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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF01024 alignment
(9 sequences with 609 bp)


CEAN_ECOLI/185-382 AAGGAAGAAAAAGAAAAAAATGAAAAAGAAGCCTTGCTAAAGGCTAGTGAACTTGTGTCTGGTATGGGGGATAAGCTTGGCGAGTATCTTGGAGTAAAATATAAAAATGTAGCTAAGGAAGTTGCCAATGATATTAAAAACTTCCATGGTCGTAATATTCGTAGCTATAATGAAGCAATGGCTTCACTTAATAAAGTGTTAGCAAATCCAAAGATGAAAGTAAACAAATCTGATAAGGATGCCATTGTGAATGCCTGGAAACAGGTTAATGCTAAGGACATGGCTAATAAGATTGGTAATCTTGGCAAGGCATTTAAGGTTGCTGATTTAGCTATAAAGGTTGAGAAAATTAGGGAAAAAAGCATTGAGGGATACAATACTGGCAACTGGGGACCTCTCCTGTTGGAGGTTGAATCATGGATCATTGGTGGCGTTGTT------------GCTGGAGTTGCTATTAGTTTATTCGGGGCTGTGTTG---AGTTTTCTCCCAATCTCTGGACTTGCAGTTACTGCGTTGGGGGTAATAGGAATAATGACGATTAGTTACTTGTCATCTTTCATAGATGCAAATCGAGTTTCGAATATAAATAACATTATA
CEA_CITFR/389-587 GTTGCGGAAAAAGCCAAAGATGAGCGGGAGCTGCTTGAAAAAACCAGTGAACTGATTGCTGGTATGGGAGATAAAATCGGCGAGCATCTTGGAGATAAATATAAGGCGATAGCGAAAGATATTGCGGACAATATTAAAAATTTTCAGGGGAAGACCATCCGTAGCTTTGATGATGCAATGGCATCGCTGAATAAAATCACAGCCAACCCAGCCATGAAAATTAATAAGGCGGACAGAGATGCTCTGGTTAATGCCTGGAAACATGTTGATGCTCAGGATATGGCGAATAAACTGGGTAATCTCAGCAAGGCTTTTAAAGTCGCCGACGTGGTGATGAAGGTTGAGAAGGTCCGGGAGAAGAGCATTGAGGGGTATGAAACCGGGAACTGGGGGCCGCTGATGCTGGAGGTGGAATCCTGGGTGCTCAGTGGTATAGCT------------TCCTCTGTTGCTCTGGGGATTTTTTCCGCTACATTAGGAGCATATGCCTTATCTCTTGGAGTTCCTGCTATTGCTGTTGGTATCGCCGGTATTCTACTCGCAGCAGTTGTTGGTGCGTTAATTGATGATAAGTTTGCAGATGCTTTGAATAATGAAATA
O24681_SHIBO/416-614 GCAGAGGAAAAAGCAAATGATGAGAAGGCTGTTCTGACAAAAGCCAGTGAAATTATCATCAGTGTTGGTGATAAGGCTGGGGAGTATCTGGGTGATAAATATAAAGTTCTTTCTCGTGAGATAGCAGATAATATCAAAAACTTTCAGGGCAAAACGATTCGTAGTTACGATGAGGCGATGGCTTCTGTCAATAAACTGATGGCTAATCCTGATCTTAAAATTAATGCCGCCGACAGGGATGCAATTGTGAATGCCTGGAAAGCATTTGATGCAGAGGATATGGGGAATAAGTTTGCCGCGCTGGGTAAGACGTTTAAAGCCGCAGATTATGTGATGAAGGCAAACAACGTCCGGGAGAAGAGTATCGAGGGGTATCAGACCGGAAACTGGGGGCCGCTGATGCTGGAGATTGAGTCCTGGGTATTGAGTGGTATTGCT------------TCTGCTGTGGCGCTATCATTTTTCTCAGCTATCTTTGGTACTTTTGCTATGCTGGGTGTTTTTTCGACTAGTTTAGCTGGGATCTTGGCTGTTATTTTGGCTGGTTTAGTTGGGGCGTTGATTGATGATAATTTTGTTGATAAGTTAAATAATGAAATT
CEAB_ECOLI/310-508 AAGAAAGAACAAGAAAATGACGAGAAGACGGTCCTGACAAAAACCAGCGAGGTCATCATTAGTGTCGGTGACAAAGTCGGGGAATATCTTGGAGATAAATACAAGGCGCTTTCCCGTGAAATTGCAGAGAATATAAATAATTTTCAGGGAAAAACGATTCGTAGTTATGATGATGCAATGTCTTCCATTAATAAGTTAATGGCTAACCCCAGCCTTAAAATAAATGCAACGGACAAAGAAGCCATTGTGAATGCGTGGAAAGCATTTAATGCTGAGGATATGGGGAATAAATTTGCTGCGTTGGGTAAAACGTTCAAAGCAGCAGATTATGCAATAAAGGCAAACAACATCAGGGAGAAGAGTATTGAGGGTTACCAGACTGGTAACTGGGGGCCATTAATGCTGGAAGTCGAGTCCTGGGTTATCAGTGGGATGGCA------------TCTGCTGTAGCTCTTAGTTTGTTTTCTTTGACATTAGGCTCGGCCCTTATAGCCTTTGGTCTTTCGGCCACAGTTGTTGGTTTTGTTGGCGTAGTTATTGCAGGTGCTATTGGTGCATTTATCGATGATAAATTTGTTGATGAGTTGAATCACAAGATC
Q06308_SERMA/258-446 ------GAATATCAAAATGCGGAATTAAAAGCCATCAAGGATGGCGTCAGCCTGGCCGCAGGTATCAATAAAGATATCGCGGAAAAGATCGGCGCGAAATACGCCAAACTCGCCAAGGATTTGGAGGCGGGAATTCAA---------GGAAAATATATCCGCAACGTGCAAGATGCGGAGAAAACCTACGAGCAATTGACGAAGGGCCTGAACAAAAAGCTCAAGGCGCAGGACAAAGCGGCGATTGTCGCCTGGCTGAAAATGATCGATGCGGAACAGTATGCCCGCAATGCGCGGGTATTGGGCAAGGTCTTCACCGGGGTGGACTGGGCGATCAAGGGCGCGGATCTGGTAAACGCCGCGATTGAAGGTTTCTCTACCGGCAACTGGAAAGCGTTCCGCAACCAGCTCGAAGCGCTCGGGTTGTCGATCGGCGCAGGGTATACGCTTTCCGCTATCGCCGCGTTTTTCGCGCCGACGCTAGTGTCGTCGACGGTGGGCATTTTCGCCTTCGCTTACCTGTTTGGC---------------------------TGGGCCACCAGCTATATCGATGCGGAACGTGCGGGGGAGCTGGAGAAGTGGGTC
CEIB_ECOLI/438-624 GAAGAGAAAAGAAAAAGGGATGAAATAAATATGGTAAAGGATGCCATAAAACTCACCTCTGATTTCTACAGAACGATATATGATGAGTTCGGTAAACAAGCATCCGAACTTGCTAAGGAGCTGGCTTCTGTATCTCAA---------GGGAAACAGATTAAGAGTGTGGATGATGCACTGAACGCTTTTGATAAATTCCGTAATAATCTGAACAAGAAATATAACATACAAGATCGCATGGCCATTTCTAAAGCCCTGGAAGCTATTAATCAGGTCCATATGGCGGAGAATTTTAAGCTGTTCAGTAAGGCATTTGGTTTTACCGGAAAAGTTATTGAACGTTATGATGTTGCTGTGGAGTTACAAAAGGCTGTAAAAACGGACAACTGGCGTCCATTTTTTGTAAAACTTGAATCACTGGCAGCAGGAAGAGCTGCT------------TCAGCAGTTACAGCATGGGCGTTTTCCGTCATGCTGGGAACCCCTGTAGGTATTCTGGGTTTTGCAATTATTATGGCG---------------------------GCTGTGAGTGCGCTTGTTAATGATAAGTTTATTGAGCAGGTCAATAAACTTATT
CEIA_ECOLI/438-624 GAAGAGAAAAGAAAACAGGATGAACTGAAGGCAACGAAAGACGCAATTAATTTCACAACAGAGTTCCTGAAATCAGTTTCAGAAAAATATGGTGCAAAAGCTGAGCAGTTAGCCAGAGAGATGGCCGGGCAGGCTAAA---------GGGAAGAAAATACGTAATGTTGAAGAGGCATTAAAAACGTATGAAAAGTACCGGGCTGACATTAACAAAAAAATTAATGCAAAAGATCGTGCAGCGATTGCCGCAGCCCTTGAGTCTGTGAAGCTGTCTGATATATCGTCTAATCTGAACAGATTCAGTCGGGGACTGGGATATGCAGGAAAATTTACAAGTCTTGCTGACTGGATCACTGAGTTTGGTAAGGCTGTCCGGACAGAGAACTGGCGTCCTCTTTTTGTTAAAACAGAAACCATCATAGCAGGCAATGCCGCA------------ACGGCTCTTGTGGCACTGGTCTTCAGTATTCTTACCGGAAGCGCTTTAGGCATTATCGGGTATGGTTTACTGATGGCT---------------------------GTCACCGGTGCGCTGATTGATGAATCGCTTGTGGAAAAAGCGAATAAGTTCTGG
CEAK_ECOLI/360-546 AAAGAAGCTCAGGATGCTCTTGAAAAGAGCCAGATAAAAGATGCTGTTGATACTATGGTTGGATTTTATCAATATATAACCGAACAATATGGAGAAAAATACGCAAAAATTGCTCAGGATTTAGCGGAAAAGTCTAAA---------GGAAAGAAAATTCAAGGTGTTGATGAAGCTCTGGCAGCATTTGAAAAGTATAAGAATGTACTGGATAAGAAATTCAGTAAGGTTGATCGGGATGCTATTTTTAATGCGTTAGAGTCTGTTAATTATGATGAGTTATCTAAGAATTTAACGAAGATATCAAAGTCGCTTAAAATCACCAGTCGAGTATCTTTTCTATATGATGTTGGTTCTGATTTTAAAAATGCAATAGAAACTGGTAACTGGCGACCTTTGTTTGTCACGCTGGAGAAAAGTGCGGTCGATGTAGGTGTG------------GCAAAAATTGTGGCATTAATGTTTAGTTTTATTGTTGGTGTGCCTCTTGGTTTCTGGGGGATTGCAATTGTCACAGGT---------------------------ATTGTTTCTTCTTACATAGGGGATGATGAGTTGAGCAAACTTAATGAGTTGTTA
CEA1_ECOLI/334-520 AAAAAAGCACAGAATAATCTCCTTAATTCACAGATTAAGGATGCTGTTGATGCAACAGTTAGCTTTTATCAAACGCTGACTGAAAAATATGGTGAAAAATATTCGAAAATGGCACAGGAACTTGCTGATAAGTCTAAA---------GGTAAGAAAATCGGCAATGTGAATGAAGCTCTCGCTGCTTTTGAAAAATACAAGGATGTTTTAAATAAGAAATTCAGCAAAGCCGATCGTGATGCTATTTTTAATGCGTTGGCATCGGTGAAGTATGATGACTGGGCTAAACATTTAGATCAGTTTGCCAAGTACTTGAAGATTACGGGGCATGTTTCTTTTGGATATGATGTGGTATCTGATATCCTAAAAATTAAGGATACAGGTGACTGGAAGCCACTATTTCTTACATTAGAGAAGAAAGCTGCAGATGCAGGGGTG------------AGTTATGTTGTTGCTTTACTTTTTAGCTTGCTTGCTGGAACTACATTAGGTATTTGGGGTATTGCTATTGTTACAGGA---------------------------ATTCTATGCTCCTATATTGATAAGAATAAACTTAATACTATAAATGAGGTGTTA