EMBL-EBI > Goldman Group

PANDIT Home | Browse PANDIT | Help on PANDIT | Release notes | Pfam



PANDIT Homepage
pan•dit
PANDIT
Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF04075 alignment
(10 sequences with 450 bp)


Q9WX21_STRCO/11-134 GAC---GAGTTC------------------------CGCGCCAACGAGGGG---AAGGTCGGCGGCCCCTTCGAA......GGC---GGGGAT...CTGCTTCTGCTGACCACCACCGGCGCCCGGTCGGGGGCCTCGCGGACCACACCGCTC------GGTTACGTCCGCCACGGGGAGTCC------CTGCTCGTGGTCGGGTCCAACCTCGGTGGCCCGCGGCACCCCGGTTGGTACTACAACCTGCTCGCCCATCCCCTGGTCCGGGTGGAGGTGGGCGCGGCGGGTTTCGAGGCGCTCGCG---GTGCCCGCCGAG------GGGGAGCGGCGCGAGGAGCTGTTCGCGCACGTCGTACGGGAGGCGCCCGGG---TACGGCGACTACCAGGCCGGCACCAGCAGGCCG...CTGCCG---------GTCGTGGTGCTGGAGCAG
Q9ZH81_MYCPA/16-143 GAC---------------GACCACGTGCGCGCATACCGCGAAACCGGCGGC---GAGACCGGCTATCTGTGGAAC......GGC---GTTCCG...ATCTTGCTGCTCACGGTGACCGGGCGTCGCACCGGCCGCGCACTCACGTCGGCGCTG------ATCTTCGGCCGCGACGGCGACGAC------TATCTGGTGGTGGCCTCCATGGGCGGCGCGCCGCGGCACCCGTCGTGGTATCTGAATCTGCAAGCCAATCCGGCGGCCGGAATTCAGGTGCAAGCCGACGAGTTGGCGGTCGTGGCG---CGCACCGCGTCG------GCCGCCGAGAAGCCGCGGTTTTGGAAGATCATGACTGACGTGTGGCCCAAC---TACGACGTCTACCAGTCACGAACCGACCGCGAC...ATTCCC---------GTCGTTGTACTCACACCG
Y1292_MYCBO/12-148 GGCGTGCAGCTGCTCAGGCTGCACGACGCGATCTACCGAGGCACTAACGGT---CGGATCGGACACCGAATCCCC......GGC---GCGCCAccgAGTTTGCTGCTGCATACCACCGGCGCCAAGACGAGCCAGCCGCGAACCACGTCACTC------ACCTATGCTCGCGACGGCGACGCG------TACCTGATCGTGGCGTCCAAAGGTGGCGATCCCCGCTCGCCGGGTTGGTACCACAACCTCAAGGCCAACCCGGACGTCGAAATCAACGTCGGGCCCAAGCGATTCGGTGTGACAGCG---AAACCGGTGCAGCCCCACGACCCGGACTACGCGCGGCTCTGGCAGATCGTCAACGAGAACAACGCCAACCGATACACCAACTACCAGAGCCGGACGTCACGGCCA...ATCCCG---------GTCGTCGTATTGACCCGC
P71854_MYCTU/18-151 ATCAAGTGGATGTCACGGATTAATACCTGGATGTACCGCCGCAACGACGGGGAGGGTCTGGGCGGCACCTTCCAG......AAG---ATTCCG...GTCGCGCTGCTGACCACCACCGGCCGCAAGACCGGCCAGCCGCGGGTCAACCCGCTC------TACTTCCTGCGCGACGGTGGGCGG------GTCATTGTCGCGGCCTCCAAGGGCGGCGCGGAGAAGAACCCGATGTGGTACCTCAACCTCAAGGCCAACCCCAAGGTTCAGGTACAGATCAAAAAGGAAGTGCTGGACCTTACCGCG---CGGGACGCGACC------GACGAGGAGCGCGCCGAATATTGGCCACAGTTGGTCACGATGTACCCAAGT---TATCAGGACTACCAGTCCTGGACCGACCGCACG...ATCCCG---------ATCGTGGTTTGCGAACCC
O85698_STRLI/13-145 CAG---TGGGTG---CGCGAGCAGGTCGAGCGGTACGAGAGTTCGGGCGGC---ACCGAGGGCACGACGCTGATGgacaccGGT---CTGCCC...GTGATCGTCCTGACCACCCGGGGTGCGCGCAGCGGCAAGCTGCGCAAGACGCCGCTG------ATGCGCGTCGAGCACGAGGGCCGC------TATGCCGTGGTCGCCTCTCTCGGCGGGGCGCCCAAGCACCCCGTCTGGTACTTCAACGTGAAGGCCGATCCCCGGGTGGAGCTCCAGGACGGTCCGGTGAAGCAGGACATGACGGCG---CGTGAGGTCACC------GGCGCGGAGAAGGCCCGGTGGTGGGAGCGCGCGGTCGCGGCGTATCCGTCG---TACGCCGACTACCAGAAGAAGACGGAACGGGAG...ATCCCC---------GTCTTCGTCCTGGAGCCG
Y1584_MYCBO/13-143 GAC---TGGTCG---CGCGAGCAAGCCGACACGTATATGAAGTCCGGCGGA---ACCGAGGGCACACAGCTGCAG......GGA---AAGCCG...GTCATCCTGCTCACCACCGTCGGGGCGAAGACCGGCAAACTCCGTAAGACCCCGCTG------ATGCGCGTCGAGCACGACGGCCAG------TACGCGATCGTCGCCTCGCTGGGTGGGGCGCCGAAAAATCCGGTCTGGTACCACAACGTCGTGAAGAACCCACGGGTCGAGCTGCAGGACGGCACCGTGACCGGCGACTACGACGCC---CGCGAGGTGTTC------GGTGACGAGAAGGCCATCTGGTGGCAGCGCGCCGTGGCGGTCTGGCCGGAC---TATGCCAGCTACCAGACCAAGACGGACCGCCAG...ATTCCG---------GTGTTCGTGCTGACCCCG
P95144_MYCTU/6-129 AAT---CTCAAG---CGGGAATTCGTCCATCGCGTGCAACGGTTCGTGGTCAATCCAATCGGCCGGCAACTGCCG......ATG---------...---ACCATGCTCGAAACCATCGGCCGCAAAACGGGACAGCCGCGGCGTACCGCGGTG------GGCGGGCGCGTCGTAGACAACCAG------TTCTGGATGGTGTCCGAGCACGGC---------GAGCATTCCGATTACGTCTACAACATCAAGGCCAACCCCGCCGTGCGGGTCCGCATCGGCGGCCGATGGCGCAGTGGGACCGCC---TACCTGCTACCCGAC---GACGATCCGAGGCAGCGGCTGCGCGGCCTACCCCGGCTGAACAGTGCCGGC---------GTACGCGCGATGGGCACCGAC---TTG...CTGACC---------ATCCGGGTGGATTTGGAC
Q9KZZ9_STRCO/8-133 GAGCGGAAGTAC---CGGACCGTCACGGCCTTCCAGCGCCGGCTGAACGCC------GTGGTGCGCCGGCTGCCC......GGC---------...CAGACCCTGCTGGAGACCACCGGCCGCGTTTCGGGCCTCCCCCGCCGCACACCGGTG------GGCGGCCGCCGGGAGGGCGATTCC------TTCTGGCTGGTCTCGGAGTTCGGC---------GAGCGCTCGCAGTACATCCGCAACATCCGGGCCGACCCGCGGGTGCGGGTGCGCATCCGGGGCCGCTGGCACCCGGGGACGGCC---CACCTCCTTCCCGAC---GACGACCCGCTCGCCCGCCTGCGCCGCCTCCCCCGCCTCAACAGCGTGGCG---------GTGCGGGCGATGGGCGTCGGGACGGGGctgCTGACG---------GTACGGGTGGAGTTGGAG
Q9K447_STRCO/18-139 CGCCGGCTGGCCGCTCGCGCGCCCATCCTTCTGTTCCGGGCCGGACTGGGGCCCCTGCTCGGCAGACGGTTT---......------------...---CTGCTGCTGCACCACGTGGGCCGGGTCAGTGGAAGCGACCGCCGGGCGGTTCTCGAAGTCGTGGCGTACGAGGCGCCGTACCGC------TGCTGGACGGTCGCCTCC------GGCTTCGGTCCGCGCTCCGACTGGTACCGCAACCTGCGTGCCCAGCCGAAGACGGTCGTGCAGTTCGGCAACCGCCACCACGCCGTCACCGCC---CGTTTCCTCGCT------TCGGACGAGGGCGCCGACATC---------------------ATGACGGAC---TACGGGCGGCGCCACCCGCGCACCGCCCGTCGG...CTGTGC---------GCGTACCTGGGTCTGCCC
O06389_MYCTU/4-129 CCGCAGTGGCTG---------------GCTCGGTTCAATCGATATGTCACCAACCCCATTCAGCGGCTATGGGCC......GGCTGGCTCCCGgcgTTCGCGATTCTTGAGCACGTGGGCCGCCGCTCGGGCAAGCCGTACCGTACCCCGTTGAACGTGTTCAGCGCGGACGTCGACGGCCGGGCGGGCGTGGCGATTTTGCTCACCTACGGT---------CCGAACCGCGACTGGCTGAAGAACATCACCGCGGCCGGCGGTGGCCGGATGCGCCGCTACGGCAAAACCTTTGGTGTCGCCAACCCGCGGCGGCTCACC---------------AAGGCCGAGGCG---------------GCGCCGTATGTCAGC---------AGCCGATGGCGGCCGGTCTTTGCCAGA...CTGCCGTTCGACGAGGCCGTACTGCTCACCAAG