PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=671-HK-K91)

Interfaces in PDB 3v6h crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.30 Å

REPLICATION OF N2,3-ETHENOGUANINE BY DNA POLYMERASES

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`101`	`12`	`3955`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`114`	`41`	`18000`	`986.4`	`-11.2`	`0.436`	`21`	`0`	`0`	`0.347`
2	`2`		T	`81`	`8`	`3134`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`84`	`32`	`18247`	`729.9`	`-6.5`	`0.554`	`17`	`0`	`0`	`0.300`
3	`3`		B	`78`	`26`	`18247`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`64`	`22`	`18000`	`628.0`	`-2.7`	`0.425`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
4	`4`		D	`48`	`11`	`2601`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`54`	`12`	`3955`	`480.1`	`-10.1`	`0.428`	`26`	`0`	`0`	`1.000`
5	`5`		D	`55`	`8`	`2601`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`60`	`23`	`18000`	`462.6`	`-9.9`	`0.357`	`13`	`0`	`0`	`0.258`
6	`6`		P	`48`	`7`	`2430`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`60`	`23`	`18247`	`420.1`	`-11.6`	`0.270`	`7`	`0`	`0`	`0.305`
7	`7`		P	`38`	`10`	`2430`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`50`	`10`	`3134`	`407.1`	`-5.9`	`0.585`	`11`	`0`	`0`	`0.209`
8	`8`		A	`39`	`13`	`18000`	`◊`	B	x,y,z-1	`1_554`	`34`	`9`	`18247`	`323.5`	`0.6`	`0.641`	`4`	`3`	`0`	`0.000`
9	`9`		A	`33`	`9`	`18000`	`x`	A	x-1,y,z	`1_455`	`33`	`9`	`18000`	`303.8`	`-5.3`	`0.112`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		B	`29`	`10`	`18247`	`x`	B	x-1,y,z	`1_455`	`34`	`9`	`18247`	`288.5`	`-4.0`	`0.199`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`296.2`	`-4.7`	`0.155`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`11`		[DCP]B:401	`25`	`1`	`560`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`39`	`19`	`18247`	`263.7`	`-1.5`	`0.471`	`6`	`0`	`0`	`0.089`
11	`12`		[DCP]A:401	`26`	`1`	`547`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`44`	`18`	`18000`	`263.6`	`0.1`	`0.572`	`10`	`0`	`0`	`0.073`
12	`13`		[EFG]T:5	`23`	`1`	`491`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`32`	`14`	`18247`	`238.8`	`-0.6`	`0.302`	`4`	`0`	`0`	`0.052`
13	`14`		[EFG]C:5	`23`	`1`	`487`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`35`	`14`	`18000`	`225.5`	`-0.1`	`0.331`	`3`	`0`	`0`	`0.024`
14	`15`		A	`21`	`9`	`18000`	`x`	A	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`22`	`6`	`18000`	`206.8`	`1.3`	`0.704`	`4`	`4`	`0`	`0.000`
15	`16`		C	`23`	`3`	`3955`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`29`	`9`	`18000`	`192.2`	`-0.4`	`0.524`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
16	`17`		D	`25`	`3`	`2601`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`24`	`7`	`18247`	`184.5`	`-0.9`	`0.635`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
17	`18`		[EFG]C:5	`21`	`1`	`487`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`26`	`2`	`3955`	`182.1`	`1.9`	`0.537`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`19`		[EFG]T:5	`24`	`1`	`491`	`cf`	T	x,y,z	`1_555`	`23`	`2`	`3134`	`173.6`	`2.4`	`0.530`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`20`		A	`13`	`4`	`18000`	`x`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`16`	`4`	`18000`	`153.0`	`-0.0`	`0.487`	`1`	`3`	`0`	`0.000`
20	`21`		C	`12`	`2`	`3955`	`◊`	B	x-1,y,z-1	`1_454`	`14`	`4`	`18247`	`122.5`	`0.5`	`0.594`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
21	`22`		[DOC]P:13	`15`	`1`	`414`	`cf`	P	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`2430`	`109.3`	`1.9`	`0.558`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`23`		[DCP]B:401	`18`	`1`	`560`	`◊`	[DOC]P:13	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`414`	`109.2`	`2.1`	`0.491`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`24`		[DOC]D:13	`14`	`1`	`418`	`cf`	D	x,y,z	`1_555`	`12`	`1`	`2601`	`99.7`	`0.9`	`0.436`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`25`		[DCP]A:401	`15`	`1`	`547`	`◊`	[DOC]D:13	x,y,z	`1_555`	`13`	`1`	`418`	`91.3`	`1.7`	`0.432`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`26`		B	`12`	`3`	`18247`	`x`	B	-x+1,y-1/2,-z+2	`2_647`	`9`	`3`	`18247`	`85.8`	`0.8`	`0.711`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
26	`27`		[DOC]D:13	`7`	`1`	`418`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`13`	`7`	`18000`	`82.8`	`0.3`	`0.430`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`28`		[DOC]D:13	`10`	`1`	`418`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`9`	`2`	`3955`	`72.4`	`1.0`	`0.448`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
28	`29`		[DOC]P:13	`7`	`1`	`414`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`18247`	`71.5`	`-0.7`	`0.368`	`1`	`0`	`0`	`0.023`
29	`30`		[DOC]P:13	`10`	`1`	`414`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`8`	`2`	`3134`	`60.9`	`1.1`	`0.507`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`31`		B	`7`	`3`	`18247`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`7`	`2`	`18000`	`58.9`	`2.1`	`0.877`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
31	`32`		[DCP]B:401	`4`	`1`	`560`	`◊`	[EFG]T:5	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`491`	`49.0`	`0.8`	`0.492`	`2`	`0`	`0`	`0.003`
32	`33`		[DCP]A:401	`4`	`1`	`547`	`◊`	[EFG]C:5	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`487`	`47.5`	`0.9`	`0.516`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`34`		[CA]D:101	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`18000`	`46.1`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
	`35`		[CA]B:403	`1`	`1`	`85`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`18247`	`40.1`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
	*Average:*													`43.1`	`-8.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.175`
34	`36`		[CA]A:404	`1`	`1`	`85`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`7`	`18000`	`38.2`	`-8.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.134`
35	`37`		[DOC]D:13	`6`	`1`	`418`	`◊`	[EFG]C:5	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`487`	`37.9`	`0.9`	`0.391`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
36	`38`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`5`	`18000`	`32.9`	`-4.8`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
	`39`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`18247`	`31.5`	`-5.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
	*Average:*													`32.2`	`-5.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.114`
37	`40`		[MG]B:402	`1`	`1`	`98`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`9`	`6`	`18247`	`32.8`	`-4.7`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	`41`		[MG]A:402	`1`	`1`	`98`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`7`	`18000`	`31.8`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
	*Average:*													`32.3`	`-4.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.100`
38	`42`		[MG]A:402	`1`	`1`	`98`	`f`	[DCP]A:401	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`547`	`30.3`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
	`43`		[MG]B:402	`1`	`1`	`98`	`f`	[DCP]B:401	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`560`	`29.9`	`-4.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
	*Average:*													`30.1`	`-4.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.093`
39	`44`		[DOC]P:13	`5`	`1`	`414`	`◊`	[EFG]T:5	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`491`	`30.2`	`0.7`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`45`		[CA]D:101	`1`	`1`	`85`	`◊`	[DOC]D:13	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`418`	`24.7`	`-3.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
	`46`		[CA]B:403	`1`	`1`	`85`	`◊`	[DOC]P:13	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`414`	`22.8`	`-3.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
	*Average:*													`23.7`	`-3.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.069`
41	`47`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	[DCP]A:401	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`547`	`24.6`	`-3.3`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
	`48`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	[DCP]B:401	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`560`	`23.0`	`-3.0`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
	*Average:*													`23.8`	`-3.1`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.063`
42	`49`		[DCP]B:401	`9`	`1`	`560`	`◊`	P	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2430`	`23.1`	`0.7`	`0.629`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`50`		[DCP]B:401	`5`	`1`	`560`	`◊`	T	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`3134`	`22.1`	`0.0`	`0.533`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`51`		[DCP]A:401	`4`	`1`	`547`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`4`	`1`	`3955`	`20.7`	`0.0`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`52`		[CA]A:404	`1`	`1`	`85`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`2601`	`16.3`	`-3.2`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.053`
46	`53`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]B:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.8`	`-2.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.055`
47	`54`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`f`	[MG]A:402	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`98`	`12.0`	`-2.4`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.041`
48	`55`		[MG]B:404	`1`	`1`	`98`	`◊`	[DOC]P:13	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`414`	`11.3`	`-1.6`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
	`56`		[MG]A:403	`1`	`1`	`98`	`◊`	[DOC]D:13	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`418`	`11.2`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
	*Average:*													`11.2`	`-1.5`	`0.000`	`0`	`0`	`0`	`0.033`
49	`57`		[DCP]A:401	`1`	`1`	`547`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`2601`	`2.9`	`0.2`	`0.492`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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