PDBe < PISA < EMBL-EBI

PISA Interface List.

Session Map (id=497-6O-M33)

Interfaces in PDB 2i36 crystal.
Space symmetry group: P 31 1 2. Resolution: 4.10 Å

CRYSTAL STRUCTURE OF TRIGONAL CRYSTAL FORM OF GROUND-STATE RHODOPSIN

Interfaces

##			Structure 1				×	Structure 2						interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
Id	NN	«»	Range	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	×	Range	Symmetry op-n	Sym.ID	ⁱN_at	ⁱN_res	Surface Å²	interface area, Å²	ΔⁱG kcal/mol	ΔⁱG P-value	N_HB	N_SB	N_DS	CSS
1	`1`		C	`63`	`20`	`16221`	`◊`	C	x,x-y,-z+1	`6_556`	`63`	`20`	`16221`	`682.9`	`-13.3`	`0.278`	`6`	`0`	`0`	`0.000`
	`2`		B	`58`	`18`	`16147`	`◊`	A	x,y,z	`1_555`	`56`	`18`	`16679`	`509.9`	`-11.3`	`0.317`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`596.4`	`-12.3`	`0.298`	`5`	`0`	`0`	`0.000`
2	`3`		A	`72`	`22`	`16679`	`◊`	A	x,x-y,-z+1	`6_556`	`71`	`22`	`16679`	`625.6`	`-6.3`	`0.836`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`4`		C	`73`	`22`	`16221`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`73`	`22`	`16147`	`621.5`	`-6.3`	`0.849`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`623.6`	`-6.3`	`0.843`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
3	`5`		[NAG]A:505	`12`	`1`	`365`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`16679`	`143.1`	`3.6`	`0.510`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`6`		[NAG]C:505	`11`	`1`	`363`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`18`	`8`	`16221`	`130.8`	`3.0`	`0.524`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`136.9`	`3.3`	`0.517`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
4	`7`		C	`14`	`4`	`16221`	`◊`	C	-y-1,-x-1,-z+2/3	`4_445`	`14`	`4`	`16221`	`142.1`	`2.0`	`0.964`	`2`	`4`	`0`	`0.000`
5	`8`		[NAG]B:505	`12`	`1`	`360`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`17`	`7`	`16147`	`129.4`	`2.8`	`0.423`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
6	`9`		[NAG]C:705	`11`	`1`	`362`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`16221`	`107.7`	`2.3`	`0.289`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
	`10`		[NAG]B:705	`11`	`1`	`362`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`16147`	`98.4`	`1.9`	`0.237`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`103.1`	`2.1`	`0.263`	`3`	`0`	`0`	`0.000`
7	`11`		[NAG]A:705	`10`	`1`	`361`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`16`	`6`	`16679`	`102.2`	`1.6`	`0.289`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
8	`12`		[PLM]A:401	`8`	`1`	`548`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`8`	`4`	`16679`	`88.5`	`1.3`	`0.330`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
9	`13`		[NAG]B:705	`8`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]B:704	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`361`	`82.6`	`2.2`	`0.074`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
10	`14`		[NAG]B:504	`9`	`1`	`359`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`3`	`16221`	`78.0`	`1.9`	`0.273`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	`15`		[NAG]C:504	`10`	`1`	`358`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`16147`	`70.4`	`2.0`	`0.224`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`74.2`	`1.9`	`0.248`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
11	`16`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`171`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`6`	`16147`	`76.9`	`-1.9`	`0.722`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
12	`17`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`172`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`16221`	`76.4`	`-1.8`	`0.729`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
13	`18`		[ACE]A:0	`3`	`1`	`172`	`◊`	A	x,x-y,-z+1	`6_556`	`11`	`6`	`16679`	`76.1`	`-2.0`	`0.642`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
14	`19`		[NAG]C:705	`9`	`1`	`362`	`cf`	[NAG]C:704	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`358`	`75.2`	`1.6`	`0.062`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
15	`20`		[NAG]A:705	`8`	`1`	`361`	`cf`	[NAG]A:704	x,y,z	`1_555`	`9`	`1`	`363`	`75.2`	`2.2`	`0.096`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
16	`21`		C	`10`	`5`	`16221`	`◊`	A	x-1,x-y,-z+1	`6_456`	`9`	`5`	`16679`	`73.3`	`-1.1`	`0.625`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
17	`22`		[NAG]B:505	`6`	`1`	`360`	`cf`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`359`	`71.1`	`2.1`	`0.131`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
18	`23`		[NAG]A:504	`6`	`1`	`360`	`◊`	A	x,x-y,-z+1	`6_556`	`12`	`3`	`16679`	`70.8`	`2.0`	`0.451`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
19	`24`		[NAG]C:505	`6`	`1`	`363`	`cf`	[NAG]C:504	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`358`	`70.1`	`2.0`	`0.144`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
20	`25`		[NAG]C:505	`9`	`1`	`363`	`◊`	[NAG]B:505	x,y,z	`1_555`	`8`	`1`	`360`	`68.1`	`3.3`	`0.194`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
21	`26`		[NAG]A:505	`8`	`1`	`365`	`◊`	[NAG]A:505	x,x-y,-z+1	`6_556`	`8`	`1`	`365`	`67.1`	`3.2`	`0.199`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
22	`27`		[NAG]A:505	`6`	`1`	`365`	`cf`	[NAG]A:504	x,y,z	`1_555`	`10`	`1`	`360`	`66.5`	`2.4`	`0.104`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
23	`28`		[NAG]C:504	`7`	`1`	`358`	`◊`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`7`	`1`	`359`	`63.6`	`2.5`	`0.179`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
24	`29`		[MAN]C:503	`6`	`1`	`290`	`cf`	[NAG]C:504	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`358`	`59.5`	`1.4`	`0.137`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
25	`30`		[MAN]A:503	`6`	`1`	`289`	`cf`	[NAG]A:504	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`360`	`58.8`	`1.5`	`0.125`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
26	`31`		[NAG]A:504	`6`	`1`	`360`	`◊`	[NAG]A:504	x,x-y,-z+1	`6_556`	`6`	`1`	`360`	`57.8`	`1.7`	`0.143`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
27	`32`		[MAN]B:503	`6`	`1`	`294`	`cf`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`359`	`57.7`	`1.2`	`0.136`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
28	`33`		[MAN]A:503	`8`	`1`	`289`	`◊`	A	x,x-y,-z+1	`6_556`	`5`	`2`	`16679`	`57.4`	`2.2`	`0.331`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
29	`34`		[MAN]B:503	`7`	`1`	`294`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`16221`	`57.1`	`2.2`	`0.404`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
30	`35`		[ACE]A:0	`3`	`1`	`172`	`cf`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`16679`	`56.7`	`-0.3`	`0.862`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
31	`36`		[NAG]B:505	`8`	`1`	`360`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`11`	`7`	`16221`	`56.5`	`0.7`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
32	`37`		[ACE]C:0	`3`	`1`	`171`	`cf`	C	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`16221`	`56.2`	`-0.3`	`0.872`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
33	`38`		[ACE]B:0	`3`	`1`	`172`	`cf`	B	x,y,z	`1_555`	`7`	`2`	`16147`	`55.1`	`-0.2`	`0.872`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
34	`39`		[NAG]C:505	`11`	`1`	`363`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`12`	`7`	`16147`	`54.9`	`0.2`	`0.176`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`40`		[NAG]A:505	`5`	`1`	`365`	`◊`	A	x,x-y,-z+1	`6_556`	`9`	`7`	`16679`	`45.8`	`0.5`	`0.405`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`50.3`	`0.4`	`0.290`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
35	`41`		[MAN]C:503	`7`	`1`	`290`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`16147`	`44.7`	`2.0`	`0.398`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
36	`42`		[NAG]A:704	`1`	`1`	`363`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`7`	`4`	`16679`	`41.6`	`1.5`	`0.875`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
37	`43`		[NAG]C:505	`7`	`1`	`363`	`◊`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`5`	`1`	`359`	`40.3`	`0.7`	`0.102`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
38	`44`		[NAG]A:505	`5`	`1`	`365`	`◊`	[NAG]A:504	x,x-y,-z+1	`6_556`	`4`	`1`	`360`	`39.8`	`0.4`	`0.114`	`2`	`0`	`0`	`0.000`
39	`45`		[NAG]C:504	`4`	`1`	`358`	`◊`	[NAG]B:505	x,y,z	`1_555`	`6`	`1`	`360`	`37.3`	`0.4`	`0.099`	`1`	`0`	`0`	`0.000`
40	`46`		[NAG]C:705	`3`	`1`	`362`	`◊`	[NAG]B:705	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`362`	`31.7`	`1.7`	`0.325`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
41	`47`		[NAG]A:705	`3`	`1`	`361`	`◊`	[NAG]A:705	x,x-y,-z+1	`6_556`	`3`	`1`	`361`	`26.5`	`1.3`	`0.275`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
42	`48`		[NAG]B:704	`2`	`1`	`361`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`6`	`4`	`16147`	`20.5`	`0.7`	`0.622`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
43	`49`		[NAG]B:704	`2`	`1`	`361`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`2`	`16221`	`20.2`	`0.5`	`0.426`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
44	`50`		[MAN]A:503	`3`	`1`	`289`	`◊`	[NAG]A:504	x,x-y,-z+1	`6_556`	`3`	`1`	`360`	`17.7`	`0.4`	`0.204`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
45	`51`		[NAG]C:704	`2`	`1`	`358`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`2`	`16147`	`17.5`	`0.5`	`0.448`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
46	`52`		[NAG]A:705	`2`	`1`	`361`	`f`	[ACE]A:0	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`172`	`16.7`	`0.7`	`0.484`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
47	`53`		[NAG]B:705	`3`	`1`	`362`	`f`	[ACE]B:0	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`172`	`15.2`	`0.7`	`0.382`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
48	`54`		[NAG]C:504	`2`	`1`	`358`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`16221`	`14.5`	`1.0`	`0.577`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`55`		[NAG]B:504	`2`	`1`	`359`	`f`	B	x,y,z	`1_555`	`2`	`2`	`16147`	`11.6`	`0.8`	`0.462`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`13.0`	`0.9`	`0.519`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
49	`56`		[NAG]C:705	`3`	`1`	`362`	`f`	[ACE]C:0	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`171`	`13.4`	`0.6`	`0.387`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
50	`57`		[NAG]A:705	`3`	`1`	`361`	`◊`	A	x,x-y,-z+1	`6_556`	`4`	`3`	`16679`	`12.4`	`0.3`	`0.396`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
51	`58`		[NAG]A:504	`4`	`1`	`360`	`f`	A	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`16679`	`11.8`	`0.6`	`0.364`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
52	`59`		[NAG]B:705	`3`	`1`	`362`	`◊`	C	x,y,z	`1_555`	`3`	`2`	`16221`	`10.7`	`0.0`	`0.295`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	`60`		[NAG]C:705	`3`	`1`	`362`	`◊`	B	x,y,z	`1_555`	`4`	`4`	`16147`	`2.9`	`0.0`	`0.316`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
	*Average:*													`6.8`	`0.0`	`0.306`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
53	`61`		[MAN]B:503	`3`	`1`	`294`	`◊`	[NAG]C:504	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`358`	`10.6`	`0.4`	`0.186`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
54	`62`		[NAG]A:704	`1`	`1`	`363`	`◊`	A	x,x-y,-z+1	`6_556`	`2`	`1`	`16679`	`9.7`	`0.3`	`0.434`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
55	`63`		[MAN]A:503	`3`	`1`	`289`	`◊`	[MAN]A:503	x,x-y,-z+1	`6_556`	`3`	`1`	`289`	`7.1`	`-0.2`	`0.074`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
56	`64`		[MAN]C:503	`2`	`1`	`290`	`◊`	[MAN]B:503	x,y,z	`1_555`	`3`	`1`	`294`	`7.1`	`-0.0`	`0.202`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
57	`65`		[NAG]C:704	`4`	`1`	`358`	`f`	C	x,y,z	`1_555`	`5`	`5`	`16221`	`6.1`	`0.2`	`0.374`	`0`	`0`	`0`	`0.000`
58	`66`		[MAN]C:503	`2`	`1`	`290`	`◊`	[NAG]B:504	x,y,z	`1_555`	`1`	`1`	`359`	`1.4`	`0.1`	`0.194`	`0`	`0`	`0`	`0.000`

PDBe PISA v1.52 [20/10/2014]

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