`17`	`4`	`10783`	`◊`	[PG4]A:406	-x+1/2,y-1/2,-z	`3_545`	`10`	`1`	`388`	`121.3`	`2.7`	`0.280`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		[PGE]A:405	`9`	`1`	`322`	`f`	B	x-1/2,-y+5/2,-z	`4_475`	`11`	`5`	`10783`	`110.5`	`1.2`	`0.114`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`15`		A	`16`	`6`	`10616`	`◊`	[SIA]A:404	x,y,z-1	`1_554`	`9`	`1`	`437`	`105.7`	`1.0`	`0.547`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`16`		[SIA]B:405	`5`	`1`	`436`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`15`	`6`	`10783`	`81.8`	`-0.6`	`0.419`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`93.7`	`0.2`	`0.483`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		[NDG]A:401	`10`	`1`	`370`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`12`	`5`	`10616`	`92.5`	`1.0`	`0.144`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
13	`18`		[FUC]A:402	`7`	`1`	`281`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`6`	`10783`	`89.6`	`1.2`	`0.312`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		[PGE]A:405	`8`	`1`	`322`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`10616`	`87.4`	`2.2`	`0.203`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[GAL]A:403	`9`	`1`	`295`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`10616`	`84.4`	`1.4`	`0.340`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	`21`		[GAL]B:404	`9`	`1`	`291`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`18`	`5`	`10783`	`82.6`	`1.6`	`0.357`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`83.5`	`1.5`	`0.349`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
16	`22`		B	`5`	`1`	`10783`	`◊`	A	x-1/2,-y+5/2,-z+1	`4_476`	`14`	`5`	`10616`	`76.5`	`-1.7`	`0.063`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`23`		[NDG]B:401	`9`	`1`	`369`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`10783`	`72.2`	`1.0`	`0.233`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`24`		[NAG]B:402	`9`	`1`	`369`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`10783`	`71.0`	`0.2`	`0.171`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`25`		[FUC]A:402	`8`	`1`	`281`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`10616`	`66.4`	`2.3`	`0.378`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
20	`26`		[FUC]A:402	`7`	`1`	`281`	`cf`	[NDG]A:401	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`370`	`63.7`	`2.2`	`0.094`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`27`		[NDG]A:401	`7`	`1`	`370`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`10783`	`60.5`	`1.4`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`28`		[FUC]B:403	`7`	`1`	`280`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`10783`	`60.4`	`2.4`	`0.379`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
23	`29`		[FUC]B:403	`7`	`1`	`280`	`cf`	[NDG]B:401	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`369`	`58.9`	`2.2`	`0.143`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`30`		[NAG]B:402	`9`	`1`	`369`	`cf`	[FUC]B:403	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`280`	`58.2`	`2.1`	`0.110`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`31`		[SIA]A:404	`9`	`1`	`437`	`cf`	[GAL]A:403	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`295`	`54.6`	`2.0`	`0.333`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`32`		[SIA]B:405	`9`	`1`	`436`	`cf`	[GAL]B:404	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`291`	`53.9`	`1.8`	`0.309`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`33`		[GAL]A:403	`6`	`1`	`295`	`cf`	[NDG]A:401	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`370`	`52.4`	`0.9`	`0.073`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`34`		[NAG]B:402	`5`	`1`	`369`	`cf`	[GAL]B:404	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`291`	`47.2`	`1.0`	`0.122`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`35`		[GAL]B:404	`6`	`1`	`291`	`f`	[FUC]B:403	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`280`	`46.7`	`2.0`	`0.143`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`36`		[GAL]A:403	`6`	`1`	`295`	`f`	[FUC]A:402	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`281`	`45.4`	`1.9`	`0.148`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`37`		[GAL]B:404	`6`	`1`	`291`	`cf`	[NDG]B:401	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`369`	`45.2`	`0.9`	`0.068`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`38`		[GAL]A:403	`5`	`1`	`295`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`5`	`3`	`10783`	`44.6`	`0.9`	`0.308`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
33	`39`		[NDG]B:401	`3`	`1`	`369`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`5`	`2`	`10783`	`38.5`	`0.5`	`0.445`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`40`		[FUC]B:403	`5`	`1`	`280`	`◊`	A	x-1/2,-y+5/2,-z	`4_475`	`4`	`2`	`10616`	`37.3`	`0.8`	`0.338`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		[NAG]B:402	`3`	`1`	`369`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`2`	`10783`	`31.1`	`0.5`	`0.414`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`42`		[SIA]A:404	`4`	`1`	`437`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`10783`	`28.8`	`1.8`	`0.758`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`43`		[SIA]A:404	`6`	`1`	`437`	`f`	[NDG]A:401	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`370`	`25.5`	`1.1`	`0.281`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`44`		[NDG]B:401	`4`	`1`	`369`	`◊`	A	x-1/2,-y+5/2,-z	`4_475`	`3`	`1`	`10616`	`24.9`	`1.0`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`45`		A	`2`	`1`	`10616`	`◊`	[GAL]A:403	x,y,z-1	`1_554`	`3`	`1`	`295`	`23.8`	`0.5`	`0.489`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`46`		[GAL]B:404	`2`	`1`	`291`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`2`	`1`	`10783`	`13.7`	`-0.1`	`0.274`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`18.8`	`0.2`	`0.382`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`47`		B	`6`	`4`	`10783`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`5`	`10616`	`23.7`	`0.4`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`48`		A	`2`	`2`	`10616`	`◊`	[NDG]A:401	x,y,z-1	`1_554`	`4`	`1`	`370`	`23.0`	`0.8`	`0.348`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`49`		[NAG]B:402	`5`	`1`	`369`	`◊`	A	x-1/2,-y+5/2,-z	`4_475`	`3`	`1`	`10616`	`21.1`	`0.8`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`50`		[NAG]B:402	`3`	`1`	`369`	`f`	[SIA]B:405	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`436`	`9.3`	`0.4`	`0.332`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`51`		[SIA]B:405	`3`	`1`	`436`	`f`	[NDG]B:401	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`369`	`7.8`	`0.3`	`0.222`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`52`		A	`6`	`3`	`10616`	`◊`	A	-x+1,-y+3,z	`2_685`	`6`	`3`	`10616`	`7.0`	`-0.0`	`0.595`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

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