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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01613 alignment
(21 sequences with 468 bp)


Q55660_SYNY3/11-160 CTGCGTAAAATTCCCCACGGCCTCTACGTCTGTGGTGTTAAGTCC---GGAGAAGAAGCCAATGGTTTCACCGCCAGTTGGGTAATGCAGGGTTCCTTTGAGCCGCCCCTGGTGGTTAATTGCGTGCGCACTGATTCCATTTCCCATCGGCTGTTACAGGAAAGTGGCCAGTTTGCCCTCAGTTTTCTGGCGGCGGAC---CAAAAAGATGTGGCGGCGCAATTTTTTAAACCCCAACGGCGG---...GTGGGGGACAAGTTTGAAAATTTTGATGTGCTTGATGCCCCCGAAACCGGTTGTCCTGTGCTCAAAGACTGTCTCGGTTATGTGGAGTGTCGGGTGGTAGGGTCTGTGGCCCACGGCGATCACACCGTTTTTGTCGGCGAAGTCATTGGAGCCCAGGTTTTTAATGAA------GGAGATCCCTTATTACTAGAAAGCACTGGCTGGAACTACGGCGGT
Q07948_SYNP7/11-160 CTGCGCAAAATTCCGCATGGTCTTTACGTTTGCGGCGTCAAGGAT---GGCGAGGAGATCAACGGCTTTACTGCCAGCTGGGTGATGCAGGGCTCGTTCCAGCCGCCCTTAGTGATCAACTGTGTCAAATCCGACTCGCGCTCCCATGCCATGCTCTCGGCAAGCGGCGTCTTCAGCTTGAGCTTCTTGGAAGCAGGC---CAGAAGGATCTGGCCGCTCAATTCTTTAAGCCGCAGCGCTTG---...GTTGCCAATAAATTTGAAACGGTCAACGCCTACCTCGGCGAAGCCACCGGTTGCCCAATTTTGGAAGAGGCCCTGGGCTACGTCGAATGCCGTGTAGTCGGCAAGGTTGAGCACGGGGATCACACGGTTTTCGTCGGTGAAGTGATTGCTGCAGGCTTACACAGCGAG------GGGGACCTGCTGACGCTGGAAAGCACCGGCTGGAACTACGGCGGC
O68503_RHOER/38-186 CTTCGCCGCCACCCCGCCGGTGTCACCGTCGTGACCCTCGATTCG---GGTACCGGCCCGGTGGGTTTCACCGCCACCTCGTTCTCGTCCGTCTCCCTCGAGCCGCCGCTCGTCTCGTTCAACATCGCGGAGACGTCGTCGAGCATCAATGCACTCAAGGCAGCCGAGTCCTTGGTGATCCACCTTCTCGGCGAACAT---CAGCAGCATCTGGCCCAGCGCTTTGCGCGTAGTGCC---------...---GATCAGCGTTTTGCAGACGAGTCACTGTGGGCAGTGCTCGACACCGGGGAACCGGTGCTGCACGGCACCCCCAGCTGGATGCGCGTCAAGGTCGACCAGCTGATCCCTGTCGGCGACCACACGCTGGTCATCGGACTCGTCACGCGGGTTCACGCCGAAGAAGACGACGAATCCGCTGCCGCGCCGCTGCTCTACCACGAGGGCAAGTACTACCGC
O68914_9ACTO/25-171 ATGTCGTGCTTCCCCGCGGGGGTGGTCCTCGTGACGACGCGCGAGGAGGACGGCACCCCCCGCGGTTTCACGGCGAGTTCCTTCTGCTCGGTGTCGCTCGCTCCCCCGCTGGTGTCGGTGTGCCAGGGCACGGGCGCGCAGTCCTACGGGGCGTTCCAGGAGTGCGCGCGGTTCGCGGTGAGCGTGCTGCGGAGCGGA---CAGCGGGAGCTGGCCTCGCGGTTCGCGACGCGCGGG---------...---GCGGACAAGTTCGGGGGCGGGGGGCTCGTGGCGCTGGAGGGCTCGGGGCTGCTGGTCGCGGCGGACGCGCTCGTCACGCTGGAGTGCGCGGTACACGCCCGGCACCTGGCCGGGGACCACGTGATCCTCGTCGGCGAGGTGCGCGGGGTGGGGCAGGGTGAG---------GGCGAACCGCTCGTGCACTGGGAGCGGGGGTTTCGCGCGCTGCGC
DIM6_STRCO/12-158 ATGGCCCGGGTGCCGGCCGGGGTGGCGCTCGTCACCGCCCATGACCGCGGGGGAGTCCCGCACGGTTTCACCGCCAGTTCGTTCGTGTCCGTCTCGATGGAGCCGCCACTGGCACTGGTCTGCCTGGCTCGTACGGCCAACTCCTTCCCGGTGTTCGACAGTTGCGGCGAGTTCGCGGTGAGCGTGCTGCGCGAGGAC---CACACGGACCTGGCCATGCGCTTCGCGCGCAAGTCC---------...---GCGGACAAGTTCGCGGGCGGGGAGTTCGTCCGTACC---GCGCGGGGAGCGACCGTGCTCGACGGAGCGGTCGCGGTCGTCGAGTGCACGGTCCACGAGCGCTACCCGGCGGGCGACCACATCATCCTGCTCGGCGAGGTCCAGTCCGTGCACGTCGAGGAGAAG------GGCGTACCGGCGGTCTACGTGGACCGCCGGTTCGCCGCCCTGTGC
SNAC_STRPR/20-167 ATGGCGCAGCTGGCGTCGCCCGTCACCGTCGTAACCGTCCTCGACGCGGCCGGACGCCGCCACGGCTTCACGGCCGGCTCGGTGGTCTCTGTGTCGCTGGACCCGCCGCTGGTGATGGTCGGCATCGCGCTCACCTCCAGCTGCCACACGGCGATGGCCGCCGCCGCCGAGTTCTGCGTCAGCATCCTCGGCGAGGAC---CAGCGCGCCGTCGCGAAGCGGTGCGCGACGCACGGC---------...---GCCGACCGGTTCGCGGGCGGCGAGTTCGCCGCCTGGGACGGTACGGGGGTGCCCTACCTGCCGGACGCCAAGGTCGTCCTGCGCTGCCGCACCACGGACGTGGTGCGCGCCGGCGACCACGACCTGGTGCTCGGCACGCCCGTGGAGATCCGCACGGGCGACCCG------GCGAAGCCACCCCTGCTGTGGTACCGCCGCGACTTCCACACCCCG
P96849_MYCTU/14-159 CTCGGTCAGTTCTGTACGGGGATCACTGTCATCACCACTGTGCAC---GACGACGTGCCCGTCGGGTTTGCGTGCCAGTCGTTCGCGGCGCTGTCGTTGGAACCGCCGTTGGTGCTGTTCTGCCCCACTAAGGTGTCGCGGTCCTGGCAGGCCATCGAGGCCAGCGGCCGGTTCTGCGTCAACGTACTGACCGAAAAG---CAGAAAGACGTCTCGGCGCGATTCGGCTCGAAGGAG---------...---CCGGACAAGTTCGCCGGTATCGATTGGCGCCCTTCG---GAACTAGGCTCACCGATCATCGAGGGATCGCTGGCCTACATTGACTGCACGGTGGCGTCGGTGCACGACGGCGGCGATCACTTCGTGGTGTTCGGTGCCGTCGAGTCACTGTCAGAGGTCCCGGCG------GTCAAGCCGCGGCCGCTGCTGTTCTATCGCGGCGACTACACCGGC
O69360_RHOER/23-166 CTCGGGCAATTCTGCACGGGTATCACCATCATCACGACAGTCGAC---GACGGTGAGCCTGTCGGGTTCGCATGTCAGTCTTTCGCGGCCCTGTCACTCGACCCGCCTTTGGTGTTGTTCTGCCCCACCAAGGGTTCTCGGTCGTGGGCGGCAATCGAGCGGACCGGTAAGTTCGCCGTCAACGTGTTGGCGGAGGAA---CAGCAGGCGGTGTGTGCTCGTTTCGGGTCACGTGAG---------...---CCGGACAAGTTCGCCGGCATCGATTGGACGCCATCG---CCTCTGGGCTCGCCAATCATCGACAAGTCCCTTGCACACATCGACTGCACGGTGGAAACCGTCCACGACGGCGGCGATCACTACGTCGTCTTCGGTCGGGTTTCGTCGATGAGTGAGATCAAGACC------GAACGC------CCGCTGCTCTTCTATCGCGGGCAGTACACGGGC
NTAB_CHEHE/25-169 CTCGGAACTTTTCCGACCGGCGTTACTATAGTTACCGCTCCCGGG---GTGGACGGTCCCGCAGGCGTTACAGCCAATTCCTTCGCTTCGGTGTCGCTCGATCCGCCGCTGGTACTCTGGTCGATCGGACACACCTCGCGTAGCCATTCGAAATTTCAGCAAAGCGCGACTTTCGCCATAAATATTCTTGCTGACGAC---CAGGTCGGCGTCTCGCAGGTATTCGCTGGCGGAAGT---------...---GCCGACAAGTTCAGTTTGGTGGACTGGCACACAGGC---AGAACGGGAGCGCCGCTGATTGACAACGCTCTGGCCTATTTCGACTGCGTCTGCGAGGCTAGGCACGAAGGAGGCGATCATACCATCATGATAGGCCGCGTCGTCGACTTCGGGCGCGCCGAG---------GGAAGCCCGCTGGCTTTTTCACAGGGTCGCTATGGAGTTACATTA
P95275_MYCTU/24-167 TTCGGCTGCTTTCCGTGCGGCGTGATCGCCGTCTGCGCGATGGTC---GACGACCAGCCGGTCGGCATGGCGGCCAGCTCGTTCACGTCGGTTTCAGTTGACCCGCCGCTGGTATCGATCTGTGTGCAGAACTGTTCGACGACGTGGCCGAAGTTGCGCGACCGCCCACGGCTCGGTGTGAGCGTGCTCGCCGAGGGG---CACGACGCGGCCTGTATGAGCCTGTCGCGCAAGGAA---------...---GGTAACCGGTTCGCCGGGGTGTTCTGGAGCGAATTG---TCCAGCGGGGGTGTGGTGATCGCCGGGGCCGGCGCCTGGCTGGATTGCCGCCCGTACGCGGAGATCCCGGCGGGGGATCACCTGATCGCCCTGCTGGAGATCTGCGCGGTGCGCGCCGATCCCGAG------ACACCG------CCGCTGGTGTTTCACGGTAGCCGGTTCCGCCGG
O53667_MYCTU/16-159 TTCGGCCATTTCCCGACCGGGGTGGTGGCCATCGCTGCGGAGGTC---GACGGAGTGCGGCAAGGCTTGGCAGCCAGTACCTTTGTCCCGGTCTCGCTGGAACCGCCGCTGGTGTCGTTCTGTGTGCAGAACACCTCGACGACATGGCCGAAACTCACCGGCGTGCCGATGCTGGGCATCAGCGTGCTCGGCGAGGCC---CATGACGCCGCAGTGCGCACACTGGCCGCAAAAACT---------...---GGGGACAGGTTCGCCGGTTTGGAGACGGTATCCAAC---GACGCCGGCGCCGTCTTCATCAAGGGCACCAGCGTGTGGCTCGAGAGCGCGATCGAGCAGCTGGTCCCGGCGGGAGATCACACCATCGTGGTCTTACGGGTCAACCAGGTCAAGGTGGATCCCAAC------GTAGCG------CCCATTGTGTTCCATCGCAGCGTGCTCCGCCGA
O06835_PSEFL/20-166 GTTGCACTGTTCGCGACGGGAATTGCGGTTCTCAGTGCGGAGACTGAAGAGGGTGAAGTGCATGGCATGACCGTGAACAGCTTCACCTCCATCAGCCTGGATCCGCCGACTGTGATGGTTTCCCTGAAA---TCGGGCCGTATGCATGAGCTGCTGACTCGAGGCGGACGCTTCGGCGTCAGTCTCCTGGGCGAAAGC---CAGAAGGTGTTCTCGGCATTCTTCAGCAAGCGCGTG---------...---ATGGATGACACGCCTTCCCCCGCCTTCACCATTCAG------GCTGGCCTTCCCACTCTGCGGGACGCCATGGCCTGGTTTGAATGCGAAGTGGAGAGCACGGTTCAAGTACATGACCACACGCTTTTCATCGCACGTGTTAGCGCCTGTGGAACGCCTGAGGCGAATGCGCCCCAGCCGCTGCTGTTTTTTGCCAGTCGTTATCACGGCAAGCCG
HPAC_KLEOX/14-163 ATGGCCAGTCTGTCGCCAGCCGTTAACGTCATCACCACCGAAGCC---GAGGCGGGCGCTGCGGTATCACCCCACCGGCCGTCCTGTTCGGTGACCGATACGCCGCCGTCGGTGATGGTCTGCATCAACGCCAATAGCGCGATGAATCCGGTGTTTCAGGGCAACGGCAAGCTGTGCATCAACGTGCTGAACCACGAG---CAAGAGGAGATGGCCCGCCACTTCGCCGGCATGACCGGGATGACG...ATGGACGACCGCTTCGGCCTCAGCGGCTGGCAAAAAGGC---GCGCTGGGCCAGCCGGTGCTGAAAGGCGCGCTGGCGAGCCTCGAAGGCGAAATTAGCCAGGTGCAGACCATCGGTAGCCATCTGGTCTATCTGGTGGAAATCAGGAATATTACCCTGAGCCAGCAA------GGTCACGGGCTGATTTACTTTAAGCGCCGCTTCCATCCGGTGATG
O68232_PHOLU/15-164 ATGGCGAGTCTGTCAGCAGCGGTGAATATCGTCACCACCGATGGC---CATGCGGATGCTGGTGGCATCACTGCCACCGCGGTATGCTCAATCACCGATACGCCACCCACGCTGATGGTATGCATTAACCGAAGCAGTGCTATGAATCCAGTTTTTCAGGAAAATGGCCGCCTGTGCGTAAATATTTTAAACCACGAA---CAAGAACTGATGGCACGCCACTTTGCCGGTATGACCCGGGTCAGC...ATGGAAGAGCGTTTTTCGCTGAGTATCTGGCAGACAGGC---CCATTAGGCCAACCAGTGTTATACGGTACCCTTGCAAGCCTTGAAGGTGAAATCGAACAGGTTCAAAGTGGAGGCACGCATAACGTGTATCTGGTTCAGATTAAACATATCACGGTAAGCGAACAA------GGCCACGGCCTCATCTATTTCAAGCGTAATTTCCGTCCAGTCATG
O34138_STRVF/25-175 ACCCGCCAGCTGCCCACGGGCGTCGCGGTGGTGACGGCCCAGGAC---GGCGAGGTGGCACACGGGGCGACTGTCAGCACCGTCAGCGTACTGTCGCAACAGCCGCTGCGCATCGGTGTCAGCCTGCGACGCGGTTCGTATCTGACAGGGCTGATCCGCCAAAGGCGCGTGTTCGCCCTCAACGTTCTGTCCTCCCGA---CAGTCGGCTGTGGCTGACTGGTTTGCCAACCCGGAACGGCCGCGG...GGGTGGCGCCAGTTCGATTACGTCCGGTGGACAGCGCATCCGAAAGCCGGGATGCCCGTCCTGGAGGACGCTCTCGCCCAGCTTCACTGCCGGCTAACGGACCTGATCCCCCTAGGAGCCAGCGACGATCTGCTGGTCGCCGAGGTTCTCGACGGCCGGGGACGGAAC------GGCAGGCCACTGGTCAACTTCAACGGCCGGCTACATGACGTCGAG
O53254_MYCTU/22-170 ATGGGGATGCTGGACCACCCGGTGTTTGTGGTGACAACCCAGGCC---GATGGTCACCCCGCGGGTTGTCTGGTCAGCTTCGCTACCCAAACGAGCGTGCAGCCCCCGAGTTTTATGGTCGGCCTGCCGAGGAGCACCGGCACCTCCGAGGTGGCGAGCCGATCCGAGCACCTCGCCGTGCACGTGCTTTCGCAGCGG---CAGCATGTGCTCGCCGAACTGTTCGGCAGCCAAACGGAGGAGGAG...---GTCAACAAGTTCGCCCGTTGCTCGTGGCGCGCTGGC---CCCTGTGGAATGCCGATTCTCGACGACGCGGCCGCCTGGTTCATCGGTAGGACGGCCAGTCGCAGCGATGTCGGGGATTATGTGGCTTACCTGTTGGAGCCCGTGAGCGTGTGGGCTCCGGAGTGC------TCGGAAGATCTGCTCTACCTCTCCGACCTCGACTTTGATGTCGAC
DFA1_SYNY3/424-573 ATCGGTCGCATTAGTGGGGGGCTGTATATCATCACTGCCCAAAAG---GGAGAGGTTAAAGGGGCCATGCTTGCCTCTTGGGTTTCCCAAGCCAGCTTTAATCCCCCTGGTTTCACCGTTGCTGTGGCCAAGGACCGGGCCATTGAATCCCTCATGCAAGTCGGTGATCGCTTTGTGTTGAACATTTTGGAGGAAGGCAACTATCAAATTTTGATGAAACATTTCCTCAAACGTTTCCCCCCTGGT...---GCTGATCGTTTTGCTGGAGTAAAAACCCAAACCGCA---AGCAACGGATCGCCTATTTTGACCGATGCGCTAGCCTATTTGGAGTGTGAAGTAGCTAGTCGGATGGAATGTAGTGATCACTGGATTGTTTACAGCCAAGTAACCAATGGTCGGGTAGCTAAAGCA------GAAGGGTTAACCGCCGTACACCATCGCAAAGTCGGCAATTATTAC
DFA2_SYNY3/429-578 ATCGGTCGCCTCAGCACTGGACTGTATATTTTAACCGCTCAAAAG---GGAGATGTGCGGAGTGCCATGTTAGCTTCCTGGGTGATTCAAGGCAGCTTTGAACCCCTGGGCATTGTCATTGCAGTGGCCAAAGACCGGGCGATCGAATCATTACTCCATCCCGGCGATACTTTCGTGCTCAATGTGCTGGAAGAGGACAACTATCAAAGCCTCATGCGCCATTTCCTCCTCCGTTTTCCCCCAGGG...---GCAGACCGCTTTGCCGGAGTTAACACCTATCCTGCC---CAGAACGGTTCTCCGATCCTGTTGGAAACCCTAGCTTATCTGGAATGTGAGGTTACCTCCCGTCTTGATGGCAATGACCATTGGTTGGTCTACAGCACCATACAAACTGGACGAGTCGCCAAATTG------AATGCCCTAACCGCCACTCACCACCGCAAACTGGGCAACCACTAC
DFA3_SYNY3/449-597 TTAGGCCGTTTAGTGGGTTCCCTCTGTGTGGTTACCGCCCAGCAA---GGGGAATTGAGCAGTGCCATGTTAGCTTCCTGGGTTTCCCAAGCTACCTTTTCCCCCCCTGGTTTGACCGTTGCCGTTGCCAAAGAAAGGGCGATCGAATCTTTGCTACACAAAAACAGTTGCTTTGTGTTGAATATTTTGCAGGAAGGCAACCATCTGGGACTGATGAAACATTTTCTCAAACCCTTTGCCCCCGGC...---GGCGATCGGTTTGCAGACGTGGCCACGGAAACGGCG---GAAAATGGCGCACCAATTTTGACGGAATCCCTGGCTTATTTGGAATGTCGGGTACAACAACGGCTGGAGTGCGGTGACCATTGGGTTCTTTACGCCGTGACTGACCGGGGTGCCCTACTCAAA---------GATGGGGTAACGGCGGTGCATCACCGGAAATCTGGCGATCATTAT
DFA4_SYNY3/445-594 GTGGGACGTATTATCGGCTCCATTGGTGTGGTTACAACCCAAACA---ACTGGCCGCCATCAAGGGATTTTGACCTCCTGGGTTTCCCAAGCCAGCTTCACTCCCCCTGGCATTATGCTCGCAATTCCGGGCGAATTTGATGCCTACGGTTTGGCCGGACAAAATAAGGCTTTTGTGCTCAATCTTCTGCAGGAAGGT------AGGAGTGTACGGCGTCATTTTGATCACCAGCCCCTGCCGAAAgatGGGGATAATCCCTTCAGCAGATTGGAACATTATTCAACC---CAGAATGGCTGTCTGATTCTAGCGGAGGCGCTGGCTTATCTTGAATGCCTCGTCCAATCTTGGTCGAATATAGGCGATCATGTCCTGGTTTATGCAACAGTTCAGGCCGGACAAGTGTTACAACCC------AACGGCATCACTGCCATACGACACCGCAAATCGGGGGGACAATAT
O29428_ARCFU/6-158 TTTTACAAAATCAGTTACGGACTCTACATTGTCACCTCTGAAAGC---AACGGCAGGAAATGCGGGCAGATAGCCAACACGGTCTTTCAGCTCACTAGCAAGCCCGTGCAGATTGCCGTTTGCCTGAACAAGGAGAACGACACCCACAATGCCGTAAAGGAGAGCGGGGCTTTTGGTGTCAGCGTTCTTGAGCTCGAAACACCGATGGAGTTCATAGGAAGATTTGGGTTCAGGAAGAGCAGCGAG...---TTTGAGAAGTTTGATGGGGTTGAGTACAAAACGGGCAAGACTGGAGTGCCTCTCGTAACCCAGCACGCTGTGGCGGTGATAGAGGCAAAGGTTGTTAAGGAGTGCGACGTCGGCACCCACACGCTGTTCGTTGGGGAGGCTGTTGATGCTGAGGTATTGAAGGATGCAGAGGTGCTTACCTACGCTGACTACCATCTCATGAAGAAGGGTAAGACG