PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=477-6O-CL5)

Interfaces in PDB 5cp6 crystal.
Space symmetry group: P 21 21 21. Resolution: 2.60 Å

NUCLEOSOME CORE PARTICLE WITH ADDUCTS FROM THE ANTICANCER COMPOUND, [(ETA6-5,8,9,10-TETRAHYDROANTHRACENE)RU(ETHYLENEDIAMINE)CL][PF6]

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		J	`683`	`145`	`31909`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`671`	`145`	`31924`	`6500.3`	`-66.6`	`0.983`	`360`	`0`	`0`	`0.977`
2	`2`		F	`237`	`55`	`7682`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`263`	`59`	`8577`	`2512.0`	`-42.5`	`0.040`	`23`	`3`	`0`	`1.000`
	`3`		B	`227`	`52`	`6906`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`255`	`59`	`8513`	`2438.9`	`-38.3`	`0.084`	`21`	`4`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`2475.5`	`-40.4`	`0.062`	`22`	`4`	`0`	`1.000`
3	`4`		H	`251`	`62`	`8269`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`244`	`58`	`8835`	`2480.5`	`-46.6`	`0.017`	`17`	`8`	`0`	`0.721`
	`5`		D	`244`	`60`	`8148`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`236`	`58`	`8782`	`2431.9`	`-45.9`	`0.017`	`20`	`5`	`0`	`0.721`
	*Average:*													`2456.2`	`-46.2`	`0.017`	`19`	`7`	`0`	`0.721`
4	`6`		J	`107`	`21`	`31909`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`80`	`23`	`8513`	`811.2`	`-6.2`	`0.799`	`13`	`0`	`0`	`0.277`
	`7`		I	`99`	`21`	`31924`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`80`	`24`	`8577`	`762.7`	`-5.0`	`0.815`	`13`	`0`	`0`	`0.277`
	*Average:*													`787.0`	`-5.6`	`0.807`	`13`	`0`	`0`	`0.277`
5	`8`		I	`92`	`16`	`31924`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`80`	`24`	`8513`	`729.2`	`-10.9`	`0.621`	`14`	`0`	`0`	`0.819`
	`9`		J	`86`	`16`	`31909`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`75`	`22`	`8577`	`697.2`	`-12.2`	`0.547`	`13`	`0`	`0`	`0.819`
	*Average:*													`713.2`	`-11.6`	`0.584`	`14`	`0`	`0`	`0.819`
6	`10`		C	`60`	`16`	`8782`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`62`	`20`	`8577`	`646.4`	`-7.9`	`0.308`	`8`	`0`	`0`	`0.257`
	`11`		G	`58`	`16`	`8835`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`61`	`20`	`8513`	`642.7`	`-7.6`	`0.295`	`8`	`0`	`0`	`0.257`
	*Average:*													`644.6`	`-7.7`	`0.301`	`8`	`0`	`0`	`0.257`
7	`12`		E	`57`	`15`	`8577`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`59`	`15`	`8513`	`624.6`	`-7.8`	`0.373`	`3`	`7`	`0`	`0.073`
8	`13`		D	`54`	`13`	`8148`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`56`	`12`	`6906`	`511.6`	`-0.7`	`0.764`	`6`	`4`	`0`	`0.074`
	`14`		H	`49`	`13`	`8269`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`51`	`12`	`7682`	`474.7`	`-1.3`	`0.679`	`5`	`3`	`0`	`0.074`
	*Average:*													`493.2`	`-1.0`	`0.722`	`6`	`4`	`0`	`0.074`
9	`15`		I	`62`	`13`	`31924`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`46`	`16`	`8835`	`460.4`	`-2.8`	`0.693`	`11`	`0`	`0`	`0.395`
	`16`		J	`61`	`13`	`31909`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`44`	`17`	`8782`	`443.8`	`-5.4`	`0.648`	`10`	`0`	`0`	`0.395`
	*Average:*													`452.1`	`-4.1`	`0.670`	`11`	`0`	`0`	`0.395`
10	`17`		J	`61`	`14`	`31909`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`50`	`14`	`8269`	`442.3`	`-9.9`	`0.461`	`11`	`0`	`0`	`0.479`
	`18`		I	`44`	`11`	`31924`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`43`	`14`	`8148`	`398.9`	`-7.9`	`0.443`	`9`	`0`	`0`	`0.479`
	*Average:*													`420.6`	`-8.9`	`0.452`	`10`	`0`	`0`	`0.479`
11	`19`		J	`51`	`10`	`31909`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`48`	`18`	`6906`	`418.4`	`-9.6`	`0.411`	`8`	`0`	`0`	`0.941`
	`20`		I	`41`	`8`	`31924`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`42`	`14`	`7682`	`351.2`	`-7.4`	`0.419`	`7`	`0`	`0`	`0.941`
	*Average:*													`384.8`	`-8.5`	`0.415`	`8`	`0`	`0`	`0.941`
12	`21`		J	`54`	`11`	`31909`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`42`	`13`	`8835`	`388.9`	`-4.1`	`0.672`	`7`	`0`	`0`	`0.167`
	`22`		I	`52`	`12`	`31924`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`48`	`12`	`8782`	`388.9`	`-5.1`	`0.622`	`6`	`0`	`0`	`0.167`
	*Average:*													`388.9`	`-4.6`	`0.647`	`7`	`0`	`0`	`0.167`
13	`23`		G	`44`	`14`	`8835`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`43`	`11`	`6906`	`383.2`	`-4.1`	`0.371`	`5`	`0`	`0`	`0.182`
	`24`		C	`44`	`15`	`8782`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`46`	`12`	`7682`	`375.6`	`-4.5`	`0.354`	`5`	`0`	`0`	`0.182`
	*Average:*													`379.4`	`-4.3`	`0.362`	`5`	`0`	`0`	`0.182`
14	`25`		J	`40`	`9`	`31909`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`34`	`12`	`8148`	`325.9`	`-4.5`	`0.588`	`5`	`0`	`0`	`0.060`
	`26`		I	`39`	`6`	`31924`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`33`	`11`	`8269`	`313.8`	`-3.1`	`0.663`	`5`	`0`	`0`	`0.060`
	*Average:*													`319.9`	`-3.8`	`0.625`	`5`	`0`	`0`	`0.060`
15	`27`		J	`47`	`13`	`31909`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`35`	`12`	`7682`	`305.5`	`-3.3`	`0.655`	`4`	`0`	`0`	`0.138`
	`28`		I	`37`	`10`	`31924`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`25`	`10`	`6906`	`251.1`	`-1.3`	`0.727`	`5`	`0`	`0`	`0.138`
	*Average:*													`278.3`	`-2.3`	`0.691`	`5`	`0`	`0`	`0.138`
16	`29`		F	`32`	`8`	`7682`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`33`	`10`	`8148`	`295.4`	`0.4`	`0.737`	`3`	`4`	`0`	`0.012`
17	`30`		H	`35`	`12`	`8269`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`8`	`6906`	`273.8`	`-0.4`	`0.710`	`5`	`1`	`0`	`0.116`
	`31`		D	`32`	`10`	`8148`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`28`	`7`	`7682`	`250.8`	`-0.9`	`0.652`	`5`	`2`	`0`	`0.116`
	*Average:*													`262.3`	`-0.6`	`0.681`	`5`	`2`	`0`	`0.116`
18	`32`		F	`25`	`6`	`7682`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`32`	`9`	`8782`	`246.8`	`-1.8`	`0.514`	`2`	`3`	`0`	`0.006`
19	`33`		[RUH]J:101	`15`	`1`	`438`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`27`	`3`	`31909`	`183.6`	`-0.8`	`0.568`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
20	`34`		[RUH]I:101	`15`	`1`	`438`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`24`	`3`	`31924`	`169.6`	`-2.0`	`0.464`	`1`	`0`	`0`	`0.116`
21	`35`		G	`20`	`6`	`8835`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`19`	`4`	`8782`	`153.9`	`0.9`	`0.753`	`3`	`0`	`0`	`0.002`
22	`36`		J	`14`	`3`	`31909`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`16`	`4`	`8148`	`115.0`	`-0.1`	`0.699`	`1`	`0`	`0`	`0.001`
23	`37`		E	`15`	`5`	`8577`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`9`	`3`	`8782`	`108.5`	`1.6`	`0.777`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
24	`38`		J	`15`	`3`	`31909`	`◊`	A	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`10`	`3`	`8513`	`106.9`	`-0.7`	`0.625`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
25	`39`		J	`13`	`1`	`31909`	`◊`	I	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`12`	`1`	`31924`	`86.8`	`2.9`	`0.858`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`40`		[SO4]H:201	`5`	`1`	`186`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`10`	`5`	`8269`	`86.7`	`-13.5`	`0.785`	`4`	`0`	`0`	`0.494`
27	`41`		I	`12`	`2`	`31924`	`◊`	J	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`10`	`3`	`31909`	`79.5`	`-1.1`	`0.573`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`42`		I	`9`	`3`	`31924`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`11`	`5`	`8148`	`79.5`	`-1.7`	`0.457`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
29	`43`		[RUH]J:101	`8`	`1`	`438`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`12`	`4`	`31924`	`76.8`	`-0.4`	`0.540`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
30	`44`		[RUH]J:102	`4`	`1`	`227`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`31909`	`68.5`	`-0.7`	`0.820`	`0`	`0`	`0`	`0.003`
31	`45`		H	`10`	`4`	`8269`	`◊`	I	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`11`	`3`	`31924`	`68.2`	`-1.8`	`0.467`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`46`		J	`9`	`1`	`31909`	`x`	J	x-1/2,-y-1/2,-z+1	`4_446`	`11`	`1`	`31909`	`67.7`	`1.3`	`0.749`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`47`		[SO4]D:201	`4`	`1`	`187`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`8148`	`65.4`	`-9.4`	`0.739`	`3`	`0`	`0`	`0.139`
34	`48`		[RUH]J:102	`4`	`1`	`227`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`31924`	`65.4`	`-0.9`	`0.786`	`1`	`0`	`0`	`0.065`
35	`49`		[SO4]G:201	`5`	`1`	`187`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`8835`	`65.2`	`-9.9`	`0.730`	`5`	`0`	`0`	`0.280`
36	`50`		[SO4]G:201	`4`	`1`	`187`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`8269`	`62.7`	`-8.7`	`0.760`	`2`	`0`	`0`	`0.101`
37	`51`		E	`9`	`3`	`8577`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`7`	`4`	`8148`	`62.6`	`0.2`	`0.723`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`52`		D	`5`	`2`	`8148`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`8835`	`58.7`	`-0.4`	`0.476`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
	`53`		H	`7`	`3`	`8269`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`8782`	`54.9`	`-0.5`	`0.521`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
	*Average:*													`56.8`	`-0.5`	`0.499`	`1`	`0`	`0`	`0.017`
39	`54`		[SO4]D:201	`5`	`1`	`187`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`8782`	`57.6`	`-8.6`	`0.722`	`5`	`0`	`0`	`0.433`
40	`55`		[RUH]J:102	`4`	`1`	`227`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`7`	`2`	`8148`	`56.1`	`-0.6`	`0.884`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
41	`56`		H	`6`	`3`	`8269`	`◊`	J	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`9`	`2`	`31909`	`54.7`	`0.2`	`0.610`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`57`		[RUH]I:101	`6`	`1`	`438`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`31909`	`52.8`	`0.3`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`58`		G	`3`	`2`	`8835`	`◊`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`8`	`2`	`31924`	`41.0`	`-0.5`	`0.571`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
44	`59`		[MG]E:201	`1`	`1`	`98`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`8`	`3`	`8577`	`37.6`	`-3.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.169`
45	`60`		G	`1`	`1`	`8835`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`8577`	`36.4`	`0.6`	`0.814`	`2`	`0`	`0`	`0.003`
	`61`		C	`1`	`1`	`8782`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`8513`	`32.3`	`0.6`	`0.823`	`1`	`0`	`0`	`0.003`
	*Average:*													`34.4`	`0.6`	`0.819`	`2`	`0`	`0`	`0.003`
46	`62`		[MG]E:201	`1`	`1`	`98`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`8`	`4`	`8148`	`29.4`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.028`
47	`63`		[SO4]D:201	`4`	`1`	`187`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`31909`	`23.6`	`-3.5`	`0.501`	`0`	`0`	`0`	`0.139`
48	`64`		[SO4]G:201	`3`	`1`	`187`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`31924`	`21.4`	`-3.4`	`0.347`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
49	`65`		I	`6`	`3`	`31924`	`◊`	J	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`4`	`2`	`31909`	`20.3`	`-0.6`	`0.503`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`66`		J	`2`	`2`	`31909`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`2`	`8782`	`19.7`	`-0.5`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`67`		[SO4]H:201	`3`	`1`	`186`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`8835`	`14.3`	`-1.9`	`0.721`	`0`	`0`	`0`	`0.020`
52	`68`		[MG]E:201	`1`	`1`	`98`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z+1/2	`3_545`	`3`	`1`	`8782`	`14.1`	`-1.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
53	`69`		J	`1`	`1`	`31909`	`x`	J	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`3`	`1`	`31909`	`10.0`	`-0.0`	`0.569`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`70`		H	`3`	`2`	`8269`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`8148`	`9.6`	`0.1`	`0.623`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`71`		[MG]E:201	`1`	`1`	`98`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`7682`	`9.0`	`-0.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.012`
56	`72`		I	`1`	`1`	`31924`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`6906`	`3.7`	`0.1`	`0.531`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`73`		J	`1`	`1`	`31909`	`◊`	B	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`6906`	`3.0`	`0.2`	`0.689`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`74`		J	`1`	`1`	`31909`	`◊`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`31924`	`1.5`	`-0.2`	`0.262`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
59	`75`		I	`1`	`1`	`31924`	`x`	I	-x-1,y-1/2,-z+1/2	`3_445`	`1`	`1`	`31924`	`0.3`	`-0.0`	`0.334`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

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