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Protein and Associated NucleotideDomains with Inferred Trees

PF00801 phylogeny
for nucleotide alignment


 
((((((((((PKD1_HUMAN/1217-1291,O08852_MOUSE/1211-1285),O42181_FUGRU/1264-1338),SORC3_HUMAN/826-910),Q9WXI8_9BACI/1570-1651),(PKD1_HUMAN/745-817,(PKD1_HUMAN/855-928,O08852_MOUSE/845-922))),(((((((PKD1_HUMAN/1807-1883,O08852_MOUSE/1804-1879),(((PKD1_HUMAN/1892-1967,O08852_MOUSE/1888-1963),Q15142_HUMAN/1425-1493),O42181_FUGRU/1956-2032)),((PKD1_HUMAN/1131-1208,O08852_MOUSE/1125-1202),O42181_FUGRU/1180-1255)),(((PKD1_HUMAN/1723-1798,O08852_MOUSE/1720-1795),(PKD1_HUMAN/1553-1628,O42181_FUGRU/1602-1677)),(P115_CHICK/230-315,PM17_HUMAN/224-300))),(Q9WXI8_9BACI/1264-1356,O42181_FUGRU/1788-1862)),((O69947_STRCO/512-588,(((XANP_XANS2/645-715,API_ACHLY/483-553),O54108_STRCO/673-749),((COLA_VIBAL/614-688,(((Y1468_METJA/818-882,(O26179_METTH/182-253,(((O26812_METTH/1357-1430,O26812_METTH/252-327),(Q9XBW4_PORGI/486-562,(Q9XBW4_PORGI/658-732,Q9XBW4_PORGI/571-646))),(((Q50245_METMA/353-424,Q50246_METMA/245-314),(O53132_METMA/33-104,O53132_METMA/115-188)),(((Q50247_METMA/22-92,(Q50247_METMA/105-177,((Q50247_METMA/278-348,(Q50247_METMA/457-527,Q50247_METMA/370-442)),(Q50247_METMA/705-781,((Q50247_METMA/627-699,Q50247_METMA/192-264),Q50247_METMA/542-614))))),Q50244_METMA/575-647),Q50244_METMA/316-386))))),(((Y1468_METJA/730-806,(P71140_CLOTM/1365-1442,(O28874_ARCFU/242-314,O28621_ARCFU/382-455))),Y1468_METJA/900-973),((Q9YFD7_AERPE/171-260,Q9YFD7_AERPE/72-149),(((Q9X721_CLOHI/802-878,Q46085_CLOHI/732-808),(O58659_PYRHO/3454-3527,Q46085_CLOHI/823-898)),COLA_CLOPE/781-855)))),(O07351_VIBCH/766-836,O58659_PYRHO/3917-3986))),(O27076_METTH/276-350,HOC_BPT4/106-186)))),(((((PKD1_HUMAN/1471-1544,O08852_MOUSE/1465-1538),Q15142_HUMAN/1152-1247),O42181_FUGRU/1518-1593),Q9Z5Z7_METCA/130-207),(((O42181_FUGRU/2131-2204,(PKD1_HUMAN/2066-2141,O08852_MOUSE/2062-2137)),(PKD1_HUMAN/277-352,O08852_MOUSE/277-352)),O42181_FUGRU/296-364)))),((((Q15142_HUMAN/652-728,O42181_FUGRU/987-1063),((Q43919_AERPU/671-751,Q9RQJ3_AERHY/668-748),((GUNA_PSEFL/730-813,CHIA_ALTSO/599-678),(((Q9ZIX3_9GAMM/348-425,Q9ZIX2_9GAMM/692-769),CHIA_ALTSO/692-768),Q9ZIX2_9GAMM/597-675)))),(((PKD1_HUMAN/1637-1714,O08852_MOUSE/1631-1711),O07351_VIBCH/843-917),O42181_FUGRU/1871-1947)),((PKD1_HUMAN/1024-1122,O08852_MOUSE/1018-1116),O42181_FUGRU/1074-1171)))),(PKD1_HUMAN/1301-1376,O42181_FUGRU/1348-1423)),(PKD1_HUMAN/1976-2057,O42181_FUGRU/2041-2118)),O42181_FUGRU/1432-1509),PKD1_HUMAN/1385-1462,O08852_MOUSE/1379-1456);
((((((((((PKD1_HUMAN/1217-1291:0.09528,O08852_MOUSE/1211-1285:0.18906):0.27865,O42181_FUGRU/1264-1338:0.50241):0.15435,SORC3_HUMAN/826-910:0.59163):0.19750,Q9WXI8_9BACI/1570-1651:0.59164):0.04983,(PKD1_HUMAN/745-817:0.96387,(PKD1_HUMAN/855-928:0.01971,O08852_MOUSE/845-922:0.46586):0.28137):0.54311):0.04448,(((((((PKD1_HUMAN/1807-1883:0.04400,O08852_MOUSE/1804-1879:0.32264):0.48887,(((PKD1_HUMAN/1892-1967:0.04577,O08852_MOUSE/1888-1963:0.20221):0.11805,Q15142_HUMAN/1425-1493:0.21319):0.19884,O42181_FUGRU/1956-2032:0.52178):0.14993):0.02925,((PKD1_HUMAN/1131-1208:0.09989,O08852_MOUSE/1125-1202:0.23563):0.09925,O42181_FUGRU/1180-1255:0.70455):0.31633):0.06722,(((PKD1_HUMAN/1723-1798:0.04479,O08852_MOUSE/1720-1795:0.21846):0.47219,(PKD1_HUMAN/1553-1628:0.18746,O42181_FUGRU/1602-1677:0.37182):0.19920):0.07915,(P115_CHICK/230-315:0.33203,PM17_HUMAN/224-300:0.45925):0.25078):0.09137):0.03944,(Q9WXI8_9BACI/1264-1356:0.47573,O42181_FUGRU/1788-1862:0.67777):0.24391):0.04736,((O69947_STRCO/512-588:0.28873,(((XANP_XANS2/645-715:0.24475,API_ACHLY/483-553:0.07204):0.10120,O54108_STRCO/673-749:0.16199):0.10158,((COLA_VIBAL/614-688:0.48332,(((Y1468_METJA/818-882:0.34718,(O26179_METTH/182-253:0.37897,(((O26812_METTH/1357-1430:0.04564,O26812_METTH/252-327:0.10761):0.26444,(Q9XBW4_PORGI/486-562:0.23350,(Q9XBW4_PORGI/658-732:0.37228,Q9XBW4_PORGI/571-646:0.24230):0.14345):0.32749):0.11260,(((Q50245_METMA/353-424:0.22039,Q50246_METMA/245-314:0.17117):0.08167,(O53132_METMA/33-104:0.23129,O53132_METMA/115-188:0.29876):0.31434):0.14127,(((Q50247_METMA/22-92:0.14689,(Q50247_METMA/105-177:0.18828,((Q50247_METMA/278-348:0.23397,(Q50247_METMA/457-527:0.09879,Q50247_METMA/370-442:0.16773):0.03176):0.02572,(Q50247_METMA/705-781:0.37944,((Q50247_METMA/627-699:0.07383,Q50247_METMA/192-264:0.26145):0.06652,Q50247_METMA/542-614:0.10362):0.04156):0.09199):0.01909):0.04616):0.18374,Q50244_METMA/575-647:0.29743):0.12932,Q50244_METMA/316-386:0.16549):0.12962):0.13874):0.14068):0.05593):0.11970,(((Y1468_METJA/730-806:0.35706,(P71140_CLOTM/1365-1442:0.31446,(O28874_ARCFU/242-314:0.42298,O28621_ARCFU/382-455:0.53340):0.05836):0.10876):0.07053,Y1468_METJA/900-973:0.33380):0.13204,((Q9YFD7_AERPE/171-260:0.42334,Q9YFD7_AERPE/72-149:0.38377):0.16245,(((Q9X721_CLOHI/802-878:0.22132,Q46085_CLOHI/732-808:0.29325):0.06171,(O58659_PYRHO/3454-3527:0.44418,Q46085_CLOHI/823-898:0.32426):0.11774):0.09098,COLA_CLOPE/781-855:0.24300):0.10273):0.04426):0.12694):0.07704,(O07351_VIBCH/766-836:0.38092,O58659_PYRHO/3917-3986:0.44152):0.07102):0.11153):0.10311,(O27076_METTH/276-350:0.31914,HOC_BPT4/106-186:0.80019):0.17242):0.25196):0.13951):0.09041,(((((PKD1_HUMAN/1471-1544:0.01482,O08852_MOUSE/1465-1538:0.24405):0.11202,Q15142_HUMAN/1152-1247:0.09949):0.26703,O42181_FUGRU/1518-1593:0.45558):0.14248,Q9Z5Z7_METCA/130-207:0.67697):0.10471,(((O42181_FUGRU/2131-2204:0.53666,(PKD1_HUMAN/2066-2141:0.01588,O08852_MOUSE/2062-2137:0.23027):0.20964):0.19823,(PKD1_HUMAN/277-352:0.09668,O08852_MOUSE/277-352:0.15476):0.48260):0.17398,O42181_FUGRU/296-364:0.64439):0.13928):0.11423):0.05591):0.06196,((((Q15142_HUMAN/652-728:0.20130,O42181_FUGRU/987-1063:0.36260):0.26441,((Q43919_AERPU/671-751:0.12041,Q9RQJ3_AERHY/668-748:0.10237):0.09877,((GUNA_PSEFL/730-813:0.54252,CHIA_ALTSO/599-678:0.44186):0.12391,(((Q9ZIX3_9GAMM/348-425:0.61074,Q9ZIX2_9GAMM/692-769:0.10593):0.12745,CHIA_ALTSO/692-768:0.31813):0.07591,Q9ZIX2_9GAMM/597-675:0.50120):0.17700):0.26767):0.33078):0.05852,(((PKD1_HUMAN/1637-1714:0.06765,O08852_MOUSE/1631-1711:0.26552):0.27769,O07351_VIBCH/843-917:0.81672):0.10124,O42181_FUGRU/1871-1947:0.84818):0.15680):0.10350,((PKD1_HUMAN/1024-1122:0.06275,O08852_MOUSE/1018-1116:0.15646):0.33937,O42181_FUGRU/1074-1171:0.37667):0.37711):0.00655):0.06147):0.07133,(PKD1_HUMAN/1301-1376:0.40284,O42181_FUGRU/1348-1423:0.42472):0.31666):0.05273,(PKD1_HUMAN/1976-2057:0.22174,O42181_FUGRU/2041-2118:0.76428):0.39149):0.23007,O42181_FUGRU/1432-1509:0.47015):0.44560,PKD1_HUMAN/1385-1462:0.02508,O08852_MOUSE/1379-1456:0.19600);