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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF02355 alignment
(19 sequences with 627 bp)


SECF_STRCO/109-305 ATCAAGGAGGACCTCTCCAAGAACCTGGACGTC---TCCGCGGAGAAGATCAACGCCGACCTGGTCGGCCCCAGCTGGGGTGACCAGATCGCGAACAAGGCCTGGCAGGGCCTCGGGATCTTCATGGTCCTCGTGGTGATCTACCTGGCGATCGCGTTCGAGTGGCGGATGGCACTGGCCGCCTTCGTCGCA---CTGATCCACGACATCACCATCACCGTGGGCATCTACGCCCTGGTCGGT---------...---TTCGAGGTCACACCCGGCACGGTGATCGGTCTGCTGACGATCCTCGGTTACTCGCTCTACGACACGGTCGTCGTCTTCGACAGCCTCAAGGAGCAGACCCGGGACATCACCAAGCAGACCCGCTGGACCTACGCGGAGATCGCCAACCGCTCGATCAACAGCACCCTGGTCCGCTCCATCAACACCACGGTGGTC............---GCGCTGCTGCCGGTGGCGGGCCTGCTGTTCATCGGCGGCGGTgtcctcggtGCCGGCATGCTCAACGACATCTCGCTGTCGCTGTTCGTCGGTCTCGCCGCGGGCGCCTACTCGTCGATCTTCATCGCCACGCCGCTCGTCGCCGACCTCAAGGAGGCC
SECF_MYCLE/183-379 GCATTCGGACCCAAAGGCGCCGACGCTAAGCCT---AGCAAGCAGGCAATCAGCGACGCGGCGGTATCGGAGACCTGGGGCGGTCAGATCACCAAGAAGGTGGTGATCGCTCTTGTGGTGTTTCTGGTGCTAGTCGGCCTGTACATCACTGTGCGGTACGAGCGTTATATGGCTATCTCCGCACTGACTACC---ATGTGTTTTGACCTGACCGTCACAGCCGGCGTGTACTCGCTGGTGGGC---------...---TTCGAAGTCACTCCGGCCACTGTCATCGGCTTGTTGACGATCCTCGGTTTCTCTCTCTACGACACCGTTATCGTGTTCGACAAAGTTGAGGAGAATACCCACGGTTTCCAGCACACCACTCGGCGCACCTTCGCTGAGCAGGCTAACTTGGCGATCAATCAGACCTTCATGCGTTCGATCAACACCAGCCTGATCtcggtactaccgGTGTTGGCGCTGATGGTGGTCGCGGTGTGGTTGCTGGGCGTC---.........---GGTACGCTCAAGGACCTGGCATTAGTGCAGCTGGTCGGCATCATTGTCGGCACCTACTCGTCGATCTTCTTTGCAACTCCACTGTTGGTCACGCTGCGTGAACGC
SECF_HAEIN/120-308 CACGTCAAAAGTATGCTACAGAATGTAGATAAA---GACATTCAAATTCGCAGTATTGAGTTCGTTGGCCCAAATGTTGGTGAAGAATTAGCACAAGGTGCGGTATATGCGACTTTAGCGACATTAGCAATGGTGCTTATTTATGTGGGGTCACGTTTTGAATGGCGTTTAGGCTTTGGCAGTATCGCTTCT---CTTGCGCACGACGTCATTATTACGCTAGGGGTATTCTCTGCATTACAA---------...---ATTGAAATTGATCTTACTTTTGTCGCAGCGATTTTATCTGTGGTGGGTTACTCCATCAACGATAGTATTGTGGTATTTGACCGGGTTCGTGAAAAT---------TTCCGAAAAATTAGACGATTGGATACGATTGATATTATTGATATTTCTTTAACGCAAACTTTATCAAGAACTATCATTACTTCGGTTACT............---ACATTAGTTGTCGTGATGGCATTGTTCTTCTTTGGTGGT---.........---CCTTCCATTCATAACTTTTCACTTGCTTTACTCGTAGGTATTGGATTTGGTACTTATTCCTCGATTTTTGTTGCCATTGCCATTGCATACGATGTTGGTTTACGT
SECF_ECOLI/114-302 GTTCTGAAGGTGATTAACGAATCCACCAATCAG---AATGCAGCAGTGAAGCGTATTGAGTTCGTCGGTCCGAGCGTGGGGGCAGACCTTGCGCAAACCGGTGCGATGGCGTTGATGGCAGCGCTGCTGTCTATCCTCGTGTACGTAGGTTTCCGCTTTGAGTGGCGACTGGCGGCAGGGGTGGTTATTGCG---CTGGCGCACGACGTTATCATTACGCTGGGTATTTTGTCGTTATTCCAT---------...---ATCGAGATTGACCTGACCATTGTGGCATCGTTGATGTCGGTTATCGGTTACTCGCTTAACGACAGTATCGTGGTATCGGACCGTATTCGTGAAAAC---------TTCCGCAAGATCCGTCGCGGTACGCCTTACGAAATCTTTAACGTGTCCTTGACCCAGACGCTGCACCGTACCTTGATCACATCCGGTACT............---ACCTTGATGGTTATCCTGATGCTGTACCTCTTCGGTGGT---.........---CCGGTACTGGAAGGCTTCTCGCTGACCATGCTTATCGGTGTTTCCATCGGTACTGCATCTTCCATCTATGTGGCATCTGCGTTGGCTCTGAAACTGGGTATGAAG
SECF_RHOSH/117-305 CAGGTCGAGGAGGCGCTGAAGACCGTCGATCCG---TCCATCACCTTCCCGTCCGTCGAGTCGGTGGGGCCGAAGGTCTCGGGCGAGCTGATCCGGTCGGCGATCCTGGCGGTCGCCGCCGCCTGCGCGGGCATCGCCGTCTATATCTGGCTCAGGTTCGAATGGCAGTTCGCCCTGGGCTCGGTGGCCGCA---TTGATCCACGACGTGCTGGTGACGATCGGCGTCTTCGCGCTGTTCCAG---------...---ATCAAGTTCGACCTGACGACGGTCGCGGCCCTCCTCACCGTTCTCGGCTATTCGATCAACGACACGGTGGTGGTGTTCGACCGGCTGCGCGAGAAC---------CTCGTCAAGTACAAGACCATGCCGCTCCGCGACGTGATGAACCTCTCGGTCAACGAGACGCTGAGCCGGACGATCATGACGCTGATGACC............---ACACTCATCGCGCTCGTGTCGCTTCTCGTCTTCGGCGGC---.........---GACGTGATCCGCGGCTTCGTCTTCGCCATCACCTTCGGCGTGGTGATCGGGACCTATTCCTCGGTCTACATGGCCAAGAACATCGTGCTCTATCTCGGCGTGGAC
SECF_RHOCA/123-311 AAGGTCGAGACCGCGCTGACCGCGGTCGATCCG---GCGCTGAAGATCACCTCGTTTGAATCCGTCGGCCCCAAGGTCTCGGGCGAGCTGGTCTGGACCGCGGTCTGGTCGCTTCTGGCGGCGACCGTGGTGATCATGTTCTACATCTGGGTCCGGTTCGAATGGCAATTCGCGCTTGGCGCCGTGGTGGCG---CTTGTCCATGACGTGCTGCTGACGGTCGGGCTTTTCGCCGTGCTGCAG---------...---CTGAAGTTCGATCTGACCACGGTGGCGGCGCTGTTGACGATCACCGGCTATTCGATCAACGACACCGTCGTCGTCTTTGACCGGCTGCGCGAAAAC---------CTGATCAAATACAAGACGATGCCGCTGCGCGACGTGATGAACCTGTCGGTCAACGAAACGCTTTCGCGCACGGTGATGACCGGCATGACG............---ACGCTTCTGGCGCTGGTGCCGATGCTGATCTGGGGCGGC---.........---GACGTGATCCGCGGCTTCGTCTTCGCCATGGTCTGGGGGGTGTTCACCGGCACCTATTCCTCGGTCTATGTGGCGAAGAACATCGTGCTGTTCATCGGTCTTGAC
SECF_AQUAE/92-279 AAACTGGAGGATGTTCTTAAGAAATTCGGA------AAGTACGAGTTAATCAGGAAGGAAACAATAAGTGGGGTGGTGAGTGAAGAGCTTCAGAAAAAAGCGGTGTTTGCCATACTCACGGCCCTCGGAGGAATACTCCTTTACTTAGGAGTGCGATTTCAACCAGTTTGGGGATTTGGCGCGATCCTCGCC---CTCGCCCACGACGTTATCACTGTTCTCGGAGCTTACTCCATTACTCAG---------...---CGTGAGGTAAACCTCGAAGTAGTTTCCGCAATTCTCGTGGTTGCAGGATATTCCGTTGCCGACACAGTCGTTATTTTTGACAGGATAAGGGAAAAC---------CTAAGAAAGAAGAAAGGCTTTACCCTTGAAGAGATAATGGATCTTTCCATAAACCAAACCCTTTCCAGAACTATAATGACCTCTCTTACC............---ACTCTGGTAACGGCGTTAACGCTCTTTATCCTCGGCGGA---.........---TACGCCCTTTCTAACATAATGTTTGCCTTCGTTGTGGGCGTTGTAGTGGGAACTTACTCCTCCGTGTTTGTGGCTTCAGCATTTGTTCTGGATATGCAAAAACTC
SECF_RICPR/110-299 ATAATTAAGACATCTTTACGAAATAATTTTCCGTATAATTTTGAATATCGTAAGGTAGATTTTGTAGGTCCGCAGGTTGGTAGACAGCTAATAGAAGCAGGGGCTATGGCTATGCTATTCTCTTTCTTAGCGATTATGGTTTATATTGGAGTGCGTTTTGAGTGGTATTTCGGTTTTGGTATACTTATTGCT---TTAGTTCATGACGTAATACTAGCTCTTGGGTTTATGAGTATGACTAAG---------...---CTTGATTTTAATTTAAGTACTATTGCTGCAGTATTAACTATTATAGGTTATTCTGTTAATGATTCAGTAGTAATATACGATAGGATTAGAGAAAAT---------TTGCGTAAATACCATAAAAAAAATATCACAGAAATTATTAATTTAAGTATTAATGAGACTTTATCCAGAACTATTTTGACAGTAATTACT............---ACACTACTTGCAAATTTAGCTCTTATTCTTTTCGGTGGT---.........---AAAGCGATTCATAGTTTTAGCGTACTTGTATTTTTTGGAATAATAGCTGGTACTTATTCATCAATTTTTATCTCTGCTCCAATACTTACAATGTTTGCTAATAGG
SECF_HELPY/106-293 ATCGTGGCCAACATTCTAAAACCCAGCGGC------GATTTTGAAATCCGTAAATTTGACACCGTGGGCCCTAGAGTGGGGAGCGAATTGAAAGAGAAAGGCATTTTGTCGCTGATTTTAGCATTAATAGCGATCATGGTTTATGTGAGTTTCCGCTATGAATGGCGTTTTGCTTTAGCGAGCGTCATTGCG---CTTGTGCATGATGTGATTTTAGTGGCAAGCTCGGTGATTGTTTTTAAG---------...---ATTGATATGAATTTGGAAGTGATTGCGGCCTTGCTCACCTTGATTGGGTATTCCATTAATGATACGATCATTATTTTTGACAGGATCAGAGAAGAG---------ATGCTCTCTCAAAAAACCAAAAACGCCACTCAAGCCATTGATGAAGCCATTTCTAGCACGCTCACGCGCACGCTTTTAACTTCTTTAACC............---GTGTTTTTTGTGGTGTTGATTTTGTGCGTGTTTGGGAGT---.........---AAGATCATCATTGGCTTTTCATTGCCCATGTTAATAGGCACGATTGTAGGGACTTATAGCTCTATTTTCATCGCCCCTAAAGTGGCGTTATTGTTAGGCTTTGAT
Q9ZBS8_STRCO/569-757 ACCGTCACGAAGGCCGTCGCCGAACTGGGCGGC---GAGACGGAGAAGGTCCGCGACGAGCTGATCGGCCCGAGCCTCGGCGAGGAGCTGCGCCGGGACGCCCTGATCGCCCTCGGCCTGGCGCTGGCCGCGCAGCTGGCGTACCTGGCGGTCCGGTTCCGCCTGCTGTTCGGCACGGCGGCGGTCGGCGCG---CTCGCCCACGACGTGGTCATTCTGGTCGGTGTGTTCGCCTGGCTGGGC---------...---AAGCCGATCGACGGGGTGTTCCTGGCGGCGCTGCTGACCGTGATCGGCTACTCGGTGAACGACTCGGTGGTGCTCTTCGACCGCATCCGGGAACTG---------CTGGGCAAGGAGCGGAAGGCACCGTTCGACCGGCTCACCAACGACGCGATCCTGCAGACCCTGCCGCGCACGGTCAACACCGGCATGGGC............---GCGGTGCTCATCCTGGCCTCGCTGGCGATCCTGGCCGAC---.........---GACTCGCTCACCGACTTCGCGCTCGCGCTGCTGATCGGCGTGGGGGTCGGCACGTACTCGTCGGTCTTCACCGCCTCTCCCCTGGCCATCGAGCTGCACAACCGC
SECF_SYNY3/108-301 GTGCAAAAAGCATTGAATGAAGGCATAGGTAAGTTCGACCCGGAAACTATCCAAATTGACACCGTTGGCCCCACGGTAGGCAAAGCTTTATTCCGTTCTGGGGTGTTAGCCCTGGTGATTTCCCTGCTGGGGATTATCATCTATTTAACTATCCGTTTTCAGCTTGATTACGCTGTTTTTGCCATTATCGCC---CTACTTTATGATGCCTTGATTACCATGGGAGCCTTTGCCATTTTTGGC---TTAGTGggaGGAGTGGAAGTTGATAGTCTTTTCCTGGTGGCGTTACTGACCATCATCGGCTTTTCTGTCAATGACACCGTGGTCATATACGACCGGGTGCGGGAAACC---------CTAGAGCGCCATTCTGACTGGGATATTAACCATGTGGTGGATGATGCAGTCAATCAAACTTTGACCCGTTCCATTAACACTTCTTTGACC............---ACTTCTTTGCCCCTGGTAGCAATCTTTCTTTTCGGTGGT---.........---GATAGTCTCAAATTCTTTGCTTTAGCTTTGATTATTGGCTTTGCTTCCGGGGTTTATTCCAGTATTTTCATGGCCACAACCCTCTGGGCCTGGTGGCGTAAATGG
O32047_BACSU/540-729 AAAGTAAAAACGTATTTTAAAGACAAATACGGA---------TCTGATCCAAATGTCAGCACAGTTTCACCGACAGTCGGTAAGGAGCTGGCGAGAAATGCGCTGTACGCAGTTGCTATAGCTTCTATTGGCATCATTATTTACGTTTCAATCCGATTCGAATACAAAATGGCGATTGCTGCCATCGCCTCA---TTGCTATATGACGCATTCTTTATCGTCACGTTCTTCAGTATTACAAGG---------...---CTTGAGGTAGATGTTACATTCATCGCGGCCATCTTGACGATAATCGGGTATTCCATTAACGATACAATCGTTACATTTGACAGGGTCCGCGAGCATATGAAAAAGCGTAAGCCGAAAACCTTTGCCGATCTGAACCATATTGTAAACCTGAGCCTGCAGCAAACCTTTACACGTTCAATTAACACTGTATTAACC............---GTTGTGATTGTTGTTGTGACATTGCTGATCTTTGGAGCA---.........---TCTTCTATTACTAACTTCTCAATTGCTTTATTGGTCGGGCTGTTAACAGGCGTTTATTCTTCTCTATACATTGCCGCACAAATTTGGCTTGCATGGAAAGGAAGA
SECF_TREPA/222-411 GTGTACGCGGCGCTCGTGCGCGCGTATGGAGCAGATCATGTGGTCCGTTTAGCGATGGATTTTGTCGGATCTCGTTTTTCTCATCTGTTGGTGCGTCAGGCGTTGTTGTTGGTTTTGGGTGCCTTGGTGTTGATTTTTTTATATGTGGCGCTTCGTTTTCGGTGGTTCTTTGCGCTTGGAGCGATAGTCGCG---CTCGTGCATGATGCGTGCATTATGGTGTCATTCATGGTGTGGTTTGGT---------...---TTGGAGTTTAACTCTGCGAGTATCGCGGCGATTCTGACGATTATCGGGTACTCGATCAACGACACGGTGGTAGTTTTTGATCGGGTGAGACAGACC---------ATTCTCCTGGATCCTATCGCGTCAGTGACGACAGTACTTGACCGATCGCAAACAGACATGCTCACGCGCACTGTAGTGACAACGGTGACG............---ACGCTGCTTGCAGCGCTGATGTTGTATGTGTTTACCGAG---.........---GGAGGCAGTCGGGATTTCTCACTCGCGCTAATGGTGGGGATGGTCAGCGGCGTGTACTCGACCATTTACATCGCCGGTGGCTGTATCGCCCTGATCAGCCGGGGG
SECF_BORBU/108-297 ACAATATTAGATAAACTTAAAGAAACATTTGATGCTAATATTGAAGTTTTGGATTCTTATTTTATTGATTCAAGTTTTTCTTCTACTTTGAGAATTAGGTCAATTTTTTTGGTATTAGGAACATTTATCCTGATTTTGATTTATATAACTTTAAGATTTAAACTAAGTTATGCTATTGCTTCCATACTTTCA---ATATTTCATGATATATTTTTTATAGTTGCTTTTTTAGGGGTATTTAGA---------...---ATAGAGATTAATAGCTATATTATTGTGGCAATACTTACCATTATTGGATATTCTTTAAACGACACAATAATTATTTTTGATAGGATTAGAGATAAT---------GTTAAGCGATTAACCGATAACACATTTTTAAATGTATTAAACATAAGTATTAGTCAAACTTTATCAAGAACTGTTTTGACGTCAGTTACA............---ACATTTGTTGCAGTATTTTCTATTTATGTGTTTACTGAAGGA.........------TCTATAAAAGATTTTTCTTTGGTATTTATGGTAGGGGTAATTGTTGGAACTTATTCTTCTGTATTCATAGCGTCTCCAATACTTTTAAACCTGTATAAAAAG
Q9Z7Y9_CHLPN/1204-1397 GAAACAGGCCTAGATTTCTCTACGGAAACTCTA---AACGAAACGCAAAATTTTTGGTCAAAGGTAAGCAGCAAACTATCGAAGAAAATGCGTTATCAGGCGACCATCGGGCTTTTAGGAGCTTTGGCAATCATCTTGCTCTATGTGAGTTTGCGCTTTGAATGGCAATATGCTTTCAGTGCCGTATGCGCT---TTAATTCATGACCTTTTGGCTACCTGTGCAGTCTTGTTTATAGCACATTTCTTTTTGaagAAAATTCAAATAGATTTGCAAGCCATTGGTGCTTTAATGACTGTATTGGGGTATTCATTAAACAATACTTTGATCATTTTTGATCGTATTCGTGAAGAT---------CGCCAAGCGAACCTGTTTACCCCTATGCATGTTTTAGTTAATGATGCCCTTCAAAAGACGTTCAGCCGCACGGTAATGACAACAGCTACA............---ACTCTATCAGTTTTGTTAATGCTTTTGTTTATAGGCGGC---.........---TCCTCTGTCTTTAATTTTGCATTTATTATGACCATAGGGATTCTTCTAGGAACTTTATCGTCTCTTTATATTGCACCACCTCTGTTGTTGTTTATGGTCCGTAAA
O84454_CHLTR/1200-1393 GATTCCGGAAGTTCTACTACTTCTATGGTATTT---GATGCTTCTCGAGGTAGCTGGTTTAAGGTAAGTGGACAGCTTTCCAATAAAATGCGTACACAGGCTGTCATCGCATTATTTGGAGCTTTAGGAATTATCTTATTTTATGTTAGCTTGCGCTTTGAGTGGAGATATGCCTTCAGTGCGATTTGTGCT---TTAATGCACGACTTATTAGCGACTTGTGCTGTGCTAGTTGCCTTACATTTCTTTTTGcagAGAATACAGATTGATTTGCAAGCAATAGGCGCATTGATGACAGTGCTAGGGTACTCTTTGAACAATACGTTGATTATTTTTGATCGTATTCGAGAAGAT---------CGGCGCGAAAAACTGTTCACCCCAATGCCGATTTTGATCAATGATGCATTGCAGAAGACATTAGGACGTACAGTTATGACTACGGCAACA............---ACTCTATCTGTACTGGTCATTTTGTTATTCGTTGGGGGA---.........---GGTTCTATTTTCAATTTTGCATTCATTATGACAGTGGGGATCTTGTTAGGAACGCTATCTTCATTGTACATAGCTCCTCCGCTTCTCTTATTCATGGTGCGTAAG
Y1253_METJA/88-276 CAGAAAATTAAGGAATTTTTCCACGTGGATAGCTTAGATAAGTTAAATTATTCTGAAAAGACGATTGGGGCTACTTTAAGCTCTAAATTCTTTGAAGAAGGATTTAAAGCTGTTGGATTTGCATTTATGTTTATGGCTATTGTAGTTTATCTATATTTCAGAAATCCAGTGCCAAGTGGTGCTATAATATTATCTGCACTTTCAGATATAATTATGGCTTTAGGGGCTATGAGCTTATTAGGA---------...---ATTGAGCTTTCCTCTGCAACTATAGCGGCTTTATTAATGGTTATTGGTTACAGTGTAGATTCAGATATACTGCTAACAACAAGAGTTCTAAAGAGA---------TTAACAAAGAGCTTTGATGAAACTGTTAAAGAGGCTATGAAAACAGGTTTAACAATGACATTAACA---ACAATCACTGCTATGCTAATA............------TTATTAATTGTTGTAAAGCTCTTCATTCCAGTAGCA---.........---GATATACTGGCAAATATAGCAACTGTCTTAATTTTGGCTTTAATTGCTGACATTATAAACACTTGGCTATTGAATGCTGGAATATTAAAATACTACATAACTGAA
O26936_METTH/72-255 GTGAGTGAAGCC---CTCAGGGGCACCGCAACC------------ATCAACAGTTACAAGGCAGTCGGTCCCGTTCTGAGCAAACAGGCCATGAACCAGATCTACTGGGCCATTGGCTTCGCATTCCTCTTCATGTCGGTGACGGTTTTCATAATATTCAGGGACCCGGTCCCCTCACTGGCAGTTATACTCGCAGCAGCATCTGATATCATAATAGCCGTGGGTGGGATGTCACTCTTTGGC---------...---ATACCCCTCTCACTGGCATCTGTCGGTGCGATACTGATGCTCATAGGTTACAGCGTGGACACAGACATACTCCTTACCACAAGGGTCCTTAAACGC------------AGGAAG---------GGGACCATAAACGAGAGGGCCCTGGGGGCCATGAAGACGGGTGTTACAATGTCCATAGCTGCAATCGCATCA............ATGGCAGCACTCTACCTTGTGACGGTGTTTGTGATGCCCGAGGCC.........---AGGGTGCTGAGTGATATAGCAGCAGTCCTGATAATTGGGCTCCTGGCGGATATCCTGACCACATGGCTCATGAACCTTGGAATTCTGAGATGGTACCTGGAGGTT
O57717_PYRHO/107-288 AAGGTTCAGAACTTTTTAAAAGAGAAATTTCCT------GGGGTTGAGCCCCAAGTAACCTTTATCGGTCCAACATTTGGTAAGATGGTTAGGGAGCAAGGGATTAAAGCTATAGTGTACGCTTTCATTGGTATGGCAGTTGTTGTTTTCCTGTTCTTTAGAGTCCCAGTTCCGTCTTTAACTGTAGTGTTCTCGGCGTTTTCAGATATGGTTATAGCAGTAGCTTTAATGGATATATTTGGG---------...---ATTGAACTTAGCCAGGCTACGATAGCTGCACTTCTAATGCTAATAGGATATTCAGTTGACAGTAATATTCTGCTGACGACGAGACTTCTAAGGAGG------------AAGGAA---------TTTTCCGTTGAAGAGGCCTATTACTCTTCACTAAGAACAGGCTTTACA---------ATGTCAACGACGACT............------TTAGGTGCTTTGGCTTCATTGTGGATCTTCTCAACG---.........GCTAAGGTTATAGATGATATAGCCTCTGTCTTGATCTTTGGACTTCTAGCAGATTTCATGAACACTTGGATATTCAATGCAGGAGTCTTGAGGCTTTACATAAAAAAG