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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF03412 alignment
(34 sequences with 432 bp)


P74829_9SPHN/25-147 ------------GAATTGCGC...GAATCCGGGCTTGTGGCGCTGTCGCTGCTGCTCGGCGTCCACAACATCGCCGTCACCCCCGAACAGCTGCGGCACATGCTGGGC......CATGCCGAGGGTGCCAGCGTCGACGACCTGATCCTGCTCGCCAAGCGCCAGCAGGGCGTGCGCGCCAAGGCGGTGGACGTGCCGCGCGGC...------------------GGTCTGGCCCGCCAGCCGCTGCCGGCCATCGCCGACGGCCCGGAGGGCTGGTTCGTGATCGGTGGCCTGACC............---GAGCATGGCGTGATCATCCAGCGTCCC------GGCCACGCCCCCGAACAGGTCGACCGCGAGGGGCTGGATGCGCTGTGGTCCGGCacgCTCGTGCTGCTGACGACGCGCGCCGTGGCC
CYAB_BORPE/5-133 GTGGCGCAATGCGCCAGCGTGcccGATTCCGGGTTGCTCTGCCTGGTCATGCTGGCTCGCTATCACGGATTGGCAGCCGATCCCGAGCAGTTGCGGCATGAGTTCGCC......------GAGCAGGCATTCTGTAGCGAAACGATACAGCTGGCGGCGCGCCGGGTCGGCCTGAAAGTGCGGCGGCACCGACCCGCGCCGGCG...------CGGCTGCCACGCGCGCCGCTGCCGGCCATCGCGCTG------------GACCGGCAGGGCGGCTACTTTGTTCTTGCCCGCTTCgag...cccggcGCGGACCAGGCCGTACTCATCCAGCGTCCG------GGCCAGGCGCCCGCGCGCCTGGGGCAGGCCGAGTTCGAGGCGCTGTGGGCGGGG...GAGCTGCTGCTTTGTGCTTGCGCGGCCAGC
HLYB_PASSP/5-131 ---------CATCAAAGCAAT...GATCTTGGATTAGTTGCTCTGAAAATGCTTGCCCAATATCATAATATTCCCCTCAATCCAGAAGAAATAAAACATAAATTTGAT......ATCGAAGGAAAAGGTCTCACCTTAACTTCTTGGCTATTGGCTGCAAAATCATTAGAACTTAAAGCCAAACATATTAAAAAAGAAATTTCC...---------------CGCTTGCACTTAGTTAACTTGCCTGCATTGGTATGGCAAGACAACGGTAAGCACTTTTTATTGGTAAAAATCGAT............ACCGATAAAAAACGTTACTTAACTTATAATTTAGAGCAAGATGCCCCCAAGATCCTCTCTCAGGAAGAGTTTGAAAGTTGTTACCAAGGA...AAAATTATCCTAGTCACTTCAAGGGCTTCT
RT1B_ACTPL/4-130 ---------TATCGGGAAGAA...GACTACGGATTATACGCACTGACGATTTTAGCCCAGTACCATAATATTGCTGTAAATCCGGAAGAACTAAAACATAAATTCGAC......CTTGAAGGAAAAGGCTTAGATCTAACCGCTTGGCTATTAGCCGCAAAATCATTAGAACTTAAAGCAAAACAAGTAAAAAAAGCGATTGAT...---------------CGTTTGGCGTTTATCGCACTACCGGCACTTGTATGGCGAGAAGACGGTAAACATTTTATTTTGACTAAAATTGAT............AATGAAGCAAAAAAATATTTAATTTTTGATTTGGAAACGCATAATCCTCGCATTTTGGAACAAGCGGAATTCGAGAGCTTATACCAAGGA...AAACTGATTTTAGTTGCATCAAGAGCTTCC
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Y390_MYCPN/4-131 ATTTATCAAGAACAACCCAAC...GAATGTGGCATTTGTGTGCTTGGCATGTTAGCCAATGAACTGCATGAGGATAAGTATGCCCATGATGAACTGTTGGAACAAATT...aacCTACCAGCTAGTGGTTTGAGTTTCTTTGAACTAGAGACCTATGGCAAGAAGTTTGGTCTCGAAATTGCTAGTTACCAGCTAACCCTA---...---------------GAAGAGCTCAAACAACTAGAGGGTAAATACTTTATTGTCCACTTCCCTAAGCATTTTGTGGTGGTGCATAAAAAA............CAAGATAATCTCTGGGAAGTATTTGACCCC------GCTAAAGGGAAATATCTTTTAAATGATGAAGAATTAAAGAAACAGTGAACTGGT...TATGCCGCTACAGTGCAAAAATCATTTAAA
SUNT_BPSPC/10-143 ACTAAACAGTTTAATAGTCAT...GATTGTGGACTAGCTTGTATCTCGTCAATTTTAAAGTTTCATAACCTTAACTATGGAATTGATTTCTTACTAGACCTAATTGGG......---GATAAGGAAGGCTATAGTTTAAGAGACTTAATTGTTATTTTTAAGAAGATGGGGATAAAAACTAGGCCACTTGAATTGCAAGAAAATaagACATTCGAAGCCCTAAAACAAATAAAGCTCCCTTGTATAGCTTTGTTAGAAGGGGAGGAATATGGACATTACATAACAATATACGAAATT............AGAAATAACTATTTACTTGTTAGTGATCCTGAT---AAAGACAAAATAACTAAAATAAAAAAAGAGGATTTTGAAAGTAAATTCACAAAC...TTTATATTAGAAATTGACAAAGAGTCAATT
O53037_HAEIN/41-169 ATTAGGCAAACAAAAAATAAT...TCTTGTGGAGCAGCAGCTCTTGCCACAATGCTAAAATATAAATTTCATATTAGTGAAATTAACGAAGATACTATTCTATATAAAttgaaaAATCCAAATGAAGAAGCATCCTTTTTTGAACTTGCAAGAATTTCAAAAGAATTCAATATAAATGCTATTGGATTAGCATTAACGTTAAAG...------GAATTATTAAACATAAATAAACCAGTAATTGCCTATGTAAACAACAGTTTAAACAATGATCATTTTATTATCATCAATGGTATT............TTTAATAAAGAGTTATTAATATCAGATCCA------GCAATTGGAAATTACTCACTAAAAGTTTCTGACTTTGAAAAAATATGGCTATTGagaAATGATAAAAAAGGA---------------
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Y1463_METTH/16-142 GTCATGCAGAGCAGGAGCTAC...AGCTGTGGACCGGCAGCGCTTGCAACGGTCCTCAGAAACCTTGGAGTGAACTGTACCGAGGCAGAACTTGCAGAACTTGCAGGT......ACAGACGAATCAGGTACCACAATGTATGGACTGATCGTTGCAGCAACTTCAAAGGGCCTGAGAGCAAGGGGAGTTAAAATGGAACTCAAT...------------------GATCTTAGAAAAAACCACATAGTCTTTGTTAAGTATGGAGACACATGTCACTACACAGTCATCATGTCCATG............GATGAGAGAAATGTCACACTTGCAGACCCT------GCACTTGGGAGGATCACAGTTAAGAGGGAGATATTTTCAAGGATCTTCACGGGC...AATGTCCTTGTTGTTGAAAGACCCTGTGAT
Q9RJD7_STRCO/33-163 GTGCTCCAGATGGAGGCCGTG...GAGTGCGGTGCCGCCTCCCTCGCCATGGTGCTGGGACACTACGGCCGCCATGTCCCCCTGGAGGAGCTGCGGATCGCCTGCGGT......GTCTCCCGCGACGGGTCCCGGGCGAGCAACCTGCTGAAGGCCGCGCGGAGTTACGGGTTCACCGCCAAGGGCATGCAGATGGACCTGGCC...------------------GCCCTCGCCGAGGTGACGGCACCGGCCATCCTCTTCTGGGAGTTCAACCACTACGTCGTCTACGACGGCATGggccgccggttcGGGCGGCGCGGGGTGTTCATCAACGACCCG------GGCAAGGGACGCAGGTTCGTGTCCCTGGAGGACTTCGACGGGTCCTTCACCGGT...GTCGTGCTGACCATGGAGCCCGGTGACGGC
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MESD_LEUME/14-148 ATTTCACAAGTAGATGAACGT...GATTGTGGTGTGGCTGCACTCGCTATGATTTTAGCTCATTACAAAACACGCCTATCTTTAGCCAAGCTACGTGATTTAGCCAAA......ACGGATATGGAAGGAACGACTGCTTTAGGCATTGTTAAAGCTGCTAATGCGCTAGACTTTGAAACTATGCCGATTCAGGCTGACTTGAGT...TTATTCGATAAAAAAGATTTACCCTATCCTTTTATTGCTCATGTGATTAAAGAAGGCAAATACCCGCATTACTACGTTGTCTATGGCATG............AAAGGTGATCAGCTATTAATCGCTGATCCAGATAATACCGTTGGGAAGACTAAAATGACGAAAGCGCATTTTAATGAGGAGTGGACCGGT...GTGTCCATTTTTATTGCGCCAAATCCAACC
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Q9RC21_BACSY/8-137 GTAAGGCAAATGGGACAATAT...GAGTGTGGGCCCGCCTGTCTCACCATGATTTTAAGTTATTATGGGAGTACTATATCTCTAAATAAAATAAGTGAACAATGTGAT......GCCCAAAGAAATGGCGTATCTGTATCCATTTTAAAATCAGTATCAGAATATTATGGGCTTAACTGCAAAGTATACCAAGTTTCGTTTAAA...---------GATTTGAAAAAATATATCAATTCATATCTTCCCTGCATCATATTTTGGGATGAACGGCACTTTGTGGTTTTAGAACAGATT............AAAAAAGGTCTTTTTCATATAATTGACCCC------AACAGAGGAAAATTGAAATTATCCGAAGAAGAATTTAAAAGACATTATAGCAAG...GTAATCTTGACTTTTAAGAAGTCAGATAAA
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LCN3_LACLA/4-135 GTTTTACAAAATAATGAGCAG...GATTGTTTGCTAGCATGCTATTCAATGATATTGGGATATTTTGGTAGGGATGTTGCAATACATGAGCTTTATAGTGGGGAAATG......ATCCCGCCTGATGGCTTGTCTGTTTCATATTTAAAAAATATTAATATGAAGCATCAAGTTAGTATGCATGTTTATAAGACTGATAAAAAG...AAT---TCTCCAAATAAGATATTCTATCCAAAGATGCTGCCTGTAATTATACAATGGAATGATAATCATTTTGTTGTAGTAACTAAGATT............TACAGAAAAAATGTAACACTCATTGACCCT------GCAATAGGTAAAGTGAAGTATAACTATAATGATTTTATGAAAAAATTTTCTGGT...TATATTATTACTTTATCACCGAATAGTTCT
Q9ZAB2_STRMU/4-134 GTATTACAAAATAATGAGCAA...GATTGTTTAATTGCCTGTTATGCAATGATTCTTTCCTCTTTTGGCTGTAATGTTAGTCTAGAAGATCTATACCTTGATGAATAT......ATTCCGCCAGACGGCCTATCCGTTTCATATTTACATAGTTTAAATACTAAATTCCGTCTTAAGATGCAAGTATTAAAAGGCGATGGGCAA...CAA---GTTCTTGAATATATCTATCAACATAAATGTAAG---GCAATCGCCTACTGGAAAAATAGCCATTTCGTTGTTGTTGATAAATGT............ACTAAGAAGTCGGTCAATATAATGGATCCT------AGTTTAGGCACAATAACTATTCCTATAAGCAGTTTCCTTGATAACTTCAGTAGC...TATATTTTAATCTTTTCTAAGCAGTCTAAC