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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF05031 alignment
(18 sequences with 534 bp)


Q99TD3_STAAN/101-232 AATAAAGAACATGATATAGGTCCAAGAGAACAAGTCAATTTCCAGTTATTAGATAAAAACAATGAAACGCAGTACTATCACTTTTTCAGC------------ATCAAAGATCCAGCAGATGTGTATTACACTAAAAAGAAAGCAGAAGTTGAATTAGACATCAATACT------...---...---GCTTCAACATGGAAAAAGTTTGAAGTCTATGAA---AACAATCAA..........................................AAATTACCAGTG---------AGACTTGTATCATATAGTCCT..............................---GTACCAGAAGACCATGCCTATATTCGATTC...---CCAGTTTCAGATGGCACACAAGAATTGAAAATTGTTTCTTCGACTCAAATTGATGATGGA---.........---GAAGAAACAAATTATGATTATACTAAATTAGTATTTGCTAAACCTATTTATAACGATCCTTCACTTGTGAAATCA
Q99UX5_STAAM/140-269 GATAAAGATCATAGCGCACCAAACTCTCGTCCAATTGATTTTGAAATGAAAAAAGAAAATGGTGAGCAACAATTTTATCATTATGCCAGCTCT------------GTTAAACCTGCTAGAGTTATTTTCACTGATTCAAAACCAGAAATTGAATTAGGATTACAATCA------...---...---GGTCAATTTTGGAGAAAATTTGAAGTTTATGAA---GGTGACAAA..........................................AAGTTGCCAATT---------AAATTAGTATCATACGATACT..............................------GTTAAAGATTACGCTTACATTCGCTTC...---TCTGTTTCAAATGGAACAAAAGCCGTTAAAATTGTAAGTTCAACTCACTTCAATAAC------.........---AAAGAAGAAAAATACGATTACACATTAATGGAATTCGCACAACCAATTTATAACAGTGCAGATAAATTCAAAACT
Q99TD3_STAAN/341-471 GATAAAGAACATACAGCTGATAATTGGCGACCAATTGATTTTCAAATGAAAAATGATAAAGGTGAAAGACAGTTCTATCATTATGCTAGT------------ACTGTTGAACCAGCAACTGTCATTTTTACAAAAACAGGTCCAGTAATTGAGTTAGGTTTAAAGACA------...---...---GCTTCAACATGGAAGAAATTTGAAGTTTATGAA---GGTGACAAA..........................................AAGTTACCAGTC---------GAATTAGTATCATATGATTCT..............................------GATAAAGATTATGCCTATATTCGTTTC...---CCAGTATCTAATGGTACGAGAGACGTTAAAAATGTGTCATCTATTGAATATGGTGAGAAC---.........---ATCCATGAAGACTATGATTATACGCTAATGGTCTTTGCACAGCCTATTACTAATAACCCAGACGACTATGTGGAT
Q9KGV9_LISMO/30-177 GATTCTCGTCTGAAAGATGGCGGGGAATACCAAGTTCAAGTGAATTTTTATAAAGATAATACTGGTAAGACAACGAAAGAATCTTCAGAAGCAGATAAATATATTGACCATACAGCAACGATTAAAGTGGAAAATGGTCAACCTTATATGTACTTAACAATTACAAAT------...---...---AGTACTTGGTGGCAAACAATGGCGGTTTCA---AAAAATGGAACTcgtcctgaaaaacccgcacaagcggatgtttaccaagaccgtTATGAAGATGTT---------CAAACAGTGAGCACTGATGCA..............................------GCAAAAGATACGCGTGTAGAGAAATTC...---AAGCTTAGTTCTTTAGATGATGTTATTTTCTCCTATATGCATATTAAGGTAGATGCA------.........---ATTAGTTATGATCACTGGTATCAAGTGGATTTAACTATTGATCCAAGTACTTTCAAAGTCATCTCAGAACCTGCT
Q9K7R0_BACHD/31-160 CATGCGCAGAATCTGGCGGATGGTACATACACAATCCAATATACGGTTCTGCATGCCGATAACGATTCG------------GCTTCAATGGCGAATGATTATTGGGAAAAACCTGCGCGCTTGACGGTTAACGGTGGCAACATGACCATGCAAATGACGATTAACCAT------...---...---AGTTCATGGGTAACAGAATTTAAAGTGCCG---AGCAATGGTGGC..........................................TTCCGTGATGTA---------ACGGTTGTCAGTACGGACGAA..............................------GCAGCGGATAAGCGGGTCGTTGAATTT...---CCAATTTCAGATCTATCAACTCCGTTAGAGTCAAAGATTCACGTGACGGTGGAAGAT------.........---ATCGACTATGACCATGATTATACGATTCGTCTTTCCTTTGATACGAGCAGTATCCAAGAAGTAAATGTAGCAAGC
Q9KGV9_LISMO/356-488 CCGAAAAATCTACTGAACAACCATACGTACTCGATTGATTTTGATGTATTTAAAGATGGAACAACAGAA------------ACTTCCATGATGGAAAGCTATGTGATGAAGCCAGCTTTAATCAAAGTTGAAAATAACCAACCCTATGTTTATTTAACTTTAACAAAC------...---...---AGTAGTTGGATTAAAACCTTCCAGTATAAA---GTAAATGGTGTT..........................................TGGAAAGATATG---------GAAGTTGTTTCCGGAGATATC..............................------AACAAAAATACGAGAACCGTCAAGTAT...---CCTGTGAAAGATGGTACGGCTAATACAGATGTAAAAACGCATGTATTAATTGAAGATATGCCA.........GGTTTTTCTTATGACCATGAGTATACTGTTCAAGTAAAACTAAATGCAGCAACGATTAAAGACATTACAGGGAAAGAT
Q9K7R1_BACHD/868-998 CCTGAAGAAGGGTTGAAGGATGGAGAGTATACCATTGACTTTACGGTCTTGAAAAATAACACAAACGAA------------GTTTCTGTAATGGATGATTACACCGTAAAGCCAGCGATTTTGTCTGTAGAAAATCAAGAAACGTATGTTACTGTGACTTTAAAGAAT------...---...---AGTGAATGGATTAAAGTGTTCCAAACTGAG---CAAGACGGGACA..........................................TATGTTGATGCA---------GAAATCGTCTCAGTCAATGCA..............................------GTGGAAGATACACGTGATGTGCGCTTC...---TATGTTGAAGATCTAGAGGAACTGGTTCATGCATACACGGAAGTTTATTTTGAAGAGCCA---.........---ATCTTATATGACGGCAAGTATTTTGTTCAATTTGACTTTGATGTTCATAGCATTACACCGCTCGGAGAAGGCGGT
Q9K7R1_BACHD/705-834 CCAACAACAGGCTTACCTAATGGCACATATACGATTGATTTTACAGTGCTAAAGCATAACACCAACGAA------------GTTTCCGTGATGGATAACTATACAGAAAAACCAGCAACACTCGTTGTTCAAGACGGACAACAAACGATTGATTTAACGTTGACGAAT------...---...---AGTGATTGGATTAAGCTGTTCCAAACGAAG---CAAAATGGTGAG..........................................TATGTCGATGCC---------GAAGTTGTTTCAGCAGATACA..............................------GCAGCCAATAAGCGAGTCGTTCGGTTT...---GACGTTCAAGACCTTTCAGCCAAGCAGTCTGCGTATACCCATGTGGTCATTCCAGAG------.........---CTTCAATACGATAACTTCTATGAGGTGCACATTCGTTTTGATACGAATAGCATTCGGGACGAGGATGGTAACATT
Q9K7R1_BACHD/376-505 GATGAAACCGAATTAGCGGTCGGGGAATATACGATCGATTTTATGGTTTTAAAAGATGGGACAAATGAT------------ACATCCGTTATGGACGGCTATACAGAAAAACCAGCTCATCTGACAGTAGAGGAAGCTGGGGCCTATGTAGACTTAACGTTGACGAAT------...---...---AGCGATTGGATCAAGCTATTCCAAACGAAG---CAAAATGGTACA..........................................TTCGTCGATGCG---------GAAGTCGTTTCAGAGGATGCG..............................------GAAGCAAACAAGAGAGTCGTTCGCTTC...---CCAATTGACAATGTCCATGAACAGCTTGACGCGTACACGCATGTCGTCATTCCAATG------.........---ATTAACTATGATAACTACTACACCGTGCAGCTTTCGTTTGATGTTAATAGCTTGAAGCCAGCAGATAATGAATCC
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Q9KGV9_LISMO/180-311 ACACCTGTGACTCTTTCGGATGGAATTTATACGATTCCGTTTGTAGCGAAAAAAGCAAATGATGATAGC------------AATTCAAGCATGCAAAATTATTTTAACAATCCTGCTTGGTTGAAAGTGAAAAATGGTAAGAAAATGGTAGCAATGACAGTTAATGAT------...---...---AATAAAACAGTAACAGCTTTAAAAACAACT---CTTGCTGGAACT..........................................TTACAAGATGTA---------AAAGTTGTTTCTGAAGATAAA..............................------GATGCTAATACACGTATTGTGGAGTTT...---GAAGTGGAGGACTTAAATCAACCACTTGCGGCTCATGTTAATTATGAAGCGCCTTTCAATGGT.........---TCTGTATACAAAGGACAAGCAGACTTCCGTTATGTTTTTGACACAGCGAAAGCAACTGCAGCAAGTTCATACCCA
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Q99UX3_STAAM/23-154 AGTAATTCTGCAAATGCCGCAGATAGCGGTACTTTGAATTATGAGGTTTACAAATACAATACCAATGAC------------ACGTCAATTGCTAATGACTATTTTAATAAACCGGCAAAGTACATTAAGAAAAATGGTAAATTGTATGTTCAAATAACTGTCAACCAC------...---...---AGTCATTGGATTACTGGAATGAGTATCGAA---GGACATAAA---..........................................------------------GAAAATATTATTAGTAAAAACACT..............................------GCCAAAGATGAACGCACTTCTGAATTT...---GAAGTAAGTAAGTTGAACGGTAAAATAGATGGAAAAATTGACGTTTATATCGATGAAAAAGTAaatggaaagCCATTCAAATATGACCATCATTACAACATTACATATAAATTTAATGGACCAACTGATGTAGCAGGTGCTAATGCACCA
Q99UX4_STAAM/58-188 AGCACACAAGTTTCTCAAGCAACATCACAACCAATTAATTTCCAAGTGCAAAAAGATGGCTCTTCAGAG------------AAGTCACACATGGATGACTATATGCAACACCCTGGTAAAGTAATTAAACAAAATAATAAATATTATTTCCAAACCGTGTTAAACAAT------...---...---GCATCATTCTGGAAAGAATACAAATTTTACAATGCAAACAATCAA..........................................GAATTAGCAACA---------ACTGTTGTTAACGATAATAAA..............................------AAAGCGGATACTAGAACAATCAATGTT...---GCAGTTGAACCTGGATATAAGAGCTTAACTACTAAAGTACATATTGTCGTGCCACAA------.........---ATTAATTACAATCATAGATATACTACGCATTTGGAATTTGAAAAAGCAATTCCTACATTAGCTGACGCAGCAAAA
Q99YA0_STRPY/365-507 TCTATTAACAATCTCACAGAAGGAACCTATACGCTAAACTTTAAAGCTAATAAAGAAAACTCAGAAGAG------------TCCTCCATGCTTCAAGGTGCTTTTGATAAAAGAGCCAAATTAGTGGTTAAAGCAGATGGTACAATGGAAATTTCCATGCTTAATACTGCTTTG...---...---GGACAATTTTTGATTGACTTTTCTATTGAA---AGCAAAGGGACC..........................................TACCCAGCAGCAGTGCGTAAACAAGTTGGCCAAAAAGATATC..............................------AATGGTAGCTATATTCGAAGCGAATTTaccATGCCTATTGATGATTTGGATAAATTACACAAAGGTGCTGTTTTGGTATCAGCCATGGGAGGTCAAgaaagtgatTTAAACCACTATGACAAATACACCAAACTTGACATGACCTTTAGTAAGACCGTTACCAAAGGCTGGAGTGGTTATCAG
Q99UX5_STAAM/337-462 CCAACAAATGAAAAAATGACTGATTTACAAGATACAAAATATGTTGTTTATGAAAGTGTTGAGAATAAC------------GAATCTATGATGGATACTTTTGTTAAACACCCTATTAAAACAGGTATGCTTAACGGCAAAAAATATATGGTCATGGAAACTACTAAT------...---...---GACGATTACTGGAAAGATTTCATGGTTGAAGGTCAACGTGTT---..........................................---------------------AGAACTATAAGCAAAGATGCT..............................------AAAAATAATACTAGAACAATTATTTTC...---CCATATGTTGAAGGTAAAACTCTATATGATGCTATCGTTAAAGTTCACGTAAAAACG------.........---ATTGATTATGATGGACAATACCATGTCAGAATCGTTGATAAAGAAGCATTTACAAAAGCCAATACCGATAAATCT
Q99TD3_STAAN/539-664 CCTACAAATGATCAATTAACAGATTTACAAGAAGCGCATTTTGTTGTTTTTGAAAGTGAAGAAAATAGT------------GAGTCAGTTATGGACGGCTTTGTTGAACATCCATTCTATACAGCAACTTTAAATGGTCAAAAATATGTAGTGATGAAAACAAAGGAT------...---...---GACAGTTACTGGAAAGATTTAATTGTAGAAGGTAAACGTGTC---..........................................---------------------ACTACTGTTTCTAAAGATCCT..............................------AAAAATAATTCTAGAACGTTGATTTTC...---CCATATATACCTGACAAAGCAGTTTACAATGCGATTGTTAAAGTCGTTGTGGCAAAC------.........---ATTGGTTATGAAGGTCAATATCATGTCAGAATTATAAATCAGGATATCAATACAAAAGATGATGATACATCACAA
Q99YA0_STRPY/972-1135 AATCAAAAACAATTGCGTGATGGTATTTACTATTTAAATGCCAGCATGTTAAAAACTGACTTAGCATCT------------GAGTCCATGTCAAACAAGGCTATTAATCATCGAGTGACTTTGGTAGTTAAAAAAGGTGTTTCCTATTTAGAAGTTGAGTTTAGAGGTATAAAGgttGGTaaaATGTTAGGCTACCTTGGTGAATTGAGCTATTTCGTAGATGGTTACCAAagagattta.....................gctggtaaaccaGTTGGTCGAACAAAAAAGGCAGAGGTTGTGTCTTATTTCACGgatgtaactggcctaccattggcagatcgtTATGGAAAAAACTATCCAAAAGTGCTGCGTATG...AAATTGATTGAACAAGCGAAGAAAGACGGACTTGTGCCATTACAGGTCTTTGTGCCTATCATGGATgcc......ATTTCAAAAGGGTCTGGCCTTCAAACCGTTTTTATGCGTTTAGACTGGGCAAGCCTTACAACAGAGAAGGCAAAGGTT