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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF05677 alignment
(5 sequences with 1116 bp)


Q9Z6X9_CHLPN/13-370 GATACGATTCTAGAGACGGATCCAAAGCCGTCTTTAATCATGTTCTCTTCAAAAAAAACAGAGATAGCTTCTGAAAGACGGAAGGCCCATCCCACCTTATTTAAAGTTCTAGGAACGATTTGGAATATTGTGAAGTTTATTATCTCAATCATTCTGTTCCTTCCCTTAGCGTTATTGTGGGTACTCAAGAAAACCTGTCAGTTTTTCATTCTCCCATCTTCTATC------ATATCTCAG---AGCATGTCA---------AAAACAGCTGTGGCAATTCGGCGAATGACCTTTCTGTCCCATATTAAACAACTCCTAAGCCTTAAGGAAATCTCAGCTGCCGATCGTGTGGTTATACAATATGACGATTTGGTGGTTGATAGCTTAGCTATAAAGATACCTCATGCTCTTCCCCACAGGTGGATTCTTTATTCTCAAGGAAACTCTGGATTGATGGAAAAC------CTGTTCGATCGGGGCGATTCC---------TCTCTACACCAGCTAGCCAAAGCAACCGGCTCGAATCTTCTTGTGTTCAACTATCCTGGAATTATGTCCAGCAAAGGAGAAGCGAAACGAGAAAATCTGGTTAAATCGTATCAGGCATGCGTACGCTACCTACGAGATGAAGAGACAGGTCCTAAAGCCAATCAAATCATAGCTTTCGGATACTCTTTGGGAACTAGTGTCCAAGCTGCTGCTCTAGATCGTGAGGTCACTGATGGCAGTGATGGAACTTCATGGATTGTTGTAAAAGATCGGGGCCCTCGCTCTCTAGCAGATGTCGCGAATCAAATTTGTAAGCCCATAGCTTCCGCGATTATAAAACTCGTTGGTTGGAACATAGACTCTGTGAAACCTAGCGAAAGATTGCGTTGTCCCGAAATTTTCATTTACAACTCTAATCAT---GATCAAGAACTCATTAGCGAC---GGCCTCTTCGAAAGAGAAAATTGCGTAGCAACACCTTTTCTAGAGCTTCCTGAAGTA---AAAACCTCGGGGACTAAAATTCCTATACCCGAAAGGGATCTTCTCCATCTAAATCCTCTCAGTCCAAATGTAGTAGACAGATTAGCAGCAGTGATCTCTAATTATTTAGAT
P94660_CHLCV/12-372 AATTCCCTGATCACGATGAACCCACAACCTGAAATTTTAATATTTTCCTCAGAAGCGGCTCGTCAGGCGCATAGGAGGCGAACTCTTTACCCCGTAATTTACAAGATACTTGATGTCATTTGTGAAATTATTAAGTGCATTTTCCGCATTATTTTGTTTATTCCGTTCGGATTACTTTGGGTATTGGGGAAGATTTGTCAGAATTGTTTGCTTCCGGCTGCTGGAGGGCTATTCACAGAG---CAGCTATGCTTTGCG------------AAAAAAATATTGCAAGAGAGTTTTCGTTGTTATGTGGACGATTGGCTAGAGAGTGGTTATGCAAGTTCTGTAAAGCGTATTCCTATTCAATGTGATGATTTACTCATTGACGCCATTAGTATTCAATTCCCTGATGCTGAAAAAGATAGATGGATGCTGGTTTCCTTAGGGAATAGCGAATGTTTTGAAACTAGAGCTATGGTTTACTCTCGTAATGAT---------TGGATATTGAATGTGGCGAAACAAGCGCGGGCTAATGTTGTAGTATTTAACTATCCAGGGGTGATGCATAGCAAGGGCCCCATTACACGGGAGTCTTTAGGAAAGGCTTATCAGGCATGTGTTCATTATCTTCGAGATCACCCTGACGGACCGAAGGCAAAACAAATTATAGCTTACGGCTATTCTTTAGGAACCCTAGTACAAGCGTTAGGATTGAGCAAGGAAGTCGTCGATGGAAGTGACGGGGTCGATTGGTTTGTCATTAAAGACCGTGGACCGAGGTCAGTTGCGGCGATAGCATCTCAATGGCTCGGGAAAGTTGCTGGATGGACAGCAACACAGTTAGGTTGGGAAATCAATTCGGCAAAATACAGTGAATCTCTTGTTTGCCCAGAATTATTCATACACGGAGAGGATTAC---CAAGCTCAACTCATAGGAGAT---GGTATGTTCAATAGGGATAATTGTTTTGCAGCACCATTTTTAGATCCT---AATGCTCCTAAATTCCCTGGAAAGAAAATTCCTGTAGGGGAGTTCCTACTACAGCATAAGGGAGAGCTTGATGAGACGACCATACAGAATGTAGTTAAACACATCATAGATCACTATAGT
Q9JS10_CHLPN/11-372 GCAGCTATATTGGATATGCATCCTAAACCTTCGATCGCCATGTTTTCTTCGGAGCAGGCGAGAACTTCTTGGGAGAAACGACAGGCTCATCCTTACCTTTATCGTCTTCTTGAGATCATATGGGGTGTTGTGAAATTTCTTCTCGGCTTAATCTTCTTTATTCCCTTGGGTCTTTTCTGGGTCCTTCAGAAGATATGTCAGAATTTTATTCTTCTTGGTGCAGGAGGGTGGATTTTTAGA---CCCATATGCAGGGAC------------TCTAATTTATTGCGACAAGCTTACGCCGCGCGTCTTTTCTCCGCTTCATTCCAAGATCATGTCTCCTCTGTGCGAAGGGTTTGCTTACAGTATGACGAGGTCTTTATTGACGGATTGGAGTTACGTCTTCCCAATGCTAAGCCAGATCGATGGATGTTAATCTCCAATGGAAACTCCGATTGCTTAGAGTATAGGACAGTGCTGCAAGGGGAAAAGGAC---------TGGATATTCCGTATTGCTGAAGAGTCTCAATCCAACATTTTAATCTTCAATTACCCAGGAGTCATGAAGAGCCAAGGGAATATAACAAGAAACAATGTAGTCAAATCTTATCAAGCATGCGTACGCTATCTTAGAGATGAACCCGCAGGACCTCAGGCGCGTCAAATCGTTGCTTATGGCTATTCTTTAGGAGCTAGTGTTCAAGCCGAAGCATTAAGTAAAGAGATCGCAGACGGAAGTGATAGCGTCCGTTGGTTTGTCGTTAAAGATCGAGGAGCTCGCTCTACAGGAGCCGTTGCTAAACAGTTTATTGGAAGTCTAGGAGTTTGGCTGGCGAATCTTACCCATTGGAATATTAATTCTGAAAAGAGAAGCAAGGACTTGCATTGCCCAGAACTCTTTATTTATGGCAAGGATTCC---CAAGGTAATCTTATCGGGGAT---GGATTGTTCAAAAAAGAGACGTGCTTCGCAGCACCATTTTTAGATCCTAAAAACTTGGAAGAGTGTTCAGGGAAGAAAATCCCTGTAGCTCAGACCGGTCTAAGACACGATCATATCCTTTCCGATGATGTGATTAAAGAAGTTGCAGGTCATATTCGAAGACATTTCGAT
Q9K1U7_CHLPN/1-363 TTGTCAGGAATATTTTCAAATCCTCATCCA---GTTTCCTATTTTTCGTCAACACACGCCAAGCAGTTAAGTGACTTTAGTAAGAAGCACCCCATACTCACCAAAATTGTTACGATCATTGTTAAAATTTTCAAACTCTTAATCGGTCTGATTATT---CCGCCCCTGGGAATTTATTGGTTATGTCAATTAGTATGTTCCTTGGCTCTTTTCCCCCGTTCTTCGATGCTTTACAGCGTCTTGAAAACCTGCTTTAAAAAGTATCGTTTGGAACAGGAAATACAAGATTATTTTGTAAAGAATCTAGATCCCTCTTTCAAAGACCCAGCAGTCTCGGAAAGTAAAAGAATCACGATCCAACAAGACCATCTTACCATTGATACTTTAGCAATACATTTCAGTACGGCAAGGCCTAAACGTTGGCTGCTGATTTCTCTAGGAAGTGGAGATTTCCTCGAAGAC------ATGATAGGCCTGAAAGATTCCTTGTTTCTCTCCTGGAAAGAGTTAGCTAAACTGCTAGGCGCTAATATCCTAATTTACAACTATCCTGGGGTTAAGTCGAGCACAGGAAAATTGAACTTAGAGAACCTAGCGACAGCTCATAATCTATGTGCAAAGTACCTACAAGATAAAATTCAGGGCCCTGGGGCTAACGAAATCATCACCTACGGATATTCCTTAGGAGGGGTAGTCCAGTCTGCAGCTTTGCAAAAAAATCCTTTTACAAATAGCGAG---ACTTCTTGGGTAGCAGTCAAAGACCGTGCTCCCCACTCTTTACCCGCAGCTGCTAATAGTTTCTTCGGGCCAATAGGAAAACTCATCGCAGTCCTCGCTCGATGGAAAATGGATGCGGAAAAAAACAGCCGAGAGCTTCCTTGCCCAGAAATTCTTGTTTATTCTGCGGATCGATTTCGCCCTTCAGAAGTTGGTGATGATACCGCATTGCTCCCGGAGTTTACTCTTGCTCATGCAATAAAACGAACCCCATTTGCC------------AGGAGTAAAAAATTTATAGGAGAGGTAAATCTACTCCACTCAAGCCCTCTGAAACACCCTACAATACAAAAGCTTGCTGAAGCAATCCTTGAGAGTCTCTCT
Q9JRV1_CHLPN/12-369 GAGGATATTTTACATTCCCACCCTTCTCCACAAGCGACTTATTTTTCTTCAACACGCGCCCAAAAACTTCATGAGTTTAAAGACAGGCATCCCGTGCTTACACGGATTGCTTCTGTAATTATTAAAATTTTTAAAGTTCTGATAGGGCTGATCATC---CTTCCCTTAGGAATCTACTGGCTATGTCAAACGCTTTGTACAAACTCGATTCTCCCTTCCAAGAATTTATTAAAAATTTTC---------------AAGAAGCAACCCAACACTAAAACCTTAAAAACTAATTATTTGCGTGCTTTGCAAGATTATTCCTCGAAAAACCGCGTTGCTTCCATGAGACGAGTTCCTATCCTCCAGGATAATGTTCTCATCGACACTTTGGAAATATGCCTTTCACAAGCACCTACGAATCGTTGGATGCTCATTTCTTTAGGAAGTGACTGTAGCTTGGAAGAAATCGCTTGT------------AAGGAGATCTTTGATTCTTGGCAAAGATTTGCCAAGTTGATAGGGGCCAATATACTCGTTTATAACTACCCCGGAGTCATGTCCAGCACAGGGAGCAGCAGCCTAAAGGACCTAGCATCAGCTCATAATATTTGTACAAGATACCTTAAAGATAAAGAACAGGGCCCTGGAGCAAAAGAAATCATTACCTATGGGTACTCCCTAGGAGGTTTGATACAAGCAGAAGCATTGCGAGACCAGAAGATTGTTGCAAACGATGATACTACTTGGATAGCAGTCAAAGATAGGTGTCCTCTCTTTATATCTCCAGAAGGTTTCCACAGTTGCAGACGCATAGGAAAGCTAGTAGCTCGTCTTTTTGGCTGGGGGACCAAAGCCGTAGAGAGAAGCCAAGACCTTCCCTGCCTAGAAATTTTTCTCTATCCTACGGATTCCTTACGAAGATCAACAGTCAGACAGAACAAGCTCTTAGCACCTGAACTTACTCTCGCTCATGCGATAAAAAATAGTCCCTATGTTCAA------------AATAAAGAATTTATAGAAGTACGATTATCGTCTGATATCGATCCCATCGACAGCAAAACAAGAGTGGCTCTTGCCACACCAATTTTGAAAAAGCTCTCT