PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=872-HN-23L)

Interfaces in PDB 4efj crystal.
Space symmetry group: C 1 2 1. Resolution: 2.80 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF I-GZEII LAGLIDADG HOMING ENDONUCLEASE IN COMPLEX WITH DNA TARGET SITE

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		D	`137`	`20`	`6022`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`163`	`56`	`14591`	`1368.4`	`-17.1`	`0.640`	`20`	`0`	`0`	`0.563`
	`2`		F	`137`	`20`	`5979`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`153`	`52`	`14688`	`1306.9`	`-17.7`	`0.578`	`21`	`0`	`0`	`0.563`
	*Average:*													`1337.6`	`-17.4`	`0.609`	`21`	`0`	`0`	`0.563`
2	`3`		E	`131`	`19`	`6340`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`158`	`52`	`14688`	`1316.2`	`-17.1`	`0.330`	`27`	`0`	`0`	`0.595`
	`4`		C	`132`	`19`	`6321`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`140`	`50`	`14591`	`1229.7`	`-20.2`	`0.355`	`22`	`0`	`0`	`0.595`
	*Average:*													`1272.9`	`-18.6`	`0.343`	`25`	`0`	`0`	`0.595`
3	`5`		D	`141`	`26`	`6022`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`134`	`26`	`6321`	`1296.2`	`-18.7`	`0.767`	`66`	`0`	`0`	`1.000`
	`6`		F	`142`	`26`	`5979`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`130`	`26`	`6340`	`1278.9`	`-15.4`	`0.755`	`67`	`0`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1287.6`	`-17.1`	`0.761`	`67`	`0`	`0`	`1.000`
4	`7`		A	`43`	`16`	`14688`	`x`	A	-x-1/2,y-1/2,-z-1	`4_444`	`46`	`12`	`14688`	`374.2`	`0.7`	`0.660`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
5	`8`		B	`45`	`14`	`14591`	`x`	B	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`39`	`16`	`14591`	`352.7`	`2.8`	`0.762`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
6	`9`		A	`38`	`12`	`14688`	`◊`	B	-x-1,y-1,-z-1	`2_444`	`27`	`9`	`14591`	`303.8`	`-2.4`	`0.398`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
7	`10`		B	`39`	`12`	`14591`	`◊`	A	-x,y,-z	`2_555`	`28`	`9`	`14688`	`296.2`	`-3.8`	`0.249`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
8	`11`		A	`22`	`7`	`14688`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`31`	`10`	`14591`	`242.9`	`1.0`	`0.704`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
9	`12`		E	`23`	`2`	`6340`	`◊`	E	-x,y,-z	`2_555`	`23`	`2`	`6340`	`180.5`	`4.1`	`0.882`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`13`		B	`25`	`8`	`14591`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`14688`	`176.0`	`-0.2`	`0.607`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
11	`14`		C	`21`	`2`	`6321`	`◊`	C	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`21`	`2`	`6321`	`168.0`	`3.8`	`0.888`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
12	`15`		A	`10`	`6`	`14688`	`◊`	C	x,y-1,z	`1_545`	`13`	`3`	`6321`	`121.9`	`-0.0`	`0.639`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
13	`16`		A	`16`	`5`	`14688`	`◊`	A	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`17`	`5`	`14688`	`119.8`	`-0.6`	`0.540`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
14	`17`		F	`15`	`2`	`5979`	`◊`	E	-x,y,-z	`2_555`	`14`	`1`	`6340`	`97.5`	`0.2`	`0.687`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`18`		E	`13`	`1`	`6340`	`◊`	D	x-1/2,y-1/2,z-1	`3_444`	`12`	`1`	`6022`	`83.2`	`2.5`	`0.830`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
16	`19`		B	`11`	`4`	`14591`	`◊`	B	-x,y,-z	`2_555`	`11`	`4`	`14591`	`82.2`	`-1.4`	`0.330`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
17	`20`		F	`11`	`1`	`5979`	`◊`	C	x-1/2,y-1/2,z-1	`3_444`	`12`	`1`	`6321`	`79.4`	`1.6`	`0.759`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`21`		E	`13`	`1`	`6340`	`◊`	C	x-1/2,y-1/2,z-1	`3_444`	`13`	`1`	`6321`	`77.5`	`2.1`	`0.794`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`22`		D	`10`	`1`	`6022`	`◊`	C	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`8`	`1`	`6321`	`69.0`	`-0.1`	`0.638`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`23`		A	`7`	`3`	`14688`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`9`	`2`	`6022`	`57.8`	`-0.5`	`0.329`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`24`		D	`8`	`2`	`6022`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`14688`	`51.4`	`-0.8`	`0.562`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
22	`25`		B	`4`	`1`	`14591`	`◊`	C	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`4`	`1`	`6321`	`36.3`	`-1.9`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`26`		E	`4`	`2`	`6340`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`2`	`2`	`14591`	`32.9`	`-2.2`	`0.146`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`27`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`5`	`5`	`14688`	`30.2`	`-5.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.121`
	`28`		[CA]C:101	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`14591`	`27.7`	`-5.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.121`
	*Average:*													`28.9`	`-5.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.121`
25	`29`		[CA]B:401	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`5`	`14591`	`29.7`	`-6.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.128`
	`30`		[CA]A:401	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`6`	`14688`	`29.0`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.128`
	*Average:*													`29.4`	`-5.9`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.128`
26	`31`		[CA]A:401	`1`	`1`	`85`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`5979`	`24.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.098`
	`32`		[CA]B:401	`1`	`1`	`85`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`6022`	`23.3`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.098`
	*Average:*													`24.0`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.098`
27	`33`		[CA]C:101	`1`	`1`	`85`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6022`	`24.3`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	`34`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`5979`	`23.2`	`-4.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
	*Average:*													`23.8`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.101`
28	`35`		[CA]C:101	`1`	`1`	`85`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6321`	`24.2`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
	`36`		[CA]A:402	`1`	`1`	`85`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6340`	`23.4`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
	*Average:*													`23.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.095`
29	`37`		F	`3`	`1`	`5979`	`◊`	B	x,y-1,z	`1_545`	`5`	`2`	`14591`	`22.6`	`-1.3`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`38`		C	`4`	`2`	`6321`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`14688`	`22.1`	`-1.3`	`0.180`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`39`		[CA]B:401	`1`	`1`	`85`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6321`	`21.5`	`-4.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
	`40`		[CA]A:401	`1`	`1`	`85`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`6340`	`21.4`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
	*Average:*													`21.4`	`-4.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.083`
32	`41`		B	`3`	`2`	`14591`	`◊`	D	-x-1/2,y-1/2,-z	`4_445`	`5`	`2`	`6022`	`19.1`	`-0.5`	`0.596`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`42`		A	`5`	`2`	`14688`	`◊`	F	-x-1/2,y-1/2,-z-1	`4_444`	`3`	`1`	`5979`	`18.0`	`-0.9`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`43`		E	`2`	`2`	`6340`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`14591`	`9.8`	`-0.7`	`0.354`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`44`		F	`1`	`1`	`5979`	`◊`	D	x,y-1,z	`1_545`	`1`	`1`	`6022`	`6.0`	`-0.6`	`0.183`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`45`		A	`2`	`1`	`14688`	`◊`	D	-x-1,y-1,-z-1	`2_444`	`1`	`1`	`6022`	`5.0`	`-0.3`	`0.294`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`46`		E	`1`	`1`	`6340`	`◊`	A	-x-1,y,-z-1	`2_454`	`1`	`1`	`14688`	`1.3`	`-0.0`	`0.451`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

Protein Data Bank
in Europe

Bringing Structure to Biology

PDBePISA

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