PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=523-HK-7G4)

Interfaces in PDB 2nxi crystal.
Space symmetry group: P 1 21 1. Resolution: 2.30 Å

STRUCTURAL AND MECHANISTIC CHANGES ALONG AN ENGINEERED PATH FROM METALLO TO NON-METALLO KDO8P SYNTHASE.

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		J	`181`	`46`	`11984`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`183`	`47`	`11854`	`1752.1`	`-7.8`	`0.503`	`30`	`10`	`0`	`0.460`
	`2`		B	`178`	`45`	`11959`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`185`	`45`	`11829`	`1751.4`	`-9.0`	`0.501`	`25`	`10`	`0`	`0.460`
	`3`		H	`179`	`45`	`11913`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`182`	`46`	`12058`	`1742.8`	`-8.3`	`0.480`	`28`	`10`	`0`	`0.460`
	`4`		D	`181`	`43`	`11827`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`174`	`43`	`11604`	`1726.2`	`-9.2`	`0.453`	`22`	`12`	`0`	`0.460`
	`5`		L	`179`	`46`	`11960`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`177`	`43`	`11873`	`1713.8`	`-8.4`	`0.462`	`23`	`10`	`0`	`0.460`
	`6`		F	`176`	`42`	`11738`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`181`	`44`	`11624`	`1692.6`	`-9.3`	`0.422`	`24`	`8`	`0`	`0.460`
	*Average:*													`1729.8`	`-8.7`	`0.470`	`25`	`10`	`0`	`0.460`
2	`7`		C	`135`	`38`	`11604`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`133`	`37`	`11959`	`1363.1`	`-14.5`	`0.118`	`17`	`9`	`0`	`0.489`
	`8`		H	`135`	`37`	`11913`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`136`	`37`	`11624`	`1360.0`	`-15.0`	`0.091`	`18`	`8`	`0`	`0.489`
	`9`		G	`139`	`39`	`12058`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`140`	`38`	`11738`	`1353.5`	`-15.1`	`0.092`	`18`	`9`	`0`	`0.489`
	`10`		L	`138`	`37`	`11960`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`138`	`38`	`11854`	`1352.5`	`-15.6`	`0.079`	`15`	`10`	`0`	`0.489`
	`11`		D	`138`	`38`	`11827`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`137`	`39`	`11829`	`1344.8`	`-15.4`	`0.095`	`19`	`11`	`0`	`0.489`
	`12`		K	`133`	`37`	`11873`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`135`	`37`	`11984`	`1323.2`	`-14.7`	`0.095`	`16`	`7`	`0`	`0.489`
	*Average:*													`1349.5`	`-15.0`	`0.095`	`17`	`9`	`0`	`0.489`
3	`13`		G	`30`	`7`	`12058`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`40`	`11`	`11829`	`293.5`	`0.8`	`0.724`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	`14`		J	`28`	`7`	`11984`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`36`	`11`	`12058`	`253.5`	`0.8`	`0.620`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`273.5`	`0.8`	`0.672`	`3`	`1`	`0`	`0.000`
4	`15`		J	`34`	`11`	`11984`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`28`	`8`	`11829`	`257.1`	`0.8`	`0.672`	`4`	`2`	`0`	`0.000`
5	`16`		G	`29`	`10`	`12058`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`26`	`8`	`11959`	`255.4`	`1.8`	`0.813`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
	`17`		J	`24`	`8`	`11984`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`11913`	`223.8`	`2.9`	`0.877`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	`18`		I	`18`	`7`	`11854`	`◊`	A	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`21`	`10`	`11829`	`202.6`	`1.4`	`0.607`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`227.3`	`2.1`	`0.766`	`1`	`2`	`0`	`0.000`
6	`19`		L	`31`	`7`	`11960`	`◊`	D	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`29`	`7`	`11827`	`254.4`	`-2.1`	`0.373`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`20`		C	`29`	`6`	`11604`	`◊`	F	x-1,y,z-1	`1_454`	`24`	`6`	`11738`	`220.6`	`-2.7`	`0.315`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`237.5`	`-2.4`	`0.344`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
7	`21`		L	`20`	`9`	`11960`	`◊`	C	-x,y-1/2,-z	`2_545`	`28`	`8`	`11604`	`206.0`	`0.7`	`0.670`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	`22`		C	`18`	`6`	`11604`	`◊`	E	x-1,y,z-1	`1_454`	`16`	`5`	`11624`	`157.0`	`-2.0`	`0.328`	`4`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`181.5`	`-0.7`	`0.499`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
8	`23`		[PEP]K:268	`10`	`1`	`292`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`29`	`14`	`11873`	`203.0`	`-3.3`	`0.655`	`8`	`0`	`0`	`0.138`
9	`24`		[PEP]E:268	`10`	`1`	`287`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`28`	`14`	`11624`	`199.8`	`-3.0`	`0.699`	`8`	`0`	`0`	`0.132`
10	`25`		[PEP]C:268	`10`	`1`	`289`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`27`	`17`	`11604`	`199.3`	`-3.6`	`0.671`	`10`	`0`	`0`	`0.336`
	`26`		[PEP]G:268	`10`	`1`	`289`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`28`	`17`	`12058`	`197.8`	`-3.3`	`0.689`	`11`	`0`	`0`	`0.336`
	`27`		[PEP]H:268	`10`	`1`	`287`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`26`	`16`	`11913`	`197.6`	`-3.2`	`0.707`	`10`	`0`	`0`	`0.336`
	`28`		[PEP]A:268	`10`	`1`	`290`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`27`	`16`	`11829`	`196.6`	`-3.1`	`0.697`	`10`	`0`	`0`	`0.336`
	`29`		[PEP]D:268	`10`	`1`	`289`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`27`	`16`	`11827`	`196.3`	`-3.8`	`0.667`	`11`	`0`	`0`	`0.336`
	`30`		[PEP]J:268	`10`	`1`	`289`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`27`	`15`	`11984`	`195.8`	`-3.4`	`0.672`	`10`	`0`	`0`	`0.336`
	`31`		[PEP]I:268	`10`	`1`	`288`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`27`	`15`	`11854`	`194.3`	`-3.1`	`0.686`	`10`	`0`	`0`	`0.336`
	`32`		[PEP]F:268	`10`	`1`	`290`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`29`	`15`	`11738`	`193.6`	`-4.3`	`0.640`	`12`	`0`	`0`	`0.336`
	`33`		[PEP]B:268	`10`	`1`	`289`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`27`	`16`	`11959`	`189.5`	`-3.1`	`0.701`	`9`	`0`	`0`	`0.336`
	*Average:*													`195.6`	`-3.4`	`0.681`	`10`	`0`	`0`	`0.336`
11	`34`		[PEP]L:268	`10`	`1`	`291`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`25`	`15`	`11960`	`192.1`	`-3.6`	`0.672`	`10`	`0`	`0`	`0.162`
12	`35`		[PEP]I:269	`10`	`1`	`290`	`f`	I	x,y,z	`1_555`	`36`	`16`	`11854`	`191.7`	`-2.3`	`0.705`	`5`	`0`	`0`	`0.090`
13	`36`		K	`23`	`6`	`11873`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`23`	`6`	`11854`	`189.8`	`-3.6`	`0.173`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`37`		C	`21`	`6`	`11604`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`11829`	`187.3`	`-3.6`	`0.146`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`38`		G	`21`	`6`	`12058`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`21`	`6`	`11624`	`183.8`	`-3.7`	`0.145`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`39`		D	`21`	`6`	`11827`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`11959`	`183.1`	`-3.6`	`0.165`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`40`		H	`23`	`6`	`11913`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`11738`	`181.5`	`-3.5`	`0.183`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	`41`		L	`21`	`6`	`11960`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`22`	`6`	`11984`	`180.9`	`-3.6`	`0.154`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
	*Average:*													`184.4`	`-3.6`	`0.161`	`0`	`0`	`0`	`0.048`
14	`42`		[PEP]C:269	`10`	`1`	`286`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`30`	`14`	`11604`	`188.7`	`-2.8`	`0.694`	`6`	`0`	`0`	`0.115`
15	`43`		[PEP]G:269	`10`	`1`	`284`	`f`	G	x,y,z	`1_555`	`33`	`15`	`12058`	`187.6`	`-3.0`	`0.683`	`5`	`0`	`0`	`0.107`
16	`44`		[PEP]B:269	`10`	`1`	`292`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`30`	`14`	`11959`	`185.9`	`-1.6`	`0.774`	`4`	`0`	`0`	`0.072`
17	`45`		I	`25`	`7`	`11854`	`◊`	J	x-1,y,z	`1_455`	`19`	`6`	`11984`	`178.4`	`-0.3`	`0.613`	`3`	`2`	`0`	`0.000`
	`46`		B	`22`	`6`	`11959`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`18`	`5`	`11829`	`162.0`	`0.2`	`0.679`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	`47`		G	`16`	`5`	`12058`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`18`	`5`	`11913`	`154.4`	`-0.6`	`0.555`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`165.0`	`-0.3`	`0.616`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
18	`48`		[PEP]H:269	`10`	`1`	`291`	`f`	H	x,y,z	`1_555`	`30`	`13`	`11913`	`162.1`	`-2.0`	`0.768`	`5`	`0`	`0`	`0.087`
19	`49`		L	`14`	`5`	`11960`	`◊`	J	x-1,y,z	`1_455`	`17`	`4`	`11984`	`139.0`	`1.1`	`0.759`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`50`		G	`18`	`5`	`12058`	`◊`	E	x-1,y,z	`1_455`	`18`	`6`	`11624`	`136.5`	`0.4`	`0.692`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`51`		C	`16`	`6`	`11604`	`◊`	A	x-1,y,z	`1_455`	`16`	`5`	`11829`	`131.7`	`1.4`	`0.733`	`2`	`1`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`135.7`	`1.0`	`0.728`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
20	`52`		[PO4]J:269	`5`	`1`	`187`	`f`	J	x,y,z	`1_555`	`18`	`10`	`11984`	`114.2`	`-6.5`	`0.803`	`5`	`0`	`0`	`0.167`
21	`53`		[PO4]L:269	`5`	`1`	`186`	`f`	L	x,y,z	`1_555`	`20`	`8`	`11960`	`113.5`	`-5.8`	`0.775`	`3`	`0`	`0`	`0.143`
22	`54`		I	`17`	`6`	`11854`	`◊`	B	-x,y-1/2,-z+1	`2_546`	`12`	`5`	`11959`	`109.5`	`1.2`	`0.774`	`1`	`1`	`0`	`0.000`
	`55`		B	`21`	`7`	`11959`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`5`	`11913`	`108.1`	`3.2`	`0.931`	`2`	`3`	`0`	`0.000`
	`56`		I	`10`	`5`	`11854`	`◊`	H	x-1,y,z	`1_455`	`13`	`6`	`11913`	`99.9`	`2.1`	`0.870`	`3`	`3`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`105.8`	`2.2`	`0.858`	`2`	`2`	`0`	`0.000`
23	`57`		[PO4]E:269	`5`	`1`	`186`	`f`	E	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`11624`	`107.5`	`-5.1`	`0.895`	`4`	`0`	`0`	`0.139`
24	`58`		[PO4]D:269	`5`	`1`	`187`	`f`	D	x,y,z	`1_555`	`21`	`9`	`11827`	`105.9`	`-5.4`	`0.888`	`4`	`0`	`0`	`0.144`
25	`59`		[PO4]K:269	`5`	`1`	`187`	`f`	K	x,y,z	`1_555`	`19`	`7`	`11873`	`105.3`	`-5.0`	`0.892`	`5`	`0`	`0`	`0.145`
26	`60`		[PO4]A:269	`5`	`1`	`188`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`15`	`7`	`11829`	`103.8`	`-4.9`	`0.914`	`5`	`0`	`0`	`0.151`
27	`61`		K	`12`	`4`	`11873`	`◊`	E	x-1,y,z-1	`1_454`	`12`	`4`	`11624`	`103.4`	`0.8`	`0.765`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`62`		[PO4]F:269	`5`	`1`	`187`	`f`	F	x,y,z	`1_555`	`20`	`9`	`11738`	`102.6`	`-5.2`	`0.872`	`4`	`0`	`0`	`0.136`
29	`63`		H	`6`	`2`	`11913`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`11829`	`85.0`	`-1.5`	`0.269`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`64`		I	`5`	`2`	`11854`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`10`	`3`	`12058`	`82.6`	`-1.1`	`0.300`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`65`		J	`10`	`3`	`11984`	`◊`	B	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`4`	`2`	`11959`	`76.6`	`-0.6`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`81.4`	`-1.1`	`0.351`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`66`		[PEP]C:269	`6`	`1`	`286`	`◊`	D	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11827`	`42.4`	`1.0`	`0.872`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`67`		[PEP]B:269	`7`	`1`	`292`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11829`	`39.9`	`1.0`	`0.888`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
32	`68`		[PEP]I:269	`7`	`1`	`290`	`◊`	J	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`11984`	`36.6`	`0.0`	`0.828`	`2`	`0`	`0`	`0.017`
33	`69`		[PEP]G:269	`4`	`1`	`284`	`◊`	H	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11913`	`27.8`	`0.1`	`0.818`	`1`	`0`	`0`	`0.006`
34	`70`		[PEP]H:269	`4`	`1`	`291`	`◊`	G	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`12058`	`27.7`	`-0.2`	`0.808`	`1`	`0`	`0`	`0.013`
35	`71`		[PO4]A:269	`4`	`1`	`188`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`11959`	`26.9`	`-0.1`	`0.976`	`1`	`0`	`0`	`0.012`
36	`72`		[PO4]L:269	`4`	`1`	`186`	`◊`	K	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11873`	`26.0`	`0.0`	`0.991`	`1`	`0`	`0`	`0.009`
37	`73`		[PO4]D:269	`4`	`1`	`187`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11604`	`24.6`	`-0.1`	`0.990`	`1`	`0`	`0`	`0.011`
38	`74`		[PO4]J:269	`4`	`1`	`187`	`◊`	I	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11854`	`23.6`	`0.0`	`0.990`	`1`	`0`	`0`	`0.008`
39	`75`		[PO4]K:269	`4`	`1`	`187`	`◊`	L	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11960`	`22.7`	`0.0`	`0.987`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
40	`76`		[PEP]B:269	`2`	`1`	`292`	`f`	[PEP]B:268	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`289`	`22.5`	`-0.4`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.008`
41	`77`		K	`2`	`1`	`11873`	`◊`	D	-x+1,y-1/2,-z	`2_645`	`5`	`3`	`11827`	`21.9`	`0.9`	`0.804`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`78`		[PO4]F:269	`4`	`1`	`187`	`◊`	E	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11624`	`20.8`	`0.1`	`0.989`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`79`		[PO4]E:269	`3`	`1`	`186`	`◊`	F	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`11738`	`19.1`	`-0.1`	`0.984`	`0`	`0`	`0`	`0.002`
44	`80`		[PEP]I:269	`3`	`1`	`290`	`f`	[PEP]I:268	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`288`	`19.0`	`0.3`	`0.692`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`81`		[PEP]C:269	`2`	`1`	`286`	`f`	[PEP]C:268	x,y,z	`1_555`	`2`	`1`	`289`	`11.8`	`-0.0`	`0.645`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`82`		D	`1`	`1`	`11827`	`◊`	F	x,y,z-1	`1_554`	`1`	`1`	`11738`	`5.1`	`0.2`	`0.839`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`83`		L	`1`	`1`	`11960`	`◊`	F	-x+1,y-1/2,-z+1	`2_646`	`1`	`1`	`11738`	`2.5`	`0.0`	`0.590`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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