PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=455-H3-P5G)

Interfaces in PDB 3d2u crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.21 Å

STRUCTURE OF UL18, A PEPTIDE-BINDING VIRAL MHC MIMIC, BOUND TO A HOST INHIBITORY RECEPTOR

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		F	`150`	`33`	`6615`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`161`	`50`	`15022`	`1476.0`	`-13.5`	`0.197`	`19`	`12`	`0`	`1.000`
	`2`		B	`143`	`33`	`6513`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`160`	`50`	`15050`	`1458.2`	`-14.4`	`0.172`	`17`	`12`	`0`	`1.000`
	*Average:*													`1467.1`	`-14.0`	`0.184`	`18`	`12`	`0`	`1.000`
2	`3`		C	`64`	`9`	`1472`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`113`	`36`	`15050`	`900.5`	`-12.3`	`0.480`	`8`	`4`	`0`	`1.000`
3	`4`		G	`64`	`9`	`1415`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`118`	`37`	`15022`	`892.1`	`-12.0`	`0.494`	`9`	`2`	`0`	`1.000`
4	`5`		D	`62`	`16`	`10009`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`68`	`17`	`15050`	`594.6`	`-0.2`	`0.724`	`9`	`9`	`0`	`0.023`
	`6`		H	`63`	`17`	`10031`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`68`	`17`	`15022`	`579.4`	`-1.4`	`0.569`	`7`	`8`	`0`	`0.023`
	*Average:*													`587.0`	`-0.8`	`0.646`	`8`	`9`	`0`	`0.023`
5	`7`		D	`56`	`15`	`10009`	`◊`	A	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`60`	`18`	`15050`	`530.2`	`1.0`	`0.787`	`11`	`1`	`0`	`0.000`
	`8`		E	`56`	`16`	`15022`	`◊`	H	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`52`	`14`	`10031`	`474.9`	`-0.1`	`0.666`	`9`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`502.6`	`0.5`	`0.727`	`10`	`1`	`0`	`0.000`
6	`9`		H	`51`	`17`	`10031`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`56`	`16`	`6615`	`518.7`	`-2.8`	`0.448`	`9`	`0`	`0`	`0.027`
	`10`		D	`54`	`18`	`10009`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`60`	`17`	`6513`	`497.1`	`-2.5`	`0.505`	`10`	`1`	`0`	`0.027`
	*Average:*													`507.9`	`-2.7`	`0.477`	`10`	`1`	`0`	`0.027`
7	`11`		E	`29`	`8`	`15022`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`31`	`8`	`15050`	`284.1`	`-4.0`	`0.254`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		H	`21`	`7`	`10031`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`18`	`3`	`6615`	`192.1`	`-2.0`	`0.331`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`13`		B	`16`	`3`	`6513`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`15`	`6`	`10009`	`160.9`	`-3.1`	`0.176`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`176.5`	`-2.5`	`0.253`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`14`		H	`17`	`6`	`10031`	`x`	H	-x+2,y-1/2,-z+1	`2_746`	`21`	`7`	`10031`	`168.9`	`-0.3`	`0.623`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
10	`15`		[NAG]A:831	`14`	`1`	`358`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`7`	`15050`	`150.0`	`3.7`	`0.467`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		[NAG]E:831	`11`	`1`	`362`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`16`	`7`	`15022`	`128.8`	`3.3`	`0.482`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		F	`12`	`5`	`6615`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`21`	`8`	`10031`	`110.0`	`2.0`	`0.852`	`3`	`4`	`0`	`0.000`
13	`18`		[NAG]A:871	`9`	`1`	`367`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`5`	`15050`	`104.3`	`2.7`	`0.482`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		[BMA]A:813	`9`	`1`	`303`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`15`	`5`	`15022`	`97.1`	`1.0`	`0.239`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[NAG]A:891	`12`	`1`	`361`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`9`	`4`	`15050`	`96.3`	`2.3`	`0.280`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		[NAG]E:891	`11`	`1`	`360`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`15022`	`87.7`	`2.0`	`0.292`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		[NAG]E:861	`9`	`1`	`367`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`13`	`5`	`15022`	`87.3`	`2.1`	`0.411`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
18	`23`		[NAG]E:871	`8`	`1`	`365`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`9`	`5`	`15022`	`86.9`	`2.1`	`0.368`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
19	`24`		[NAG]A:832	`9`	`1`	`365`	`f`	[NAG]A:831	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`358`	`78.1`	`1.5`	`0.110`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
20	`25`		[NAG]A:861	`7`	`1`	`369`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`4`	`15050`	`74.3`	`2.0`	`0.490`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
21	`26`		[NAG]A:810	`8`	`1`	`356`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`10`	`4`	`15050`	`72.9`	`1.3`	`0.310`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`27`		[NAG]A:811	`9`	`1`	`367`	`cf`	[NAG]A:810	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`356`	`66.6`	`1.1`	`0.079`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
23	`28`		[NAG]E:832	`7`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]E:831	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`362`	`66.0`	`0.8`	`0.073`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`29`		[FUC]A:814	`6`	`1`	`285`	`◊`	[NAG]A:810	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`356`	`63.9`	`2.2`	`0.146`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`30`		[BMA]A:813	`7`	`1`	`303`	`f`	[MAN]A:812	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`298`	`61.8`	`2.5`	`0.220`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`31`		[MAN]A:812	`8`	`1`	`298`	`f`	[NAG]A:811	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`367`	`59.1`	`0.8`	`0.096`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
27	`32`		[NAG]E:810	`7`	`1`	`365`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`6`	`2`	`15022`	`57.0`	`1.0`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`33`		D	`7`	`3`	`10009`	`x`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`6`	`2`	`10009`	`54.9`	`-0.0`	`0.605`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
29	`34`		[FUC]A:814	`5`	`1`	`285`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`3`	`15050`	`54.4`	`-0.4`	`0.218`	`0`	`0`	`0`	`0.029`
30	`35`		[NAG]A:871	`9`	`1`	`367`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`6`	`3`	`1472`	`52.6`	`0.0`	`0.181`	`1`	`0`	`0`	`0.100`
31	`36`		[NAG]A:811	`7`	`1`	`367`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`5`	`1`	`15022`	`50.1`	`0.3`	`0.230`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`37`		[MAN]A:812	`4`	`1`	`298`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`6615`	`46.0`	`0.4`	`0.296`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`38`		F	`3`	`1`	`6615`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`4`	`1`	`15022`	`43.8`	`1.2`	`0.799`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
34	`39`		[NAG]A:891	`3`	`1`	`361`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15022`	`43.2`	`0.4`	`0.322`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`40`		[FUC]A:814	`4`	`1`	`285`	`◊`	[NAG]A:811	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`367`	`43.0`	`1.9`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`41`		[MAN]A:812	`5`	`1`	`298`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`6`	`1`	`15022`	`42.0`	`0.9`	`0.403`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`42`		[FUC]A:814	`5`	`1`	`285`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`3`	`1`	`15022`	`33.1`	`-0.0`	`0.182`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
38	`43`		[BMA]A:813	`3`	`1`	`303`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`6615`	`32.0`	`0.6`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
39	`44`		[NAG]E:891	`4`	`1`	`360`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`15050`	`26.2`	`-0.1`	`0.266`	`0`	`0`	`0`	`0.005`
40	`45`		[BMA]A:813	`3`	`1`	`303`	`f`	[NAG]A:811	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`367`	`25.2`	`0.6`	`0.244`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
41	`46`		[NAG]E:871	`2`	`1`	`365`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`1415`	`14.4`	`0.1`	`0.395`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`47`		D	`1`	`1`	`10009`	`x`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`4`	`1`	`10009`	`10.9`	`0.2`	`0.725`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`48`		H	`1`	`1`	`10031`	`x`	H	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`2`	`1`	`10031`	`7.6`	`-0.2`	`0.343`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`9.3`	`-0.0`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`49`		[NAG]A:810	`1`	`1`	`356`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`1`	`1`	`15022`	`9.3`	`0.2`	`0.406`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`50`		[NAG]E:810	`5`	`1`	`365`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`6513`	`9.0`	`0.2`	`0.233`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`51`		[NAG]E:832	`2`	`1`	`363`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`15022`	`8.6`	`0.4`	`0.404`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`52`		[NAG]A:811	`2`	`1`	`367`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6615`	`7.6`	`-0.0`	`0.247`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
47	`53`		B	`3`	`2`	`6513`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`2`	`2`	`15050`	`5.3`	`-0.1`	`0.534`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`54`		B	`1`	`1`	`6513`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`15022`	`4.0`	`0.1`	`0.643`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`55`		[NAG]A:832	`2`	`1`	`365`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`15050`	`0.7`	`0.0`	`0.385`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`56`		[NAG]A:832	`1`	`1`	`365`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`6513`	`0.6`	`0.0`	`0.270`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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Bringing Structure to Biology

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